TopFIND 4.0

O88427: Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1H

General Information

Protein names
- Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1H
- Voltage-gated calcium channel subunit alpha Cav3.2
Gene names Cacna1h
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID O88427

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MTEGTLAADE VRVPLGASPS APAAPVRASP ASPGVPGREE QRGSGSSVLA PESPGTECGA 
        70         80         90        100        110        120 
DLGADEEQPV PYPALAATVF FCLGQTTRPR SWCLRLVSRR WFEHISMLVI MLNCVTLGMF 
       130        140        150        160        170        180 
RPCEDVECRS ERCSILEAFD DFIFAFFAVE MVIKMVALGL FGQKCYLGDT WNRLDFFIVM 
       190        200        210        220        230        240 
AGMMEYSLDG HNVSLSAIRT VRVLRPLRAI NRVPSMRILV TLLLDTLPML GNVLLLCFFV 
       250        260        270        280        290        300 
FFIFGIVGVQ LWAGLLRNRC FLDSAFVRNN NLTFLRPYYQ TEEGEENPFI CSSRRDNGMQ 
       310        320        330        340        350        360 
KCSHIPSRRE LRVQCTLGWE AYGQPQAEDG GAGRNACINW NQYYNVCRSG EFNPHNGAIN 
       370        380        390        400        410        420 
FDNIGYAWIA IFQVITLEGW VDIMYYVMDA HSFYNFIYFI LLIIVGSFFM INLCLVVIAT 
       430        440        450        460        470        480 
QFSETKQREN QLMREQRARY LSNDSTLASF SEPGSCYEEL LKYVGHIFRK VKRRSLRLYA 
       490        500        510        520        530        540 
RWQSRWRKKV DPSSTLHGQG PRRRPRRAGR RTASVHHLVY HHHHHHHHHY HFSHGGPRRP 
       550        560        570        580        590        600 
SPEPGAGDTR LVRACVPPSP PSPGHGPPDS ESVHSIYHAD CHVEGPQERA RVAHTIATAA 
       610        620        630        640        650        660 
SLKLASGLGT MNYPTILPSG AVNSKGSTSS RPKGLRSAGT PGATAHSPLS LGSPSPYEKI 
       670        680        690        700        710        720 
QHVVGEQGLG RASSHLSGLS VPCPLPSPQA GTLTCELKSC PYCASALEDP EFEFSGSESG 
       730        740        750        760        770        780 
DSDAHGVYEF TQDVRHGDCR DPVQQPHEGG TPGHGNERWR PPLRTASQPG GLGRLWASFS 
       790        800        810        820        830        840 
SKLRRIVDSK YFNRGIMAAI LVNTLSMGVE YHEQPDELTN ALEISNIVFT SMFALEMLLK 
       850        860        870        880        890        900 
LLACGPLGYI RNPYNIFDGI VVIISVWEIV GQADGGLSVL RTFRLLRVLK LVRFLPALRR 
       910        920        930        940        950        960 
QLVVLMRTMD NVATFCMLLM LFIFIFSILG MHLFGCKFSL KTDSGDTVPD RKNFDSLLWA 
       970        980        990       1000       1010       1020 
IVTVFQILTQ EDWNVVLYNG MASTSSWAAL YFVALMTFGN YVLFNLLVAI LVEGFQAEGD 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
ATRSDTDEDK TSTHLEEDFD KLRDVQATEM KMYSLAVTPN GHLEGRGSLP PPLITHTAAT 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
PMPTPKSSPH LDMAHTLLDS RRSSSGSVDP QLGDQKSLAS LRSSPCAPWG PNSAGSSRRS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SWNSLGRAPS LKRRSQCGER ESLLSGEGKG STDDEAEDSR PNSGTHPGAS PGPRATPLRR 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
AESLGHRSTM DLCPPRPATL LPTKFRDCNG QMVALPSEFF LRIDSHKEDA AEFDDDIEDS 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
CCFRLHKVLE PYAPQWCSSR ESWALYLFPP QNRLRVSCQK VIAHKMFDHV VLVFIFLNCI 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
TIALERPDID PGSTERAFLS VSNYIFTAIF VVEMMVKVVA LGLLWGEHAY LQSSWNVLDG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LLVLVSLVDI IVAVASAGGA KILGVLRVLR LLRTLRPLRV ISRAPGLKLV VETLISSLRP 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
IGNIVLICCA FFIIFGILGV QLFKGKFYYC EGTDTRNITT KAECHAAHYR WVRRKYNFDN 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
LGQALMSLFV LSSKDGWVNI MYDGLDAVGI DQQPVQNHNP WMLLYFISFL LIVSFFVLNM 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
FVGVVVENFH KCRQHQEAEE ARRREEKRLR RLERRRRSTF PNPEAQRRPY YADYSHTRRS 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
IHSLCTSHYL DLFITFIICL NVITMSMEHY NQPKSLDEAL KYCNYVFTIV FVFEAALKLV 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
AFGFRRFFKD RWNQLDLAIV LLSIMGIALE EIEMNAALPI NPTIIRIMRV LRIARVLKLL 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
KMATGMRALL DTVVQALPQV GNLGLLFMLL FFIYAALGVE LFGRLECSED NPCEGLSRHA 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
TFTNFGMAFL TLFRVSTGDN WNGIMKDTLR ECTREDKHCL SYLPALSPVY FVTFVLVAQF 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
VLVNVVVAVL MKHLEESNKE AREDAEMDAE IELEIAQGST AQPPSTAQES QGTEPDTPNL 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
LVVRKVSVSR MLSLPNDSYM FRPVAPAAAP HSHPLQEVEM ETYTGPVTSA HSPSLEPRTS 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
FQVPSAASSP ARVSDPLCAL SPRDTPRSLS LSRILCRQEA MHAESLEGQI DDAGEDSIPD 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
YTEPAENISM SQAPLGTLRS PPCSPRPASV RTRKHTFGQH CISSRPPTLG GDDAEAADPA 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
DEEVSHITSS AHPWPATEPH SPEASPTASP AKGTVGSGRD PHRFCSVDAQ SFLDKPGRPD 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
AQRWSSVELD NGDGHLESGE VRARASELEP ALGARRKKKM SPPCISIDPP TEDEGSSRPP 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
AAEGGNTTLR RRTPSCEAAL HRDCPESTEG PGTGGDPVAK GERWGQASCR AEHLTVPNFA 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
FEPLDMGGPG GDCFLDSDQS VTPEPRVSSL GAIVPLILET ELSMPSGDPP EKEQGLYLTV 
      2350       2360    
PQTPLKKPGS PPATPAPDDS GDEPV

Isoforms

- Isoform 2 of Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1H

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MTEGTLAADE VRVPLGASPS APAAPVRASP ASPGVPGREE QRGSGSSVLA PESPGTECGA 
        70         80         90        100        110        120 
DLGADEEQPV PYPALAATVF FCLGQTTRPR SWCLRLVSRR WFEHISMLVI MLNCVTLGMF 
       130        140        150        160        170        180 
RPCEDVECRS ERCSILEAFD DFIFAFFAVE MVIKMVALGL FGQKCYLGDT WNRLDFFIVM 
       190        200        210        220        230        240 
AGMMEYSLDG HNVSLSAIRT VRVLRPLRAI NRVPSMRILV TLLLDTLPML GNVLLLCFFV 
       250        260        270        280        290        300 
FFIFGIVGVQ LWAGLLRNRC FLDSAFVRNN NLTFLRPYYQ TEEGEENPFI CSSRRDNGMQ 
       310        320        330        340        350        360 
KCSHIPSRRE LRVQCTLGWE AYGQPQAEDG GAGRNACINW NQYYNVCRSG EFNPHNGAIN 
       370        380        390        400        410        420 
FDNIGYAWIA IFQVITLEGW VDIMYYVMDA HSFYNFIYFI LLIIVGSFFM INLCLVVIAT 
       430        440        450        460        470        480 
QFSETKQREN QLMREQRARY LSNDSTLASF SEPGSCYEEL LKYVGHIFRK VKRRSLRLYA 
       490        500        510        520        530        540 
RWQSRWRKKV DPSSTLHGQG PRRRPRRAGR RTASVHHLVY HHHHHHHHHY HFSHGGPRRP 
       550        560        570        580        590        600 
SPEPGAGDTR LVRACVPPSP PSPGHGPPDS ESVHSIYHAD CHVEGPQERA RVAHTIATAA 
       610        620        630        640        650        660 
SLKLASGLGT MNYPTILPSG AVNSKGSTSS RPKGLRSAGT PGATAHSPLS LGSPSPYEKI 
       670        680        690        700        710        720 
QHVVGEQGLG RASSHLSGLS VPCPLPSPQA GTLTCELKSC PYCASALEDP EFEFSGSESG 
       730        740        750        760        770        780 
DSDAHGVYEF TQDVRHGDCR DPVQQPHEGG TPGHGNERWR PPLRTASQPG GLGRLWASFS 
       790        800        810        820        830        840 
SKLRRIVDSK YFNRGIMAAI LVNTLSMGVE YHEQPDELTN ALEISNIVFT SMFALEMLLK 
       850        860        870        880        890        900 
LLACGPLGYI RNPYNIFDGI VVIISVWEIV GQADGGLSVL RTFRLLRVLK LVRFLPALRR 
       910        920        930        940        950        960 
QLVVLMRTMD NVATFCMLLM LFIFIFSILG MHLFGCKFSL KTDSGDTVPD RKNFDSLLWA 
       970        980        990       1000       1010       1020 
IVTVFQILTQ EDWNVVLYNG MASTSSWAAL YFVALMTFGN YVLFNLLVAI LVEGFQAEGD 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
ATRSDTDEDK TSTHLEEDFD KLRDVQATEM KMYSLAVTPN GHLEGRGSLP PPLITHTAAT 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
PMPTPKSSPH LDMAHTLLDS RRSSSGSVDP QLGDQKSLAS LRSSPCAPWG PNSAGSSRRS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SWNSLGRAPS LKRRSQCGER ESLLSGEGKG STDDEAEDSR PNSGTHPGAS PGPRATPLRR 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
AESLGHRSTM DLCPPRPATL LPTKFRDCNG QMVALPSEFF LRIDSHKEDA AEFDDDIEDS 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
CCFRLHKVLE PYAPQWCSSR ESWALYLFPP QNRLRVSCQK VIAHKMFDHV VLVFIFLNCI 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
TIALERPDID PGSTERAFLS VSNYIFTAIF VVEMMVKVVA LGLLWGEHAY LQSSWNVLDG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LLVLVSLVDI IVAVASAGGA KILGVLRVLR LLRTLRPLRV ISRAPGLKLV VETLISSLRP 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
IGNIVLICCA FFIIFGILGV QLFKGKFYYC EGTDTRNITT KAECHAAHYR WVRRKYNFDN 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
LGQALMSLFV LSSKDGWVNI MYDGLDAVGI DQQPVQNHNP WMLLYFISFL LIVSFFVLNM 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
FVGVVVENFH KCRQHQEAEE ARRREEKRLR RLERRRRSTF PNPEAQRRPY YADYSHTRRS 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
IHSLCTSHYL DLFITFIICL NVITMSMEHY NQPKSLDEAL KYCNYVFTIV FVFEAALKLV 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
AFGFRRFFKD RWNQLDLAIV LLSIMGIALE EIEMNAALPI NPTIIRIMRV LRIARVLKLL 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
KMATGMRALL DTVVQALPQV GNLGLLFMLL FFIYAALGVE LFGRLECSED NPCEGLSRHA 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
TFTNFGMAFL TLFRVSTGDN WNGIMKDTLR ECTREDKHCL SYLPALSPVY FVTFVLVAQF 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
VLVNVVVAVL MKHLEESNKE AREDAEMDAE IELEIAQGST AQPPSTAQES QGTEPDTPNL 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
LVVRKVSVSR MLSLPNDSYM FRPVAPAAAP HSHPLQEVEM ETYTGPVTSA HSPSLEPRTS 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
FQVPSAASSP ARVSDPLCAL SPRDTPRSLS LSRILCRQEA MHAESLEGQI DDAGEDSIPD 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
YTEPAENISM SQAPLGTLRS PPCSPRPASV RTRKHTFGQH CISSRPPTLG GDDAEAADPA 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
DEEVSHITSS AHPWPATEPH SPEASPTASP AKGTVGSGRD PHRFCSVDAQ SFLDKPGRPD 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
AQRWSSVELD NGDGHLESGE VRARASELEP ALGARRKKKM SPPCISIDPP TEDEGSSRPP 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
AAEGGNTTLR RRTPSCEAAL HRDCPESTEG PGTGGDPVAK GERWGQASCR AEHLTVPNFA 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
FEPLDMGGPG GDCFLDSDQS VTPEPRVSSL GAIVPLILET ELSMPSGDPP EKEQGLYLTV 
      2350       2360    
PQTPLKKPGS PPATPAPDDS GDEPV



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    O88427-1-unknown MTEGTL... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    O88427-1-unknown MTEGTL... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt69070

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...GDEPV 2365 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...GDEPV 2365 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt64688

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)