TopFIND 4.0

F4IPE3: Zinc finger protein SHOOT GRAVITROPISM 5 {ECO:0000303|PubMed:9210330}

General Information

Protein names
- Zinc finger protein SHOOT GRAVITROPISM 5 {ECO:0000303|PubMed:9210330}
- Protein indeterminate-domain 15 {ECO:0000303|PubMed:16784536}
- AtIDD15 {ECO:0000303|PubMed:16784536}

Gene names SGR5
Organism Arabidopsis thaliana
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID F4IPE3

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MRTDQVMLSN KNTNTCCVVS SSSSDPFLSS SENGVTTTNT STQKRKRRPA GTPDPDAEVV 
        70         80         90        100        110        120 
SLSPRTLLES DRYICEICNQ GFQRDQNLQM HRRRHKVPWK LLKRDNNIEV KKRVYVCPEP 
       130        140        150        160        170        180 
TCLHHNPCHA LGDLVGIKKH FRRKHSNHKQ WVCERCSKGY AVQSDYKAHL KTCGTRGHSC 
       190        200        210        220        230        240 
DCGRVFSRVE SFIEHQDNCS ARRVHREPPR PPQTAVTVPA CSSRTASTVS TPSSETNYGG 
       250        260        270        280        290        300 
TVAVTTPQPL EGRPIHQRIS SSILTNSSNN LNLELQLLPL SSNQNPNQEN QQQKVKEPSH 
       310        320        330        340        350        360 
HHNHNHDTTN LNLSIAPSSS YQHYNNFDRI KEIMASEQIM KIAMKEKAYA EEAKREAKRQ 
       370        380        390        400        410        420 
REIAENEFAN AKKIRQKAQA ELERAKFLKE QSMKKISSTI MQVTCQTCKG QFQAVAVPAA 
       430        440    
TADETSLVVS YMSSANTDGE LENGF

Isoforms

- Isoform 2 of Protein SHOOT GRAVITROPISM 5 - Isoform 3 of Protein SHOOT GRAVITROPISM 5 - Isoform 2 of Zinc finger protein SHOOT GRAVITROPISM 5 - Isoform 3 of Zinc finger protein SHOOT GRAVITROPISM 5

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MRTDQVMLSN KNTNTCCVVS SSSSDPFLSS SENGVTTTNT STQKRKRRPA GTPDPDAEVV 
        70         80         90        100        110        120 
SLSPRTLLES DRYICEICNQ GFQRDQNLQM HRRRHKVPWK LLKRDNNIEV KKRVYVCPEP 
       130        140        150        160        170        180 
TCLHHNPCHA LGDLVGIKKH FRRKHSNHKQ WVCERCSKGY AVQSDYKAHL KTCGTRGHSC 
       190        200        210        220        230        240 
DCGRVFSRVE SFIEHQDNCS ARRVHREPPR PPQTAVTVPA CSSRTASTVS TPSSETNYGG 
       250        260        270        280        290        300 
TVAVTTPQPL EGRPIHQRIS SSILTNSSNN LNLELQLLPL SSNQNPNQEN QQQKVKEPSH 
       310        320        330        340        350        360 
HHNHNHDTTN LNLSIAPSSS YQHYNNFDRI KEIMASEQIM KIAMKEKAYA EEAKREAKRQ 
       370        380        390        400        410        420 
REIAENEFAN AKKIRQKAQA ELERAKFLKE QSMKKISSTI MQVTCQTCKG QFQAVAVPAA 
       430        440    
TADETSLVVS YMSSANTDGE LENGF         10         20         30         40         50         60 
MRTDQVMLSN KNTNTCCVVS SSSSDPFLSS SENGVTTTNT STQKRKRRPA GTPDPDAEVV 
        70         80         90        100        110        120 
SLSPRTLLES DRYICEICNQ GFQRDQNLQM HRRRHKVPWK LLKRDNNIEV KKRVYVCPEP 
       130        140        150        160        170        180 
TCLHHNPCHA LGDLVGIKKH FRRKHSNHKQ WVCERCSKGY AVQSDYKAHL KTCGTRGHSC 
       190        200        210        220        230        240 
DCGRVFSRVE SFIEHQDNCS ARRVHREPPR PPQTAVTVPA CSSRTASTVS TPSSETNYGG 
       250        260        270        280        290        300 
TVAVTTPQPL EGRPIHQRIS SSILTNSSNN LNLELQLLPL SSNQNPNQEN QQQKVKEPSH 
       310        320        330        340        350        360 
HHNHNHDTTN LNLSIAPSSS YQHYNNFDRI KEIMASEQIM KIAMKEKAYA EEAKREAKRQ 
       370        380        390        400        410        420 
REIAENEFAN AKKIRQKAQA ELERAKFLKE QSMKKISSTI MQVTCQTCKG QFQAVAVPAA 
       430        440    
TADETSLVVS YMSSANTDGE LENGF         10         20         30         40         50         60 
MRTDQVMLSN KNTNTCCVVS SSSSDPFLSS SENGVTTTNT STQKRKRRPA GTPDPDAEVV 
        70         80         90        100        110        120 
SLSPRTLLES DRYICEICNQ GFQRDQNLQM HRRRHKVPWK LLKRDNNIEV KKRVYVCPEP 
       130        140        150        160        170        180 
TCLHHNPCHA LGDLVGIKKH FRRKHSNHKQ WVCERCSKGY AVQSDYKAHL KTCGTRGHSC 
       190        200        210        220        230        240 
DCGRVFSRVE SFIEHQDNCS ARRVHREPPR PPQTAVTVPA CSSRTASTVS TPSSETNYGG 
       250        260        270        280        290        300 
TVAVTTPQPL EGRPIHQRIS SSILTNSSNN LNLELQLLPL SSNQNPNQEN QQQKVKEPSH 
       310        320        330        340        350        360 
HHNHNHDTTN LNLSIAPSSS YQHYNNFDRI KEIMASEQIM KIAMKEKAYA EEAKREAKRQ 
       370        380        390        400        410        420 
REIAENEFAN AKKIRQKAQA ELERAKFLKE QSMKKISSTI MQVTCQTCKG QFQAVAVPAA 
       430        440    
TADETSLVVS YMSSANTDGE LENGF         10         20         30         40         50         60 
MRTDQVMLSN KNTNTCCVVS SSSSDPFLSS SENGVTTTNT STQKRKRRPA GTPDPDAEVV 
        70         80         90        100        110        120 
SLSPRTLLES DRYICEICNQ GFQRDQNLQM HRRRHKVPWK LLKRDNNIEV KKRVYVCPEP 
       130        140        150        160        170        180 
TCLHHNPCHA LGDLVGIKKH FRRKHSNHKQ WVCERCSKGY AVQSDYKAHL KTCGTRGHSC 
       190        200        210        220        230        240 
DCGRVFSRVE SFIEHQDNCS ARRVHREPPR PPQTAVTVPA CSSRTASTVS TPSSETNYGG 
       250        260        270        280        290        300 
TVAVTTPQPL EGRPIHQRIS SSILTNSSNN LNLELQLLPL SSNQNPNQEN QQQKVKEPSH 
       310        320        330        340        350        360 
HHNHNHDTTN LNLSIAPSSS YQHYNNFDRI KEIMASEQIM KIAMKEKAYA EEAKREAKRQ 
       370        380        390        400        410        420 
REIAENEFAN AKKIRQKAQA ELERAKFLKE QSMKKISSTI MQVTCQTCKG QFQAVAVPAA 
       430        440    
TADETSLVVS YMSSANTDGE LENGF



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)