TopFIND 4.0

A2AX52: Collagen alpha-4(VI) chain

General Information

Protein names
- Collagen alpha-4(VI) chain
Gene names Col6a4
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID A2AX52

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MGTWKTFWLI ISLAAGLGFV KSQRIVCREA SVGDIVFLVH NSINPQHAHS VRNFLYILAN 
        70         80         90        100        110        120 
SLQVGRDNIR VGLAQYSDTP TSEFLLSVYH RKGDVLKHIR GLQFKPGGNR MGQALQFILE 
       130        140        150        160        170        180 
HHFREGAGSR ASQGVPQVAV VVSSGLTEDH IREPAEALRR AGILVYAIGV KDASQAELRE 
       190        200        210        220        230        240 
ISSSPKDNFT FFVPNFPGLP GLAQKLRPEL CSTLGKAAQY TERESPACSE ASPADIVFLV 
       250        260        270        280        290        300 
DSSTSIGLQN FQKVKHFLHS VVSGLDVRSD QVQVGLVQYS DNIYPAFPLK QSSLKSAVLD 
       310        320        330        340        350        360 
RIRNLPYSMG GTSTGSALEF IRANSLTEMS GSRAKDGVPQ IVVLVTDGES SDEVQDVADQ 
       370        380        390        400        410        420 
LKRDGVFVFV VGINIQDVQE LQKIANEPFE EFLFTTENFS ILQALSGTLL QALCSTVERQ 
       430        440        450        460        470        480 
MKKSTKTYAD VVFLIDTSQG TSQASFQWMQ NFISRIIGIL EVGQDKYQIG LAQYSDQGHT 
       490        500        510        520        530        540 
EFLFNTHKTR NEMVAHIHEL LVFQGGSRKT GQGLRFLHRT FFQEAAGSRL LQGVPQYVVV 
       550        560        570        580        590        600 
ITSGKSEDEV GEVAQILRKR GVDIVSVGLQ DFDRAELEGI GPVVLVSDLQ GEDRIRQLML 
       610        620        630        640        650        660 
DVNMFIQGSP KPPRVMTDVA KDAVEECLVP VPADLVFLVE DFSSARQPNF QRVVHFLTTT 
       670        680        690        700        710        720 
VHSLNIHPDT TRVSLVFYSE KPRLEFSLDM YQSAAQVLRH LDRLTFRARR GRAKAGAALD 
       730        740        750        760        770        780 
FLRKEVFLPE KGSRPHRGVQ QIAVVIIESP SLDNVSTPAS YLRRAGVTIY AAGTQPASES 
       790        800        810        820        830        840 
KDLEKIVTYP PWKHAIRLES FLQLSVVGNK LKKKLCPEML SGMPPLMSFI PESTRQSTQE 
       850        860        870        880        890        900 
GCESVEKADI YFLIDGSGSI KPNDFIEMKD FMKEVIKMFH IGPDRVRFGV VQYSDKIISQ 
       910        920        930        940        950        960 
FFLTQYASMA GLSAAIDNIQ QVGGGTTTGK ALSKMVPVFQ NTARIDVARY LIVITDGQST 
       970        980        990       1000       1010       1020 
DPVAEAAQGL RDIGVNIYAI GVRDANTTEL EEIASKKMFF IYEFDSLKSI HQEVIRDICS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SENCKSQKAD IIFLIDGSES IAPKDFEKMK DFMERMVNQS NIGADEIQIG LLQFSSNPQE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
EFRLNRYSSK VDMCRAILSV QQMSDGTHTG KALNFTLPFF DSSRGGRPRV HQYLIVITDG 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
VSQDNVAPPA KALRDRNIII FAIGVGNVQR AQLLEITNDQ DKVFQEENFE SLQSLEKEIL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SEVCSSQGCN IDLSVGVDTS TSSERAQQEL RRLLPELMQQ LAFLSNISCE APGQMEPRFR 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
YVVPGSSDQP VFDSGFEKYS DETIQKFLVH QGSVNNRMDV DFLQSLGETA IHLSLAKVKV 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
LLVFTDGLDE DLERLRRTSE FLRSRGLSGL LLIGLGGAHK LEELQELEFG RGFAYRQPLS 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SSLPSLPSVL LKQLDTIVER TCCNMYAKCY GDDGIRGEPG SRGEQGERGL DGLPGHPGEE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
GDHGQRGPRG LPGLRGEEGC PGVRGPKGAR GFSGEKGNPG EEGVGGLDGE QGDRGAAGPS 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
GEKGSSGSRG LTGLPGPAGP RGEPGLRGDP GDPGIDNLIQ GPKGEKGRRG HQGSPGFHGP 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LGEAGSVGPR GSLGRHGLPG LKGVLGETGE LGSRGEPGHP GPQGPRGRQG PPGFFGQKGD 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PGTQGNPGLP GPSGSKGPDG PRGLKGEVGP AGERGPRGQQ GPRGQPGLFG PDGHGYPGRK 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
GRKGEPGFPG YPGVQGEDGN PGRGGEKGAK GIRGKRGNSG FPGLAGTPGD QGPPGKMGTK 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
GSKGLADRTP CEIVDFVRGN CPCSTGISRC PAFPTEVVFT LDMSNDVAPS DFERMRNILL 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
SLLMKLEMCE SNCPTGARVA IVSYNTRTDY LVRLSDHRGK AALLQAVRKI PLERSSGSRN 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
LGATMRFVAR HVFKRVRSGL LVRKVAVFFQ AGRNYDTASV STATLELHAA DIATAVVTFT 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
EEHNLPEAGL VDGPNEFHLF TWETEGQQDV ERLASCTLCY DKCRPALGCQ LRAPGPQKLD 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
MDLVFLVDSS QGVSRDIYLG ALRLVDSVLK DLEVAAQPGT SWHGARAALL THTTPGFWPG 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
VDQAPVLEYF HLTSHGHRTE MQRQIREAAS GLLQGGPALG HALEWTLENV LLTAVLPRRS 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
RVLYAIVASE TSIWDREKLR TLSQEAKCKG IALFVLAVGP GVGAQELAEL AKVASAPWEQ 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
HLLRLEGVSE AEVAYASRFT EAFLNLLNSG INQYPPPELV KECGGPNRGD TLLHFFTSAK 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
RFSRSQSGTS AAFANDSEAL KSQGIFLGER KSRVASVALQ EALGSHGKDR ADTEDIDQET 
      2290       2300    
PAKGRHLGPT HGPCPMGPEE GECLNYVLK

Isoforms



Sequence View



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    A2AX52-23-unknown QRIVCR... 23 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...NYVLK 2309 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)