TopFIND 4.0

Q925J9: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1

General Information

Protein names
- Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1
- Mediator complex subunit 1
- Peroxisome proliferator-activated receptor-binding protein
- PBP
- PPAR-binding protein
- Thyroid hormone receptor-associated protein complex 220 kDa component
- Trap220
- Thyroid receptor-interacting protein 2
- TR-interacting protein 2
- TRIP-2
Gene names Med1
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q925J9

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MKAQGETEDS ERLSKMSSLL ERLHAKFNQN RPWSETIKLV RQVMEKRVVM SSGGHQHLVS 
        70         80         90        100        110        120 
CLETLQKALK VTSLPAMTDR LESIARQNGL GSHLSASGTE CYITSDMFYV EVQLDPAGQL 
       130        140        150        160        170        180 
CDVKVAHHGE NPVSCPELVQ QLREKNFEEF SKHLKGLVNL YNLPGDNKLK TKMYLALQSL 
       190        200        210        220        230        240 
EQDLSKMAIM YWKATNAAPL DKILHGSVGY LTPRSGGHLM NMKYYASPSD LLDDKTASPI 
       250        260        270        280        290        300 
ILHEKNVPRS LGMNASVTIE GTSAMYKLPI APLIMGSHPA DNKWTPSFSA VTSANSVDLP 
       310        320        330        340        350        360 
ACFFLKFPQP IPVSKAFVQK LQNCTGIPLF ETPPTYLPLY ELITQFELSK DPDPLPLNHN 
       370        380        390        400        410        420 
MRFYAALPGQ QHCYFLNKDA PLPDGQSLQG TLVSKITFQH PGRVPLILNM IRHQVAYNTL 
       430        440        450        460        470        480 
IGSCVKRTIL KEDSPGLLQF EVCPLSESRF SVSFQHPVND SLVCVVMDVQ DSTHVSCKLY 
       490        500        510        520        530        540 
KGLSDALICT DDFIAKVVQR CMSIPVTMRA IRRKAETIQA DTPALSLIAE TVEDMVKKNL 
       550        560        570        580        590        600 
PPASSPGYGM TTGNNPMSGT TTPTNTFPGG PITTLFNMSM SIKDRHESVG HGEDFSKVSQ 
       610        620        630        640        650        660 
NPILTSLLQI TGNGGSTIGS SPTPPHHTPP PVSSMAGNTK NHPMLMNLLK DNPAQDFSTL 
       670        680        690        700        710        720 
YGSSPLERQN SSSGSPRMEM CSGSNKAKKK KSSRVPPDKP KHQTEDDFQR ELFSMDVDSQ 
       730        740        750        760        770        780 
NPMFDVSMTA DALDTPHITP APSQCSTPPA TYPQPVSHPQ PSIQRMVRLS SSDSIGPDVT 
       790        800        810        820        830        840 
DILSDIAEEA SKLPSTSDDC PPIGTPVRDS SSSGHSQSAL FDSDVFQTNN NENPYTDPAD 
       850        860        870        880        890        900 
LIADAAGSPN SDSPTNHFFP DGVDFNPDLL NSQSQSGFGE EYFDESSQSG DNDDFKGFAS 
       910        920        930        940        950        960 
QALNTLGMPM LGGDNGEPKF KGSSQADTVD FSIISVAGKA LGAADLMEHH SGSQSPLLTT 
       970        980        990       1000       1010       1020 
GELGKEKTQK RVKEGNGTGA SSGSGPGSDS KPGKRSRTPS NDGKSKDKPP KRKKADTEGK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SPSHSSSNRP FTPPTSTGGS KSPGSSGRSQ TPPGVATPPI PKITIQIPKG TVMVGKPSSH 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SQYTSSGSVS SSGSKSHHSH SSSSSSLASA STSGKVKSSK SEGSSSSKLS GSMYASQGSS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
GSSQSKNSSQ TGGKPGSSPI TKHGLSSGSS STKMKPQGKP SSLMNPSISK PNISPSHSRP 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PGGSDKLASP MKPVPGTPPS SKAKSPISSG SSGSHVSGTS SSSGMKSSSG SASSGSVSQK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
TPPASNSCTP SSSSFSSSGS SMSSSQNQHG SSKGKSPSRN KKPSLTAVID KLKHGVVTSG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PGGEDPIDSQ MGASTNSSNH PMSSKHNTSG GEFQSKREKS DKDKSKVSAS GGSVDSSKKT 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SESKNVGSTG VAKIIISKHD GGSPSIKAKV TLQKPGESGG DGLRPQIASS KNYGSPLISG 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
STPKHERGSP SHSKSPAYTP QNVDSESESG SSIAERSYQN SPSSEDGIRP LPEYSTEKHK 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KHKKEKKKVR DKDRDKKKSH SMKPENWSKS PISSDPTASV TNNPILSADR PSRLSPDFMI 
      1570    
GEEDDDLMDV ALIGN

Isoforms

- Isoform 2 of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1 - Isoform 3 of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1 - Isoform 4 of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MKAQGETEDS ERLSKMSSLL ERLHAKFNQN RPWSETIKLV RQVMEKRVVM SSGGHQHLVS 
        70         80         90        100        110        120 
CLETLQKALK VTSLPAMTDR LESIARQNGL GSHLSASGTE CYITSDMFYV EVQLDPAGQL 
       130        140        150        160        170        180 
CDVKVAHHGE NPVSCPELVQ QLREKNFEEF SKHLKGLVNL YNLPGDNKLK TKMYLALQSL 
       190        200        210        220        230        240 
EQDLSKMAIM YWKATNAAPL DKILHGSVGY LTPRSGGHLM NMKYYASPSD LLDDKTASPI 
       250        260        270        280        290        300 
ILHEKNVPRS LGMNASVTIE GTSAMYKLPI APLIMGSHPA DNKWTPSFSA VTSANSVDLP 
       310        320        330        340        350        360 
ACFFLKFPQP IPVSKAFVQK LQNCTGIPLF ETPPTYLPLY ELITQFELSK DPDPLPLNHN 
       370        380        390        400        410        420 
MRFYAALPGQ QHCYFLNKDA PLPDGQSLQG TLVSKITFQH PGRVPLILNM IRHQVAYNTL 
       430        440        450        460        470        480 
IGSCVKRTIL KEDSPGLLQF EVCPLSESRF SVSFQHPVND SLVCVVMDVQ DSTHVSCKLY 
       490        500        510        520        530        540 
KGLSDALICT DDFIAKVVQR CMSIPVTMRA IRRKAETIQA DTPALSLIAE TVEDMVKKNL 
       550        560        570        580        590        600 
PPASSPGYGM TTGNNPMSGT TTPTNTFPGG PITTLFNMSM SIKDRHESVG HGEDFSKVSQ 
       610        620        630        640        650        660 
NPILTSLLQI TGNGGSTIGS SPTPPHHTPP PVSSMAGNTK NHPMLMNLLK DNPAQDFSTL 
       670        680        690        700        710        720 
YGSSPLERQN SSSGSPRMEM CSGSNKAKKK KSSRVPPDKP KHQTEDDFQR ELFSMDVDSQ 
       730        740        750        760        770        780 
NPMFDVSMTA DALDTPHITP APSQCSTPPA TYPQPVSHPQ PSIQRMVRLS SSDSIGPDVT 
       790        800        810        820        830        840 
DILSDIAEEA SKLPSTSDDC PPIGTPVRDS SSSGHSQSAL FDSDVFQTNN NENPYTDPAD 
       850        860        870        880        890        900 
LIADAAGSPN SDSPTNHFFP DGVDFNPDLL NSQSQSGFGE EYFDESSQSG DNDDFKGFAS 
       910        920        930        940        950        960 
QALNTLGMPM LGGDNGEPKF KGSSQADTVD FSIISVAGKA LGAADLMEHH SGSQSPLLTT 
       970        980        990       1000       1010       1020 
GELGKEKTQK RVKEGNGTGA SSGSGPGSDS KPGKRSRTPS NDGKSKDKPP KRKKADTEGK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SPSHSSSNRP FTPPTSTGGS KSPGSSGRSQ TPPGVATPPI PKITIQIPKG TVMVGKPSSH 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SQYTSSGSVS SSGSKSHHSH SSSSSSLASA STSGKVKSSK SEGSSSSKLS GSMYASQGSS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
GSSQSKNSSQ TGGKPGSSPI TKHGLSSGSS STKMKPQGKP SSLMNPSISK PNISPSHSRP 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PGGSDKLASP MKPVPGTPPS SKAKSPISSG SSGSHVSGTS SSSGMKSSSG SASSGSVSQK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
TPPASNSCTP SSSSFSSSGS SMSSSQNQHG SSKGKSPSRN KKPSLTAVID KLKHGVVTSG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PGGEDPIDSQ MGASTNSSNH PMSSKHNTSG GEFQSKREKS DKDKSKVSAS GGSVDSSKKT 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SESKNVGSTG VAKIIISKHD GGSPSIKAKV TLQKPGESGG DGLRPQIASS KNYGSPLISG 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
STPKHERGSP SHSKSPAYTP QNVDSESESG SSIAERSYQN SPSSEDGIRP LPEYSTEKHK 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KHKKEKKKVR DKDRDKKKSH SMKPENWSKS PISSDPTASV TNNPILSADR PSRLSPDFMI 
      1570    
GEEDDDLMDV ALIGN         10         20         30         40         50         60 
MKAQGETEDS ERLSKMSSLL ERLHAKFNQN RPWSETIKLV RQVMEKRVVM SSGGHQHLVS 
        70         80         90        100        110        120 
CLETLQKALK VTSLPAMTDR LESIARQNGL GSHLSASGTE CYITSDMFYV EVQLDPAGQL 
       130        140        150        160        170        180 
CDVKVAHHGE NPVSCPELVQ QLREKNFEEF SKHLKGLVNL YNLPGDNKLK TKMYLALQSL 
       190        200        210        220        230        240 
EQDLSKMAIM YWKATNAAPL DKILHGSVGY LTPRSGGHLM NMKYYASPSD LLDDKTASPI 
       250        260        270        280        290        300 
ILHEKNVPRS LGMNASVTIE GTSAMYKLPI APLIMGSHPA DNKWTPSFSA VTSANSVDLP 
       310        320        330        340        350        360 
ACFFLKFPQP IPVSKAFVQK LQNCTGIPLF ETPPTYLPLY ELITQFELSK DPDPLPLNHN 
       370        380        390        400        410        420 
MRFYAALPGQ QHCYFLNKDA PLPDGQSLQG TLVSKITFQH PGRVPLILNM IRHQVAYNTL 
       430        440        450        460        470        480 
IGSCVKRTIL KEDSPGLLQF EVCPLSESRF SVSFQHPVND SLVCVVMDVQ DSTHVSCKLY 
       490        500        510        520        530        540 
KGLSDALICT DDFIAKVVQR CMSIPVTMRA IRRKAETIQA DTPALSLIAE TVEDMVKKNL 
       550        560        570        580        590        600 
PPASSPGYGM TTGNNPMSGT TTPTNTFPGG PITTLFNMSM SIKDRHESVG HGEDFSKVSQ 
       610        620        630        640        650        660 
NPILTSLLQI TGNGGSTIGS SPTPPHHTPP PVSSMAGNTK NHPMLMNLLK DNPAQDFSTL 
       670        680        690        700        710        720 
YGSSPLERQN SSSGSPRMEM CSGSNKAKKK KSSRVPPDKP KHQTEDDFQR ELFSMDVDSQ 
       730        740        750        760        770        780 
NPMFDVSMTA DALDTPHITP APSQCSTPPA TYPQPVSHPQ PSIQRMVRLS SSDSIGPDVT 
       790        800        810        820        830        840 
DILSDIAEEA SKLPSTSDDC PPIGTPVRDS SSSGHSQSAL FDSDVFQTNN NENPYTDPAD 
       850        860        870        880        890        900 
LIADAAGSPN SDSPTNHFFP DGVDFNPDLL NSQSQSGFGE EYFDESSQSG DNDDFKGFAS 
       910        920        930        940        950        960 
QALNTLGMPM LGGDNGEPKF KGSSQADTVD FSIISVAGKA LGAADLMEHH SGSQSPLLTT 
       970        980        990       1000       1010       1020 
GELGKEKTQK RVKEGNGTGA SSGSGPGSDS KPGKRSRTPS NDGKSKDKPP KRKKADTEGK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SPSHSSSNRP FTPPTSTGGS KSPGSSGRSQ TPPGVATPPI PKITIQIPKG TVMVGKPSSH 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SQYTSSGSVS SSGSKSHHSH SSSSSSLASA STSGKVKSSK SEGSSSSKLS GSMYASQGSS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
GSSQSKNSSQ TGGKPGSSPI TKHGLSSGSS STKMKPQGKP SSLMNPSISK PNISPSHSRP 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PGGSDKLASP MKPVPGTPPS SKAKSPISSG SSGSHVSGTS SSSGMKSSSG SASSGSVSQK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
TPPASNSCTP SSSSFSSSGS SMSSSQNQHG SSKGKSPSRN KKPSLTAVID KLKHGVVTSG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PGGEDPIDSQ MGASTNSSNH PMSSKHNTSG GEFQSKREKS DKDKSKVSAS GGSVDSSKKT 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SESKNVGSTG VAKIIISKHD GGSPSIKAKV TLQKPGESGG DGLRPQIASS KNYGSPLISG 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
STPKHERGSP SHSKSPAYTP QNVDSESESG SSIAERSYQN SPSSEDGIRP LPEYSTEKHK 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KHKKEKKKVR DKDRDKKKSH SMKPENWSKS PISSDPTASV TNNPILSADR PSRLSPDFMI 
      1570    
GEEDDDLMDV ALIGN         10         20         30         40         50         60 
MKAQGETEDS ERLSKMSSLL ERLHAKFNQN RPWSETIKLV RQVMEKRVVM SSGGHQHLVS 
        70         80         90        100        110        120 
CLETLQKALK VTSLPAMTDR LESIARQNGL GSHLSASGTE CYITSDMFYV EVQLDPAGQL 
       130        140        150        160        170        180 
CDVKVAHHGE NPVSCPELVQ QLREKNFEEF SKHLKGLVNL YNLPGDNKLK TKMYLALQSL 
       190        200        210        220        230        240 
EQDLSKMAIM YWKATNAAPL DKILHGSVGY LTPRSGGHLM NMKYYASPSD LLDDKTASPI 
       250        260        270        280        290        300 
ILHEKNVPRS LGMNASVTIE GTSAMYKLPI APLIMGSHPA DNKWTPSFSA VTSANSVDLP 
       310        320        330        340        350        360 
ACFFLKFPQP IPVSKAFVQK LQNCTGIPLF ETPPTYLPLY ELITQFELSK DPDPLPLNHN 
       370        380        390        400        410        420 
MRFYAALPGQ QHCYFLNKDA PLPDGQSLQG TLVSKITFQH PGRVPLILNM IRHQVAYNTL 
       430        440        450        460        470        480 
IGSCVKRTIL KEDSPGLLQF EVCPLSESRF SVSFQHPVND SLVCVVMDVQ DSTHVSCKLY 
       490        500        510        520        530        540 
KGLSDALICT DDFIAKVVQR CMSIPVTMRA IRRKAETIQA DTPALSLIAE TVEDMVKKNL 
       550        560        570        580        590        600 
PPASSPGYGM TTGNNPMSGT TTPTNTFPGG PITTLFNMSM SIKDRHESVG HGEDFSKVSQ 
       610        620        630        640        650        660 
NPILTSLLQI TGNGGSTIGS SPTPPHHTPP PVSSMAGNTK NHPMLMNLLK DNPAQDFSTL 
       670        680        690        700        710        720 
YGSSPLERQN SSSGSPRMEM CSGSNKAKKK KSSRVPPDKP KHQTEDDFQR ELFSMDVDSQ 
       730        740        750        760        770        780 
NPMFDVSMTA DALDTPHITP APSQCSTPPA TYPQPVSHPQ PSIQRMVRLS SSDSIGPDVT 
       790        800        810        820        830        840 
DILSDIAEEA SKLPSTSDDC PPIGTPVRDS SSSGHSQSAL FDSDVFQTNN NENPYTDPAD 
       850        860        870        880        890        900 
LIADAAGSPN SDSPTNHFFP DGVDFNPDLL NSQSQSGFGE EYFDESSQSG DNDDFKGFAS 
       910        920        930        940        950        960 
QALNTLGMPM LGGDNGEPKF KGSSQADTVD FSIISVAGKA LGAADLMEHH SGSQSPLLTT 
       970        980        990       1000       1010       1020 
GELGKEKTQK RVKEGNGTGA SSGSGPGSDS KPGKRSRTPS NDGKSKDKPP KRKKADTEGK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SPSHSSSNRP FTPPTSTGGS KSPGSSGRSQ TPPGVATPPI PKITIQIPKG TVMVGKPSSH 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SQYTSSGSVS SSGSKSHHSH SSSSSSLASA STSGKVKSSK SEGSSSSKLS GSMYASQGSS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
GSSQSKNSSQ TGGKPGSSPI TKHGLSSGSS STKMKPQGKP SSLMNPSISK PNISPSHSRP 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PGGSDKLASP MKPVPGTPPS SKAKSPISSG SSGSHVSGTS SSSGMKSSSG SASSGSVSQK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
TPPASNSCTP SSSSFSSSGS SMSSSQNQHG SSKGKSPSRN KKPSLTAVID KLKHGVVTSG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PGGEDPIDSQ MGASTNSSNH PMSSKHNTSG GEFQSKREKS DKDKSKVSAS GGSVDSSKKT 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SESKNVGSTG VAKIIISKHD GGSPSIKAKV TLQKPGESGG DGLRPQIASS KNYGSPLISG 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
STPKHERGSP SHSKSPAYTP QNVDSESESG SSIAERSYQN SPSSEDGIRP LPEYSTEKHK 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KHKKEKKKVR DKDRDKKKSH SMKPENWSKS PISSDPTASV TNNPILSADR PSRLSPDFMI 
      1570    
GEEDDDLMDV ALIGN



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...ALIGN 1575 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...ALIGN 1575 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt76382

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)