TopFIND 4.0

O15061: Synemin

General Information

Protein names
- Synemin
- Desmuslin
Gene names SYNM
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID O15061

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MLSWRLQTGP EKAELQELNA RLYDYVCRVR ELERENLLLE EELRGRRGRE GLWAEGQARC 
        70         80         90        100        110        120 
AEEARSLRQQ LDELSWATAL AEGERDALRR ELRELQRLDA EERAARGRLD AELGAQQREL 
       130        140        150        160        170        180 
QEALGARAAL EALLGRLQAE RRGLDAAHER DVRELRARAA SLTMHFRARA TGPAAPPPRL 
       190        200        210        220        230        240 
REVHDSYALL VAESWRETVQ LYEDEVRELE EALRRGQESR LQAEEETRLC AQEAEALRRE 
       250        260        270        280        290        300 
ALGLEQLRAR LEDALLRMRE EYGIQAEERQ RAIDCLEDEK ATLTLAMADW LRDYQDLLQV 
       310        320        330        340        350        360 
KTGLSLEVAT YRALLEGESN PEIVIWAEHV ENMPSEFRNK SYHYTDSLLQ RENERNLFSR 
       370        380        390        400        410        420 
QKAPLASFNH SSALYSNLSG HRGSQTGTSI GGDARRGFLG SGYSSSATTQ QENSYGKAVS 
       430        440        450        460        470        480 
SQTNVRTFSP TYGLLRNTEA QVKTFPDRPK AGDTREVPVY IGEDSTIARE SYRDRRDKVA 
       490        500        510        520        530        540 
AGASESTRSN ERTVILGKKT EVKATREQER NRPETIRTKP EEKMFDSKEK ASEERNLRWE 
       550        560        570        580        590        600 
ELTKLDKEAR QRESQQMKEK AKEKDSPKEK SVREREVPIS LEVSQDRRAE VSPKGLQTPV 
       610        620        630        640        650        660 
KDAGGGTGRE AEARELRFRL GTSDATGSLQ GDSMTETVAE NIVTSILKQF TQSPETEASA 
       670        680        690        700        710        720 
DSFPDTKVTY VDRKELPGER KTKTEIVVES KLTEDVDVSD EAGLDYLLSK DIKEVGLKGK 
       730        740        750        760        770        780 
SAEQMIGDII NLGLKGREGR AKVVNVEIVE EPVSYVSGEK PEEFSVPFKV EEVEDVSPGP 
       790        800        810        820        830        840 
WGLVKEEEGY GESDVTFSVN QHRRTKQPQE NTTHVEEVTE AGDSEGEQSY FVSTPDEHPG 
       850        860        870        880        890        900 
GHDRDDGSVY GQIHIEEEST IRYSWQDEIV QGTRRRTQKD GAVGEKVVKP LDVPAPSLEG 
       910        920        930        940        950        960 
DLGSTHWKEQ ARSGEFHAEP TVIEKEIKIP HEFHTSMKGI SSKEPRQQLV EVIGQLEETL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PERMREELSA LTREGQGGPG SVSVDVKKVQ GAGGSSVTLV AEVNVSQTVD ADRLDLEELS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KDEASEMEKA VESVVRESLS RQRSPAPGSP DEEGGAEAPA AGIRFRRWAT RELYIPSGES 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
EVAGGASHSS GQRTPQGPVS ATVEVSSPTG FAQSQVLEDV SQAARHIKLG PSEVWRTERM 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SYEGPTAEVV EVSAGGDLSQ AASPTGASRS VRHVTLGPGQ SPLSREVIFL GPAPACPEAW 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GSPEPGPAES SADMDGSGRH STFGCRQFHA EKEIIFQGPI SAAGKVGDYF ATEESVGTQT 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
SVRQLQLGPK EGFSGQIQFT APLSDKVELG VIGDSVHMEG LPGSSTSIRH ISIGPQRHQT 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
TQQIVYHGLV PQLGESGDSE STVHGEGSAD VHQATHSHTS GRQTVMTEKS TFQSVVSESP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
QEDSAGDTSG AEMTSGVSRS FRHIRLGPTE TETSEHIAIR GPVSRTFVLA GSADSPELGK 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
LADSSRTLRH IAPGPKETSF TFQMDVSNVE AIRSRTQEAG ALGVSDRGSW RDADSRNDQA 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
VGVSFKASAG EGDQAHREQG KEQAMFDKKV QLQRMVDQRS VISDEKKVAL LYLDNEEEEN 
   
DGHWF

Isoforms

- Isoform 2 of Synemin - Isoform 3 of Synemin

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MLSWRLQTGP EKAELQELNA RLYDYVCRVR ELERENLLLE EELRGRRGRE GLWAEGQARC 
        70         80         90        100        110        120 
AEEARSLRQQ LDELSWATAL AEGERDALRR ELRELQRLDA EERAARGRLD AELGAQQREL 
       130        140        150        160        170        180 
QEALGARAAL EALLGRLQAE RRGLDAAHER DVRELRARAA SLTMHFRARA TGPAAPPPRL 
       190        200        210        220        230        240 
REVHDSYALL VAESWRETVQ LYEDEVRELE EALRRGQESR LQAEEETRLC AQEAEALRRE 
       250        260        270        280        290        300 
ALGLEQLRAR LEDALLRMRE EYGIQAEERQ RAIDCLEDEK ATLTLAMADW LRDYQDLLQV 
       310        320        330        340        350        360 
KTGLSLEVAT YRALLEGESN PEIVIWAEHV ENMPSEFRNK SYHYTDSLLQ RENERNLFSR 
       370        380        390        400        410        420 
QKAPLASFNH SSALYSNLSG HRGSQTGTSI GGDARRGFLG SGYSSSATTQ QENSYGKAVS 
       430        440        450        460        470        480 
SQTNVRTFSP TYGLLRNTEA QVKTFPDRPK AGDTREVPVY IGEDSTIARE SYRDRRDKVA 
       490        500        510        520        530        540 
AGASESTRSN ERTVILGKKT EVKATREQER NRPETIRTKP EEKMFDSKEK ASEERNLRWE 
       550        560        570        580        590        600 
ELTKLDKEAR QRESQQMKEK AKEKDSPKEK SVREREVPIS LEVSQDRRAE VSPKGLQTPV 
       610        620        630        640        650        660 
KDAGGGTGRE AEARELRFRL GTSDATGSLQ GDSMTETVAE NIVTSILKQF TQSPETEASA 
       670        680        690        700        710        720 
DSFPDTKVTY VDRKELPGER KTKTEIVVES KLTEDVDVSD EAGLDYLLSK DIKEVGLKGK 
       730        740        750        760        770        780 
SAEQMIGDII NLGLKGREGR AKVVNVEIVE EPVSYVSGEK PEEFSVPFKV EEVEDVSPGP 
       790        800        810        820        830        840 
WGLVKEEEGY GESDVTFSVN QHRRTKQPQE NTTHVEEVTE AGDSEGEQSY FVSTPDEHPG 
       850        860        870        880        890        900 
GHDRDDGSVY GQIHIEEEST IRYSWQDEIV QGTRRRTQKD GAVGEKVVKP LDVPAPSLEG 
       910        920        930        940        950        960 
DLGSTHWKEQ ARSGEFHAEP TVIEKEIKIP HEFHTSMKGI SSKEPRQQLV EVIGQLEETL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PERMREELSA LTREGQGGPG SVSVDVKKVQ GAGGSSVTLV AEVNVSQTVD ADRLDLEELS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KDEASEMEKA VESVVRESLS RQRSPAPGSP DEEGGAEAPA AGIRFRRWAT RELYIPSGES 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
EVAGGASHSS GQRTPQGPVS ATVEVSSPTG FAQSQVLEDV SQAARHIKLG PSEVWRTERM 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SYEGPTAEVV EVSAGGDLSQ AASPTGASRS VRHVTLGPGQ SPLSREVIFL GPAPACPEAW 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GSPEPGPAES SADMDGSGRH STFGCRQFHA EKEIIFQGPI SAAGKVGDYF ATEESVGTQT 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
SVRQLQLGPK EGFSGQIQFT APLSDKVELG VIGDSVHMEG LPGSSTSIRH ISIGPQRHQT 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
TQQIVYHGLV PQLGESGDSE STVHGEGSAD VHQATHSHTS GRQTVMTEKS TFQSVVSESP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
QEDSAGDTSG AEMTSGVSRS FRHIRLGPTE TETSEHIAIR GPVSRTFVLA GSADSPELGK 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
LADSSRTLRH IAPGPKETSF TFQMDVSNVE AIRSRTQEAG ALGVSDRGSW RDADSRNDQA 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
VGVSFKASAG EGDQAHREQG KEQAMFDKKV QLQRMVDQRS VISDEKKVAL LYLDNEEEEN 
   
DGHWF         10         20         30         40         50         60 
MLSWRLQTGP EKAELQELNA RLYDYVCRVR ELERENLLLE EELRGRRGRE GLWAEGQARC 
        70         80         90        100        110        120 
AEEARSLRQQ LDELSWATAL AEGERDALRR ELRELQRLDA EERAARGRLD AELGAQQREL 
       130        140        150        160        170        180 
QEALGARAAL EALLGRLQAE RRGLDAAHER DVRELRARAA SLTMHFRARA TGPAAPPPRL 
       190        200        210        220        230        240 
REVHDSYALL VAESWRETVQ LYEDEVRELE EALRRGQESR LQAEEETRLC AQEAEALRRE 
       250        260        270        280        290        300 
ALGLEQLRAR LEDALLRMRE EYGIQAEERQ RAIDCLEDEK ATLTLAMADW LRDYQDLLQV 
       310        320        330        340        350        360 
KTGLSLEVAT YRALLEGESN PEIVIWAEHV ENMPSEFRNK SYHYTDSLLQ RENERNLFSR 
       370        380        390        400        410        420 
QKAPLASFNH SSALYSNLSG HRGSQTGTSI GGDARRGFLG SGYSSSATTQ QENSYGKAVS 
       430        440        450        460        470        480 
SQTNVRTFSP TYGLLRNTEA QVKTFPDRPK AGDTREVPVY IGEDSTIARE SYRDRRDKVA 
       490        500        510        520        530        540 
AGASESTRSN ERTVILGKKT EVKATREQER NRPETIRTKP EEKMFDSKEK ASEERNLRWE 
       550        560        570        580        590        600 
ELTKLDKEAR QRESQQMKEK AKEKDSPKEK SVREREVPIS LEVSQDRRAE VSPKGLQTPV 
       610        620        630        640        650        660 
KDAGGGTGRE AEARELRFRL GTSDATGSLQ GDSMTETVAE NIVTSILKQF TQSPETEASA 
       670        680        690        700        710        720 
DSFPDTKVTY VDRKELPGER KTKTEIVVES KLTEDVDVSD EAGLDYLLSK DIKEVGLKGK 
       730        740        750        760        770        780 
SAEQMIGDII NLGLKGREGR AKVVNVEIVE EPVSYVSGEK PEEFSVPFKV EEVEDVSPGP 
       790        800        810        820        830        840 
WGLVKEEEGY GESDVTFSVN QHRRTKQPQE NTTHVEEVTE AGDSEGEQSY FVSTPDEHPG 
       850        860        870        880        890        900 
GHDRDDGSVY GQIHIEEEST IRYSWQDEIV QGTRRRTQKD GAVGEKVVKP LDVPAPSLEG 
       910        920        930        940        950        960 
DLGSTHWKEQ ARSGEFHAEP TVIEKEIKIP HEFHTSMKGI SSKEPRQQLV EVIGQLEETL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PERMREELSA LTREGQGGPG SVSVDVKKVQ GAGGSSVTLV AEVNVSQTVD ADRLDLEELS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KDEASEMEKA VESVVRESLS RQRSPAPGSP DEEGGAEAPA AGIRFRRWAT RELYIPSGES 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
EVAGGASHSS GQRTPQGPVS ATVEVSSPTG FAQSQVLEDV SQAARHIKLG PSEVWRTERM 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SYEGPTAEVV EVSAGGDLSQ AASPTGASRS VRHVTLGPGQ SPLSREVIFL GPAPACPEAW 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GSPEPGPAES SADMDGSGRH STFGCRQFHA EKEIIFQGPI SAAGKVGDYF ATEESVGTQT 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
SVRQLQLGPK EGFSGQIQFT APLSDKVELG VIGDSVHMEG LPGSSTSIRH ISIGPQRHQT 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
TQQIVYHGLV PQLGESGDSE STVHGEGSAD VHQATHSHTS GRQTVMTEKS TFQSVVSESP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
QEDSAGDTSG AEMTSGVSRS FRHIRLGPTE TETSEHIAIR GPVSRTFVLA GSADSPELGK 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
LADSSRTLRH IAPGPKETSF TFQMDVSNVE AIRSRTQEAG ALGVSDRGSW RDADSRNDQA 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
VGVSFKASAG EGDQAHREQG KEQAMFDKKV QLQRMVDQRS VISDEKKVAL LYLDNEEEEN 
   
DGHWF



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...DGHWF 1565 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...DGHWF 1565 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt86840

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)