TopFIND 4.0

A2AGH6: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12

General Information

Protein names
- Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12
- Mediator complex subunit 12
- OPA-containing protein
- Thyroid hormone receptor-associated protein complex 230 kDa component
- Trap230
- Trinucleotide repeat-containing gene 11 protein
Gene names Med12
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID A2AGH6

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MAAFGILSYE HRPLKRLRLG PPDVYPQDPK QKEDELTALN VKQGFNNQPA VSGDEHGSAK 
        70         80         90        100        110        120 
NVNFNPAKIS SNFSSIIAEK LRCNTLSDTG RRKSLMNQKD NFWLVTARSQ SAINTWFTDL 
       130        140        150        160        170        180 
AGTKPLTHLA KKVPIFSKKE EVFGYLAKYT VPVMRAAWLI KMTCAYYAAM SETKVKKKNT 
       190        200        210        220        230        240 
ADPFTEWTQI ITKYLWEQLQ KMAEYYRPGP AGSGGCGSTI GPLPHDVEMA IRQWDYNEKL 
       250        260        270        280        290        300 
ALFMFQDGML DRHEFLTWVL ECFEKIRPGE DELLKLLLPL LLRYSGEFVQ SAYLSRRLAY 
       310        320        330        340        350        360 
FCTRRLALQL DGVSSHSSHV IAAQSTSSLP TTPAPQPPTS STPSTPFSDL LMCPQHRPLV 
       370        380        390        400        410        420 
FGLSCILQTI LLCCPSALVW HYSLTDSRIK TGSPLDHLPI APSNLPMPEG NSAFTQQVRA 
       430        440        450        460        470        480 
KLREIEQQIK ERGQAVEVRW SFDKCQEATA GFTIGRVLHT LEVLDSHSFE RSDFSNSLDS 
       490        500        510        520        530        540 
LCNRIFGLGP SKDGHEISSD DDAVVSLLCE WAVSCKRSGR HRAMVVAKLL EKRQAEIEAE 
       550        560        570        580        590        600 
RCGESEAADE KGSVASGSLS APSAPIFQDV LLQFLDTQAP MLTDPRSESE RVEFFNLVLL 
       610        620        630        640        650        660 
FCELIRHDVF SHNMYTCTLI SRGDLAFGAP GPRPPSPFDD PTDDPERKEA EGSSSSKLED 
       670        680        690        700        710        720 
PGLSESMDID PSSSVLFEDM EKPDFSLFSP TMPCEGKGSP SPEKPDVEKE VKPPAKEKIE 
       730        740        750        760        770        780 
GTLGILYDQP RHVQYATHFP IPQEESCSHE CNQRLVVLFG VGKQRDDARH AIKKITKDIL 
       790        800        810        820        830        840 
KVLNRKGTAE TDQLAPIVPL NPGDLTFLGG EDGQKRRRNR PEAFPTAEDI FAKFQHLSHY 
       850        860        870        880        890        900 
DQHQVTAQVS RNVLEQITSF ALGMSYHLPL VQHVQFIFDL MEYSLSISGL IDFAIQLLNE 
       910        920        930        940        950        960 
LSVVEAELLL KSSDLVGSYT TSLCLCIVAV LRHYHACLIL NQDQMAQVFE GLCGVVKHGM 
       970        980        990       1000       1010       1020 
NRSDGSSAER CILAYLYDLY TSCSHLKSKF GELFSDFCSK VKNTIYCNVE PSESNMRWAP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
EFMIDTLENP AAHTFTYTGL GKSLSENPAN RYSFVCNALM HVCVGHHDPD RVNDIAILCA 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
ELTGYCKSLS AEWLGVLKAL CCSSNNGTCG FNDLLCNVDV SDLSFHDSLA TFVAILIARQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
CLLLEDLIRC AAIPSLLNAA CSEQDSEPGA RLTCRILLHL FKTPQLNPCQ SDGNKPTVGI 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
RSSCDRHLLA ASQNRIVDGA VFAVLKAVFV LGDAELKGSG FTVPGGTEEL PEEEGGGGSS 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GRRQGGRNIS VETASLDVYA KYVLRSICQQ EWVGERCLKS LCEDSNDLQD PVLSSAQAQR 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
LMQLICYPHR LLDNEDGENP QRQRIKRILK NLDQWTMRQS SLELQLMIKQ TPNTEMNSLL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
ENIAKATIEV FQQSAETGSS SGSTASNMPS SSKTKPVLSS LERSGVWLVA PLIAKLPTSV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QGHVLKAAGE ELEKGQHLGS SSRKERDRQK QKSMSLLSQQ PFLSLVLTCL KGQDEQREGL 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
LASLHSQVHQ IVINWRENQY LDDCKPKQLM HEALKLRLNL VGGMFDTVQR STQQTTEWAQ 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LLLEIIISGT VDMQSNNELF TTVLDMLSVL INGTLAADMS SISQGSMEEN KRAYMNLVKK 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
LQKDLGERQS DSLEKVHQLL PLPKQNRDVI TCEPQGSLID TKGNKIAGFD SIFKKEGLQV 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
STKQKISPWE LFEGLKPSTA PLSWAWFGTV RVDRRVARGE EQQRLLLYHT HLRPRPRAYY 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
LEPLPLPPED EEPPAPALLE PEKKAPEPPK TDKPGAAPPS TEERKKKSTK GKKRSQPATK 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
NEDYGMGPGR SGPYGVTVPP DLLHHANPGS ISHLSYRQSS MGLYTQNQPL PAGGPRVDPY 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
RPVRLPMQKL PTRPTYPGVL PTTMSTVMGL EPSSYKTSVY RQQQPTVPQG QRLRQQLQAK 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
IQSQGMLGQS SVHQMTPSSS YGLQTSQGYT SYVSHVGLQQ HTGPAGTMVP PSYSSQPYQS 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
THPSTNPTLV DPTRHLQQRP SGYVHQQAPT YGHGLTSTQR FSHQTLQQTP MMGTMTPLSA 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
QGVQAGVRST SILPEQQQQQ QQQQQQQQQQ QQQQQQQQQQ QQQQQQQQYH IRQQQQQQQM 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
LRQQQQQQQQ QQQQQQQQQQ QQQQQQQQQP HQQQQQAAPP QPQPQSQPQF QRQGLQQTQQ 
      2170       2180       2190    
QQQTAALVRQ LQQQLSNTQP QPSTNIFGRY 

Isoforms

- Isoform 2 of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12 - Isoform 3 of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MAAFGILSYE HRPLKRLRLG PPDVYPQDPK QKEDELTALN VKQGFNNQPA VSGDEHGSAK 
        70         80         90        100        110        120 
NVNFNPAKIS SNFSSIIAEK LRCNTLSDTG RRKSLMNQKD NFWLVTARSQ SAINTWFTDL 
       130        140        150        160        170        180 
AGTKPLTHLA KKVPIFSKKE EVFGYLAKYT VPVMRAAWLI KMTCAYYAAM SETKVKKKNT 
       190        200        210        220        230        240 
ADPFTEWTQI ITKYLWEQLQ KMAEYYRPGP AGSGGCGSTI GPLPHDVEMA IRQWDYNEKL 
       250        260        270        280        290        300 
ALFMFQDGML DRHEFLTWVL ECFEKIRPGE DELLKLLLPL LLRYSGEFVQ SAYLSRRLAY 
       310        320        330        340        350        360 
FCTRRLALQL DGVSSHSSHV IAAQSTSSLP TTPAPQPPTS STPSTPFSDL LMCPQHRPLV 
       370        380        390        400        410        420 
FGLSCILQTI LLCCPSALVW HYSLTDSRIK TGSPLDHLPI APSNLPMPEG NSAFTQQVRA 
       430        440        450        460        470        480 
KLREIEQQIK ERGQAVEVRW SFDKCQEATA GFTIGRVLHT LEVLDSHSFE RSDFSNSLDS 
       490        500        510        520        530        540 
LCNRIFGLGP SKDGHEISSD DDAVVSLLCE WAVSCKRSGR HRAMVVAKLL EKRQAEIEAE 
       550        560        570        580        590        600 
RCGESEAADE KGSVASGSLS APSAPIFQDV LLQFLDTQAP MLTDPRSESE RVEFFNLVLL 
       610        620        630        640        650        660 
FCELIRHDVF SHNMYTCTLI SRGDLAFGAP GPRPPSPFDD PTDDPERKEA EGSSSSKLED 
       670        680        690        700        710        720 
PGLSESMDID PSSSVLFEDM EKPDFSLFSP TMPCEGKGSP SPEKPDVEKE VKPPAKEKIE 
       730        740        750        760        770        780 
GTLGILYDQP RHVQYATHFP IPQEESCSHE CNQRLVVLFG VGKQRDDARH AIKKITKDIL 
       790        800        810        820        830        840 
KVLNRKGTAE TDQLAPIVPL NPGDLTFLGG EDGQKRRRNR PEAFPTAEDI FAKFQHLSHY 
       850        860        870        880        890        900 
DQHQVTAQVS RNVLEQITSF ALGMSYHLPL VQHVQFIFDL MEYSLSISGL IDFAIQLLNE 
       910        920        930        940        950        960 
LSVVEAELLL KSSDLVGSYT TSLCLCIVAV LRHYHACLIL NQDQMAQVFE GLCGVVKHGM 
       970        980        990       1000       1010       1020 
NRSDGSSAER CILAYLYDLY TSCSHLKSKF GELFSDFCSK VKNTIYCNVE PSESNMRWAP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
EFMIDTLENP AAHTFTYTGL GKSLSENPAN RYSFVCNALM HVCVGHHDPD RVNDIAILCA 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
ELTGYCKSLS AEWLGVLKAL CCSSNNGTCG FNDLLCNVDV SDLSFHDSLA TFVAILIARQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
CLLLEDLIRC AAIPSLLNAA CSEQDSEPGA RLTCRILLHL FKTPQLNPCQ SDGNKPTVGI 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
RSSCDRHLLA ASQNRIVDGA VFAVLKAVFV LGDAELKGSG FTVPGGTEEL PEEEGGGGSS 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GRRQGGRNIS VETASLDVYA KYVLRSICQQ EWVGERCLKS LCEDSNDLQD PVLSSAQAQR 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
LMQLICYPHR LLDNEDGENP QRQRIKRILK NLDQWTMRQS SLELQLMIKQ TPNTEMNSLL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
ENIAKATIEV FQQSAETGSS SGSTASNMPS SSKTKPVLSS LERSGVWLVA PLIAKLPTSV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QGHVLKAAGE ELEKGQHLGS SSRKERDRQK QKSMSLLSQQ PFLSLVLTCL KGQDEQREGL 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
LASLHSQVHQ IVINWRENQY LDDCKPKQLM HEALKLRLNL VGGMFDTVQR STQQTTEWAQ 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LLLEIIISGT VDMQSNNELF TTVLDMLSVL INGTLAADMS SISQGSMEEN KRAYMNLVKK 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
LQKDLGERQS DSLEKVHQLL PLPKQNRDVI TCEPQGSLID TKGNKIAGFD SIFKKEGLQV 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
STKQKISPWE LFEGLKPSTA PLSWAWFGTV RVDRRVARGE EQQRLLLYHT HLRPRPRAYY 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
LEPLPLPPED EEPPAPALLE PEKKAPEPPK TDKPGAAPPS TEERKKKSTK GKKRSQPATK 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
NEDYGMGPGR SGPYGVTVPP DLLHHANPGS ISHLSYRQSS MGLYTQNQPL PAGGPRVDPY 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
RPVRLPMQKL PTRPTYPGVL PTTMSTVMGL EPSSYKTSVY RQQQPTVPQG QRLRQQLQAK 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
IQSQGMLGQS SVHQMTPSSS YGLQTSQGYT SYVSHVGLQQ HTGPAGTMVP PSYSSQPYQS 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
THPSTNPTLV DPTRHLQQRP SGYVHQQAPT YGHGLTSTQR FSHQTLQQTP MMGTMTPLSA 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
QGVQAGVRST SILPEQQQQQ QQQQQQQQQQ QQQQQQQQQQ QQQQQQQQYH IRQQQQQQQM 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
LRQQQQQQQQ QQQQQQQQQQ QQQQQQQQQP HQQQQQAAPP QPQPQSQPQF QRQGLQQTQQ 
      2170       2180       2190    
QQQTAALVRQ LQQQLSNTQP QPSTNIFGRY          10         20         30         40         50         60 
MAAFGILSYE HRPLKRLRLG PPDVYPQDPK QKEDELTALN VKQGFNNQPA VSGDEHGSAK 
        70         80         90        100        110        120 
NVNFNPAKIS SNFSSIIAEK LRCNTLSDTG RRKSLMNQKD NFWLVTARSQ SAINTWFTDL 
       130        140        150        160        170        180 
AGTKPLTHLA KKVPIFSKKE EVFGYLAKYT VPVMRAAWLI KMTCAYYAAM SETKVKKKNT 
       190        200        210        220        230        240 
ADPFTEWTQI ITKYLWEQLQ KMAEYYRPGP AGSGGCGSTI GPLPHDVEMA IRQWDYNEKL 
       250        260        270        280        290        300 
ALFMFQDGML DRHEFLTWVL ECFEKIRPGE DELLKLLLPL LLRYSGEFVQ SAYLSRRLAY 
       310        320        330        340        350        360 
FCTRRLALQL DGVSSHSSHV IAAQSTSSLP TTPAPQPPTS STPSTPFSDL LMCPQHRPLV 
       370        380        390        400        410        420 
FGLSCILQTI LLCCPSALVW HYSLTDSRIK TGSPLDHLPI APSNLPMPEG NSAFTQQVRA 
       430        440        450        460        470        480 
KLREIEQQIK ERGQAVEVRW SFDKCQEATA GFTIGRVLHT LEVLDSHSFE RSDFSNSLDS 
       490        500        510        520        530        540 
LCNRIFGLGP SKDGHEISSD DDAVVSLLCE WAVSCKRSGR HRAMVVAKLL EKRQAEIEAE 
       550        560        570        580        590        600 
RCGESEAADE KGSVASGSLS APSAPIFQDV LLQFLDTQAP MLTDPRSESE RVEFFNLVLL 
       610        620        630        640        650        660 
FCELIRHDVF SHNMYTCTLI SRGDLAFGAP GPRPPSPFDD PTDDPERKEA EGSSSSKLED 
       670        680        690        700        710        720 
PGLSESMDID PSSSVLFEDM EKPDFSLFSP TMPCEGKGSP SPEKPDVEKE VKPPAKEKIE 
       730        740        750        760        770        780 
GTLGILYDQP RHVQYATHFP IPQEESCSHE CNQRLVVLFG VGKQRDDARH AIKKITKDIL 
       790        800        810        820        830        840 
KVLNRKGTAE TDQLAPIVPL NPGDLTFLGG EDGQKRRRNR PEAFPTAEDI FAKFQHLSHY 
       850        860        870        880        890        900 
DQHQVTAQVS RNVLEQITSF ALGMSYHLPL VQHVQFIFDL MEYSLSISGL IDFAIQLLNE 
       910        920        930        940        950        960 
LSVVEAELLL KSSDLVGSYT TSLCLCIVAV LRHYHACLIL NQDQMAQVFE GLCGVVKHGM 
       970        980        990       1000       1010       1020 
NRSDGSSAER CILAYLYDLY TSCSHLKSKF GELFSDFCSK VKNTIYCNVE PSESNMRWAP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
EFMIDTLENP AAHTFTYTGL GKSLSENPAN RYSFVCNALM HVCVGHHDPD RVNDIAILCA 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
ELTGYCKSLS AEWLGVLKAL CCSSNNGTCG FNDLLCNVDV SDLSFHDSLA TFVAILIARQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
CLLLEDLIRC AAIPSLLNAA CSEQDSEPGA RLTCRILLHL FKTPQLNPCQ SDGNKPTVGI 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
RSSCDRHLLA ASQNRIVDGA VFAVLKAVFV LGDAELKGSG FTVPGGTEEL PEEEGGGGSS 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GRRQGGRNIS VETASLDVYA KYVLRSICQQ EWVGERCLKS LCEDSNDLQD PVLSSAQAQR 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
LMQLICYPHR LLDNEDGENP QRQRIKRILK NLDQWTMRQS SLELQLMIKQ TPNTEMNSLL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
ENIAKATIEV FQQSAETGSS SGSTASNMPS SSKTKPVLSS LERSGVWLVA PLIAKLPTSV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QGHVLKAAGE ELEKGQHLGS SSRKERDRQK QKSMSLLSQQ PFLSLVLTCL KGQDEQREGL 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
LASLHSQVHQ IVINWRENQY LDDCKPKQLM HEALKLRLNL VGGMFDTVQR STQQTTEWAQ 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LLLEIIISGT VDMQSNNELF TTVLDMLSVL INGTLAADMS SISQGSMEEN KRAYMNLVKK 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
LQKDLGERQS DSLEKVHQLL PLPKQNRDVI TCEPQGSLID TKGNKIAGFD SIFKKEGLQV 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
STKQKISPWE LFEGLKPSTA PLSWAWFGTV RVDRRVARGE EQQRLLLYHT HLRPRPRAYY 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
LEPLPLPPED EEPPAPALLE PEKKAPEPPK TDKPGAAPPS TEERKKKSTK GKKRSQPATK 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
NEDYGMGPGR SGPYGVTVPP DLLHHANPGS ISHLSYRQSS MGLYTQNQPL PAGGPRVDPY 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
RPVRLPMQKL PTRPTYPGVL PTTMSTVMGL EPSSYKTSVY RQQQPTVPQG QRLRQQLQAK 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
IQSQGMLGQS SVHQMTPSSS YGLQTSQGYT SYVSHVGLQQ HTGPAGTMVP PSYSSQPYQS 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
THPSTNPTLV DPTRHLQQRP SGYVHQQAPT YGHGLTSTQR FSHQTLQQTP MMGTMTPLSA 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
QGVQAGVRST SILPEQQQQQ QQQQQQQQQQ QQQQQQQQQQ QQQQQQQQYH IRQQQQQQQM 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
LRQQQQQQQQ QQQQQQQQQQ QQQQQQQQQP HQQQQQAAPP QPQPQSQPQF QRQGLQQTQQ 
      2170       2180       2190    
QQQTAALVRQ LQQQLSNTQP QPSTNIFGRY 



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    A2AGH6-1-unknown MAAFGI... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    A2AGH6-1-unknown MAAFGI... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt80746
    A2AGH6-1322-unknown MQLICY... 1322 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt80747
    A2AGH6-1322-unknown MQLICY... 1322 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt101977

C-termini

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)