TopFIND 4.0

A6H584: Collagen alpha-5(VI) chain

General Information

Protein names
- Collagen alpha-5(VI) chain
- Collagen alpha-1(XXIX) chain

Gene names Col6a5
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID A6H584

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MKLRLIAFVL ILWTETLADQ SPGPGPEYAD VVFLVDSSNY LGIKSFPFVR TFLNRMISSL 
        70         80         90        100        110        120 
PIEANKYRVA LAQYSDALHN EFQLGTFKNR NPMLNHLKKN FGFIGGSLKI GNALQEAHRT 
       130        140        150        160        170        180 
YFSAPTNGRD KKQFPPILVV LASAESEDDV EEAAKALRED GVKIISVGVQ KASEENLKAM 
       190        200        210        220        230        240 
ATSQFHFNLR TARDLGMFAP NMTRIIKDVT QYREGTTVDL ITAVAPTTPA APATPAAPTI 
       250        260        270        280        290        300 
PAALTTAANH VDKTVPFPTS CQKDSLADLI FLVDESVGTT QNLRDLQNFL ENVTSSVDVK 
       310        320        330        340        350        360 
DNCMRLGLMS FSDRAQTISS LRSSANQSEF QQQIQKLSLQ TGASNVGAAI EQMRKEGFSE 
       370        380        390        400        410        420 
SSGSRKAQGV PQIAVLVTHR ASDDMVREAA LDLRLEGVTM FAMGIEGANN TQLEDIVSYP 
       430        440        450        460        470        480 
SRQSISTHSS YSHLESYSGN FLKKIRNEIW TQVSTRAEQM ELDKTGCVDT KEADIYFLID 
       490        500        510        520        530        540 
GSSSIRKKEF EQIQIFMSSV IDMFPIGPNK VRVGVVQYSH KNEVEFPVSR YTDGIDLKKA 
       550        560        570        580        590        600 
VFNIKQLKGL TFTGKALDFI LPLIKKGKTE RTDRAPCYLI VLTDGKSNDS VLEPANRLRA 
       610        620        630        640        650        660 
EQITIHAIGI GEANKTQLRQ IAGKDERVNF GQNFDSLKSI KNEIVHRICS EKGCEDMKAD 
       670        680        690        700        710        720 
IMFLVDSSGS IGPTNFETMK TFMKNLVGKI QIGADRSQVG VVQFSDYNRE EFQLNKYSTH 
       730        740        750        760        770        780 
EEIYAAIDRM SPINRNTLTG GALTFVNEYF DLSKGGRPQV RKFLILLTDG KAQDEVGGPA 
       790        800        810        820        830        840 
TALRSKSVTI FSVGVYGANR AQLEEISGDG SLVFHVENFD HLKAIESKLI FRVCALHDCK 
       850        860        870        880        890        900 
RIELLDIVFV LDHSGSIGPR EQESMMNLTI HLVKKADVGR DRVQIGALTY SNHPEILFYL 
       910        920        930        940        950        960 
NTYSSGSAIA EHLRRPRDTG GETYTAKALQ HSNVLFTEEH GSRLTQNVRQ LMIVITDGVS 
       970        980        990       1000       1010       1020 
HDRDKLDEAA RELRDKGITI FAVGVGNANQ DELETMAGKK ENTVHVDNFD KLRDIYLPLQ 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
ETLCNNSQET CNLPEADVIF LCDGSDMVSD SEFVTMTTFL SDLIDNFDIE SQRMKIGMAQ 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
YGSRYQEIIE LESSLNKTQW KSQVHSVAQS KGLPRLDFAL KHVSDMFDPS VGGRRNAGVP 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
QTLVVITSSS PRYDVTDAVK VLKDLGICVL ALGIGDVYKE QLLPITGNSE KIITFRDFNK 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
LKNVDVKKRM VREICQSCGK ANCFVDVVVG FDISTHRQGQ PLFQGHPRLE SYLPGILEDI 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
TSIRGVSCGA GAEAQVSLAF KVNSDQEFPA KFQIYQKAAF DSLLHVTVRG PTHLDAPFLQ 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
SLWDMFEERS ASRGQVLLIF SDGLQGESIT LLERQSDRLR EAGLDALLVV SLNTFGHDEF 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SSFEFGKGFD YRTQLTIGML DLGKTLSQYL GNIAERACCC TFCKCPGIPG PHGTRGLQAS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
KGSSGPKGSR GHRGEDGDPG RRGEIGLQGD RGVVGCPGTR GQKGVKGFSG AQGEHGEDGL 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
DGLDGEEGFY GFRGGKGQKG DPGNQGYPGI RGAAGEDGEK GFPGDPGDPG KDSNIKGQKG 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
EKGERGRQGI TGQKGTHGRP SSKGSRGMEG QRGPQGPSGQ AGNPGPQGTQ GPEGLQGSQG 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
SSGNRGGKGD KGSQGYQGPQ GSPGPAGPRG DIGRPGFGGR KGEPGVPGGP GPVGPPGQRG 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
KQGDYGIPGY GQTGRKGVKG PTGFPGDPGQ KGDAGNPGIP GGPGPKGFKG LTLSQGLKGR 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
SGLQGSQGPP GRRGPKGTAG QPIYSPCELI QFLRDHSLIF TDKCPVYPTE LVFALDQSSG 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
ITERRFNETR DTITSIVSDL NIRENNCPVG ARVAVVSYDS DTSYLIRGSD YHNKKHLLQL 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
LSQIKYQVPR KARDIGNAMR FVARNVFKRM SAGTNTRRVA VFFSNGQAAS RASILTATME 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
LSALDISLAV FAYNERVFLD EAFGFDDTGT FQVIPVPPVG DYEPLEKLRR CTLCYDKCFP 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
NTCAEEPFFP ENSYMDVAFL LDNSKNIASD DFQAVKALVS SVIDSFHITS NPSASESGDR 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
VALLSYSPSE SSRRKGRVKT EFAFTTYDNQ SIMKNYIYTS LQQLNGDATI GLALQWAMEG 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
LFLGTPNPRK HKVIIVISAG ENHEEKEFVK TVALRAKCQG YVVFVISLGS TQRDEMEELA 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
SYPLDHHLIQ LGRMYKPDLN YIVKFLKPFI YSVRRGFNQY PPPTLKDDCR LVELERGDTL 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
PHGLRLTAKL REVPESTISL ADQELNAGKD SSFVLEDHRG DHLVYVPSQM LEPHKLVSHY 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
GNDRESVAMA SLTSEHESHG REELGLAHEP GDASLQEYYM DVAFLIDASQ RVGGRNEFKE 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
VRTLITSVLD YFHIAPAPLT SVLGDRVAVL TYSPPGYLPN TEECPVYLEF DLVTYNTVHQ 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
MKHHLQESLQ QLNGDVFIGH ALQWTVDNVF VGTPNLRKNK VIFIVTAGET NPLDKEVLRN 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
ASLRAKCQGY SIFVFSFGPI HNDMELEELA SHPLDHHLVR LGRVHRPDLD YVIKFIKPFV 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
HSIRRAINKY PGRDLQAKCD NLTFPGPENA GTEDSALLIP EVYRIEAGEN ELSGDSGSQE 
      2590       2600       2610       2620       2630       2640 
QHFFLLGNSH GNHSESTADL MRQLYLLLSS GELMVNDKEE PCSAETPAPV NSKQDGEDAR 
   

Isoforms



Sequence View



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    A6H584-19-unknown DQSPGP... 19 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...GEDAR 2640 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)