TopFIND 4.0

O15054: Lysine-specific demethylase 6B

General Information

Protein names
- Lysine-specific demethylase 6B
- 1.14.11.- {ECO:0000269|PubMed:17713478, ECO:0000269|PubMed:17825402, ECO:0000269|PubMed:17851529, ECO:0000269|PubMed:18003914}
- JmjC domain-containing protein 3
- Jumonji domain-containing protein 3
- Lysine demethylase 6B
Gene names KDM6B
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID O15054

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MHRAVDPPGA RAAREAFALG GLSCAGAWSS CPPHPPPRSA WLPGGRCSAS IGQPPLPAPL 
        70         80         90        100        110        120 
PPSHGSSSGH PSKPYYAPGA PTPRPLHGKL ESLHGCVQAL LREPAQPGLW EQLGQLYESE 
       130        140        150        160        170        180 
HDSEEATRCY HSALRYGGSF AELGPRIGRL QQAQLWNFHT GSCQHRAKVL PPLEQVWNLL 
       190        200        210        220        230        240 
HLEHKRNYGA KRGGPPVKRA AEPPVVQPVP PAALSGPSGE EGLSPGGKRR RGCNSEQTGL 
       250        260        270        280        290        300 
PPGLPLPPPP LPPPPPPPPP PPPPLPGLAT SPPFQLTKPG LWSTLHGDAW GPERKGSAPP 
       310        320        330        340        350        360 
ERQEQRHSLP HPYPYPAPAY TAHPPGHRLV PAAPPGPGPR PPGAESHGCL PATRPPGSDL 
       370        380        390        400        410        420 
RESRVQRSRM DSSVSPAATT ACVPYAPSRP PGLPGTTTSS SSSSSSNTGL RGVEPNPGIP 
       430        440        450        460        470        480 
GADHYQTPAL EVSHHGRLGP SAHSSRKPFL GAPAATPHLS LPPGPSSPPP PPCPRLLRPP 
       490        500        510        520        530        540 
PPPAWLKGPA CRAAREDGEI LEELFFGTEG PPRPAPPPLP HREGFLGPPA SRFSVGTQDS 
       550        560        570        580        590        600 
HTPPTPPTPT TSSSNSNSGS HSSSPAGPVS FPPPPYLARS IDPLPRPPSP AQNPQDPPLV 
       610        620        630        640        650        660 
PLTLALPPAP PSSCHQNTSG SFRRPESPRP RVSFPKTPEV GPGPPPGPLS KAPQPVPPGV 
       670        680        690        700        710        720 
GELPARGPRL FDFPPTPLED QFEEPAEFKI LPDGLANIMK MLDESIRKEE EQQQHEAGVA 
       730        740        750        760        770        780 
PQPPLKEPFA SLQSPFPTDT APTTTAPAVA VTTTTTTTTT TTATQEEEKK PPPALPPPPP 
       790        800        810        820        830        840 
LAKFPPPSQP QPPPPPPPSP ASLLKSLASV LEGQKYCYRG TGAAVSTRPG PLPTTQYSPG 
       850        860        870        880        890        900 
PPSGATALPP TSAAPSAQGS PQPSASSSSQ FSTSGGPWAR ERRAGEEPVP GPMTPTQPPP 
       910        920        930        940        950        960 
PLSLPPARSE SEVLEEISRA CETLVERVGR SATDPADPVD TAEPADSGTE RLLPPAQAKE 
       970        980        990       1000       1010       1020 
EAGGVAAVSG SCKRRQKEHQ KEHRRHRRAC KDSVGRRPRE GRAKAKAKVP KEKSRRVLGN 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LDLQSEEIQG REKSRPDLGG ASKAKPPTAP APPSAPAPSA QPTPPSASVP GKKAREEAPG 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
PPGVSRADML KLRSLSEGPP KELKIRLIKV ESGDKETFIA SEVEERRLRM ADLTISHCAA 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
DVVRASRNAK VKGKFRESYL SPAQSVKPKI NTEEKLPREK LNPPTPSIYL ESKRDAFSPV 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
LLQFCTDPRN PITVIRGLAG SLRLNLGLFS TKTLVEASGE HTVEVRTQVQ QPSDENWDLT 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GTRQIWPCES SRSHTTIAKY AQYQASSFQE SLQEEKESED EESEEPDSTT GTPPSSAPDP 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
KNHHIIKFGT NIDLSDAKRW KPQLQELLKL PAFMRVTSTG NMLSHVGHTI LGMNTVQLYM 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
KVPGSRTPGH QENNNFCSVN INIGPGDCEW FAVHEHYWET ISAFCDRHGV DYLTGSWWPI 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
LDDLYASNIP VYRFVQRPGD LVWINAGTVH WVQATGWCNN IAWNVGPLTA YQYQLALERY 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
EWNEVKNVKS IVPMIHVSWN VARTVKISDP DLFKMIKFCL LQSMKHCQVQ RESLVRAGKK 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
IAYQGRVKDE PAYYCNECDV EVFNILFVTS ENGSRNTYLV HCEGCARRRS AGLQGVVVLE 
      1630       1640    
QYRTEELAQA YDAFTLAPAS TSR

Isoforms

- Isoform 1 of Lysine-specific demethylase 6B

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MHRAVDPPGA RAAREAFALG GLSCAGAWSS CPPHPPPRSA WLPGGRCSAS IGQPPLPAPL 
        70         80         90        100        110        120 
PPSHGSSSGH PSKPYYAPGA PTPRPLHGKL ESLHGCVQAL LREPAQPGLW EQLGQLYESE 
       130        140        150        160        170        180 
HDSEEATRCY HSALRYGGSF AELGPRIGRL QQAQLWNFHT GSCQHRAKVL PPLEQVWNLL 
       190        200        210        220        230        240 
HLEHKRNYGA KRGGPPVKRA AEPPVVQPVP PAALSGPSGE EGLSPGGKRR RGCNSEQTGL 
       250        260        270        280        290        300 
PPGLPLPPPP LPPPPPPPPP PPPPLPGLAT SPPFQLTKPG LWSTLHGDAW GPERKGSAPP 
       310        320        330        340        350        360 
ERQEQRHSLP HPYPYPAPAY TAHPPGHRLV PAAPPGPGPR PPGAESHGCL PATRPPGSDL 
       370        380        390        400        410        420 
RESRVQRSRM DSSVSPAATT ACVPYAPSRP PGLPGTTTSS SSSSSSNTGL RGVEPNPGIP 
       430        440        450        460        470        480 
GADHYQTPAL EVSHHGRLGP SAHSSRKPFL GAPAATPHLS LPPGPSSPPP PPCPRLLRPP 
       490        500        510        520        530        540 
PPPAWLKGPA CRAAREDGEI LEELFFGTEG PPRPAPPPLP HREGFLGPPA SRFSVGTQDS 
       550        560        570        580        590        600 
HTPPTPPTPT TSSSNSNSGS HSSSPAGPVS FPPPPYLARS IDPLPRPPSP AQNPQDPPLV 
       610        620        630        640        650        660 
PLTLALPPAP PSSCHQNTSG SFRRPESPRP RVSFPKTPEV GPGPPPGPLS KAPQPVPPGV 
       670        680        690        700        710        720 
GELPARGPRL FDFPPTPLED QFEEPAEFKI LPDGLANIMK MLDESIRKEE EQQQHEAGVA 
       730        740        750        760        770        780 
PQPPLKEPFA SLQSPFPTDT APTTTAPAVA VTTTTTTTTT TTATQEEEKK PPPALPPPPP 
       790        800        810        820        830        840 
LAKFPPPSQP QPPPPPPPSP ASLLKSLASV LEGQKYCYRG TGAAVSTRPG PLPTTQYSPG 
       850        860        870        880        890        900 
PPSGATALPP TSAAPSAQGS PQPSASSSSQ FSTSGGPWAR ERRAGEEPVP GPMTPTQPPP 
       910        920        930        940        950        960 
PLSLPPARSE SEVLEEISRA CETLVERVGR SATDPADPVD TAEPADSGTE RLLPPAQAKE 
       970        980        990       1000       1010       1020 
EAGGVAAVSG SCKRRQKEHQ KEHRRHRRAC KDSVGRRPRE GRAKAKAKVP KEKSRRVLGN 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LDLQSEEIQG REKSRPDLGG ASKAKPPTAP APPSAPAPSA QPTPPSASVP GKKAREEAPG 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
PPGVSRADML KLRSLSEGPP KELKIRLIKV ESGDKETFIA SEVEERRLRM ADLTISHCAA 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
DVVRASRNAK VKGKFRESYL SPAQSVKPKI NTEEKLPREK LNPPTPSIYL ESKRDAFSPV 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
LLQFCTDPRN PITVIRGLAG SLRLNLGLFS TKTLVEASGE HTVEVRTQVQ QPSDENWDLT 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GTRQIWPCES SRSHTTIAKY AQYQASSFQE SLQEEKESED EESEEPDSTT GTPPSSAPDP 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
KNHHIIKFGT NIDLSDAKRW KPQLQELLKL PAFMRVTSTG NMLSHVGHTI LGMNTVQLYM 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
KVPGSRTPGH QENNNFCSVN INIGPGDCEW FAVHEHYWET ISAFCDRHGV DYLTGSWWPI 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
LDDLYASNIP VYRFVQRPGD LVWINAGTVH WVQATGWCNN IAWNVGPLTA YQYQLALERY 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
EWNEVKNVKS IVPMIHVSWN VARTVKISDP DLFKMIKFCL LQSMKHCQVQ RESLVRAGKK 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
IAYQGRVKDE PAYYCNECDV EVFNILFVTS ENGSRNTYLV HCEGCARRRS AGLQGVVVLE 
      1630       1640    
QYRTEELAQA YDAFTLAPAS TSR



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    O15054-1-unknown MHRAVD... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...ASTSR 1643 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)