TopFIND 4.0

P41230: Lysine-specific demethylase 5C

General Information

Protein names
- Lysine-specific demethylase 5C
- 1.14.11.-
- Histone demethylase JARID1C
- Jumonji/ARID domain-containing protein 1C
- Protein SmcX
- Protein Xe169
Gene names Kdm5c
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID P41230

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MELGSDDFLP PPECPVFEPS WAEFRDPLGY IAKIRPIAEK SGICKIRPPA DWQPPFAVEV 
        70         80         90        100        110        120 
DNFRFTPRIQ RLNELEAQTR VKLNYLDQIA KFWEIQGSSL KIPNVERRIL DLYSLSKIVV 
       130        140        150        160        170        180 
EEGGYETICK DRRWARVAQR LNYPPGKNIG SLLRSHYERI VYPYEMYQSG ANLVQCNTRP 
       190        200        210        220        230        240 
FDNEEKDKEY KPHSIPLRQS VQPSKFNSYG RRAKRLQPDP EPTEEDIEKN PELKKLQIYG 
       250        260        270        280        290        300 
AGPKMMGLGL MAKDKTLRKK DKEGPECPPT VVVKEELGGD VKMESTSPKT FLEGKEELSH 
       310        320        330        340        350        360 
SPEPCTKMTM RLRRNHSNAQ FIESYVCRMC SRGDEDDKLL LCDGCDDNYH IFCLLPPLPE 
       370        380        390        400        410        420 
IPKGVWRCPK CVMAECKRPP EAFGFEQATR EYTLQSFGEM ADSFKADYFN MPVHMVPTEL 
       430        440        450        460        470        480 
VEKEFWRLVN SIEEDVTVEY GADIHSKEFG SGFPVSDSKR HLTPEEEEYA TSGWNLNVMP 
       490        500        510        520        530        540 
VLEQSVLCHI NADISGMKVP WLYVGMVFSA FCWHIEDHWS YSINYLHWGE PKTWYGVPSL 
       550        560        570        580        590        600 
AAEHLEEVMK KLTPELFDSQ PDLLHQLVTL MNPNTLMSHG VPVVRTNQCA GEFVITFPRA 
       610        620        630        640        650        660 
YHSGFNQGYN FAEAVNFCTA DWLPAGRQCI EHYRRLRRYC VFSHEELICK MAACPEKLDL 
       670        680        690        700        710        720 
NLAAAVHKEM FIMVQEERRL RKALLEKGIT EAEREAFELL PDDERQCIKC KTTCFLSALA 
       730        740        750        760        770        780 
CYDCPDGLVC LSHINDLCKC SSSRQYLRYR YTLDELPAML HKLKVRAESF DTWANKVRVA 
       790        800        810        820        830        840 
LEVEDGRKRS LEELRALESE ARERRFPNSE LLQRLKNCLS EAEACVSRAL GLVSGQEAGP 
       850        860        870        880        890        900 
DRVAGLQMTL AELRDFLGQM NNLPCAMHQI GDVKGILEQV EAYQTEAREA LVSQPSSPGL 
       910        920        930        940        950        960 
LQSLLERGQQ LGVEVPEAQQ LQRQVEQARW LDEVKRTLAP SARRGTLAIM RGLLVAGASV 
       970        980        990       1000       1010       1020 
APSPAVDKAQ AELQELLTIA ERWEEKAHLC LEARQKHPPA TLEAIIHEAE NIPVHLPNIQ 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SLKEALAKAR AWIADVDEIQ NGDHYPCLDD LEGLVAVGRD LPVGLEELRQ LELQVLTAHS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
WREKASKTFL KKNSCYTLLE VLCPCADAGS DSTKRSRWME KELGLYKSDT ELLGLSAQDL 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
RDPGSVIVAF KEGEQKEKEG ILQLRRTNSA KPSPLALLTT ASSTASICVC GQVPAGVGAL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
QCDLCQDWFH GRCVTVPRLL SSQRSSLPSS PLLAWWEWDT KFLCPLCMRS RRPRLETILA 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
LLVALQRLPV RLPEGEALQC LTERAISWQG RARQVLASEE VTALLGRLAE LRQRLQAESK 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PEESLAYPSD GGEGTGNMPK VQGLLENGDS VTSPEKVATE EGSGKRDLEL LSSILPQLSG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PVLELPEATR APLEELMMEG DLLEVTLDEN HSIWQLLQAG QPPDLKRVQT LLELEKAERH 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
GSRTRGRALE RRRRRKVDRG GEPDDPAREE LEPKRVRSSG PEAEEVQEEE ELEEETGGEV 
      1510       1520       1530       1540       1550    
PPVPFPNSGS PSIQEDQDGL EPVLEAGSDT SAPFSTLTSR LLMSCPQQPS LQQL

Isoforms

- Isoform 2 of Lysine-specific demethylase 5C - Isoform 3 of Lysine-specific demethylase 5C

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MELGSDDFLP PPECPVFEPS WAEFRDPLGY IAKIRPIAEK SGICKIRPPA DWQPPFAVEV 
        70         80         90        100        110        120 
DNFRFTPRIQ RLNELEAQTR VKLNYLDQIA KFWEIQGSSL KIPNVERRIL DLYSLSKIVV 
       130        140        150        160        170        180 
EEGGYETICK DRRWARVAQR LNYPPGKNIG SLLRSHYERI VYPYEMYQSG ANLVQCNTRP 
       190        200        210        220        230        240 
FDNEEKDKEY KPHSIPLRQS VQPSKFNSYG RRAKRLQPDP EPTEEDIEKN PELKKLQIYG 
       250        260        270        280        290        300 
AGPKMMGLGL MAKDKTLRKK DKEGPECPPT VVVKEELGGD VKMESTSPKT FLEGKEELSH 
       310        320        330        340        350        360 
SPEPCTKMTM RLRRNHSNAQ FIESYVCRMC SRGDEDDKLL LCDGCDDNYH IFCLLPPLPE 
       370        380        390        400        410        420 
IPKGVWRCPK CVMAECKRPP EAFGFEQATR EYTLQSFGEM ADSFKADYFN MPVHMVPTEL 
       430        440        450        460        470        480 
VEKEFWRLVN SIEEDVTVEY GADIHSKEFG SGFPVSDSKR HLTPEEEEYA TSGWNLNVMP 
       490        500        510        520        530        540 
VLEQSVLCHI NADISGMKVP WLYVGMVFSA FCWHIEDHWS YSINYLHWGE PKTWYGVPSL 
       550        560        570        580        590        600 
AAEHLEEVMK KLTPELFDSQ PDLLHQLVTL MNPNTLMSHG VPVVRTNQCA GEFVITFPRA 
       610        620        630        640        650        660 
YHSGFNQGYN FAEAVNFCTA DWLPAGRQCI EHYRRLRRYC VFSHEELICK MAACPEKLDL 
       670        680        690        700        710        720 
NLAAAVHKEM FIMVQEERRL RKALLEKGIT EAEREAFELL PDDERQCIKC KTTCFLSALA 
       730        740        750        760        770        780 
CYDCPDGLVC LSHINDLCKC SSSRQYLRYR YTLDELPAML HKLKVRAESF DTWANKVRVA 
       790        800        810        820        830        840 
LEVEDGRKRS LEELRALESE ARERRFPNSE LLQRLKNCLS EAEACVSRAL GLVSGQEAGP 
       850        860        870        880        890        900 
DRVAGLQMTL AELRDFLGQM NNLPCAMHQI GDVKGILEQV EAYQTEAREA LVSQPSSPGL 
       910        920        930        940        950        960 
LQSLLERGQQ LGVEVPEAQQ LQRQVEQARW LDEVKRTLAP SARRGTLAIM RGLLVAGASV 
       970        980        990       1000       1010       1020 
APSPAVDKAQ AELQELLTIA ERWEEKAHLC LEARQKHPPA TLEAIIHEAE NIPVHLPNIQ 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SLKEALAKAR AWIADVDEIQ NGDHYPCLDD LEGLVAVGRD LPVGLEELRQ LELQVLTAHS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
WREKASKTFL KKNSCYTLLE VLCPCADAGS DSTKRSRWME KELGLYKSDT ELLGLSAQDL 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
RDPGSVIVAF KEGEQKEKEG ILQLRRTNSA KPSPLALLTT ASSTASICVC GQVPAGVGAL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
QCDLCQDWFH GRCVTVPRLL SSQRSSLPSS PLLAWWEWDT KFLCPLCMRS RRPRLETILA 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
LLVALQRLPV RLPEGEALQC LTERAISWQG RARQVLASEE VTALLGRLAE LRQRLQAESK 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PEESLAYPSD GGEGTGNMPK VQGLLENGDS VTSPEKVATE EGSGKRDLEL LSSILPQLSG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PVLELPEATR APLEELMMEG DLLEVTLDEN HSIWQLLQAG QPPDLKRVQT LLELEKAERH 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
GSRTRGRALE RRRRRKVDRG GEPDDPAREE LEPKRVRSSG PEAEEVQEEE ELEEETGGEV 
      1510       1520       1530       1540       1550    
PPVPFPNSGS PSIQEDQDGL EPVLEAGSDT SAPFSTLTSR LLMSCPQQPS LQQL         10         20         30         40         50         60 
MELGSDDFLP PPECPVFEPS WAEFRDPLGY IAKIRPIAEK SGICKIRPPA DWQPPFAVEV 
        70         80         90        100        110        120 
DNFRFTPRIQ RLNELEAQTR VKLNYLDQIA KFWEIQGSSL KIPNVERRIL DLYSLSKIVV 
       130        140        150        160        170        180 
EEGGYETICK DRRWARVAQR LNYPPGKNIG SLLRSHYERI VYPYEMYQSG ANLVQCNTRP 
       190        200        210        220        230        240 
FDNEEKDKEY KPHSIPLRQS VQPSKFNSYG RRAKRLQPDP EPTEEDIEKN PELKKLQIYG 
       250        260        270        280        290        300 
AGPKMMGLGL MAKDKTLRKK DKEGPECPPT VVVKEELGGD VKMESTSPKT FLEGKEELSH 
       310        320        330        340        350        360 
SPEPCTKMTM RLRRNHSNAQ FIESYVCRMC SRGDEDDKLL LCDGCDDNYH IFCLLPPLPE 
       370        380        390        400        410        420 
IPKGVWRCPK CVMAECKRPP EAFGFEQATR EYTLQSFGEM ADSFKADYFN MPVHMVPTEL 
       430        440        450        460        470        480 
VEKEFWRLVN SIEEDVTVEY GADIHSKEFG SGFPVSDSKR HLTPEEEEYA TSGWNLNVMP 
       490        500        510        520        530        540 
VLEQSVLCHI NADISGMKVP WLYVGMVFSA FCWHIEDHWS YSINYLHWGE PKTWYGVPSL 
       550        560        570        580        590        600 
AAEHLEEVMK KLTPELFDSQ PDLLHQLVTL MNPNTLMSHG VPVVRTNQCA GEFVITFPRA 
       610        620        630        640        650        660 
YHSGFNQGYN FAEAVNFCTA DWLPAGRQCI EHYRRLRRYC VFSHEELICK MAACPEKLDL 
       670        680        690        700        710        720 
NLAAAVHKEM FIMVQEERRL RKALLEKGIT EAEREAFELL PDDERQCIKC KTTCFLSALA 
       730        740        750        760        770        780 
CYDCPDGLVC LSHINDLCKC SSSRQYLRYR YTLDELPAML HKLKVRAESF DTWANKVRVA 
       790        800        810        820        830        840 
LEVEDGRKRS LEELRALESE ARERRFPNSE LLQRLKNCLS EAEACVSRAL GLVSGQEAGP 
       850        860        870        880        890        900 
DRVAGLQMTL AELRDFLGQM NNLPCAMHQI GDVKGILEQV EAYQTEAREA LVSQPSSPGL 
       910        920        930        940        950        960 
LQSLLERGQQ LGVEVPEAQQ LQRQVEQARW LDEVKRTLAP SARRGTLAIM RGLLVAGASV 
       970        980        990       1000       1010       1020 
APSPAVDKAQ AELQELLTIA ERWEEKAHLC LEARQKHPPA TLEAIIHEAE NIPVHLPNIQ 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SLKEALAKAR AWIADVDEIQ NGDHYPCLDD LEGLVAVGRD LPVGLEELRQ LELQVLTAHS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
WREKASKTFL KKNSCYTLLE VLCPCADAGS DSTKRSRWME KELGLYKSDT ELLGLSAQDL 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
RDPGSVIVAF KEGEQKEKEG ILQLRRTNSA KPSPLALLTT ASSTASICVC GQVPAGVGAL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
QCDLCQDWFH GRCVTVPRLL SSQRSSLPSS PLLAWWEWDT KFLCPLCMRS RRPRLETILA 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
LLVALQRLPV RLPEGEALQC LTERAISWQG RARQVLASEE VTALLGRLAE LRQRLQAESK 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PEESLAYPSD GGEGTGNMPK VQGLLENGDS VTSPEKVATE EGSGKRDLEL LSSILPQLSG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PVLELPEATR APLEELMMEG DLLEVTLDEN HSIWQLLQAG QPPDLKRVQT LLELEKAERH 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
GSRTRGRALE RRRRRKVDRG GEPDDPAREE LEPKRVRSSG PEAEEVQEEE ELEEETGGEV 
      1510       1520       1530       1540       1550    
PPVPFPNSGS PSIQEDQDGL EPVLEAGSDT SAPFSTLTSR LLMSCPQQPS LQQL



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    P41230-1-unknown MELGSD... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    P41230-1-unknown MELGSD... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt78888
    P41230-1-unknown MELGSD... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt78889

C-termini

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)