TopFIND 4.0

P04050: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1

General Information

Protein names
- DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
- RNA polymerase II subunit 1
- RNA polymerase II subunit B1
- 2.7.7.6
- DNA-directed RNA polymerase III largest subunit
- RNA polymerase II subunit B220
Gene names RPO21
Organism Saccharomyces cerevisiae
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID P04050

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MVGQQYSSAP LRTVKEVQFG LFSPEEVRAI SVAKIRFPET MDETQTRAKI GGLNDPRLGS 
        70         80         90        100        110        120 
IDRNLKCQTC QEGMNECPGH FGHIDLAKPV FHVGFIAKIK KVCECVCMHC GKLLLDEHNE 
       130        140        150        160        170        180 
LMRQALAIKD SKKRFAAIWT LCKTKMVCET DVPSEDDPTQ LVSRGGCGNT QPTIRKDGLK 
       190        200        210        220        230        240 
LVGSWKKDRA TGDADEPELR VLSTEEILNI FKHISVKDFT SLGFNEVFSR PEWMILTCLP 
       250        260        270        280        290        300 
VPPPPVRPSI SFNESQRGED DLTFKLADIL KANISLETLE HNGAPHHAIE EAESLLQFHV 
       310        320        330        340        350        360 
ATYMDNDIAG QPQALQKSGR PVKSIRARLK GKEGRIRGNL MGKRVDFSAR TVISGDPNLE 
       370        380        390        400        410        420 
LDQVGVPKSI AKTLTYPEVV TPYNIDRLTQ LVRNGPNEHP GAKYVIRDSG DRIDLRYSKR 
       430        440        450        460        470        480 
AGDIQLQYGW KVERHIMDND PVLFNRQPSL HKMSMMAHRV KVIPYSTFRL NLSVTSPYNA 
       490        500        510        520        530        540 
DFDGDEMNLH VPQSEETRAE LSQLCAVPLQ IVSPQSNKPC MGIVQDTLCG IRKLTLRDTF 
       550        560        570        580        590        600 
IELDQVLNML YWVPDWDGVI PTPAIIKPKP LWSGKQILSV AIPNGIHLQR FDEGTTLLSP 
       610        620        630        640        650        660 
KDNGMLIIDG QIIFGVVEKK TVGSSNGGLI HVVTREKGPQ VCAKLFGNIQ KVVNFWLLHN 
       670        680        690        700        710        720 
GFSTGIGDTI ADGPTMREIT ETIAEAKKKV LDVTKEAQAN LLTAKHGMTL RESFEDNVVR 
       730        740        750        760        770        780 
FLNEARDKAG RLAEVNLKDL NNVKQMVMAG SKGSFINIAQ MSACVGQQSV EGKRIAFGFV 
       790        800        810        820        830        840 
DRTLPHFSKD DYSPESKGFV ENSYLRGLTP QEFFFHAMGG REGLIDTAVK TAETGYIQRR 
       850        860        870        880        890        900 
LVKALEDIMV HYDNTTRNSL GNVIQFIYGE DGMDAAHIEK QSLDTIGGSD AAFEKRYRVD 
       910        920        930        940        950        960 
LLNTDHTLDP SLLESGSEIL GDLKLQVLLD EEYKQLVKDR KFLREVFVDG EANWPLPVNI 
       970        980        990       1000       1010       1020 
RRIIQNAQQT FHIDHTKPSD LTIKDIVLGV KDLQENLLVL RGKNEIIQNA QRDAVTLFCC 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LLRSRLATRR VLQEYRLTKQ AFDWVLSNIE AQFLRSVVHP GEMVGVLAAQ SIGEPATQMT 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
LNTFHFAGVA SKKVTSGVPR LKEILNVAKN MKTPSLTVYL EPGHAADQEQ AKLIRSAIEH 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
TTLKSVTIAS EIYYDPDPRS TVIPEDEEII QLHFSLLDEE AEQSFDQQSP WLLRLELDRA 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
AMNDKDLTMG QVGERIKQTF KNDLFVIWSE DNDEKLIIRC RVVRPKSLDA ETEAEEDHML 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
KKIENTMLEN ITLRGVENIE RVVMMKYDRK VPSPTGEYVK EPEWVLETDG VNLSEVMTVP 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
GIDPTRIYTN SFIDIMEVLG IEAGRAALYK EVYNVIASDG SYVNYRHMAL LVDVMTTQGG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LTSVTRHGFN RSNTGALMRC SFEETVEILF EAGASAELDD CRGVSENVIL GQMAPIGTGA 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
FDVMIDEESL VKYMPEQKIT EIEDGQDGGV TPYSNESGLV NADLDVKDEL MFSPLVDSGS 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
NDAMAGGFTA YGGADYGEAT SPFGAYGEAP TSPGFGVSSP GFSPTSPTYS PTSPAYSPTS 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
PSYSPTSPSY SPTSPSYSPT SPSYSPTSPS YSPTSPSYSP TSPSYSPTSP SYSPTSPSYS 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PTSPSYSPTS PSYSPTSPSY SPTSPSYSPT SPSYSPTSPA YSPTSPSYSP TSPSYSPTSP 
      1690       1700       1710       1720       1730    
SYSPTSPSYS PTSPNYSPTS PSYSPTSPGY SPGSPAYSPK QDEQKHNENE NSR

Isoforms



Sequence View



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...NENSR 1733 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)