TopFIND 4.0

A8TX70: Collagen alpha-5(VI) chain

General Information

Protein names
- Collagen alpha-5(VI) chain
- Collagen alpha-1(XXIX) chain
- von Willebrand factor A domain-containing protein 4
Gene names COL6A5
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID A8TX70

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MKILLIIFVL IIWTETLADQ SPGPGPVYAD VVFLVDSSDH LGPKSFPFVK TFINKMINSL 
        70         80         90        100        110        120 
PIEANKYRVA LAQYSDEFHS EFHLSTFKGR SPMLNHLKKN FQFIGGSLQI GKALQEAHRT 
       130        140        150        160        170        180 
YFSAPINGRD RKQFPPILVV LASAESEDEV EEASKALQKD GVKIISVGVQ KASEENLKAM 
       190        200        210        220        230        240 
ATSHFHFNLR TIRDLSTFSQ NMTQIIKDVT KYKEGAVDAD MQVHFPISCQ KDSLADLVFL 
       250        260        270        280        290        300 
VDESLGTGGN LRHLQTFLEN ITSSMDVKEN CMRLGLMSYS NSAKTISFLK SSTTQSEFQQ 
       310        320        330        340        350        360 
QIKNLSIQVG KSNTGAAIDQ MRRDGFSESY GSRRAQGVPQ IAVLVTHRPS DDEVHDAALN 
       370        380        390        400        410        420 
LRLEDVNVFA LSIQGANNTQ LEEIVSYPPE QTISTLKSYA DLETYSTKFL KKLQNEIWSQ 
       430        440        450        460        470        480 
ISTYAEQRNL DKTGCVDTKE ADIHFLIDGS SSIQEKQFEQ IKRFMLEVTE MFSIGPDKVR 
       490        500        510        520        530        540 
VGVVQYSDDT EVEFYITDYS NDIDLRKAIF NIKQLTGGTY TGKALDYILQ IIKNGMKDRM 
       550        560        570        580        590        600 
SKVPCYLIVL TDGMSTDRVV EPAKRLRAEQ ITVHAVGIGA ANKIELQEIA GKEERVSFGQ 
       610        620        630        640        650        660 
NFDALKSIKN EVVREICAEK GCEDMKADIM FLVDSSWSIG NENFRKMKIF MKNLLTKIQI 
       670        680        690        700        710        720 
GADKTQIGVV QFSDKTKEEF QLNRYFTQQE ISDAIDRMSL INEGTLTGKA LNFVGQYFTH 
       730        740        750        760        770        780 
SKGARLGAKK FLILITDGVA QDDVRDPARI LRGKDVTIFS VGVYNANRSQ LEEISGDSSL 
       790        800        810        820        830        840 
VFHVENFDHL KALERKLIFR VCALHDCKRI TLLDVVFVLD HSGSIKKQYQ DHMINLTIHL 
       850        860        870        880        890        900 
VKKADVGRDR VQFGALKYSD QPNILFYLNT YSNRSAIIEN LRKRRDTGGN TYTAKALKHA 
       910        920        930        940        950        960 
NALFTEEHGS RIKQNVKQML IVITDGESHD HDQLNDTALE LRNKGITIFA VGVGKANQKE 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LEGMAGNKNN TIYVDNFDKL KDVFTLVQER MCTEAPEVCH LQEADVIFLC DGSDRVSNSD 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
FVTMTTFLSD LIDNFDIQSQ RMKIGMAQFG SNYQSIIELK NSLTKTQWKT QIQNVSKSGG 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
FPRIDFALKK VSNMFNLHAG GRRNAGVPQT LVVITSGDPR YDVADAVKTL KDLGICVLVL 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
GIGDVYKEHL LPITGNSEKI ITFQDFDKLK NVDVKKRIIR EICQSCGKTN CFMDIVVGFD 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
ISTHVQGQPL FQGHPQLESY LPGILEDISS IKGVSCGAGT EAQVSLAFKV NSDQGFPAKF 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
QIYQKAVFDS LLQVNVSGPT HLNAQFLRSL WDTFKDKSAS RGQVLLIFSD GLQSESNIML 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
ENQSDRLREA GLDALLVVSL NTTAHHEFSS FEFGKRFDYR THLTIGMREL GKKLSQYLGN 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
IAERTCCCTF CKCPGIPGPH GTRGLQAMKG SQGLKGSRGH RGEDGNPGVR GDTGPQGDKG 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
IAGCPGAWGQ KGLKGFSGPK GGHGDDGIDG LDGEEGCHGF PGIKGEKGDP GSQGSPGSRG 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
APGQYGEKGF PGDPGNPGQN NNIKGQKGSK GEQGRQGRSG QKGVQGSPSS RGSRGREGQR 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
GLRGVSGEPG NPGPTGTLGA EGLQGPQGSQ GNPGRKGEKG SQGQKGPQGS PGLMGAKGST 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
GRPGLLGKKG EPGLPGDLGP VGQTGQRGRQ GDSGIPGYGQ MGRKGVKGPR GFPGDAGQKG 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
DIGNPGIPGG PGPKGFRGLA LTVGLKGEEG SRGLPGPPGQ RGIKGMAGQP VYSQCDLIRF 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
LREHSPCWKE KCPAYPTELV FALDNSYDVT EESFNKTRDI ITSIVNDLNI RENNCPVGAR 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
VAMVSYNSGT SYLIRWSDYN RKKQLLQQLS QIKYQDTTEP RDVGNAMRFV TRNVFKRTYA 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
GANVRRVAVF FSNGQTASRS SIITATMEFS ALDISPTVFA FDERVFLEAF GFDNTGTFQV 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
IPVPPNGENQ TLERLRRCAL CYDKCFPNAC IREAFLPEDS YMDVVFLIDN SRNIAKDEFK 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
AVKALVSSVI DNFNIASDPL ISDSGDRIAL LSYSPWESSR RKMGTVKTEF DFITYDNQLL 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
MKNHIQTSFQ QLNGEATIGR ALLWTTENLF PETPYLRKHK VIFVVSAGEN YERKEFVKMM 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
ALRAKCQGYV IFVISLGSTR KDDMEELASY PLDQHLIQLG RIHKPDLNYI AKFLKPFLYS 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
VRRGFNQYPP PMLEDACRLI NLGGENIQND GFQFVTELQE DFLGGNGFIG QELNSGRESP 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
FVKTEDNGSD YLVYLPSQMF EPQKLMINYE KDQKSAEIAS LTSGHENYGR KEEPDHTYEP 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
GDVSLQEYYM DVAFLIDASQ RVGSDEFKEV KAFITSVLDY FHIAPTPLTS TLGDRVAVLS 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
YSPPGYMPNT EECPVYLEFD LVTYNSIHQM KHHLQDSQQL NGDVFIGHAL QWTIDNVFVG 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
TPNLRKNKVI FVISAGETNS LDKDVLRNVS LRAKCQGYSI FVFSFGPKHN DKELEELASH 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
PLDHHLVQLG RTHKPDWNYI IKFVKPFVHL IRRAINKYPT EDMKATCVNM TSPNPENGGT 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
ENTVLLLPGI YEIKTENGDL FDEFDSQAQH LLVLGNNHSS GSETATDLMQ KLYLLFSTEK 
      2590       2600       2610    
LAMKDKEKAH LEEISALVVD KQQEKEDKEM EATDI

Isoforms

- Isoform 2 of Collagen alpha-5(VI) chain

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MKILLIIFVL IIWTETLADQ SPGPGPVYAD VVFLVDSSDH LGPKSFPFVK TFINKMINSL 
        70         80         90        100        110        120 
PIEANKYRVA LAQYSDEFHS EFHLSTFKGR SPMLNHLKKN FQFIGGSLQI GKALQEAHRT 
       130        140        150        160        170        180 
YFSAPINGRD RKQFPPILVV LASAESEDEV EEASKALQKD GVKIISVGVQ KASEENLKAM 
       190        200        210        220        230        240 
ATSHFHFNLR TIRDLSTFSQ NMTQIIKDVT KYKEGAVDAD MQVHFPISCQ KDSLADLVFL 
       250        260        270        280        290        300 
VDESLGTGGN LRHLQTFLEN ITSSMDVKEN CMRLGLMSYS NSAKTISFLK SSTTQSEFQQ 
       310        320        330        340        350        360 
QIKNLSIQVG KSNTGAAIDQ MRRDGFSESY GSRRAQGVPQ IAVLVTHRPS DDEVHDAALN 
       370        380        390        400        410        420 
LRLEDVNVFA LSIQGANNTQ LEEIVSYPPE QTISTLKSYA DLETYSTKFL KKLQNEIWSQ 
       430        440        450        460        470        480 
ISTYAEQRNL DKTGCVDTKE ADIHFLIDGS SSIQEKQFEQ IKRFMLEVTE MFSIGPDKVR 
       490        500        510        520        530        540 
VGVVQYSDDT EVEFYITDYS NDIDLRKAIF NIKQLTGGTY TGKALDYILQ IIKNGMKDRM 
       550        560        570        580        590        600 
SKVPCYLIVL TDGMSTDRVV EPAKRLRAEQ ITVHAVGIGA ANKIELQEIA GKEERVSFGQ 
       610        620        630        640        650        660 
NFDALKSIKN EVVREICAEK GCEDMKADIM FLVDSSWSIG NENFRKMKIF MKNLLTKIQI 
       670        680        690        700        710        720 
GADKTQIGVV QFSDKTKEEF QLNRYFTQQE ISDAIDRMSL INEGTLTGKA LNFVGQYFTH 
       730        740        750        760        770        780 
SKGARLGAKK FLILITDGVA QDDVRDPARI LRGKDVTIFS VGVYNANRSQ LEEISGDSSL 
       790        800        810        820        830        840 
VFHVENFDHL KALERKLIFR VCALHDCKRI TLLDVVFVLD HSGSIKKQYQ DHMINLTIHL 
       850        860        870        880        890        900 
VKKADVGRDR VQFGALKYSD QPNILFYLNT YSNRSAIIEN LRKRRDTGGN TYTAKALKHA 
       910        920        930        940        950        960 
NALFTEEHGS RIKQNVKQML IVITDGESHD HDQLNDTALE LRNKGITIFA VGVGKANQKE 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LEGMAGNKNN TIYVDNFDKL KDVFTLVQER MCTEAPEVCH LQEADVIFLC DGSDRVSNSD 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
FVTMTTFLSD LIDNFDIQSQ RMKIGMAQFG SNYQSIIELK NSLTKTQWKT QIQNVSKSGG 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
FPRIDFALKK VSNMFNLHAG GRRNAGVPQT LVVITSGDPR YDVADAVKTL KDLGICVLVL 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
GIGDVYKEHL LPITGNSEKI ITFQDFDKLK NVDVKKRIIR EICQSCGKTN CFMDIVVGFD 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
ISTHVQGQPL FQGHPQLESY LPGILEDISS IKGVSCGAGT EAQVSLAFKV NSDQGFPAKF 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
QIYQKAVFDS LLQVNVSGPT HLNAQFLRSL WDTFKDKSAS RGQVLLIFSD GLQSESNIML 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
ENQSDRLREA GLDALLVVSL NTTAHHEFSS FEFGKRFDYR THLTIGMREL GKKLSQYLGN 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
IAERTCCCTF CKCPGIPGPH GTRGLQAMKG SQGLKGSRGH RGEDGNPGVR GDTGPQGDKG 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
IAGCPGAWGQ KGLKGFSGPK GGHGDDGIDG LDGEEGCHGF PGIKGEKGDP GSQGSPGSRG 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
APGQYGEKGF PGDPGNPGQN NNIKGQKGSK GEQGRQGRSG QKGVQGSPSS RGSRGREGQR 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
GLRGVSGEPG NPGPTGTLGA EGLQGPQGSQ GNPGRKGEKG SQGQKGPQGS PGLMGAKGST 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
GRPGLLGKKG EPGLPGDLGP VGQTGQRGRQ GDSGIPGYGQ MGRKGVKGPR GFPGDAGQKG 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
DIGNPGIPGG PGPKGFRGLA LTVGLKGEEG SRGLPGPPGQ RGIKGMAGQP VYSQCDLIRF 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
LREHSPCWKE KCPAYPTELV FALDNSYDVT EESFNKTRDI ITSIVNDLNI RENNCPVGAR 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
VAMVSYNSGT SYLIRWSDYN RKKQLLQQLS QIKYQDTTEP RDVGNAMRFV TRNVFKRTYA 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
GANVRRVAVF FSNGQTASRS SIITATMEFS ALDISPTVFA FDERVFLEAF GFDNTGTFQV 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
IPVPPNGENQ TLERLRRCAL CYDKCFPNAC IREAFLPEDS YMDVVFLIDN SRNIAKDEFK 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
AVKALVSSVI DNFNIASDPL ISDSGDRIAL LSYSPWESSR RKMGTVKTEF DFITYDNQLL 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
MKNHIQTSFQ QLNGEATIGR ALLWTTENLF PETPYLRKHK VIFVVSAGEN YERKEFVKMM 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
ALRAKCQGYV IFVISLGSTR KDDMEELASY PLDQHLIQLG RIHKPDLNYI AKFLKPFLYS 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
VRRGFNQYPP PMLEDACRLI NLGGENIQND GFQFVTELQE DFLGGNGFIG QELNSGRESP 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
FVKTEDNGSD YLVYLPSQMF EPQKLMINYE KDQKSAEIAS LTSGHENYGR KEEPDHTYEP 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
GDVSLQEYYM DVAFLIDASQ RVGSDEFKEV KAFITSVLDY FHIAPTPLTS TLGDRVAVLS 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
YSPPGYMPNT EECPVYLEFD LVTYNSIHQM KHHLQDSQQL NGDVFIGHAL QWTIDNVFVG 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
TPNLRKNKVI FVISAGETNS LDKDVLRNVS LRAKCQGYSI FVFSFGPKHN DKELEELASH 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
PLDHHLVQLG RTHKPDWNYI IKFVKPFVHL IRRAINKYPT EDMKATCVNM TSPNPENGGT 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
ENTVLLLPGI YEIKTENGDL FDEFDSQAQH LLVLGNNHSS GSETATDLMQ KLYLLFSTEK 
      2590       2600       2610    
LAMKDKEKAH LEEISALVVD KQQEKEDKEM EATDI



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    A8TX70-1-unknown MKILLI... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt71286
    A8TX70-19-unknown DQSPGP... 19 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    A8TX70-19-unknown DQSPGP... 19 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt112141

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...EATDI 2615 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)