TopFIND 4.0

F4IFN6: DNA polymerase epsilon catalytic subunit B

General Information

Protein names
- DNA polymerase epsilon catalytic subunit B
- 2.7.7.7
- DNA polymerase 2 b
- AtPOL2b
- DNA polymerase II subunit b
- Protein TILTED 2
Gene names POL2B
Organism Arabidopsis thaliana
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID F4IFN6

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MSGRRCDRRL NVQKVSAADE LETKLGFGLF SQGETRLGWL LTFASSSWED ADTGKTFSCV 
        70         80         90        100        110        120 
DLFFVTQDGS SFKTKYKFRP YLYAATKDNM ELEVEAYLRR RYERQVADIQ IVHKEDLYLK 
       130        140        150        160        170        180 
NHLSGLQKKY LKVSFDTVQQ LVEVKRDLLH IVERNLAKFN ALEAYESILS GKREQRPQDC 
       190        200        210        220        230        240 
LDSVVDLREY DVPYHVRFAI DNDVRSGQWY NVSISSTDVI LEKRTDLLQR AEVRVCAFDI 
       250        260        270        280        290        300 
ETVKLPLKFP DAEYDQIMMI SYMVDGQGFL ITNRECVGKD IEDLEYTPKP EFEGYFKVTN 
       310        320        330        340        350        360 
VTNEVELLRK WFSHMQELKP GIYVTYNGDF FDWPFIERRA SHHGIKMNEE LGFRCDQNQG 
       370        380        390        400        410        420 
ECRAKFVCHL DCFSWVKRDS YLPQGSQGLK AVTKVKLGYD PLEVNPEDMV RFAMEKPQTM 
       430        440        450        460        470        480 
ASYSVSDAVA TYYLYMTYVH PFVFSLATII PMVPDEVLRK GSGTLCEMLL MVEAYKANVV 
       490        500        510        520        530        540 
CPNKNQADPE KFYQGKLLES ETYIGGHVEC LQSGVFRSDI PTSFKLDASA YQQLIDNLGR 
       550        560        570        580        590        600 
DLEYAITVEG KMRMDSVSNF DEVKEVIREK LEKLRDDPIR EEGPLIYHLD VAAMYPNIIL 
       610        620        630        640        650        660 
TNRLQPPSIV TDEVCTACDF NGPEKTCLRK LEWVWRGVTF KGNKSEYYHL KKQIESESVD 
       670        680        690        700        710        720 
AGANMQSSKP FLDLPKVEQQ SKLKERLKKY CQKAYSRVLD KPITEVREAG ICMRENPFYV 
       730        740        750        760        770        780 
DTVRSFRDRR YEYKTLNKVW KGKLSEAKAS GNLIKIQEAH DMVVVYDSLQ LAHKCILNSF 
       790        800        810        820        830        840 
YGYVMRKGAR WYSMEMAGVV TYTGAKIIQN ARLLIERIGK PLELDTDGIW CALPGSFPEN 
       850        860        870        880        890        900 
FTFKTIDMKK FTISYPCVIL NVDVAKNNSN DQYQTLVDPV RKTYNSRSEC SIEFEVDGPY 
       910        920        930        940        950        960 
KAMIIPASKE EGILIKKRYA VFNHDGTIAE LKGFEMKRRG ELKLIKVFQA ELFDKFLHGS 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TLEECYSAVA AVANRWLDLL EGQGKDIADS ELLDYISESS TMSKSLADYG QQKSCAVTTA 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KRLADFLGDT MVKDKGLRCQ YIVAREPEGT PVSERAVPVA IFQTDDPEKK FYLQKWCKIS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SYTGIRSIID WMYYKQRLHS AIQKVITIPA AMQKVANPVL RVRHPYWLEK KVCDKFRQGK 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
IVDMFSSANK DHSTTQDNVV ADIEEFCKEN RPSVKGPKPV ARSFEVDRNH SEGKQQESWD 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PEFHDISLQN VDKNVDYQGW LELEKRKWKM TLTNKKKRRY SSSLFGFDLE QNINKKVCKG 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RVGVGSYFRR PEEALTSSYL QIIQLVQSPQ SGQFFAWVVV EGLMLKIPLT IPRVFYINSK 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
ASIAGNFTGK CINKILPHGK PCYNLMEVNI QEDQFIKESK KLAALLADPE IEGIYETKMP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LEFSAICQIG CVCKIEDTAK HRNTQDGWKL GELHRITTTE CRYLENSIPL VYLYHSTSTG 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
RAVYVLYCHA SKLMSVVVVN PYGDKELLSS ALERQFRDRC QELSPEPFSW DGILFQVEYV 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
DHPEAATKFL QKALCEYREE NCGATVAVIE CPDFNTTKEG VKALEDFPCV RIPFNDDDNS 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
YQPVSWQRPA AKIAVLRCAS AIQWLDRRIA QSRYAHVPLG NFGRDWLTFT VDIFLSRALR 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
DQQQVLWVSD NGVPDLGDIN NEETFLADET SLLFPGAYRK VSVELKVHRL AVNALLKSDL 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
VSEMEGGGFL GVNSRGSSLN DNGSFDENNG CAQAFRVLKQ LIKRLLHDAC NSGNIYADSI 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
LQHLSWWLRS PSSKLHDPAL HLMLHKVMQK VFALLLTDLR RLGAIIIYAD FSKVIIDTGK 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
FDLSAAKTYC ESLLTVMGSR DIFKLILLEP VHYWHSLLFM DQHNYAGIRA TGDEISGNEV 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
TIEPKWSVAR HLPEYIQKDF IIIVATFIFG PWKFALEKKR GSAESLEAEM VEYLKEQIGT 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
RFISMIVEKI GNIRSHIKDI NVSDASWASG QAPKGDYTFE FIQIITAVLA LDQNVQQDVL 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
VMRKILLKYI KVKECAAEAE FIDPGPSFIL PNVACSNCGA YRDLDFCRDS ALLTEKEWSC 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
ADPQCVKIYD KEQIESSIIQ MVRQRERMYQ LQDLVCNRCN QVKAAHLTEQ CECSGSFRCK 
      2110       2120       2130    
ESGSDFHKRI EIFLDIAKRQ KFRLLEECIS WILFATSC

Isoforms



Sequence View



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    F4IFN6-1-unknown MSGRRC... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...FATSC 2138 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)