TopFIND 4.0

A6NMZ7: Collagen alpha-6(VI) chain

General Information

Protein names
- Collagen alpha-6(VI) chain
Gene names COL6A6
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID A6NMZ7

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MMLLILFLVI ICSHISVNQD SGPEYADVVF LVDSSDRLGS KSFPFVKMFI TKMISSLPIE 
        70         80         90        100        110        120 
ADKYRVALAQ YSDKLHSEFH LSTFKGRSPM LNHLRKNFGF IGGSLQIGKA LQEAHRTYFS 
       130        140        150        160        170        180 
APANGRDKKQ FPPILVVLAS SESEDNVEEA SKALRKDGVK IISVGVQKAS EENLKAMATS 
       190        200        210        220        230        240 
QFHFNLRTVR DLSMFSQNMT HIIKDVIKYK EGAVDDIFVE ACQGPSMADV VFLLDMSING 
       250        260        270        280        290        300 
SEENFDYLKG FLEESVSALD IKENCMRVGL VAYSNETKVI NSLSMGINKS EVLQHIQNLS 
       310        320        330        340        350        360 
PRTGKAYTGA AIKKLRKEVF SARNGSRKNQ GVPQIAVLVT HRDSEDNVTK AAVNLRREGV 
       370        380        390        400        410        420 
TIFTLGIEGA SDTQLEKIAS HPAEQYVSKL KTFADLAAHN QTFLKKLRNQ ITHTVSVFSE 
       430        440        450        460        470        480 
RTETLKSGCV DTEEADIYLL IDGSGSTQAT DFHEMKTFLS EVVGMFNIAP HKVRVGAVQY 
       490        500        510        520        530        540 
ADSWDLEFEI NKYSNKQDLG KAIENIRQMG GNTNTGAALN FTLSLLQKAK KQRGNKVPCH 
       550        560        570        580        590        600 
LVVLTNGMSK DSILEPANRL REEHIRVYAI GIKEANQTQL REIAGEEKRV YYVHDFDALK 
       610        620        630        640        650        660 
DIRNQVVQEI CTEEACKEMK ADIMFLVDSS GSIGPENFSK MKTFMKNLVS KSQIGPDRVQ 
       670        680        690        700        710        720 
IGVVQFSDIN KEEFQLNRFM SQSDISNAID QMAHIGQTTL TGSALSFVSQ YFSPTKGARP 
       730        740        750        760        770        780 
NIRKFLILIT DGEAQDIVKE PAVVLRQEGV IIYSVGVFGS NVTQLEEISG RPEMVFYVEN 
       790        800        810        820        830        840 
FDILQRIEDD LVFGICSPRE ECKRIEVLDV VFVIDSSGSI DYDEYNIMKD FMIGLVKKAD 
       850        860        870        880        890        900 
VGKNQVRFGA LKYADDPEVL FYLDDFGTKL EVISVLQNDQ AMGGSTYTAE ALGFSDHMFT 
       910        920        930        940        950        960 
EARGSRLNKG VPQVLIVITD GESHDADKLN ATAKALRDKG ILVLAVGIDG ANPVELLAMA 
       970        980        990       1000       1010       1020 
GSSDKYFFVE TFGGLKGIFS DVTASVCNSS KVDCEIDKVD LVFLMDGSTS IQPNDFKKMK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
EFLASVVQDF DVSLNRVRIG AAQFSDTYHP EFPLGTFIGE KEISFQIENI KQIFGNTHIG 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
AALREVEHYF RPDMGSRINT GTPQVLLVLT DGQSQDEVAQ AAEALRHRGI DIYSVGIGDV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
DDQQLIQITG TAEKKLTVHN FDELKKVNKR IVRNICTTAG ESNCFVDVVV GFDVSTQEKG 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
QTLLEGQPWM ETYLQDILRA ISSLNGVSCE VGTETQVSVA FQVTNAMEKY SPKFEIYSEN 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
ILNSLKDITV KGPSLLNANL LDSLWDTFQN KSAARGKVVL LFSDGLDDDV EKLEQKSDEL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
RKEGLNALIT VALDGPADSS DLADLPYIEF GKGFEYRTQL SIGMRELGSR LSKQLVNVAE 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
RTCCCLFCKC IGGDGTMGDP GPPGKRGPPG FKGSEGYLGE EGIAGERGAP GPVGEQGTKG 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
CYGTKGPKGN RGLNGQEGEV GENGIDGLNG EQGDNGLPGR KGEKGDEGSQ GSPGKRGTPG 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
DRGAKGLRGD PGAPGVDSSI EGPTGLKGER GRQGRRGWPG PPGTPGSRRK TAAHGRRGHT 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
GPQGTAGIPG PDGLEGSLGL KGPQGPRGEA GVKGEKGGVG SKGPQGPPGP GGEAGNQGRL 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
GSQGNKGEPG DLGEKGAVGF PGPRGLQGND GSPGYGSVGR KGAKGQEGFP GESGPKGEIG 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
DPGGPGETGL KGARGKMISA GLPGEMGSPG EPGPPGRKGV KGAKGLASFS TCELIQYVRD 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
RSPGRHGKPE CPVHPTELVF ALDHSRDVTE QEFERMKEMM AFLVRDIKVR ENSCPVGAHI 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
AILSYNSHAR HLVRFSDAYK KSQLLREIET IPYERSSASR EIGRAMRFIS RNVFKRTLPG 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
AHTRKIATFF SSGQSADAHS ITTAAMEFGA LEIIPVVITF SNVPSVRRAF AIDDTGTFQV 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
IVVPSGADYI PALERLQRCT FCYDVCKPDA SCDQARPPPV QSYMDAAFLL DASRNMGSAE 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
FEDIRAFLGA LLDHFEITPE PETSVTGDRV ALLSHAPPDF LPNTQKSPVR AEFNLTTYRS 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
KRLMKRHVHE SVKQLNGDAF IGHALQWTLD NVFLSTPNLR RNKVIFVISA GETSHLDGEI 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
LKKESLRAKC QGYALFVFSL GPIWDDKELE DLASHPLDHH LVQLGRIHKP DHSYGVKFVK 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
SFINSIRRAI NKYPPINLKI KCNRLNSIDP KQPPRPFRSF VPGPLKATLK EDVLQKAKFF 
      2230       2240       2250       2260    
QDKKYLSRVA RSGRDDAIQN FMRSTSHTFK NGRMIESAPK QHD

Isoforms

- Isoform 2 of Collagen alpha-6(VI) chain

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MMLLILFLVI ICSHISVNQD SGPEYADVVF LVDSSDRLGS KSFPFVKMFI TKMISSLPIE 
        70         80         90        100        110        120 
ADKYRVALAQ YSDKLHSEFH LSTFKGRSPM LNHLRKNFGF IGGSLQIGKA LQEAHRTYFS 
       130        140        150        160        170        180 
APANGRDKKQ FPPILVVLAS SESEDNVEEA SKALRKDGVK IISVGVQKAS EENLKAMATS 
       190        200        210        220        230        240 
QFHFNLRTVR DLSMFSQNMT HIIKDVIKYK EGAVDDIFVE ACQGPSMADV VFLLDMSING 
       250        260        270        280        290        300 
SEENFDYLKG FLEESVSALD IKENCMRVGL VAYSNETKVI NSLSMGINKS EVLQHIQNLS 
       310        320        330        340        350        360 
PRTGKAYTGA AIKKLRKEVF SARNGSRKNQ GVPQIAVLVT HRDSEDNVTK AAVNLRREGV 
       370        380        390        400        410        420 
TIFTLGIEGA SDTQLEKIAS HPAEQYVSKL KTFADLAAHN QTFLKKLRNQ ITHTVSVFSE 
       430        440        450        460        470        480 
RTETLKSGCV DTEEADIYLL IDGSGSTQAT DFHEMKTFLS EVVGMFNIAP HKVRVGAVQY 
       490        500        510        520        530        540 
ADSWDLEFEI NKYSNKQDLG KAIENIRQMG GNTNTGAALN FTLSLLQKAK KQRGNKVPCH 
       550        560        570        580        590        600 
LVVLTNGMSK DSILEPANRL REEHIRVYAI GIKEANQTQL REIAGEEKRV YYVHDFDALK 
       610        620        630        640        650        660 
DIRNQVVQEI CTEEACKEMK ADIMFLVDSS GSIGPENFSK MKTFMKNLVS KSQIGPDRVQ 
       670        680        690        700        710        720 
IGVVQFSDIN KEEFQLNRFM SQSDISNAID QMAHIGQTTL TGSALSFVSQ YFSPTKGARP 
       730        740        750        760        770        780 
NIRKFLILIT DGEAQDIVKE PAVVLRQEGV IIYSVGVFGS NVTQLEEISG RPEMVFYVEN 
       790        800        810        820        830        840 
FDILQRIEDD LVFGICSPRE ECKRIEVLDV VFVIDSSGSI DYDEYNIMKD FMIGLVKKAD 
       850        860        870        880        890        900 
VGKNQVRFGA LKYADDPEVL FYLDDFGTKL EVISVLQNDQ AMGGSTYTAE ALGFSDHMFT 
       910        920        930        940        950        960 
EARGSRLNKG VPQVLIVITD GESHDADKLN ATAKALRDKG ILVLAVGIDG ANPVELLAMA 
       970        980        990       1000       1010       1020 
GSSDKYFFVE TFGGLKGIFS DVTASVCNSS KVDCEIDKVD LVFLMDGSTS IQPNDFKKMK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
EFLASVVQDF DVSLNRVRIG AAQFSDTYHP EFPLGTFIGE KEISFQIENI KQIFGNTHIG 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
AALREVEHYF RPDMGSRINT GTPQVLLVLT DGQSQDEVAQ AAEALRHRGI DIYSVGIGDV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
DDQQLIQITG TAEKKLTVHN FDELKKVNKR IVRNICTTAG ESNCFVDVVV GFDVSTQEKG 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
QTLLEGQPWM ETYLQDILRA ISSLNGVSCE VGTETQVSVA FQVTNAMEKY SPKFEIYSEN 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
ILNSLKDITV KGPSLLNANL LDSLWDTFQN KSAARGKVVL LFSDGLDDDV EKLEQKSDEL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
RKEGLNALIT VALDGPADSS DLADLPYIEF GKGFEYRTQL SIGMRELGSR LSKQLVNVAE 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
RTCCCLFCKC IGGDGTMGDP GPPGKRGPPG FKGSEGYLGE EGIAGERGAP GPVGEQGTKG 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
CYGTKGPKGN RGLNGQEGEV GENGIDGLNG EQGDNGLPGR KGEKGDEGSQ GSPGKRGTPG 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
DRGAKGLRGD PGAPGVDSSI EGPTGLKGER GRQGRRGWPG PPGTPGSRRK TAAHGRRGHT 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
GPQGTAGIPG PDGLEGSLGL KGPQGPRGEA GVKGEKGGVG SKGPQGPPGP GGEAGNQGRL 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
GSQGNKGEPG DLGEKGAVGF PGPRGLQGND GSPGYGSVGR KGAKGQEGFP GESGPKGEIG 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
DPGGPGETGL KGARGKMISA GLPGEMGSPG EPGPPGRKGV KGAKGLASFS TCELIQYVRD 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
RSPGRHGKPE CPVHPTELVF ALDHSRDVTE QEFERMKEMM AFLVRDIKVR ENSCPVGAHI 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
AILSYNSHAR HLVRFSDAYK KSQLLREIET IPYERSSASR EIGRAMRFIS RNVFKRTLPG 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
AHTRKIATFF SSGQSADAHS ITTAAMEFGA LEIIPVVITF SNVPSVRRAF AIDDTGTFQV 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
IVVPSGADYI PALERLQRCT FCYDVCKPDA SCDQARPPPV QSYMDAAFLL DASRNMGSAE 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
FEDIRAFLGA LLDHFEITPE PETSVTGDRV ALLSHAPPDF LPNTQKSPVR AEFNLTTYRS 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
KRLMKRHVHE SVKQLNGDAF IGHALQWTLD NVFLSTPNLR RNKVIFVISA GETSHLDGEI 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
LKKESLRAKC QGYALFVFSL GPIWDDKELE DLASHPLDHH LVQLGRIHKP DHSYGVKFVK 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
SFINSIRRAI NKYPPINLKI KCNRLNSIDP KQPPRPFRSF VPGPLKATLK EDVLQKAKFF 
      2230       2240       2250       2260    
QDKKYLSRVA RSGRDDAIQN FMRSTSHTFK NGRMIESAPK QHD



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    A6NMZ7-1-unknown MMLLIL... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt71287
    A6NMZ7-20-unknown DSGPEY... 20 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    A6NMZ7-20-unknown DSGPEY... 20 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt112392

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...PKQHD 2263 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)