TopFIND 4.0

P15389: Sodium channel protein type 5 subunit alpha

General Information

Protein names
- Sodium channel protein type 5 subunit alpha
- Sodium channel protein cardiac muscle subunit alpha
- Sodium channel protein type V subunit alpha
- Voltage-gated sodium channel subunit alpha Nav1.5
Gene names Scn5a
Organism Rattus norvegicus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID P15389

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MANLLLPRGT SSFRRFTRES LAAIEKRMAE KQARGGSATS QESREGLQEE EAPRPQLDLQ 
        70         80         90        100        110        120 
ASKKLPDLYG NPPRELIGEP LEDLDPFYST QKTFIVLNKG KTIFRFSATN ALYVLSPFHP 
       130        140        150        160        170        180 
VRRAAVKILV HSLFSMLIMC TILTNCVFMA QHDPPPWTKY VEYTFTAIYT FESLVKILAR 
       190        200        210        220        230        240 
GFCLHAFTFL RDPWNWLDFS VIVMAYTTEF VDLGNVSALR TFRVLRALKT ISVISGLKTI 
       250        260        270        280        290        300 
VGALIQSVKK LADVMVLTVF CLSVFALIGL QLFMGNLRHK CVRNFTELNG TNGSVEADGL 
       310        320        330        340        350        360 
VWNSLDVYLN DPANYLLKNG TTDVLLCGNS SDAGTCPEGY RCLKAGENPD HGYTSFDSFA 
       370        380        390        400        410        420 
WAFLALFRLM TQDCWERLYQ QTLRSAGKIY MIFFMLVIFL GSFYLVNLIL AVVAMAYEEQ 
       430        440        450        460        470        480 
NQATIAETEE KEKRFQEAME MLKKEHEALT IRGVDTVSRS SLEMSPLAPV TNHERKSKRR 
       490        500        510        520        530        540 
KRLSSGTEDG GDDRLPKSDS EDGPRALNQL SLTHGLSRTS MRPRSSRGSI FTFRRRDQGS 
       550        560        570        580        590        600 
EADFADDENS TAGESESHRT SLLVPWPLRH PSAQGQPGPG ASAPGYVLNG KRNSTVDCNG 
       610        620        630        640        650        660 
VVSLLGAGDA EATSPGSYLL RPMVLDRPPD TTTPSEEPGG PQMLTPQAPC ADGFEEPGAR 
       670        680        690        700        710        720 
QRALSAVSVL TSALEELEES HRKCPPCWNR FAQHYLIWEC CPLWMSIKQK VKFVVMDPFA 
       730        740        750        760        770        780 
DLTITMCIVL NTLFMALEHY NMTAEFEEML QVGNLVFTGI FTAEMTFKII ALDPYYYFQQ 
       790        800        810        820        830        840 
GWNIFDSIIV ILSLMELGLS RMGNLSVLRS FRLLRVFKLA KSWPTLNTLI KIIGNSVGAL 
       850        860        870        880        890        900 
GNLTLVLAII VFIFAVVGMQ LFGKNYSELR HRISDSGLLP RWHMMDFFHA FLIIFRILCG 
       910        920        930        940        950        960 
EWIETMWDCM EVSGQSLCLL VFLLVMVIGN LVVLNLFLAL LLSSFSADNL TAPDEDGEMN 
       970        980        990       1000       1010       1020 
NLQLALARIQ RGLRFVKRTT WDFCCGILRR RPKKPAALAT HSQLPSCITA PRSPPPPEVE 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KVPPARKETR FEEDKRPGQG TPGDSEPVCV PIAVAESDTE DQEEDEENSL GTEEESSKQE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SQVVSGGHEP YQEPRAWSQV SETTSSEAGA STSQADWQQE QKTEPQAPGC GETPEDSYSE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
GSTADMTNTA DLLEQIPDLG EDVKDPEDCF TEGCVRRCPC CMVDTTQSPG KVWWRLRKTC 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
YRIVEHSWFE TFIIFMILLS SGALAFEDIY LEERKTIKVL LEYADKMFTY VFVLEMLLKW 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
VAYGFKKYFT NAWCWLDFLI VDVSLVSLVA NTLGFAEMGP IKSLRTLRAL RPLRALSRFE 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
GMRVVVNALV GAIPSIMNVL LVCLIFWLIF SIMGVNLFAG KFGRCINQTE GDLPLNYTIV 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
NNKSECESFN VTGELYWTKV KVNFDNVGAG YLALLQVATF KGWMDIMYAA VDSRGYEEQP 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QWEDNLYMYI YFVVFIIFGS FFTLNLFIGV IIDNFNQQKK KLGGQDIFMT EEQKKYYNAM 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KKLGSKKPQK PIPRPLNKYQ GFIFDIVTKQ AFDVTIMFLI CLNMVTMMVE TDDQSPEKVN 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
ILAKINLLFV AIFTGECIVK MAALRHYYFT NSWNIFDFVV VILSIVGTVL SDIIQKYFFS 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PTLFRVIRLA RIGRILRLIR GAKGIRTLLF ALMMSLPALF NIGLLLFLVM FIYSIFGMAN 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
FAYVKWEAGI DDMFNFQTFA NSMLCLFQIT TSAGWDGLLS PILNTGPPYC DPNLPNSNGS 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
RGNCGSPAVG ILFFTTYIII SFLIVVNMYI AIILENFSVA TEESTEPLSE DDFDMFYEIW 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
EKFDPEATQF IEYLALSDFA DALSEPLRIA KPNQISLINM DLPMVSGDRI HCMDILFAFT 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
KRVLGESGEM DALKIQMEEK FMAANPSKIS YEPITTTLRR KHEEVSATVI QRAFRRHLLQ 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
RSVKHASFLF RQQAGGSGLS DEDAPEREGL IAYMMNGNFS RRSAPLSSSS ISSTSFPPSY 
      1990       2000       2010    
DSVTRATSDN LPVRASDYSR SEDLADFPPS PDRDRESIV

Isoforms

- Isoform 2 of Sodium channel protein type 5 subunit alpha

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MANLLLPRGT SSFRRFTRES LAAIEKRMAE KQARGGSATS QESREGLQEE EAPRPQLDLQ 
        70         80         90        100        110        120 
ASKKLPDLYG NPPRELIGEP LEDLDPFYST QKTFIVLNKG KTIFRFSATN ALYVLSPFHP 
       130        140        150        160        170        180 
VRRAAVKILV HSLFSMLIMC TILTNCVFMA QHDPPPWTKY VEYTFTAIYT FESLVKILAR 
       190        200        210        220        230        240 
GFCLHAFTFL RDPWNWLDFS VIVMAYTTEF VDLGNVSALR TFRVLRALKT ISVISGLKTI 
       250        260        270        280        290        300 
VGALIQSVKK LADVMVLTVF CLSVFALIGL QLFMGNLRHK CVRNFTELNG TNGSVEADGL 
       310        320        330        340        350        360 
VWNSLDVYLN DPANYLLKNG TTDVLLCGNS SDAGTCPEGY RCLKAGENPD HGYTSFDSFA 
       370        380        390        400        410        420 
WAFLALFRLM TQDCWERLYQ QTLRSAGKIY MIFFMLVIFL GSFYLVNLIL AVVAMAYEEQ 
       430        440        450        460        470        480 
NQATIAETEE KEKRFQEAME MLKKEHEALT IRGVDTVSRS SLEMSPLAPV TNHERKSKRR 
       490        500        510        520        530        540 
KRLSSGTEDG GDDRLPKSDS EDGPRALNQL SLTHGLSRTS MRPRSSRGSI FTFRRRDQGS 
       550        560        570        580        590        600 
EADFADDENS TAGESESHRT SLLVPWPLRH PSAQGQPGPG ASAPGYVLNG KRNSTVDCNG 
       610        620        630        640        650        660 
VVSLLGAGDA EATSPGSYLL RPMVLDRPPD TTTPSEEPGG PQMLTPQAPC ADGFEEPGAR 
       670        680        690        700        710        720 
QRALSAVSVL TSALEELEES HRKCPPCWNR FAQHYLIWEC CPLWMSIKQK VKFVVMDPFA 
       730        740        750        760        770        780 
DLTITMCIVL NTLFMALEHY NMTAEFEEML QVGNLVFTGI FTAEMTFKII ALDPYYYFQQ 
       790        800        810        820        830        840 
GWNIFDSIIV ILSLMELGLS RMGNLSVLRS FRLLRVFKLA KSWPTLNTLI KIIGNSVGAL 
       850        860        870        880        890        900 
GNLTLVLAII VFIFAVVGMQ LFGKNYSELR HRISDSGLLP RWHMMDFFHA FLIIFRILCG 
       910        920        930        940        950        960 
EWIETMWDCM EVSGQSLCLL VFLLVMVIGN LVVLNLFLAL LLSSFSADNL TAPDEDGEMN 
       970        980        990       1000       1010       1020 
NLQLALARIQ RGLRFVKRTT WDFCCGILRR RPKKPAALAT HSQLPSCITA PRSPPPPEVE 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KVPPARKETR FEEDKRPGQG TPGDSEPVCV PIAVAESDTE DQEEDEENSL GTEEESSKQE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SQVVSGGHEP YQEPRAWSQV SETTSSEAGA STSQADWQQE QKTEPQAPGC GETPEDSYSE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
GSTADMTNTA DLLEQIPDLG EDVKDPEDCF TEGCVRRCPC CMVDTTQSPG KVWWRLRKTC 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
YRIVEHSWFE TFIIFMILLS SGALAFEDIY LEERKTIKVL LEYADKMFTY VFVLEMLLKW 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
VAYGFKKYFT NAWCWLDFLI VDVSLVSLVA NTLGFAEMGP IKSLRTLRAL RPLRALSRFE 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
GMRVVVNALV GAIPSIMNVL LVCLIFWLIF SIMGVNLFAG KFGRCINQTE GDLPLNYTIV 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
NNKSECESFN VTGELYWTKV KVNFDNVGAG YLALLQVATF KGWMDIMYAA VDSRGYEEQP 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QWEDNLYMYI YFVVFIIFGS FFTLNLFIGV IIDNFNQQKK KLGGQDIFMT EEQKKYYNAM 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KKLGSKKPQK PIPRPLNKYQ GFIFDIVTKQ AFDVTIMFLI CLNMVTMMVE TDDQSPEKVN 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
ILAKINLLFV AIFTGECIVK MAALRHYYFT NSWNIFDFVV VILSIVGTVL SDIIQKYFFS 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PTLFRVIRLA RIGRILRLIR GAKGIRTLLF ALMMSLPALF NIGLLLFLVM FIYSIFGMAN 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
FAYVKWEAGI DDMFNFQTFA NSMLCLFQIT TSAGWDGLLS PILNTGPPYC DPNLPNSNGS 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
RGNCGSPAVG ILFFTTYIII SFLIVVNMYI AIILENFSVA TEESTEPLSE DDFDMFYEIW 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
EKFDPEATQF IEYLALSDFA DALSEPLRIA KPNQISLINM DLPMVSGDRI HCMDILFAFT 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
KRVLGESGEM DALKIQMEEK FMAANPSKIS YEPITTTLRR KHEEVSATVI QRAFRRHLLQ 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
RSVKHASFLF RQQAGGSGLS DEDAPEREGL IAYMMNGNFS RRSAPLSSSS ISSTSFPPSY 
      1990       2000       2010    
DSVTRATSDN LPVRASDYSR SEDLADFPPS PDRDRESIV



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    P15389-1-unknown MANLLL... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    P15389-1-unknown MANLLL... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt193456

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...RESIV 2019 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...RESIV 2019 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt153402

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)