TopFIND 4.0

D3ZA12: Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 6

General Information

Protein names
- Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 6
- CHD-6
- 3.6.4.12
- ATP-dependent helicase CHD6

Gene names Chd6
Organism Rattus norvegicus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID D3ZA12

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MKMKIQKKEK QLSKLRALNH SPMSDASVNF DYKSPSPFDC SPDQGENIEE AANHCLPQKD 
        70         80         90        100        110        120 
FYTTEEEADT LFSRKLMSHN GMEDNGGRGT GVKKKRKKKE PGEQEGTKAS KDREPKPKRK 
       130        140        150        160        170        180 
REPKEPKEPR RAKEPKRAKE PKEAKQKDGV KKPRKPREAS GTKEGKEKRS CTDCGPRTKP 
       190        200        210        220        230        240 
KKASKDQGPT PVERKKKGKR KNETTVESLE LDQSLPNPSL QSPEEPSESA DSQKRRSGRQ 
       250        260        270        280        290        300 
VKRRKYNEDL DFKVVDDDGE TIAVLGAGRT SALSASTLAW QAEEPPEDDA NIIEKILASK 
       310        320        330        340        350        360 
TVQEVHPGEP PFDLELFYVK YRNFSYLHCK WATMEELEKD PRIAQKIKRF RNKQAQMKHI 
       370        380        390        400        410        420 
FTEPDEDLFN PDYIEIDRIL EVAHTKDAET GEEVTHYLVK WCSLPYEEST WELEEDVDPA 
       430        440        450        460        470        480 
KVKEFESLQI LPEVKPVERP ASDAWQKLET SREYKNSNRL REYQLEGMNW LLFNWYNRKN 
       490        500        510        520        530        540 
CILADEMGLG KTIQSIAFLS EIFVRGIHGP FLIIAPLSTI TNWEREFRTW TEMNAIVYHG 
       550        560        570        580        590        600 
SQISRQMIQQ YEMVYRDAQG NPLSGVFKFH VVITTFEMIL ADCPELKKIH WSCVVIDEAH 
       610        620        630        640        650        660 
RLKNRNCKLL EGLKLMALEH KVLLTGTPLQ NSVEELFSLL NFLEPSQFPS ETAFLEEFGD 
       670        680        690        700        710        720 
LKTEEQVKKL QSILKPMMLR RLKDDVEKNL APKQETIIEV ELTNIQKKYY RAILEKNFSF 
       730        740        750        760        770        780 
LTKGANQHNM PNLINTMMEL RKCCNHPYLI NGAEEKILED FRKAHSSEAS DFQLQAMIQA 
       790        800        810        820        830        840 
AGKLVLIDKL LPKLIAGGHK VLIFSQMVRC LDILEDYLIQ RRYTYERIDG RVRGNLRQAA 
       850        860        870        880        890        900 
IDRFCKPDSD RFVFLLCTRA GGLGINLTAA DTCIIFDSDW NPQNDLQAQA RCHRIGQSKA 
       910        920        930        940        950        960 
VKVYRLITRN SYEREMFDKA SLKLGLDKAI LQDINRKGST NGVQQLSKME VEDLLRKGAY 
       970        980        990       1000       1010       1020 
GALMDEEDEG SKFCEEDIDQ ILQRRTHTIT IQSEGKGSTF AKASFVASGN RTDISLDDPN 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
FWQKWAKIAE LDTEANNEKE SLVIDRPRVR KQTKHYNSFE EDELMEFSEL DSDSDERPTR 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SRRLSDKARR YLRAECFRVE KNLLTFGWGR WKDILTHGRF KWPLNEKDME VICRALLVYC 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
VKHYKGDEKI KSFIWELITP SKDGQVQTLQ NHSGLSAPVP RGRKGKKTKN QLLLPELKTA 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
DWLATCNPEV VLHDDGYKKH LKQHCNKVLL RVRMLYYLKA EILGEAADKA FEGTPARELD 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
VLLPDIDYVE IPVDWWDAEA DKSLLIGVFK HGYERYNAMR ADPALCFLEK VGMPDEKSLS 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
AEQGVTDGTS DIPERGNIDK EDSAEDKVDG LQKQTASPSD GSDGIFGEKK DDSQAVSSAL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
TARLRRLVTI YQRCNRKELC RPEILGPGNQ GYWVQEEVFR RTSDMDLINK EAQKRWTRRE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QADFYRTVSS FGVVYDQEKE AFDWTQFRAI SRLDKKSDEN LEHYFHSFVA MCRNVCRLPT 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
WKDDGPPDAS IYVEPITEER AAKTLYRIEL LRKVREQVLT CPQLHERLQL CRPSLYLPVW 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
WECGKHDRDL LIGTAKHGLN RTDYYIMNDP QLSFLDAYRN YAQHKRTDTQ APGSLCCLYQ 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
GNSKLYESLT YTPMSRTSES LESEPENLVK MDSRDDHLCL PEAGLPDITC ENFVSKVQEV 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
ISLDHDESLL PESLENMMYG KTGLSQEPRS FQEAPSTNMQ SRKKTVTVSA SRDESCQLPG 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
IEAEITSASS LMSSLEAGVA KMNIKNGKHL LVSISEEGEP CCSETGRSPE SRGRLEARCL 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
ASPTLDTGHE SGFVDLCSLS VYDSKRNFSS DQQLIDLLEN KSLENKLILN QSDEEEEENE 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
KETLAIVAST TEKPAVLDFT QPTASIPRGK NLSFHQDEAK KGRLEVGSKT PGPQRAFPPS 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
ANQCHCKHIE RWAHGLGSEE SEGEKPKAYE PDPYRSKANN TTVEGEPAII PTEPFKLKHE 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
LLKEPWKESS EGGKSFSMYV PEGSEPKSEE MDFENKDDYE KDGACHSQDY PGKYSEEESK 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
SSASGIAGDL GEEAQEVRAP TIAQLLQEKT LYSFSEWPKD RVIINRLDNI CHVVLKGKWP 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
CSHQYEPSGA LPTPVLSSSA GSRSSLSEPE ATEHSFSNGA ALAAQIQKES FLAPVFTKDE 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
QKHRRPYEFE VERDAKARSL EEYSASHGRP PIVLNGWHGE SAIDLSCSSE GSPGATSPFP 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
VSASTPKIGA ISSLQGALGM DLSGILQAGL IHPVTGQIVN GSLRRDDAAM RRRRGRRKHI 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
EGGMDLIFLK EQTLQAGILE VHEDAGQTTL NTTHPEGPGA ASSASEPTAA ASSQAEKAVP 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
SKSLLDWLRQ QADYSLDVPG FGASFSDKPK QRRPRCKEPG KLDIGSLGGE ERVSAVPKEP 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
GLRGFLPESK FNHTLAEPVL RDAGPRRRGR RPRNELLKAP AIVADSPSGM GPLFMNGLIA 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
GMDLVGLQNV RNIPGIPLTG LVGFPAGFAT MPTGEDVKNT LSMLPMMLPG MATVPQMFGV 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
GGLLNTPMAT TCTTTASASL ASTKSGASAT EKTTEDELSG RDVKADSLVE DKPGPSPFSD 
      2590       2600       2610       2620       2630       2640 
QSEPTITTSS PVAFNPFLIP GVSPGLIYPS MFLSPGMGMA LPAMQQGRHS EMAGLETQKR 
      2650       2660       2670       2680       2690    
KKKKTKGDNP TPEPASVCER EPGSDQNCTE SSVTVSPERE HVAQAREEGL KDSNDDTN

Isoforms



Sequence View



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    D3ZA12-1-unknown MKMKIQ... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...NDDTN 2698 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)