TopFIND 4.0

Q6ZPY7: Lysine-specific demethylase 3B

General Information

Protein names
- Lysine-specific demethylase 3B
- 1.14.11.-
- JmjC domain-containing histone demethylation protein 2B
- Jumonji domain-containing protein 1B

Gene names Kdm3b
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q6ZPY7

3

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MADAAASPVG KRLLLLFADP TASASASAPT AAAVVSGDPG PALRTRAWRA GTVRAMSGAV 
        70         80         90        100        110        120 
PQDLAIFVEF DGCNWKQHSW VKVHAEDVLA LLLEGSLVWA PRKDPVLLQG TRVPVAQWPA 
       130        140        150        160        170        180 
LTFTPLVDKL GLGSVVPVEY LVDRELRFLS DANGMHLFQM GTDVQNQILL EHAALRETVN 
       190        200        210        220        230        240 
ALISDQKLQE IFSRGPYSVQ GHRVKVYQPE GEEVWLCGVV SRQDSVTRLM EVSITETGEV 
       250        260        270        280        290        300 
KSVDPRLTHV MLMDSSTPQS ENSRNSSLAS SGFGVSLSSL SQPLTFGSGR SQSNGVLATD 
       310        320        330        340        350        360 
NKPLGFSFSC SSASESQKDS DLSKNLFFQC MSQNVPSTNY LSRVSESVAD DSSSRDSFTQ 
       370        380        390        400        410        420 
SLESLTSGLC KGRSVLGADT QPGPKAGSSV DRKVPAESMP TLTPAFPRSL LNTRTPENHE 
       430        440        450        460        470        480 
NLFLQPPKLS REEPSNPFLA FVEKVEHSPF SSFVSQASGS SSSATSVTSK ATASWPESHS 
       490        500        510        520        530        540 
SAESAPLAKK KPLFITTDSS KLVSGVLGSA LSTGSPSLSA VGNGRSSSPT NSLTQPIEMP 
       550        560        570        580        590        600 
TLSSSPTEER PTVGPGQQDN PLLKTFSTVF GRHSGSFLSA PAEFAQENKA PFEAVKRFSL 
       610        620        630        640        650        660 
DERSLACRQD SDSSTNSDLS DLSDSEEQLQ AKSGLKGIPE HLMGKLGPNG ERSAELLLGK 
       670        680        690        700        710        720 
GKGKQAPKGR PRTAPLKVGQ SVLKDVSKVR KLKQSGEPFL QDGSCINVAP HLHKCRECRL 
       730        740        750        760        770        780 
ERYRKFKEQE QDDSTVACRF FHFRRLVFTR KGVLRVEGFL SPQQSDPDAM NLWIPSSSLA 
       790        800        810        820        830        840 
EGIDLETSKY ILANVGDQFC QLVMSEKEAM MMVEPHQKVA WKRAVRGVRE MCDVCETTLF 
       850        860        870        880        890        900 
NIHWVCRKCG FGVCLDCYRL RKSRPRSETE EMGDEEVFSW LKCAKGQSHE PENLMPTQII 
       910        920        930        940        950        960 
PGTALYNIGD MVHAARGKWG IKANCPCISR QSKSVLRPAV TNGISQLPSV TPSASSGNET 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TFSSGGGAAA VTNPEPDQVP KGAGTDGRSE EPLKAEGSAS NSNSELKAIR PPCPDTAPPS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SALHWLADLA TQKAKEETKD AGSLRSVLNK ESHSPFGLDS FNSTAKVSPL TPKLFNSLLL 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
GPTASNSKTE GSSLRDLLHS GPGKLPQTPL DTGIPFPPVF SSSSAVAKSK ASLPDFLDHI 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
IASVVENKKT SDPSKRSCNL TDTQKEVKEM AMGLNVLDPH TSHSWLCDGR LLCLHDPSNK 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
NNWKIFRECW KQGQPVLVSG VHKKLKSELW KPEAFSQEFG DQDVDLVNCR NCAIISDVKV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RDFWDGFEII CKRLRSEDGQ PMVLKLKDWP PGEDFRDMMP TRFEDLMENL PLPEYTKRDG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
RLNLASRLPS YFVRPDLGPK MYNAYGLITA EDRRVGTTNL HLDVSDAVNV MVYVGIPVGE 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
GAHDEEVLKT IDEGDADEVT KQRIHDGKEK PGALWHIYAA KDAEKIRELL RKVGEEQGQE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
NPPDHDPIHD QSWYLDQILR KRLFEEYGVQ GWAIVQFLGD AVFIPAGAPH QVHNLYSCIK 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
VAEDFVSPEH VKHCFRLTQE FRHLSNTHTN HEDKLQVKNI IYHAVKDAVG TLKAHESKLA 
   
RS

Isoforms

- Isoform 2 of Lysine-specific demethylase 3B

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MADAAASPVG KRLLLLFADP TASASASAPT AAAVVSGDPG PALRTRAWRA GTVRAMSGAV 
        70         80         90        100        110        120 
PQDLAIFVEF DGCNWKQHSW VKVHAEDVLA LLLEGSLVWA PRKDPVLLQG TRVPVAQWPA 
       130        140        150        160        170        180 
LTFTPLVDKL GLGSVVPVEY LVDRELRFLS DANGMHLFQM GTDVQNQILL EHAALRETVN 
       190        200        210        220        230        240 
ALISDQKLQE IFSRGPYSVQ GHRVKVYQPE GEEVWLCGVV SRQDSVTRLM EVSITETGEV 
       250        260        270        280        290        300 
KSVDPRLTHV MLMDSSTPQS ENSRNSSLAS SGFGVSLSSL SQPLTFGSGR SQSNGVLATD 
       310        320        330        340        350        360 
NKPLGFSFSC SSASESQKDS DLSKNLFFQC MSQNVPSTNY LSRVSESVAD DSSSRDSFTQ 
       370        380        390        400        410        420 
SLESLTSGLC KGRSVLGADT QPGPKAGSSV DRKVPAESMP TLTPAFPRSL LNTRTPENHE 
       430        440        450        460        470        480 
NLFLQPPKLS REEPSNPFLA FVEKVEHSPF SSFVSQASGS SSSATSVTSK ATASWPESHS 
       490        500        510        520        530        540 
SAESAPLAKK KPLFITTDSS KLVSGVLGSA LSTGSPSLSA VGNGRSSSPT NSLTQPIEMP 
       550        560        570        580        590        600 
TLSSSPTEER PTVGPGQQDN PLLKTFSTVF GRHSGSFLSA PAEFAQENKA PFEAVKRFSL 
       610        620        630        640        650        660 
DERSLACRQD SDSSTNSDLS DLSDSEEQLQ AKSGLKGIPE HLMGKLGPNG ERSAELLLGK 
       670        680        690        700        710        720 
GKGKQAPKGR PRTAPLKVGQ SVLKDVSKVR KLKQSGEPFL QDGSCINVAP HLHKCRECRL 
       730        740        750        760        770        780 
ERYRKFKEQE QDDSTVACRF FHFRRLVFTR KGVLRVEGFL SPQQSDPDAM NLWIPSSSLA 
       790        800        810        820        830        840 
EGIDLETSKY ILANVGDQFC QLVMSEKEAM MMVEPHQKVA WKRAVRGVRE MCDVCETTLF 
       850        860        870        880        890        900 
NIHWVCRKCG FGVCLDCYRL RKSRPRSETE EMGDEEVFSW LKCAKGQSHE PENLMPTQII 
       910        920        930        940        950        960 
PGTALYNIGD MVHAARGKWG IKANCPCISR QSKSVLRPAV TNGISQLPSV TPSASSGNET 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TFSSGGGAAA VTNPEPDQVP KGAGTDGRSE EPLKAEGSAS NSNSELKAIR PPCPDTAPPS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SALHWLADLA TQKAKEETKD AGSLRSVLNK ESHSPFGLDS FNSTAKVSPL TPKLFNSLLL 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
GPTASNSKTE GSSLRDLLHS GPGKLPQTPL DTGIPFPPVF SSSSAVAKSK ASLPDFLDHI 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
IASVVENKKT SDPSKRSCNL TDTQKEVKEM AMGLNVLDPH TSHSWLCDGR LLCLHDPSNK 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
NNWKIFRECW KQGQPVLVSG VHKKLKSELW KPEAFSQEFG DQDVDLVNCR NCAIISDVKV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RDFWDGFEII CKRLRSEDGQ PMVLKLKDWP PGEDFRDMMP TRFEDLMENL PLPEYTKRDG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
RLNLASRLPS YFVRPDLGPK MYNAYGLITA EDRRVGTTNL HLDVSDAVNV MVYVGIPVGE 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
GAHDEEVLKT IDEGDADEVT KQRIHDGKEK PGALWHIYAA KDAEKIRELL RKVGEEQGQE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
NPPDHDPIHD QSWYLDQILR KRLFEEYGVQ GWAIVQFLGD AVFIPAGAPH QVHNLYSCIK 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
VAEDFVSPEH VKHCFRLTQE FRHLSNTHTN HEDKLQVKNI IYHAVKDAVG TLKAHESKLA 
   
RS



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

3 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...KLARS 1562 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)