TopFIND 4.0

O88279: Slit homolog 1 protein

General Information

Protein names
- Slit homolog 1 protein
- Slit-1
- Multiple epidermal growth factor-like domains protein 4
- Multiple EGF-like domains protein 4
Gene names Slit1
Organism Rattus norvegicus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID O88279

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MALTPQRGSS SGLSRPELWL LLWAAAWRLG ATACPALCTC TGTTVDCHGT GLQAIPKNIP 
        70         80         90        100        110        120 
RNTERLELNG NNITRIHKND FAGLKQLRVL QLMENQIGAV ERGAFDDMKE LERLRLNRNQ 
       130        140        150        160        170        180 
LQVLPELLFQ NNQALSRLDL SENSLQAVPR KAFRGATDLK NLQLDKNQIS CIEEGAFRAL 
       190        200        210        220        230        240 
RGLEVLTLNN NNITTIPVSS FNHMPKLRTF RLHSNHLFCD CHLAWLSQWL RQRPTIGLFT 
       250        260        270        280        290        300 
QCSGPASLRG LNVAEVQKSE FSCSGQGEAA QVPACTLSSG SCPAMCSCSN GIVDCRGKGL 
       310        320        330        340        350        360 
TAIPANLPET MTEIRLELNG IKSIPPGAFS PYRKLRRIDL SNNQIAEIAP DAFQGLRSLN 
       370        380        390        400        410        420 
SLVLYGNKIT DLPRGVFGGL YTLQLLLLNA NKINCIRPDA FQDLQNLSLL SLYDNKIQSL 
       430        440        450        460        470        480 
AKGTFTSLRA IQTLHLAQNP FICDCNLKWL ADFLRTNPIE TTGARCASPR RLANKRIGQI 
       490        500        510        520        530        540 
KSKKFRCSAK EQYFIPGTED YHLNSECTSD VACPHKCRCE ASVVECSGLK LSKIPERIPQ 
       550        560        570        580        590        600 
STTELRLNNN EISILEATGL FKKLSHLKKI NLSNNKVSEI EDGTFEGATS VSELHLTANQ 
       610        620        630        640        650        660 
LESVRSGMFR GLDGLRTLML RNNRISCIHN DSFTGLRNVR LLSLYDNHIT TISPGAFDTL 
       670        680        690        700        710        720 
QALSTLNLLA NPFNCNCQLA WLGDWLRKRK IVTGNPRCQN PDFLRQIPLQ DVAFPDFRCE 
       730        740        750        760        770        780 
EGQEEVGCLP RPQCPQECAC LDTVVRCSNK HLQALPKGIP KNVTELYLDG NQFTLVPGQL 
       790        800        810        820        830        840 
STFKYLQLVD LSNNKISSLS NSSFTNMSQL TTLILSYNAL QCIPPLAFQG LRSLRLLSLH 
       850        860        870        880        890        900 
GNDVSTLQEG IFADVTSLSH LAIGANPLYC DCHLRWLSSW VKTGYKEPGI ARCAGPPEME 
       910        920        930        940        950        960 
GKLLLTTPAK KFECQGPPSL AVQAKCDPCL SSPCQNQGTC HNDPLEVYRC TCPSGYKGRN 
       970        980        990       1000       1010       1020 
CEVSLDSCSS NPCGNGGTCH AQEGEDAGFT CSCPSGFEGL TCGMNTDDCV KHDCVNGGVC 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
VDGIGNYTCQ CPLQYTGRAC EQLVDFCSPD LNPCQHEAQC VGTPEGPRCE CVPGYTGDNC 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SKNQDDCKDH QCQNGAQCVD EINSYACLCA EGYSGQLCEI PPAPRNSCEG TECQNGANCV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
DQGSRPVCQC LPGFGGPECE KLLSVNFVDR DTYLQFTDLQ NWPRANITLQ VSTAEDNGIL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
LYNGDNDHIA VELYQGHVRV SYDPGSYPSS AIYSAETIND GQFHTVELVT FDQMVNLSID 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GGSPMTMDNF GKHYTLNSEA PLYVGGMPVD VNSAAFRLWQ ILNGTSFHGC IRNLYINNEL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
QDFTKTQMKP GVVPGCEPCR KLYCLHGICQ PNATPGPVCH CEAGWGGLHC DQPVDGPCHG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
HKCVHGKCVP LDALAYSCQC QDGYSGALCN QVGAVAEPCG GLQCLHGHCQ ASATRGAHCV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
CSPGFSGELC EQESECRGDP VRDFHRVQRG YAICQTTRPL SWVECRGACP GQGCCQGLRL 
      1510       1520       1530    
KRRKLTFECS DGTSFAEEVE KPTKCGCAPC A

Isoforms

- Isoform 2 of Slit homolog 1 protein - Isoform 3 of Slit homolog 1 protein - Isoform 4 of Slit homolog 1 protein

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MALTPQRGSS SGLSRPELWL LLWAAAWRLG ATACPALCTC TGTTVDCHGT GLQAIPKNIP 
        70         80         90        100        110        120 
RNTERLELNG NNITRIHKND FAGLKQLRVL QLMENQIGAV ERGAFDDMKE LERLRLNRNQ 
       130        140        150        160        170        180 
LQVLPELLFQ NNQALSRLDL SENSLQAVPR KAFRGATDLK NLQLDKNQIS CIEEGAFRAL 
       190        200        210        220        230        240 
RGLEVLTLNN NNITTIPVSS FNHMPKLRTF RLHSNHLFCD CHLAWLSQWL RQRPTIGLFT 
       250        260        270        280        290        300 
QCSGPASLRG LNVAEVQKSE FSCSGQGEAA QVPACTLSSG SCPAMCSCSN GIVDCRGKGL 
       310        320        330        340        350        360 
TAIPANLPET MTEIRLELNG IKSIPPGAFS PYRKLRRIDL SNNQIAEIAP DAFQGLRSLN 
       370        380        390        400        410        420 
SLVLYGNKIT DLPRGVFGGL YTLQLLLLNA NKINCIRPDA FQDLQNLSLL SLYDNKIQSL 
       430        440        450        460        470        480 
AKGTFTSLRA IQTLHLAQNP FICDCNLKWL ADFLRTNPIE TTGARCASPR RLANKRIGQI 
       490        500        510        520        530        540 
KSKKFRCSAK EQYFIPGTED YHLNSECTSD VACPHKCRCE ASVVECSGLK LSKIPERIPQ 
       550        560        570        580        590        600 
STTELRLNNN EISILEATGL FKKLSHLKKI NLSNNKVSEI EDGTFEGATS VSELHLTANQ 
       610        620        630        640        650        660 
LESVRSGMFR GLDGLRTLML RNNRISCIHN DSFTGLRNVR LLSLYDNHIT TISPGAFDTL 
       670        680        690        700        710        720 
QALSTLNLLA NPFNCNCQLA WLGDWLRKRK IVTGNPRCQN PDFLRQIPLQ DVAFPDFRCE 
       730        740        750        760        770        780 
EGQEEVGCLP RPQCPQECAC LDTVVRCSNK HLQALPKGIP KNVTELYLDG NQFTLVPGQL 
       790        800        810        820        830        840 
STFKYLQLVD LSNNKISSLS NSSFTNMSQL TTLILSYNAL QCIPPLAFQG LRSLRLLSLH 
       850        860        870        880        890        900 
GNDVSTLQEG IFADVTSLSH LAIGANPLYC DCHLRWLSSW VKTGYKEPGI ARCAGPPEME 
       910        920        930        940        950        960 
GKLLLTTPAK KFECQGPPSL AVQAKCDPCL SSPCQNQGTC HNDPLEVYRC TCPSGYKGRN 
       970        980        990       1000       1010       1020 
CEVSLDSCSS NPCGNGGTCH AQEGEDAGFT CSCPSGFEGL TCGMNTDDCV KHDCVNGGVC 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
VDGIGNYTCQ CPLQYTGRAC EQLVDFCSPD LNPCQHEAQC VGTPEGPRCE CVPGYTGDNC 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SKNQDDCKDH QCQNGAQCVD EINSYACLCA EGYSGQLCEI PPAPRNSCEG TECQNGANCV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
DQGSRPVCQC LPGFGGPECE KLLSVNFVDR DTYLQFTDLQ NWPRANITLQ VSTAEDNGIL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
LYNGDNDHIA VELYQGHVRV SYDPGSYPSS AIYSAETIND GQFHTVELVT FDQMVNLSID 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GGSPMTMDNF GKHYTLNSEA PLYVGGMPVD VNSAAFRLWQ ILNGTSFHGC IRNLYINNEL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
QDFTKTQMKP GVVPGCEPCR KLYCLHGICQ PNATPGPVCH CEAGWGGLHC DQPVDGPCHG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
HKCVHGKCVP LDALAYSCQC QDGYSGALCN QVGAVAEPCG GLQCLHGHCQ ASATRGAHCV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
CSPGFSGELC EQESECRGDP VRDFHRVQRG YAICQTTRPL SWVECRGACP GQGCCQGLRL 
      1510       1520       1530    
KRRKLTFECS DGTSFAEEVE KPTKCGCAPC A         10         20         30         40         50         60 
MALTPQRGSS SGLSRPELWL LLWAAAWRLG ATACPALCTC TGTTVDCHGT GLQAIPKNIP 
        70         80         90        100        110        120 
RNTERLELNG NNITRIHKND FAGLKQLRVL QLMENQIGAV ERGAFDDMKE LERLRLNRNQ 
       130        140        150        160        170        180 
LQVLPELLFQ NNQALSRLDL SENSLQAVPR KAFRGATDLK NLQLDKNQIS CIEEGAFRAL 
       190        200        210        220        230        240 
RGLEVLTLNN NNITTIPVSS FNHMPKLRTF RLHSNHLFCD CHLAWLSQWL RQRPTIGLFT 
       250        260        270        280        290        300 
QCSGPASLRG LNVAEVQKSE FSCSGQGEAA QVPACTLSSG SCPAMCSCSN GIVDCRGKGL 
       310        320        330        340        350        360 
TAIPANLPET MTEIRLELNG IKSIPPGAFS PYRKLRRIDL SNNQIAEIAP DAFQGLRSLN 
       370        380        390        400        410        420 
SLVLYGNKIT DLPRGVFGGL YTLQLLLLNA NKINCIRPDA FQDLQNLSLL SLYDNKIQSL 
       430        440        450        460        470        480 
AKGTFTSLRA IQTLHLAQNP FICDCNLKWL ADFLRTNPIE TTGARCASPR RLANKRIGQI 
       490        500        510        520        530        540 
KSKKFRCSAK EQYFIPGTED YHLNSECTSD VACPHKCRCE ASVVECSGLK LSKIPERIPQ 
       550        560        570        580        590        600 
STTELRLNNN EISILEATGL FKKLSHLKKI NLSNNKVSEI EDGTFEGATS VSELHLTANQ 
       610        620        630        640        650        660 
LESVRSGMFR GLDGLRTLML RNNRISCIHN DSFTGLRNVR LLSLYDNHIT TISPGAFDTL 
       670        680        690        700        710        720 
QALSTLNLLA NPFNCNCQLA WLGDWLRKRK IVTGNPRCQN PDFLRQIPLQ DVAFPDFRCE 
       730        740        750        760        770        780 
EGQEEVGCLP RPQCPQECAC LDTVVRCSNK HLQALPKGIP KNVTELYLDG NQFTLVPGQL 
       790        800        810        820        830        840 
STFKYLQLVD LSNNKISSLS NSSFTNMSQL TTLILSYNAL QCIPPLAFQG LRSLRLLSLH 
       850        860        870        880        890        900 
GNDVSTLQEG IFADVTSLSH LAIGANPLYC DCHLRWLSSW VKTGYKEPGI ARCAGPPEME 
       910        920        930        940        950        960 
GKLLLTTPAK KFECQGPPSL AVQAKCDPCL SSPCQNQGTC HNDPLEVYRC TCPSGYKGRN 
       970        980        990       1000       1010       1020 
CEVSLDSCSS NPCGNGGTCH AQEGEDAGFT CSCPSGFEGL TCGMNTDDCV KHDCVNGGVC 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
VDGIGNYTCQ CPLQYTGRAC EQLVDFCSPD LNPCQHEAQC VGTPEGPRCE CVPGYTGDNC 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SKNQDDCKDH QCQNGAQCVD EINSYACLCA EGYSGQLCEI PPAPRNSCEG TECQNGANCV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
DQGSRPVCQC LPGFGGPECE KLLSVNFVDR DTYLQFTDLQ NWPRANITLQ VSTAEDNGIL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
LYNGDNDHIA VELYQGHVRV SYDPGSYPSS AIYSAETIND GQFHTVELVT FDQMVNLSID 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GGSPMTMDNF GKHYTLNSEA PLYVGGMPVD VNSAAFRLWQ ILNGTSFHGC IRNLYINNEL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
QDFTKTQMKP GVVPGCEPCR KLYCLHGICQ PNATPGPVCH CEAGWGGLHC DQPVDGPCHG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
HKCVHGKCVP LDALAYSCQC QDGYSGALCN QVGAVAEPCG GLQCLHGHCQ ASATRGAHCV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
CSPGFSGELC EQESECRGDP VRDFHRVQRG YAICQTTRPL SWVECRGACP GQGCCQGLRL 
      1510       1520       1530    
KRRKLTFECS DGTSFAEEVE KPTKCGCAPC A         10         20         30         40         50         60 
MALTPQRGSS SGLSRPELWL LLWAAAWRLG ATACPALCTC TGTTVDCHGT GLQAIPKNIP 
        70         80         90        100        110        120 
RNTERLELNG NNITRIHKND FAGLKQLRVL QLMENQIGAV ERGAFDDMKE LERLRLNRNQ 
       130        140        150        160        170        180 
LQVLPELLFQ NNQALSRLDL SENSLQAVPR KAFRGATDLK NLQLDKNQIS CIEEGAFRAL 
       190        200        210        220        230        240 
RGLEVLTLNN NNITTIPVSS FNHMPKLRTF RLHSNHLFCD CHLAWLSQWL RQRPTIGLFT 
       250        260        270        280        290        300 
QCSGPASLRG LNVAEVQKSE FSCSGQGEAA QVPACTLSSG SCPAMCSCSN GIVDCRGKGL 
       310        320        330        340        350        360 
TAIPANLPET MTEIRLELNG IKSIPPGAFS PYRKLRRIDL SNNQIAEIAP DAFQGLRSLN 
       370        380        390        400        410        420 
SLVLYGNKIT DLPRGVFGGL YTLQLLLLNA NKINCIRPDA FQDLQNLSLL SLYDNKIQSL 
       430        440        450        460        470        480 
AKGTFTSLRA IQTLHLAQNP FICDCNLKWL ADFLRTNPIE TTGARCASPR RLANKRIGQI 
       490        500        510        520        530        540 
KSKKFRCSAK EQYFIPGTED YHLNSECTSD VACPHKCRCE ASVVECSGLK LSKIPERIPQ 
       550        560        570        580        590        600 
STTELRLNNN EISILEATGL FKKLSHLKKI NLSNNKVSEI EDGTFEGATS VSELHLTANQ 
       610        620        630        640        650        660 
LESVRSGMFR GLDGLRTLML RNNRISCIHN DSFTGLRNVR LLSLYDNHIT TISPGAFDTL 
       670        680        690        700        710        720 
QALSTLNLLA NPFNCNCQLA WLGDWLRKRK IVTGNPRCQN PDFLRQIPLQ DVAFPDFRCE 
       730        740        750        760        770        780 
EGQEEVGCLP RPQCPQECAC LDTVVRCSNK HLQALPKGIP KNVTELYLDG NQFTLVPGQL 
       790        800        810        820        830        840 
STFKYLQLVD LSNNKISSLS NSSFTNMSQL TTLILSYNAL QCIPPLAFQG LRSLRLLSLH 
       850        860        870        880        890        900 
GNDVSTLQEG IFADVTSLSH LAIGANPLYC DCHLRWLSSW VKTGYKEPGI ARCAGPPEME 
       910        920        930        940        950        960 
GKLLLTTPAK KFECQGPPSL AVQAKCDPCL SSPCQNQGTC HNDPLEVYRC TCPSGYKGRN 
       970        980        990       1000       1010       1020 
CEVSLDSCSS NPCGNGGTCH AQEGEDAGFT CSCPSGFEGL TCGMNTDDCV KHDCVNGGVC 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
VDGIGNYTCQ CPLQYTGRAC EQLVDFCSPD LNPCQHEAQC VGTPEGPRCE CVPGYTGDNC 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SKNQDDCKDH QCQNGAQCVD EINSYACLCA EGYSGQLCEI PPAPRNSCEG TECQNGANCV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
DQGSRPVCQC LPGFGGPECE KLLSVNFVDR DTYLQFTDLQ NWPRANITLQ VSTAEDNGIL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
LYNGDNDHIA VELYQGHVRV SYDPGSYPSS AIYSAETIND GQFHTVELVT FDQMVNLSID 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GGSPMTMDNF GKHYTLNSEA PLYVGGMPVD VNSAAFRLWQ ILNGTSFHGC IRNLYINNEL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
QDFTKTQMKP GVVPGCEPCR KLYCLHGICQ PNATPGPVCH CEAGWGGLHC DQPVDGPCHG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
HKCVHGKCVP LDALAYSCQC QDGYSGALCN QVGAVAEPCG GLQCLHGHCQ ASATRGAHCV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
CSPGFSGELC EQESECRGDP VRDFHRVQRG YAICQTTRPL SWVECRGACP GQGCCQGLRL 
      1510       1520       1530    
KRRKLTFECS DGTSFAEEVE KPTKCGCAPC A



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...CAPCA 1531 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...CAPCA 1531 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt153453

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)