TopFIND 4.0

O55017: Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B

General Information

Protein names
- Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B
- Brain calcium channel III
- BIII
- Calcium channel, L type, alpha-1 polypeptide isoform 5
- Voltage-gated calcium channel subunit alpha Cav2.2

Gene names Cacna1b
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID O55017

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MVRFGDELGG RYGGTGGGER ARGGGAGGAG GPGQGGLPPG QRVLYKQSIA QRARTMALYN 
        70         80         90        100        110        120 
PIPVKQNCFT VNRSLFVFSE DNVVRKYAKR ITEWPPFEYM ILATIIANCI VLALEQHLPD 
       130        140        150        160        170        180 
GDKTPMSERL DDTEPYFIGI FCFEAGIKII ALGFVFHKGS YLRNGWNVMD FVVVLTGILA 
       190        200        210        220        230        240 
TAGTDFDLRT LRAVRVLRPL KLVSGIPSLQ VVLKSIMKAM VPLLQIGLLL FFAILMFAII 
       250        260        270        280        290        300 
GLEFYMGKFH KACFPNSTDT EPVGDFPCGK DPPARQCDGD TECREYWPGP NFGITNFDNI 
       310        320        330        340        350        360 
LFAILTVFQC ITMEGWTDIL YNTNDAAGNT WNWLYFIPLI IIGSFFMLNL VLGVLSGEFA 
       370        380        390        400        410        420 
KERERVENRR AFLKLRRQQQ IERELNGYLE WIFKAEEVML AEEDKNAEEK SPLDVLKRAA 
       430        440        450        460        470        480 
TKKSRNDLIH AEEGEDRFVD LCAVGSPFAR ASLKSGKTES SSYFRRKEKM FRFFIRRMVK 
       490        500        510        520        530        540 
AQSFYWVVLC VVALNTLCVA MVHYNQPQRL TTALYFAEFV FLGLFLTEMS LKMYGLGPRS 
       550        560        570        580        590        600 
YFRSSFNCFD FGVIVGSIFE VVWAAIKPGT SFGISVLRAL RLLRIFKVTK YWNSLRNLVV 
       610        620        630        640        650        660 
SLLNSMKSII SLLFLLFLFI VVFALLGMQL FGGQFNFQDE TPTTNFDTFP AAILTVFQIL 
       670        680        690        700        710        720 
TGEDWNAVMY HGIESQGGVS KGMFSSFYFI VLTLFGNYTL LNVFLAIAVD NLANAQELTK 
       730        740        750        760        770        780 
DEEEMEEAAN QKLALQKAKE VAEVSPMSAA NISIAARQQN SAKARSVWEQ RASQLRLQNL 
       790        800        810        820        830        840 
RASCEALYSE MDPEERLRYA STRHVRPDMK THMDRPLVVE PGRDGLRGPV GSKSKPEGTE 
       850        860        870        880        890        900 
ATESADLPRR HHRHRDRDKT SATAPAGGEQ DRTESTETGA REERARPRRS HSKETPGADT 
       910        920        930        940        950        960 
QVRCERSRRH HRRGSPEEAT EREPRRHRAH RHAQDSSKEG TAPVLVPKGE RRARHRGPRT 
       970        980        990       1000       1010       1020 
GPREAENNEE PTRRHRARHK VPPTLQPPER EAAEKESNAV EGDKETRNHQ PKEPHCDLEA 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
IAVTGVGPLH MLPSTCLQKV DEQPEDADNQ RNVTRMGSQP SDPSTTVHVP VTLTGPPGET 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
PVVPSGNMNL EGQAEGKKEA EADDVLRRGP RPIVPYSSMF CLSPTNLLRR FCHYIVTMRY 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
FEMVILVVIA LSSIALAAED PVRTDSFRNN ALKYMDYIFT GVFTFEMVIK MIDLGLLLHP 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GAYFRDLWNI LDFIVVSGAL VAFAFSSFMG GSKGKDINTI KSLRVLRVLR PLKTIKRLPK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
LKAVFDCVVN SLKNVLNILI VYMLFMFIFA VIAVQLFKGK FFYCTDESKE LERDCRGQYL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
DYEKEEVEAQ PRQWKKYDFH YDNVLWALLT LFTVSTGEGW PMVLKHSVDA TYEEQGPSPG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
FRMELSIFYV VYFVVFPFFF VNIFVALIII TFQEQGDKVM SECSLEKNER ACIDFAISAK 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
PLTRYMPQNK QSFQYKTWTF VVSPPFEYFI MAMIALNTVV LMMKFYDAPY EYELMLKCLN 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
IVFTSMFSME CILKIIAFGV LNYFRDAWNV FDFVTVLGSI TDILVTEIAN NFINLSFLRL 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
FRAARLIKLL RQGYTIRILL WTFVQSFKAL PYVCLLIAML FFIYAIIGMQ VFGNIALDDD 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
TSINRHNNFR TFLQALMLLF RSATGEAWHE IMLSCLGNRA CDPHANASEC GSDFAYFYFV 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
SFIFLCSFLM LNLFVAVIMD NFEYLTRDSS ILGPHHLDEF IRVWAEYDPA ACGRISYNDM 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
FEMLKHMSPP LGLGKKCPAR VAYKRLVRMN MPISNEDMTV HFTSTLMALI RTALEIKLAP 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
AGTKQHQCDA ELRKEISSVW ANLPQKTLDL LVPPHKPDEM TVGKVYAALM IFDFYKQNKT 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
TRDQTHQAPG GLSQMGPVSL FHPLKATLEQ TQPAVLRGAR VFLRQKSATS LSNGGAIQTQ 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
ESGIKESLSW GTQRTQDALY EARAPLERGH SAEIPVGQSG TLAVDVQMQN MTLRGPDGEP 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
QPGLESQGRA ASMPRLAAET QPAPNASPMK RSISTLAPRP HGTQLCSTVL DRPPPSQASH 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
HHHHRCHRRR DKKQRSLEKG PSLSVDPEGA PSTAAGPGLP HGEGSTACRR DRKQERGRSQ 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
ERRQPSSSSS EKQRFYSCDR FGSREPPQLM PSLSSHPTSP TAALEPAPHP QGSGSVNGSP 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
LMSTSGASTP GRGGRRQLPQ TPLTPRPSIT YKTANSSPVH FAEGQSGLPA FSPGRLSRGL 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
SEHNALLQKE PLSQPLAPGS RIGSDPYLGQ RLDSEASAHT LPEDTLTFEE AVATNSGRSS 
      2290       2300       2310       2320    
RTSYVSSLTS QSHPLRRVPN GYHCTLGLST GVRARHSYHH PDQDHWC

Isoforms

- Isoform NB2 of Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MVRFGDELGG RYGGTGGGER ARGGGAGGAG GPGQGGLPPG QRVLYKQSIA QRARTMALYN 
        70         80         90        100        110        120 
PIPVKQNCFT VNRSLFVFSE DNVVRKYAKR ITEWPPFEYM ILATIIANCI VLALEQHLPD 
       130        140        150        160        170        180 
GDKTPMSERL DDTEPYFIGI FCFEAGIKII ALGFVFHKGS YLRNGWNVMD FVVVLTGILA 
       190        200        210        220        230        240 
TAGTDFDLRT LRAVRVLRPL KLVSGIPSLQ VVLKSIMKAM VPLLQIGLLL FFAILMFAII 
       250        260        270        280        290        300 
GLEFYMGKFH KACFPNSTDT EPVGDFPCGK DPPARQCDGD TECREYWPGP NFGITNFDNI 
       310        320        330        340        350        360 
LFAILTVFQC ITMEGWTDIL YNTNDAAGNT WNWLYFIPLI IIGSFFMLNL VLGVLSGEFA 
       370        380        390        400        410        420 
KERERVENRR AFLKLRRQQQ IERELNGYLE WIFKAEEVML AEEDKNAEEK SPLDVLKRAA 
       430        440        450        460        470        480 
TKKSRNDLIH AEEGEDRFVD LCAVGSPFAR ASLKSGKTES SSYFRRKEKM FRFFIRRMVK 
       490        500        510        520        530        540 
AQSFYWVVLC VVALNTLCVA MVHYNQPQRL TTALYFAEFV FLGLFLTEMS LKMYGLGPRS 
       550        560        570        580        590        600 
YFRSSFNCFD FGVIVGSIFE VVWAAIKPGT SFGISVLRAL RLLRIFKVTK YWNSLRNLVV 
       610        620        630        640        650        660 
SLLNSMKSII SLLFLLFLFI VVFALLGMQL FGGQFNFQDE TPTTNFDTFP AAILTVFQIL 
       670        680        690        700        710        720 
TGEDWNAVMY HGIESQGGVS KGMFSSFYFI VLTLFGNYTL LNVFLAIAVD NLANAQELTK 
       730        740        750        760        770        780 
DEEEMEEAAN QKLALQKAKE VAEVSPMSAA NISIAARQQN SAKARSVWEQ RASQLRLQNL 
       790        800        810        820        830        840 
RASCEALYSE MDPEERLRYA STRHVRPDMK THMDRPLVVE PGRDGLRGPV GSKSKPEGTE 
       850        860        870        880        890        900 
ATESADLPRR HHRHRDRDKT SATAPAGGEQ DRTESTETGA REERARPRRS HSKETPGADT 
       910        920        930        940        950        960 
QVRCERSRRH HRRGSPEEAT EREPRRHRAH RHAQDSSKEG TAPVLVPKGE RRARHRGPRT 
       970        980        990       1000       1010       1020 
GPREAENNEE PTRRHRARHK VPPTLQPPER EAAEKESNAV EGDKETRNHQ PKEPHCDLEA 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
IAVTGVGPLH MLPSTCLQKV DEQPEDADNQ RNVTRMGSQP SDPSTTVHVP VTLTGPPGET 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
PVVPSGNMNL EGQAEGKKEA EADDVLRRGP RPIVPYSSMF CLSPTNLLRR FCHYIVTMRY 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
FEMVILVVIA LSSIALAAED PVRTDSFRNN ALKYMDYIFT GVFTFEMVIK MIDLGLLLHP 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GAYFRDLWNI LDFIVVSGAL VAFAFSSFMG GSKGKDINTI KSLRVLRVLR PLKTIKRLPK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
LKAVFDCVVN SLKNVLNILI VYMLFMFIFA VIAVQLFKGK FFYCTDESKE LERDCRGQYL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
DYEKEEVEAQ PRQWKKYDFH YDNVLWALLT LFTVSTGEGW PMVLKHSVDA TYEEQGPSPG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
FRMELSIFYV VYFVVFPFFF VNIFVALIII TFQEQGDKVM SECSLEKNER ACIDFAISAK 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
PLTRYMPQNK QSFQYKTWTF VVSPPFEYFI MAMIALNTVV LMMKFYDAPY EYELMLKCLN 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
IVFTSMFSME CILKIIAFGV LNYFRDAWNV FDFVTVLGSI TDILVTEIAN NFINLSFLRL 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
FRAARLIKLL RQGYTIRILL WTFVQSFKAL PYVCLLIAML FFIYAIIGMQ VFGNIALDDD 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
TSINRHNNFR TFLQALMLLF RSATGEAWHE IMLSCLGNRA CDPHANASEC GSDFAYFYFV 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
SFIFLCSFLM LNLFVAVIMD NFEYLTRDSS ILGPHHLDEF IRVWAEYDPA ACGRISYNDM 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
FEMLKHMSPP LGLGKKCPAR VAYKRLVRMN MPISNEDMTV HFTSTLMALI RTALEIKLAP 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
AGTKQHQCDA ELRKEISSVW ANLPQKTLDL LVPPHKPDEM TVGKVYAALM IFDFYKQNKT 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
TRDQTHQAPG GLSQMGPVSL FHPLKATLEQ TQPAVLRGAR VFLRQKSATS LSNGGAIQTQ 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
ESGIKESLSW GTQRTQDALY EARAPLERGH SAEIPVGQSG TLAVDVQMQN MTLRGPDGEP 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
QPGLESQGRA ASMPRLAAET QPAPNASPMK RSISTLAPRP HGTQLCSTVL DRPPPSQASH 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
HHHHRCHRRR DKKQRSLEKG PSLSVDPEGA PSTAAGPGLP HGEGSTACRR DRKQERGRSQ 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
ERRQPSSSSS EKQRFYSCDR FGSREPPQLM PSLSSHPTSP TAALEPAPHP QGSGSVNGSP 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
LMSTSGASTP GRGGRRQLPQ TPLTPRPSIT YKTANSSPVH FAEGQSGLPA FSPGRLSRGL 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
SEHNALLQKE PLSQPLAPGS RIGSDPYLGQ RLDSEASAHT LPEDTLTFEE AVATNSGRSS 
      2290       2300       2310       2320    
RTSYVSSLTS QSHPLRRVPN GYHCTLGLST GVRARHSYHH PDQDHWC



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    O55017-1-unknown MVRFGD... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    O55017-1-unknown MVRFGD... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt68987

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...QDHWC 2327 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...QDHWC 2327 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt64605

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)