TopFIND 4.0

A2AKX3: Probable helicase senataxin {ECO:0000305}

General Information

Protein names
- Probable helicase senataxin {ECO:0000305}
- 3.6.4.-
- Amyotrophic lateral sclerosis 4 protein homolog
- SEN1 homolog
Gene names Setx
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID A2AKX3

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MSTCCWCTPG GSSTIDVLKR YASSTGSSEF QTADEDLCYC LECVAEYHRA RDEVPFLHEV 
        70         80         90        100        110        120 
LWELETLRLV SHFEKSMKAE AEDDDDLYIV DNNGEEQLFD CSGQDFENKL RVPLFEILKY 
       130        140        150        160        170        180 
PYLLLHERVN ELCVEALCRM EQNNCSFQVF DKYPGIYLFL VHPNEMVRRW AILTARNLGK 
       190        200        210        220        230        240 
VDRDDYYDLQ EVLTCLFKVI ELGLLESPDI YTSSVLEKGK LILLPAHMYD TTNYKNYWLG 
       250        260        270        280        290        300 
ICMLLTILEE QAMDSLLLGS DKQNDFMQSI LHTMEKQSDD DSMDPFWPAL HCFMVILDRL 
       310        320        330        340        350        360 
GSKVWGQLID PIEAFQTIIN NESYNREIQN IRNSSIRTKL EPEPHFDDMV TCSQIVYNFN 
       370        380        390        400        410        420 
PEKTKKDSGW RSAICPDYCP NMYEEMETLA NVLQSDIGQD MRVHNSTFLW FIPFVQSLMD 
       430        440        450        460        470        480 
LKDLGVAYIV EVIHHLYSEV KDVLNQTDAV CDKVTEFFIL ILISVIELHR NKKCLHLLWV 
       490        500        510        520        530        540 
SSQQWVEAVV KCAKLPTTAF VRSCEKSPGS TSRGAAIMSS LALHSVQSNS VQLACVQLIR 
       550        560        570        580        590        600 
GLLKEGYQLG QQTLCKRFWD KLNLFLRGNL SLGWQLTGQE THELQMCLKQ IIRNIKFKMP 
       610        620        630        640        650        660 
QYSTFGDSTS TFKTPPSFKE ESDKIDRKHK KNIYCLENCS PVSSKEPMKA DTHRVLMKVN 
       670        680        690        700        710        720 
TTEEENFKQH YIDLNEEEQE PLPAELCLKQ KSEALFSESA QEQVKISAEK SGKESSSYAP 
       730        740        750        760        770        780 
SNSTSRNGPE WGCDRGVIMS AHSLTDSSSD FMEQVSTSNE DVSLKDGSVG KTSKPSFKLQ 
       790        800        810        820        830        840 
KDEICAKLSH VIKKQIRKST LVDNIIDLEE NTAISDLENC SGTDGGALKE DSIGHNVPSD 
       850        860        870        880        890        900 
PVLDDKHEEQ KSQNSSLFKK EIKSEELDNS SSDDEDKLQI QEGRADDDLV SFTEVTDTLV 
       910        920        930        940        950        960 
KAPCEGHVKM VVESRDKEMR ESTALTSNLV EGQVPHDSSK PLVAGRQIDL CNITLISQTT 
       970        980        990       1000       1010       1020 
VIQFPSGLSK QNSFQLQKGD KRCLTANQNS AATCRGQVIV ISDSDEEEDE DEDERSSSEE 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
NIKQSKACIG KDCSEHRSLA VNASVEKQLV KEEERYPVEF EDSESQVFEF ESSSEVFSVW 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
QDHKIDSKNS LQGEQKSYVT HVADSTNNNL GCGDSVSEEV VRNKAEGVKE HAGPHSSVSA 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
EEFCKTGVKK PKRKRYDKVT AEDPQRPSSS VGTDQLPDRR DLTESDLKSA DMGMATPSSS 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
VERDSTILQK STKSRTHSKP VRKVPASKAT KKTHSDTRRG QSKSSCYISC RTSPAIVPPK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
KLRQCPEPTS TVEKLGLKKA PRKAFELSQR SLECIVQLRD HGKTVGVVDA PKKAKLISPQ 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
TLSIKNNKKL LTSQDLQFQR LMRSRSHKKR DFDYKNTDTV RVSRIVQGSD VLEADSDEPD 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
DHRVSEPLAI SNEKQLAKCM LSKTEVAEAS SDPWVTGITC LVNQCESRVL SGGVPTDVVM 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
VSASEDPVDG GAVTVQVGEV ASVKAAEPAS SSDTDDDDNL FLTQHDPQDM DLCSQLENKT 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
IIVAHKKDTV QREDSLSRPQ LESLSITKCK YKDCVETTKN QGEYCPRHSE AKAADDGLFR 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
KPGLPLSVAR PLRPTTTKIF SSSSASRTAN LSKSLESTTL QQSALKNKSS GAQPNLKVTP 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PSSMGSQKPV AEVKSLCNIF HFQTPSSSSK QSCKLTFSEN RPTSAASPVN ILLPSQSIFD 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
TFIKEVLKWK YQMFLNFDKC GAPTSLCQSI SRPVPVRFQD CAEYFNVFLP LIILNAFETV 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
AQEWLSSPNK ENFYQLQLRK FPADYKKYWE FLIYLNESEL AKQLHPKEND LVFLAPEKSY 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
MDRHGMQDCS HYYCGYVHKF RRTSVMRSGK AECSLCIQTQ DTLPASVKNL TRCIVISSLV 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
TTQRKLKAMS LLSSRNQLAR AVLNPNPMDF CTKDLLTTTS ERIVAYLKDF NEDQKKAIET 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
AYAMVKHSPS VAKICLIHGP PGTGKSKTIV GLLYRLLTEN QRKGHSDENF NAKIKQNRVL 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
VCAPSNAAVD ELMKKIILEF KEKCKDKKNP LGNCGDINLV RLGPEKSINT EVLKFSLDSQ 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
VNHRMKKDLP SHIQEMLRRK EILDAQLDEL SRQRALCRGG REMQRQELDE HIAIVSKERQ 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
ELASKIKEVQ GRPQRAQNTI ILESHVICCT LSTSGGLLLE SAFRGQGGVP FSCVIVDEAG 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
QSCEVETLSP LIHRCNKLIL VGDPKQLPPT VISMKAQEYG YDQSMMARFC KLLEENVEQN 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
MIGRLPVLQL TIQYRMHPDI CLFPSNYVYN KNLKTNRLTE SIRCSSEWPF QPYLVFDVGD 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
GSERRDNDSY INVQEIKLVM EIIKLIKEKR KDISFRNIGI ITHYKAQKTM IQKDLEKEFD 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
KKGPAEVDTV DAFQGRQKDC IIVTCVRASA VQGSIGFLAS LQRLNVTITR AKYSLFILGH 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
LRTLMENQHW YELIQDAQKR GAIIKTSDPN YRHDAMKILK LKPVLQRSLT HPPATAPEAP 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
RPQGGLPSNR LDSGLATTSF AASLYHTPSD TVTSKGPERP LLQDRLRDPR LLRRLDAEAK 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
GTFLKDPQPV SPQLPGVVHL LGEPGFPVVF QDLGFVVPPS TAIVAPLGSH RSPMQAEPPP 
      2590       2600       2610       2620       2630       2640 
AHPAAAASTS KRKYSDPDAG LSHKREPRAF SGEQGRHGSV THHVLRSTDW DRRRLDDSSA 
   
KRRQFL

Isoforms

- Isoform 2 of Probable helicase senataxin

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MSTCCWCTPG GSSTIDVLKR YASSTGSSEF QTADEDLCYC LECVAEYHRA RDEVPFLHEV 
        70         80         90        100        110        120 
LWELETLRLV SHFEKSMKAE AEDDDDLYIV DNNGEEQLFD CSGQDFENKL RVPLFEILKY 
       130        140        150        160        170        180 
PYLLLHERVN ELCVEALCRM EQNNCSFQVF DKYPGIYLFL VHPNEMVRRW AILTARNLGK 
       190        200        210        220        230        240 
VDRDDYYDLQ EVLTCLFKVI ELGLLESPDI YTSSVLEKGK LILLPAHMYD TTNYKNYWLG 
       250        260        270        280        290        300 
ICMLLTILEE QAMDSLLLGS DKQNDFMQSI LHTMEKQSDD DSMDPFWPAL HCFMVILDRL 
       310        320        330        340        350        360 
GSKVWGQLID PIEAFQTIIN NESYNREIQN IRNSSIRTKL EPEPHFDDMV TCSQIVYNFN 
       370        380        390        400        410        420 
PEKTKKDSGW RSAICPDYCP NMYEEMETLA NVLQSDIGQD MRVHNSTFLW FIPFVQSLMD 
       430        440        450        460        470        480 
LKDLGVAYIV EVIHHLYSEV KDVLNQTDAV CDKVTEFFIL ILISVIELHR NKKCLHLLWV 
       490        500        510        520        530        540 
SSQQWVEAVV KCAKLPTTAF VRSCEKSPGS TSRGAAIMSS LALHSVQSNS VQLACVQLIR 
       550        560        570        580        590        600 
GLLKEGYQLG QQTLCKRFWD KLNLFLRGNL SLGWQLTGQE THELQMCLKQ IIRNIKFKMP 
       610        620        630        640        650        660 
QYSTFGDSTS TFKTPPSFKE ESDKIDRKHK KNIYCLENCS PVSSKEPMKA DTHRVLMKVN 
       670        680        690        700        710        720 
TTEEENFKQH YIDLNEEEQE PLPAELCLKQ KSEALFSESA QEQVKISAEK SGKESSSYAP 
       730        740        750        760        770        780 
SNSTSRNGPE WGCDRGVIMS AHSLTDSSSD FMEQVSTSNE DVSLKDGSVG KTSKPSFKLQ 
       790        800        810        820        830        840 
KDEICAKLSH VIKKQIRKST LVDNIIDLEE NTAISDLENC SGTDGGALKE DSIGHNVPSD 
       850        860        870        880        890        900 
PVLDDKHEEQ KSQNSSLFKK EIKSEELDNS SSDDEDKLQI QEGRADDDLV SFTEVTDTLV 
       910        920        930        940        950        960 
KAPCEGHVKM VVESRDKEMR ESTALTSNLV EGQVPHDSSK PLVAGRQIDL CNITLISQTT 
       970        980        990       1000       1010       1020 
VIQFPSGLSK QNSFQLQKGD KRCLTANQNS AATCRGQVIV ISDSDEEEDE DEDERSSSEE 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
NIKQSKACIG KDCSEHRSLA VNASVEKQLV KEEERYPVEF EDSESQVFEF ESSSEVFSVW 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
QDHKIDSKNS LQGEQKSYVT HVADSTNNNL GCGDSVSEEV VRNKAEGVKE HAGPHSSVSA 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
EEFCKTGVKK PKRKRYDKVT AEDPQRPSSS VGTDQLPDRR DLTESDLKSA DMGMATPSSS 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
VERDSTILQK STKSRTHSKP VRKVPASKAT KKTHSDTRRG QSKSSCYISC RTSPAIVPPK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
KLRQCPEPTS TVEKLGLKKA PRKAFELSQR SLECIVQLRD HGKTVGVVDA PKKAKLISPQ 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
TLSIKNNKKL LTSQDLQFQR LMRSRSHKKR DFDYKNTDTV RVSRIVQGSD VLEADSDEPD 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
DHRVSEPLAI SNEKQLAKCM LSKTEVAEAS SDPWVTGITC LVNQCESRVL SGGVPTDVVM 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
VSASEDPVDG GAVTVQVGEV ASVKAAEPAS SSDTDDDDNL FLTQHDPQDM DLCSQLENKT 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
IIVAHKKDTV QREDSLSRPQ LESLSITKCK YKDCVETTKN QGEYCPRHSE AKAADDGLFR 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
KPGLPLSVAR PLRPTTTKIF SSSSASRTAN LSKSLESTTL QQSALKNKSS GAQPNLKVTP 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PSSMGSQKPV AEVKSLCNIF HFQTPSSSSK QSCKLTFSEN RPTSAASPVN ILLPSQSIFD 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
TFIKEVLKWK YQMFLNFDKC GAPTSLCQSI SRPVPVRFQD CAEYFNVFLP LIILNAFETV 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
AQEWLSSPNK ENFYQLQLRK FPADYKKYWE FLIYLNESEL AKQLHPKEND LVFLAPEKSY 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
MDRHGMQDCS HYYCGYVHKF RRTSVMRSGK AECSLCIQTQ DTLPASVKNL TRCIVISSLV 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
TTQRKLKAMS LLSSRNQLAR AVLNPNPMDF CTKDLLTTTS ERIVAYLKDF NEDQKKAIET 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
AYAMVKHSPS VAKICLIHGP PGTGKSKTIV GLLYRLLTEN QRKGHSDENF NAKIKQNRVL 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
VCAPSNAAVD ELMKKIILEF KEKCKDKKNP LGNCGDINLV RLGPEKSINT EVLKFSLDSQ 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
VNHRMKKDLP SHIQEMLRRK EILDAQLDEL SRQRALCRGG REMQRQELDE HIAIVSKERQ 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
ELASKIKEVQ GRPQRAQNTI ILESHVICCT LSTSGGLLLE SAFRGQGGVP FSCVIVDEAG 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
QSCEVETLSP LIHRCNKLIL VGDPKQLPPT VISMKAQEYG YDQSMMARFC KLLEENVEQN 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
MIGRLPVLQL TIQYRMHPDI CLFPSNYVYN KNLKTNRLTE SIRCSSEWPF QPYLVFDVGD 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
GSERRDNDSY INVQEIKLVM EIIKLIKEKR KDISFRNIGI ITHYKAQKTM IQKDLEKEFD 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
KKGPAEVDTV DAFQGRQKDC IIVTCVRASA VQGSIGFLAS LQRLNVTITR AKYSLFILGH 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
LRTLMENQHW YELIQDAQKR GAIIKTSDPN YRHDAMKILK LKPVLQRSLT HPPATAPEAP 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
RPQGGLPSNR LDSGLATTSF AASLYHTPSD TVTSKGPERP LLQDRLRDPR LLRRLDAEAK 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
GTFLKDPQPV SPQLPGVVHL LGEPGFPVVF QDLGFVVPPS TAIVAPLGSH RSPMQAEPPP 
      2590       2600       2610       2620       2630       2640 
AHPAAAASTS KRKYSDPDAG LSHKREPRAF SGEQGRHGSV THHVLRSTDW DRRRLDDSSA 
   
KRRQFL



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    A2AKX3-1-unknown MSTCCW... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    A2AKX3-382-unknown MYEEME... 382 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt89369

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...RRQFL 2646 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...RRQFL 2646 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt84987

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)