TopFIND 4.0

A6H619: PHD and RING finger domain-containing protein 1 {ECO:0000312|MGI:MGI:2141847}

General Information

Protein names
- PHD and RING finger domain-containing protein 1 {ECO:0000312|MGI:MGI:2141847}
Gene names Phrf1
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID A6H619

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MDDDNLDELV AHSPGPDGPP RVGSSELASD AEESSNGQSG DSEDDTGSEQ DDDTDGEETE 
        70         80         90        100        110        120 
GLSEEEDPED RSGSEDSEDG VEMATAAIET QGKLEASSVP NSDDDAESCP ICLNAFRDQA 
       130        140        150        160        170        180 
VGTPETCAHY FCLDCIIEWS RNANSCPVDR TVFKCICIRA QFNGKILKKI PVENTKACEA 
       190        200        210        220        230        240 
EEEDPTFCEV CGRSDREDRL LLCDGCDAGY HMECLDPPLQ EVPVDEWFCP ECTVPGVDPT 
       250        260        270        280        290        300 
HDAAPVSDEE VSLLLADVVP TTSRLRPRVG RTRAIARTRQ SERVRATVNR NRISSARRVQ 
       310        320        330        340        350        360 
HVPRYLMSSL LDETIEAVAT GLSTAVYQRP LTPRVPAKRK RKAGRRKKVL GRKKTRSRSS 
       370        380        390        400        410        420 
VKSKSGSTRA KKRQHRVRKT KGRKLKNEVT ARSRIARTLG LRRPVRGTSM PSVYKPVDPS 
       430        440        450        460        470        480 
LGLMRADIGA ASLSLFGDPY ELDPFDSNEE QSADPPSPLS AKRRVLSRSA LQSHQPVARP 
       490        500        510        520        530        540 
VAMGLSRRQL PAVAPEPSVE EAPVPDLLGS ILSGQSLLMM SSADVVIHRD GSLSAKRAAP 
       550        560        570        580        590        600 
VSLQRNSVTQ SREESRLRDN PQPGALPSES ASGGFVGDRQ PNSGLSCGNR TALCCLPARI 
       610        620        630        640        650        660 
AQTPVRSDPS LTPRSGLSRT LSDENRPSRT HSSSPQLNGS NVRVSSASTK IVTHSSFPSK 
       670        680        690        700        710        720 
NTASGLPQRT GPRRPDFSKL PRIPKIHRDG NKSTQDQAPA SGHIVELPST CISRLTGREG 
       730        740        750        760        770        780 
PGQPGRGRVD SEPSSRGPQE TGSHTSGSRP PAPSSHGSLA HLGPSRGKGI GSSFESFRIN 
       790        800        810        820        830        840 
IPGNTAHCSQ LSSPGFCNTF RPVDSKVQRK ETPFPLFSIK KPKQLKSEIY DPFDPTGSDS 
       850        860        870        880        890        900 
SPPSSSPESL GPGLLPSEIT RTISINSPKA PAFQTVRCVT SYRVESIFGT EMEPEPQPPS 
       910        920        930        940        950        960 
EPVSGMLELL SKGSAEGTSD LEQEGLGEIE PTEIRGSTAR TQRPPPPDPW DDEDEVSCTP 
       970        980        990       1000       1010       1020 
FFGSEERTVT CVTVEEPGVL PSPDAPQITT HRIVEFRASS RSRSTSSSRS RKKTKKKKKK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
VAREHQRTRS STRSGSRDRT SRSVSPVAEE HTRRHRAKTK SRRSSSDRAS SQDRAKRRKD 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
RDDRDREHRR GSWGHGRCRR KSRSRSGSPG SSSCERHESK RRKRRHSGSR SRGSSLERDR 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
RHKHRERSRE RMDKQESVTR SRERRRWRSR SPSLEHRPRR PPSREKRAHS PEKKGPVREV 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SPAPATQGES RQDGDHSAEP PVSEVSVLPE VVSVLPEVVV ADLNPPEVPP VLAEPVAHVP 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
EDLDYGESVE AGHVFEDFSN EAIFIQLDDM SSPPSPESTD SSPERDFPPN PILPPASLPQ 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
DSTLPTIQRE VLPIHSEDIS KPVPQALAPS DQSLLKQDTV EITTTTPSTP AVVPMTKDSP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
VLSARGWEAV RPRDAVAQAP LLRSRTLVKR VTWNLQEAEH STPAALDRDP RTPLQRPQRP 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QEGDWDAEDR ALIGFQQAPF SELPPPIHVL QESGLPDADP SQPPGAPRAE GLPAAGTLHS 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
AGGILAQVYS PNMPPPLAQP SSILPYALVS QPSVQLILQG TLPLAGCGTA QSLAPVPTMP 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
ATVSELAVPT TNNSEERTAT PKTAAEKTKK EEYMKKLHMQ ERAVEEVKLA IKPFYQKREV 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
TKEEYKDILR KAVQKICHSK SGEINPVKVA NLVKAYVDKY RHMRRHKKTE GGEEPPTQGA 
   
ET

Isoforms

- Isoform 2 of PHD and RING finger domain-containing protein 1

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MDDDNLDELV AHSPGPDGPP RVGSSELASD AEESSNGQSG DSEDDTGSEQ DDDTDGEETE 
        70         80         90        100        110        120 
GLSEEEDPED RSGSEDSEDG VEMATAAIET QGKLEASSVP NSDDDAESCP ICLNAFRDQA 
       130        140        150        160        170        180 
VGTPETCAHY FCLDCIIEWS RNANSCPVDR TVFKCICIRA QFNGKILKKI PVENTKACEA 
       190        200        210        220        230        240 
EEEDPTFCEV CGRSDREDRL LLCDGCDAGY HMECLDPPLQ EVPVDEWFCP ECTVPGVDPT 
       250        260        270        280        290        300 
HDAAPVSDEE VSLLLADVVP TTSRLRPRVG RTRAIARTRQ SERVRATVNR NRISSARRVQ 
       310        320        330        340        350        360 
HVPRYLMSSL LDETIEAVAT GLSTAVYQRP LTPRVPAKRK RKAGRRKKVL GRKKTRSRSS 
       370        380        390        400        410        420 
VKSKSGSTRA KKRQHRVRKT KGRKLKNEVT ARSRIARTLG LRRPVRGTSM PSVYKPVDPS 
       430        440        450        460        470        480 
LGLMRADIGA ASLSLFGDPY ELDPFDSNEE QSADPPSPLS AKRRVLSRSA LQSHQPVARP 
       490        500        510        520        530        540 
VAMGLSRRQL PAVAPEPSVE EAPVPDLLGS ILSGQSLLMM SSADVVIHRD GSLSAKRAAP 
       550        560        570        580        590        600 
VSLQRNSVTQ SREESRLRDN PQPGALPSES ASGGFVGDRQ PNSGLSCGNR TALCCLPARI 
       610        620        630        640        650        660 
AQTPVRSDPS LTPRSGLSRT LSDENRPSRT HSSSPQLNGS NVRVSSASTK IVTHSSFPSK 
       670        680        690        700        710        720 
NTASGLPQRT GPRRPDFSKL PRIPKIHRDG NKSTQDQAPA SGHIVELPST CISRLTGREG 
       730        740        750        760        770        780 
PGQPGRGRVD SEPSSRGPQE TGSHTSGSRP PAPSSHGSLA HLGPSRGKGI GSSFESFRIN 
       790        800        810        820        830        840 
IPGNTAHCSQ LSSPGFCNTF RPVDSKVQRK ETPFPLFSIK KPKQLKSEIY DPFDPTGSDS 
       850        860        870        880        890        900 
SPPSSSPESL GPGLLPSEIT RTISINSPKA PAFQTVRCVT SYRVESIFGT EMEPEPQPPS 
       910        920        930        940        950        960 
EPVSGMLELL SKGSAEGTSD LEQEGLGEIE PTEIRGSTAR TQRPPPPDPW DDEDEVSCTP 
       970        980        990       1000       1010       1020 
FFGSEERTVT CVTVEEPGVL PSPDAPQITT HRIVEFRASS RSRSTSSSRS RKKTKKKKKK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
VAREHQRTRS STRSGSRDRT SRSVSPVAEE HTRRHRAKTK SRRSSSDRAS SQDRAKRRKD 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
RDDRDREHRR GSWGHGRCRR KSRSRSGSPG SSSCERHESK RRKRRHSGSR SRGSSLERDR 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
RHKHRERSRE RMDKQESVTR SRERRRWRSR SPSLEHRPRR PPSREKRAHS PEKKGPVREV 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SPAPATQGES RQDGDHSAEP PVSEVSVLPE VVSVLPEVVV ADLNPPEVPP VLAEPVAHVP 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
EDLDYGESVE AGHVFEDFSN EAIFIQLDDM SSPPSPESTD SSPERDFPPN PILPPASLPQ 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
DSTLPTIQRE VLPIHSEDIS KPVPQALAPS DQSLLKQDTV EITTTTPSTP AVVPMTKDSP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
VLSARGWEAV RPRDAVAQAP LLRSRTLVKR VTWNLQEAEH STPAALDRDP RTPLQRPQRP 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QEGDWDAEDR ALIGFQQAPF SELPPPIHVL QESGLPDADP SQPPGAPRAE GLPAAGTLHS 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
AGGILAQVYS PNMPPPLAQP SSILPYALVS QPSVQLILQG TLPLAGCGTA QSLAPVPTMP 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
ATVSELAVPT TNNSEERTAT PKTAAEKTKK EEYMKKLHMQ ERAVEEVKLA IKPFYQKREV 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
TKEEYKDILR KAVQKICHSK SGEINPVKVA NLVKAYVDKY RHMRRHKKTE GGEEPPTQGA 
   
ET



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    A6H619-1-unknown MDDDNL... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...QGAET 1682 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...QGAET 1682 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt80722

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)