TopFIND 4.0

P33076: MHC class II transactivator

General Information

Protein names
- MHC class II transactivator
- CIITA
- 2.3.1.-
- 2.7.11.1
Gene names CIITA
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID P33076

2

N-termini

2

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MRCLAPRPAG SYLSEPQGSS QCATMELGPL EGGYLELLNS DADPLCLYHF YDQMDLAGEE 
        70         80         90        100        110        120 
EIELYSEPDT DTINCDQFSR LLCDMEGDEE TREAYANIAE LDQYVFQDSQ LEGLSKDIFK 
       130        140        150        160        170        180 
HIGPDEVIGE SMEMPAEVGQ KSQKRPFPEE LPADLKHWKP AEPPTVVTGS LLVRPVSDCS 
       190        200        210        220        230        240 
TLPCLPLPAL FNQEPASGQM RLEKTDQIPM PFSSSSLSCL NLPEGPIQFV PTISTLPHGL 
       250        260        270        280        290        300 
WQISEAGTGV SSIFIYHGEV PQASQVPPPS GFTVHGLPTS PDRPGSTSPF APSATDLPSM 
       310        320        330        340        350        360 
PEPALTSRAN MTEHKTSPTQ CPAAGEVSNK LPKWPEPVEQ FYRSLQDTYG AEPAGPDGIL 
       370        380        390        400        410        420 
VEVDLVQARL ERSSSKSLER ELATPDWAER QLAQGGLAEV LLAAKEHRRP RETRVIAVLG 
       430        440        450        460        470        480 
KAGQGKSYWA GAVSRAWACG RLPQYDFVFS VPCHCLNRPG DAYGLQDLLF SLGPQPLVAA 
       490        500        510        520        530        540 
DEVFSHILKR PDRVLLILDG FEELEAQDGF LHSTCGPAPA EPCSLRGLLA GLFQKKLLRG 
       550        560        570        580        590        600 
CTLLLTARPR GRLVQSLSKA DALFELSGFS MEQAQAYVMR YFESSGMTEH QDRALTLLRD 
       610        620        630        640        650        660 
RPLLLSHSHS PTLCRAVCQL SEALLELGED AKLPSTLTGL YVGLLGRAAL DSPPGALAEL 
       670        680        690        700        710        720 
AKLAWELGRR HQSTLQEDQF PSADVRTWAM AKGLVQHPPR AAESELAFPS FLLQCFLGAL 
       730        740        750        760        770        780 
WLALSGEIKD KELPQYLALT PRKKRPYDNW LEGVPRFLAG LIFQPPARCL GALLGPSAAA 
       790        800        810        820        830        840 
SVDRKQKVLA RYLKRLQPGT LRARQLLELL HCAHEAEEAG IWQHVVQELP GRLSFLGTRL 
       850        860        870        880        890        900 
TPPDAHVLGK ALEAAGQDFS LDLRSTGICP SGLGSLVGLS CVTRFRAALS DTVALWESLQ 
       910        920        930        940        950        960 
QHGETKLLQA AEEKFTIEPF KAKSLKDVED LGKLVQTQRT RSSSEDTAGE LPAVRDLKKL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
EFALGPVSGP QAFPKLVRIL TAFSSLQHLD LDALSENKIG DEGVSQLSAT FPQLKSLETL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
NLSQNNITDL GAYKLAEALP SLAASLLRLS LYNNCICDVG AESLARVLPD MVSLRVMDVQ 
      1090       1100       1110       1120       1130    
YNKFTAAGAQ QLAASLRRCP HVETLAMWTP TIPFSVQEHL QQQDSRISLR 

Isoforms

- Isoform 2 of MHC class II transactivator - Isoform 3 of MHC class II transactivator - Isoform 4 of MHC class II transactivator

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MRCLAPRPAG SYLSEPQGSS QCATMELGPL EGGYLELLNS DADPLCLYHF YDQMDLAGEE 
        70         80         90        100        110        120 
EIELYSEPDT DTINCDQFSR LLCDMEGDEE TREAYANIAE LDQYVFQDSQ LEGLSKDIFK 
       130        140        150        160        170        180 
HIGPDEVIGE SMEMPAEVGQ KSQKRPFPEE LPADLKHWKP AEPPTVVTGS LLVRPVSDCS 
       190        200        210        220        230        240 
TLPCLPLPAL FNQEPASGQM RLEKTDQIPM PFSSSSLSCL NLPEGPIQFV PTISTLPHGL 
       250        260        270        280        290        300 
WQISEAGTGV SSIFIYHGEV PQASQVPPPS GFTVHGLPTS PDRPGSTSPF APSATDLPSM 
       310        320        330        340        350        360 
PEPALTSRAN MTEHKTSPTQ CPAAGEVSNK LPKWPEPVEQ FYRSLQDTYG AEPAGPDGIL 
       370        380        390        400        410        420 
VEVDLVQARL ERSSSKSLER ELATPDWAER QLAQGGLAEV LLAAKEHRRP RETRVIAVLG 
       430        440        450        460        470        480 
KAGQGKSYWA GAVSRAWACG RLPQYDFVFS VPCHCLNRPG DAYGLQDLLF SLGPQPLVAA 
       490        500        510        520        530        540 
DEVFSHILKR PDRVLLILDG FEELEAQDGF LHSTCGPAPA EPCSLRGLLA GLFQKKLLRG 
       550        560        570        580        590        600 
CTLLLTARPR GRLVQSLSKA DALFELSGFS MEQAQAYVMR YFESSGMTEH QDRALTLLRD 
       610        620        630        640        650        660 
RPLLLSHSHS PTLCRAVCQL SEALLELGED AKLPSTLTGL YVGLLGRAAL DSPPGALAEL 
       670        680        690        700        710        720 
AKLAWELGRR HQSTLQEDQF PSADVRTWAM AKGLVQHPPR AAESELAFPS FLLQCFLGAL 
       730        740        750        760        770        780 
WLALSGEIKD KELPQYLALT PRKKRPYDNW LEGVPRFLAG LIFQPPARCL GALLGPSAAA 
       790        800        810        820        830        840 
SVDRKQKVLA RYLKRLQPGT LRARQLLELL HCAHEAEEAG IWQHVVQELP GRLSFLGTRL 
       850        860        870        880        890        900 
TPPDAHVLGK ALEAAGQDFS LDLRSTGICP SGLGSLVGLS CVTRFRAALS DTVALWESLQ 
       910        920        930        940        950        960 
QHGETKLLQA AEEKFTIEPF KAKSLKDVED LGKLVQTQRT RSSSEDTAGE LPAVRDLKKL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
EFALGPVSGP QAFPKLVRIL TAFSSLQHLD LDALSENKIG DEGVSQLSAT FPQLKSLETL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
NLSQNNITDL GAYKLAEALP SLAASLLRLS LYNNCICDVG AESLARVLPD MVSLRVMDVQ 
      1090       1100       1110       1120       1130    
YNKFTAAGAQ QLAASLRRCP HVETLAMWTP TIPFSVQEHL QQQDSRISLR          10         20         30         40         50         60 
MRCLAPRPAG SYLSEPQGSS QCATMELGPL EGGYLELLNS DADPLCLYHF YDQMDLAGEE 
        70         80         90        100        110        120 
EIELYSEPDT DTINCDQFSR LLCDMEGDEE TREAYANIAE LDQYVFQDSQ LEGLSKDIFK 
       130        140        150        160        170        180 
HIGPDEVIGE SMEMPAEVGQ KSQKRPFPEE LPADLKHWKP AEPPTVVTGS LLVRPVSDCS 
       190        200        210        220        230        240 
TLPCLPLPAL FNQEPASGQM RLEKTDQIPM PFSSSSLSCL NLPEGPIQFV PTISTLPHGL 
       250        260        270        280        290        300 
WQISEAGTGV SSIFIYHGEV PQASQVPPPS GFTVHGLPTS PDRPGSTSPF APSATDLPSM 
       310        320        330        340        350        360 
PEPALTSRAN MTEHKTSPTQ CPAAGEVSNK LPKWPEPVEQ FYRSLQDTYG AEPAGPDGIL 
       370        380        390        400        410        420 
VEVDLVQARL ERSSSKSLER ELATPDWAER QLAQGGLAEV LLAAKEHRRP RETRVIAVLG 
       430        440        450        460        470        480 
KAGQGKSYWA GAVSRAWACG RLPQYDFVFS VPCHCLNRPG DAYGLQDLLF SLGPQPLVAA 
       490        500        510        520        530        540 
DEVFSHILKR PDRVLLILDG FEELEAQDGF LHSTCGPAPA EPCSLRGLLA GLFQKKLLRG 
       550        560        570        580        590        600 
CTLLLTARPR GRLVQSLSKA DALFELSGFS MEQAQAYVMR YFESSGMTEH QDRALTLLRD 
       610        620        630        640        650        660 
RPLLLSHSHS PTLCRAVCQL SEALLELGED AKLPSTLTGL YVGLLGRAAL DSPPGALAEL 
       670        680        690        700        710        720 
AKLAWELGRR HQSTLQEDQF PSADVRTWAM AKGLVQHPPR AAESELAFPS FLLQCFLGAL 
       730        740        750        760        770        780 
WLALSGEIKD KELPQYLALT PRKKRPYDNW LEGVPRFLAG LIFQPPARCL GALLGPSAAA 
       790        800        810        820        830        840 
SVDRKQKVLA RYLKRLQPGT LRARQLLELL HCAHEAEEAG IWQHVVQELP GRLSFLGTRL 
       850        860        870        880        890        900 
TPPDAHVLGK ALEAAGQDFS LDLRSTGICP SGLGSLVGLS CVTRFRAALS DTVALWESLQ 
       910        920        930        940        950        960 
QHGETKLLQA AEEKFTIEPF KAKSLKDVED LGKLVQTQRT RSSSEDTAGE LPAVRDLKKL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
EFALGPVSGP QAFPKLVRIL TAFSSLQHLD LDALSENKIG DEGVSQLSAT FPQLKSLETL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
NLSQNNITDL GAYKLAEALP SLAASLLRLS LYNNCICDVG AESLARVLPD MVSLRVMDVQ 
      1090       1100       1110       1120       1130    
YNKFTAAGAQ QLAASLRRCP HVETLAMWTP TIPFSVQEHL QQQDSRISLR          10         20         30         40         50         60 
MRCLAPRPAG SYLSEPQGSS QCATMELGPL EGGYLELLNS DADPLCLYHF YDQMDLAGEE 
        70         80         90        100        110        120 
EIELYSEPDT DTINCDQFSR LLCDMEGDEE TREAYANIAE LDQYVFQDSQ LEGLSKDIFK 
       130        140        150        160        170        180 
HIGPDEVIGE SMEMPAEVGQ KSQKRPFPEE LPADLKHWKP AEPPTVVTGS LLVRPVSDCS 
       190        200        210        220        230        240 
TLPCLPLPAL FNQEPASGQM RLEKTDQIPM PFSSSSLSCL NLPEGPIQFV PTISTLPHGL 
       250        260        270        280        290        300 
WQISEAGTGV SSIFIYHGEV PQASQVPPPS GFTVHGLPTS PDRPGSTSPF APSATDLPSM 
       310        320        330        340        350        360 
PEPALTSRAN MTEHKTSPTQ CPAAGEVSNK LPKWPEPVEQ FYRSLQDTYG AEPAGPDGIL 
       370        380        390        400        410        420 
VEVDLVQARL ERSSSKSLER ELATPDWAER QLAQGGLAEV LLAAKEHRRP RETRVIAVLG 
       430        440        450        460        470        480 
KAGQGKSYWA GAVSRAWACG RLPQYDFVFS VPCHCLNRPG DAYGLQDLLF SLGPQPLVAA 
       490        500        510        520        530        540 
DEVFSHILKR PDRVLLILDG FEELEAQDGF LHSTCGPAPA EPCSLRGLLA GLFQKKLLRG 
       550        560        570        580        590        600 
CTLLLTARPR GRLVQSLSKA DALFELSGFS MEQAQAYVMR YFESSGMTEH QDRALTLLRD 
       610        620        630        640        650        660 
RPLLLSHSHS PTLCRAVCQL SEALLELGED AKLPSTLTGL YVGLLGRAAL DSPPGALAEL 
       670        680        690        700        710        720 
AKLAWELGRR HQSTLQEDQF PSADVRTWAM AKGLVQHPPR AAESELAFPS FLLQCFLGAL 
       730        740        750        760        770        780 
WLALSGEIKD KELPQYLALT PRKKRPYDNW LEGVPRFLAG LIFQPPARCL GALLGPSAAA 
       790        800        810        820        830        840 
SVDRKQKVLA RYLKRLQPGT LRARQLLELL HCAHEAEEAG IWQHVVQELP GRLSFLGTRL 
       850        860        870        880        890        900 
TPPDAHVLGK ALEAAGQDFS LDLRSTGICP SGLGSLVGLS CVTRFRAALS DTVALWESLQ 
       910        920        930        940        950        960 
QHGETKLLQA AEEKFTIEPF KAKSLKDVED LGKLVQTQRT RSSSEDTAGE LPAVRDLKKL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
EFALGPVSGP QAFPKLVRIL TAFSSLQHLD LDALSENKIG DEGVSQLSAT FPQLKSLETL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
NLSQNNITDL GAYKLAEALP SLAASLLRLS LYNNCICDVG AESLARVLPD MVSLRVMDVQ 
      1090       1100       1110       1120       1130    
YNKFTAAGAQ QLAASLRRCP HVETLAMWTP TIPFSVQEHL QQQDSRISLR 



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 2 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)