TopFIND 4.0

P07897: Aggrecan core protein

General Information

Protein names
- Aggrecan core protein
- Cartilage-specific proteoglycan core protein
- CSPCP

Gene names Acan
Organism Rattus norvegicus
Protease Family
Protease ID I63.001
Chromosome location
UniProt ID P07897

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MTTLLLVFVT LRVIAAVISE EVPDHDNSLS VSIPQPSPLK ALLGTSLTIP CYFIDPMHPV 
        70         80         90        100        110        120 
TTAPSTAPLT PRIKWSRVSK EKEVVLLVAT EGQVRVNSIY QDKVSLPNYP AIPSDATLEI 
       130        140        150        160        170        180 
QNLRSNDSGI YRCEVMHGIE DSEATLEVIV KGIVFHYRAI STRYTLDFDR AQRACLQNSA 
       190        200        210        220        230        240 
IIATPEQLQA AYEDGFHQCD AGWLADQTVR YPIHTPREGC YGDKDEFPGV RTYGIRDTNE 
       250        260        270        280        290        300 
TYDVYCFAEE MEGEVFYATS PEKFTFQEAA NECRTVGARL ATTGQLYLAW QGGMDMCSAG 
       310        320        330        340        350        360 
WLADRSVRYP ISKARPNCGG NLLGVRTVYL HANQTGYPDP SSRYDAICYT GEDFVDIPEN 
       370        380        390        400        410        420 
FFGVGGEEDI TIQTVTWPDL ELPLPRNITE GEARGNVILT AKPIFDMSPT VSEPGEALTL 
       430        440        450        460        470        480 
APEVGTTVFP EAGERTEKTT RPWGFPEEAT RGPDSATAFA SEDLVVRVTI SPGAVEVPGQ 
       490        500        510        520        530        540 
PRLPGGVVFH YRPGSTRYSL TFEEAQQACI RTGAAIASPE QLQAAYEAGY EQCDAGWLQD 
       550        560        570        580        590        600 
QTVRYPIVSP RTPCVGDKDS SPGVRTYGVR PSSETYDVYC YVDKLEGEVF FATQMEQFTF 
       610        620        630        640        650        660 
QEAQAFCAAQ NATLASTGQL YAAWSQGLDK CYAGWLADGT LRYPIVNPRP ACGGDKPGVR 
       670        680        690        700        710        720 
TVYLYPNQTG LPDPLSKHHA FCFRGVSVVP SPGGTPTSPS DIEDWIVTRV EPGVDAVPLE 
       730        740        750        760        770        780 
PETTEVPYFT TEPEKQTEWE PAYTPVGTSP LPGIPPTWLP TVPAAEEHTE SPSASQEPSA 
       790        800        810        820        830        840 
SQVPSTSEEP YTPSLAVPSG TELPSSGDTS GAPDLSGDFT GSTDTSGRLD SSGEPSGGSE 
       850        860        870        880        890        900 
SGLPSGDLDS SGLGPTVSSG LPVESGSASG DGEIPWSSTP TVDRLPSGGE SLEGSASASG 
       910        920        930        940        950        960 
TGDLSGLPSG GEITETSASG TEEISGLPSG GDDLETSTSG IDGASVLPTG RGGLETSASG 
       970        980        990       1000       1010       1020 
VEDLSGLPSG EEGSETSTSG IEDISVLPTG ESPETSASGV GDLSGLPSGG ESLETSASGV 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
EDVTQLPTER GGLETSASGI EDITVLPTGR ENLETSASGV EDVSGLPSGK EGLETSASGI 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
EDISVFPTEA EGLETSASGG YVSGIPSGED GTETSTSGVE GVSGLPSGGE GLETSASGVE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
DLGLPTRDSL ETSASGVDVT GYPSGREDTE TSVPGVGDDL SGLPSGQEGL ETSASGAEDL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GGLPSGKEDL VGSASGALDF GKLPSGTLGS GQTPEASGLP SGFSGEYSGV DIGSGPSSGL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
PDFSGLPSGF PTVSLVDSTL VEVITATTAS ELEGRGTISV SGSGEESGPP LSELDSSADI 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
SGLPSGTELS GQTSGSLDVS GETSGFFDVS GQPFGSSGTG EGTSGIPEVS GQAVRSPDTT 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
EISELSGLSS GQPDVSGEGS GILFGSGQSS GITSVSGETS GISDLSGQPS GFPVLSGTTP 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
GTPDLASGAM SGSGDSSGIT FVDTSLIEVT PTTFREEEGL GSVELSGLPS GETDLSGTSG 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
MVDVSGQSSG AIDSSGLISP TPEFSGLPSG VAEVSGEVSG VETGSSLSSG AFDGSGLVSG 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
FPTVSLVDRT LVESITLAPT AQEAGEGPSS ILEFSGAHSG TPDISGDLSG SLDQSTWQPG 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
WTEASTEPPS SPYFSGDFSS TTDASGESIT APTGSGETSG LPEVTLITSE LVEGVTEPTV 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
SQELGHGPSM TYTPRLFEAS GEASASGDLG GPVTIFPGSG VEASVPEGSS DPSAYPEAGV 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
GVSAAPEASS QLSEFPDLHG ITSASRETDL EMTTPGTEVS SNPWTFQEGT REGSAAPEVS 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
GESSTTSDID AGTSGVPFAT PMTSGDRTEI SGEWSDHTSE VNVTVSTTVP ESRWAQSTQH 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
PTETLQEIGS PNPSYSGEET QTAETAKSLT DTPTLASPEG SGETESTAAD QEQCEEGWTK 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
FQGHCYRHFP DRETWVDAER RCREQQSHLS SIVTPEEQEF VNKNAQDYQW IGLNDRTIEG 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
DFRWSDGHSL QFEKWRPNQP DNFFATGEDC VVMIWHERGE WNDVPCNYQL PFTCKKGTVA 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
CGEPPAVEHA RTLGQKKDRY EISSLVRYQC TEGFVQRHVP TIRCQPSADW EEPRITCTDP 
      2110       2120    
NTYKHRLQKR TMRPTRRSRP SMAH

Isoforms

- Isoform 2 of Aggrecan core protein

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MTTLLLVFVT LRVIAAVISE EVPDHDNSLS VSIPQPSPLK ALLGTSLTIP CYFIDPMHPV 
        70         80         90        100        110        120 
TTAPSTAPLT PRIKWSRVSK EKEVVLLVAT EGQVRVNSIY QDKVSLPNYP AIPSDATLEI 
       130        140        150        160        170        180 
QNLRSNDSGI YRCEVMHGIE DSEATLEVIV KGIVFHYRAI STRYTLDFDR AQRACLQNSA 
       190        200        210        220        230        240 
IIATPEQLQA AYEDGFHQCD AGWLADQTVR YPIHTPREGC YGDKDEFPGV RTYGIRDTNE 
       250        260        270        280        290        300 
TYDVYCFAEE MEGEVFYATS PEKFTFQEAA NECRTVGARL ATTGQLYLAW QGGMDMCSAG 
       310        320        330        340        350        360 
WLADRSVRYP ISKARPNCGG NLLGVRTVYL HANQTGYPDP SSRYDAICYT GEDFVDIPEN 
       370        380        390        400        410        420 
FFGVGGEEDI TIQTVTWPDL ELPLPRNITE GEARGNVILT AKPIFDMSPT VSEPGEALTL 
       430        440        450        460        470        480 
APEVGTTVFP EAGERTEKTT RPWGFPEEAT RGPDSATAFA SEDLVVRVTI SPGAVEVPGQ 
       490        500        510        520        530        540 
PRLPGGVVFH YRPGSTRYSL TFEEAQQACI RTGAAIASPE QLQAAYEAGY EQCDAGWLQD 
       550        560        570        580        590        600 
QTVRYPIVSP RTPCVGDKDS SPGVRTYGVR PSSETYDVYC YVDKLEGEVF FATQMEQFTF 
       610        620        630        640        650        660 
QEAQAFCAAQ NATLASTGQL YAAWSQGLDK CYAGWLADGT LRYPIVNPRP ACGGDKPGVR 
       670        680        690        700        710        720 
TVYLYPNQTG LPDPLSKHHA FCFRGVSVVP SPGGTPTSPS DIEDWIVTRV EPGVDAVPLE 
       730        740        750        760        770        780 
PETTEVPYFT TEPEKQTEWE PAYTPVGTSP LPGIPPTWLP TVPAAEEHTE SPSASQEPSA 
       790        800        810        820        830        840 
SQVPSTSEEP YTPSLAVPSG TELPSSGDTS GAPDLSGDFT GSTDTSGRLD SSGEPSGGSE 
       850        860        870        880        890        900 
SGLPSGDLDS SGLGPTVSSG LPVESGSASG DGEIPWSSTP TVDRLPSGGE SLEGSASASG 
       910        920        930        940        950        960 
TGDLSGLPSG GEITETSASG TEEISGLPSG GDDLETSTSG IDGASVLPTG RGGLETSASG 
       970        980        990       1000       1010       1020 
VEDLSGLPSG EEGSETSTSG IEDISVLPTG ESPETSASGV GDLSGLPSGG ESLETSASGV 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
EDVTQLPTER GGLETSASGI EDITVLPTGR ENLETSASGV EDVSGLPSGK EGLETSASGI 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
EDISVFPTEA EGLETSASGG YVSGIPSGED GTETSTSGVE GVSGLPSGGE GLETSASGVE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
DLGLPTRDSL ETSASGVDVT GYPSGREDTE TSVPGVGDDL SGLPSGQEGL ETSASGAEDL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GGLPSGKEDL VGSASGALDF GKLPSGTLGS GQTPEASGLP SGFSGEYSGV DIGSGPSSGL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
PDFSGLPSGF PTVSLVDSTL VEVITATTAS ELEGRGTISV SGSGEESGPP LSELDSSADI 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
SGLPSGTELS GQTSGSLDVS GETSGFFDVS GQPFGSSGTG EGTSGIPEVS GQAVRSPDTT 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
EISELSGLSS GQPDVSGEGS GILFGSGQSS GITSVSGETS GISDLSGQPS GFPVLSGTTP 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
GTPDLASGAM SGSGDSSGIT FVDTSLIEVT PTTFREEEGL GSVELSGLPS GETDLSGTSG 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
MVDVSGQSSG AIDSSGLISP TPEFSGLPSG VAEVSGEVSG VETGSSLSSG AFDGSGLVSG 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
FPTVSLVDRT LVESITLAPT AQEAGEGPSS ILEFSGAHSG TPDISGDLSG SLDQSTWQPG 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
WTEASTEPPS SPYFSGDFSS TTDASGESIT APTGSGETSG LPEVTLITSE LVEGVTEPTV 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
SQELGHGPSM TYTPRLFEAS GEASASGDLG GPVTIFPGSG VEASVPEGSS DPSAYPEAGV 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
GVSAAPEASS QLSEFPDLHG ITSASRETDL EMTTPGTEVS SNPWTFQEGT REGSAAPEVS 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
GESSTTSDID AGTSGVPFAT PMTSGDRTEI SGEWSDHTSE VNVTVSTTVP ESRWAQSTQH 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
PTETLQEIGS PNPSYSGEET QTAETAKSLT DTPTLASPEG SGETESTAAD QEQCEEGWTK 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
FQGHCYRHFP DRETWVDAER RCREQQSHLS SIVTPEEQEF VNKNAQDYQW IGLNDRTIEG 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
DFRWSDGHSL QFEKWRPNQP DNFFATGEDC VVMIWHERGE WNDVPCNYQL PFTCKKGTVA 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
CGEPPAVEHA RTLGQKKDRY EISSLVRYQC TEGFVQRHVP TIRCQPSADW EEPRITCTDP 
      2110       2120    
NTYKHRLQKR TMRPTRRSRP SMAH



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    P07897-1-unknown MTTLLL... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt193283
    P07897-20-unknown EEVPDH... 20 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    P07897-20-unknown EEVPDH... 20 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt195190

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...PSMAH 2124 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...PSMAH 2124 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt153229

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)