TopFIND 4.0

P39061: Collagen alpha-1(XVIII) chain

General Information

Protein names
- Collagen alpha-1(XVIII) chain
- Endostatin
- Non-collagenous domain 1
- NC1
Gene names Col18a1
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID P39061

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MAPDPSRRLC LLLLLLLSCR LVPASADGNS LSPLNPLVWL WPPKTSDSLE GPVSKPQNSS 
        70         80         90        100        110        120 
PVQSTENPTT HVVPQDGLTE QQTTPASSEL PPEEEEEEDQ KAGQGGSPAT PAVPIPLVAP 
       130        140        150        160        170        180 
AASPDMKEEN VAGVGAKILN VAQGIRSFVQ LWDEDSTIGH SAGTEVPDSS IPTVLPSPAE 
       190        200        210        220        230        240 
LSSAPQGSKT TLWLSSAIPS SPDAQTTEAG TLAVPTQLPP FQSNLQAPLG RPSAPPDFPG 
       250        260        270        280        290        300 
RAFLSSSTDQ GSSWGNQEPP RQPQHLEGKG FLPMTARSSQ QHRHSDVHSD IHGHVPLLPL 
       310        320        330        340        350        360 
VTGPLVTASL SVHGLLSVPS SDPSGQLSQV AALPGFPGTW VSHVAPSSGT GLSNDSALAG 
       370        380        390        400        410        420 
NGSLTSTSRC LPLPPTLTLC SRLGIGHFWL PNHLHHTDSV EVEATVQAWG RFLHTNCHPF 
       430        440        450        460        470        480 
LAWFFCLLLA PSCGPGPPPP LPPCRQFCEA LEDECWNYLA GDRLPVVCAS LPSQEDGYCV 
       490        500        510        520        530        540 
FIGPAAENVA EEVGLLQLLG DPLPEKISQI DDPHVGPAYI FGPDSNSGQV AQYHFPKLFF 
       550        560        570        580        590        600 
RDFSLLFHVR PATEAAGVLF AITDAAQVVV SLGVKLSEVR DGQQNISLLY TEPGASQTQT 
       610        620        630        640        650        660 
GASFRLPAFV GQWTHFALSV DGGSVALYVD CEEFQRVPFA RASQGLELER GAGLFVGQAG 
       670        680        690        700        710        720 
TADPDKFQGM ISELKVRKTP RVSPVHCLDE EDDDEDRASG DFGSGFEESS KSHKEDTSLL 
       730        740        750        760        770        780 
PGLPQPPPVT SPPLAGGSTT EDPRTEETEE DAAVDSIGAE TLPGTGSSGA WDEAIQNPGR 
       790        800        810        820        830        840 
GLIKGGMKGQ KGEPGAQGPP GPAGPQGPAG PVVQSPNSQP VPGAQGPPGP QGPPGKDGTP 
       850        860        870        880        890        900 
GRDGEPGDPG EDGRPGDTGP QGFPGTPGDV GPKGEKGDPG IGPRGPPGPP GPPGPSFRQD 
       910        920        930        940        950        960 
KLTFIDMEGS GFSGDIESLR GPRGFPGPPG PPGVPGLPGE PGRFGINGSY APGPAGLPGV 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PGKEGPPGFP GPPGPPGPPG KEGPPGVAGQ KGSVGDVGIP GPKGSKGDLG PIGMPGKSGL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
AGSPGPVGPP GPPGPPGPPG PGFAAGFDDM EGSGIPLWTT ARSSDGLQGP PGSPGLKGDP 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
GVAGLPGAKG EVGADGAQGI PGPPGREGAA GSPGPKGEKG MPGEKGNPGK DGVGRPGLPG 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
PPGPPGPVIY VSSEDKAIVS TPGPEGKPGY AGFPGPAGPK GDLGSKGEQG LPGPKGEKGE 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PGTIFSPDGR ALGHPQKGAK GEPGFRGPPG PYGRPGHKGE IGFPGRPGRP GTNGLKGEKG 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
EPGDASLGFS MRGLPGPPGP PGPPGPPGMP IYDSNAFVES GRPGLPGQQG VQGPSGPKGD 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
KGEVGPPGPP GQFPIDLFHL EAEMKGDKGD RGDAGQKGER GEPGAPGGGF FSSSVPGPPG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PPGYPGIPGP KGESIRGPPG PPGPQGPPGI GYEGRQGPPG PPGPPGPPSF PGPHRQTVSV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
PGPPGPPGPP GPPGAMGASA GQVRIWATYQ TMLDKIREVP EGWLIFVAER EELYVRVRNG 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
FRKVLLEART ALPRGTGNEV AALQPPLVQL HEGSPYTRRE YSYSTARPWR ADDILANPPR 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LPDRQPYPGV PHHHSSYVHL PPARPTLSLA HTHQDFQPVL HLVALNTPLS GGMRGIRGAD 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
FQCFQQARAV GLSGTFRAFL SSRLQDLYSI VRRADRGSVP IVNLKDEVLS PSWDSLFSGS 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
QGQLQPGARI FSFDGRDVLR HPAWPQKSVW HGSDPSGRRL MESYCETWRT ETTGATGQAS 
      1750       1760       1770    
SLLSGRLLEQ KAASCHNSYI VLCIENSFMT SFSK

Isoforms

- Isoform 2 of Collagen alpha-1(XVIII) chain - Isoform 3 of Collagen alpha-1(XVIII) chain

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MAPDPSRRLC LLLLLLLSCR LVPASADGNS LSPLNPLVWL WPPKTSDSLE GPVSKPQNSS 
        70         80         90        100        110        120 
PVQSTENPTT HVVPQDGLTE QQTTPASSEL PPEEEEEEDQ KAGQGGSPAT PAVPIPLVAP 
       130        140        150        160        170        180 
AASPDMKEEN VAGVGAKILN VAQGIRSFVQ LWDEDSTIGH SAGTEVPDSS IPTVLPSPAE 
       190        200        210        220        230        240 
LSSAPQGSKT TLWLSSAIPS SPDAQTTEAG TLAVPTQLPP FQSNLQAPLG RPSAPPDFPG 
       250        260        270        280        290        300 
RAFLSSSTDQ GSSWGNQEPP RQPQHLEGKG FLPMTARSSQ QHRHSDVHSD IHGHVPLLPL 
       310        320        330        340        350        360 
VTGPLVTASL SVHGLLSVPS SDPSGQLSQV AALPGFPGTW VSHVAPSSGT GLSNDSALAG 
       370        380        390        400        410        420 
NGSLTSTSRC LPLPPTLTLC SRLGIGHFWL PNHLHHTDSV EVEATVQAWG RFLHTNCHPF 
       430        440        450        460        470        480 
LAWFFCLLLA PSCGPGPPPP LPPCRQFCEA LEDECWNYLA GDRLPVVCAS LPSQEDGYCV 
       490        500        510        520        530        540 
FIGPAAENVA EEVGLLQLLG DPLPEKISQI DDPHVGPAYI FGPDSNSGQV AQYHFPKLFF 
       550        560        570        580        590        600 
RDFSLLFHVR PATEAAGVLF AITDAAQVVV SLGVKLSEVR DGQQNISLLY TEPGASQTQT 
       610        620        630        640        650        660 
GASFRLPAFV GQWTHFALSV DGGSVALYVD CEEFQRVPFA RASQGLELER GAGLFVGQAG 
       670        680        690        700        710        720 
TADPDKFQGM ISELKVRKTP RVSPVHCLDE EDDDEDRASG DFGSGFEESS KSHKEDTSLL 
       730        740        750        760        770        780 
PGLPQPPPVT SPPLAGGSTT EDPRTEETEE DAAVDSIGAE TLPGTGSSGA WDEAIQNPGR 
       790        800        810        820        830        840 
GLIKGGMKGQ KGEPGAQGPP GPAGPQGPAG PVVQSPNSQP VPGAQGPPGP QGPPGKDGTP 
       850        860        870        880        890        900 
GRDGEPGDPG EDGRPGDTGP QGFPGTPGDV GPKGEKGDPG IGPRGPPGPP GPPGPSFRQD 
       910        920        930        940        950        960 
KLTFIDMEGS GFSGDIESLR GPRGFPGPPG PPGVPGLPGE PGRFGINGSY APGPAGLPGV 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PGKEGPPGFP GPPGPPGPPG KEGPPGVAGQ KGSVGDVGIP GPKGSKGDLG PIGMPGKSGL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
AGSPGPVGPP GPPGPPGPPG PGFAAGFDDM EGSGIPLWTT ARSSDGLQGP PGSPGLKGDP 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
GVAGLPGAKG EVGADGAQGI PGPPGREGAA GSPGPKGEKG MPGEKGNPGK DGVGRPGLPG 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
PPGPPGPVIY VSSEDKAIVS TPGPEGKPGY AGFPGPAGPK GDLGSKGEQG LPGPKGEKGE 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PGTIFSPDGR ALGHPQKGAK GEPGFRGPPG PYGRPGHKGE IGFPGRPGRP GTNGLKGEKG 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
EPGDASLGFS MRGLPGPPGP PGPPGPPGMP IYDSNAFVES GRPGLPGQQG VQGPSGPKGD 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
KGEVGPPGPP GQFPIDLFHL EAEMKGDKGD RGDAGQKGER GEPGAPGGGF FSSSVPGPPG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PPGYPGIPGP KGESIRGPPG PPGPQGPPGI GYEGRQGPPG PPGPPGPPSF PGPHRQTVSV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
PGPPGPPGPP GPPGAMGASA GQVRIWATYQ TMLDKIREVP EGWLIFVAER EELYVRVRNG 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
FRKVLLEART ALPRGTGNEV AALQPPLVQL HEGSPYTRRE YSYSTARPWR ADDILANPPR 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LPDRQPYPGV PHHHSSYVHL PPARPTLSLA HTHQDFQPVL HLVALNTPLS GGMRGIRGAD 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
FQCFQQARAV GLSGTFRAFL SSRLQDLYSI VRRADRGSVP IVNLKDEVLS PSWDSLFSGS 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
QGQLQPGARI FSFDGRDVLR HPAWPQKSVW HGSDPSGRRL MESYCETWRT ETTGATGQAS 
      1750       1760       1770    
SLLSGRLLEQ KAASCHNSYI VLCIENSFMT SFSK         10         20         30         40         50         60 
MAPDPSRRLC LLLLLLLSCR LVPASADGNS LSPLNPLVWL WPPKTSDSLE GPVSKPQNSS 
        70         80         90        100        110        120 
PVQSTENPTT HVVPQDGLTE QQTTPASSEL PPEEEEEEDQ KAGQGGSPAT PAVPIPLVAP 
       130        140        150        160        170        180 
AASPDMKEEN VAGVGAKILN VAQGIRSFVQ LWDEDSTIGH SAGTEVPDSS IPTVLPSPAE 
       190        200        210        220        230        240 
LSSAPQGSKT TLWLSSAIPS SPDAQTTEAG TLAVPTQLPP FQSNLQAPLG RPSAPPDFPG 
       250        260        270        280        290        300 
RAFLSSSTDQ GSSWGNQEPP RQPQHLEGKG FLPMTARSSQ QHRHSDVHSD IHGHVPLLPL 
       310        320        330        340        350        360 
VTGPLVTASL SVHGLLSVPS SDPSGQLSQV AALPGFPGTW VSHVAPSSGT GLSNDSALAG 
       370        380        390        400        410        420 
NGSLTSTSRC LPLPPTLTLC SRLGIGHFWL PNHLHHTDSV EVEATVQAWG RFLHTNCHPF 
       430        440        450        460        470        480 
LAWFFCLLLA PSCGPGPPPP LPPCRQFCEA LEDECWNYLA GDRLPVVCAS LPSQEDGYCV 
       490        500        510        520        530        540 
FIGPAAENVA EEVGLLQLLG DPLPEKISQI DDPHVGPAYI FGPDSNSGQV AQYHFPKLFF 
       550        560        570        580        590        600 
RDFSLLFHVR PATEAAGVLF AITDAAQVVV SLGVKLSEVR DGQQNISLLY TEPGASQTQT 
       610        620        630        640        650        660 
GASFRLPAFV GQWTHFALSV DGGSVALYVD CEEFQRVPFA RASQGLELER GAGLFVGQAG 
       670        680        690        700        710        720 
TADPDKFQGM ISELKVRKTP RVSPVHCLDE EDDDEDRASG DFGSGFEESS KSHKEDTSLL 
       730        740        750        760        770        780 
PGLPQPPPVT SPPLAGGSTT EDPRTEETEE DAAVDSIGAE TLPGTGSSGA WDEAIQNPGR 
       790        800        810        820        830        840 
GLIKGGMKGQ KGEPGAQGPP GPAGPQGPAG PVVQSPNSQP VPGAQGPPGP QGPPGKDGTP 
       850        860        870        880        890        900 
GRDGEPGDPG EDGRPGDTGP QGFPGTPGDV GPKGEKGDPG IGPRGPPGPP GPPGPSFRQD 
       910        920        930        940        950        960 
KLTFIDMEGS GFSGDIESLR GPRGFPGPPG PPGVPGLPGE PGRFGINGSY APGPAGLPGV 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PGKEGPPGFP GPPGPPGPPG KEGPPGVAGQ KGSVGDVGIP GPKGSKGDLG PIGMPGKSGL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
AGSPGPVGPP GPPGPPGPPG PGFAAGFDDM EGSGIPLWTT ARSSDGLQGP PGSPGLKGDP 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
GVAGLPGAKG EVGADGAQGI PGPPGREGAA GSPGPKGEKG MPGEKGNPGK DGVGRPGLPG 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
PPGPPGPVIY VSSEDKAIVS TPGPEGKPGY AGFPGPAGPK GDLGSKGEQG LPGPKGEKGE 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PGTIFSPDGR ALGHPQKGAK GEPGFRGPPG PYGRPGHKGE IGFPGRPGRP GTNGLKGEKG 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
EPGDASLGFS MRGLPGPPGP PGPPGPPGMP IYDSNAFVES GRPGLPGQQG VQGPSGPKGD 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
KGEVGPPGPP GQFPIDLFHL EAEMKGDKGD RGDAGQKGER GEPGAPGGGF FSSSVPGPPG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PPGYPGIPGP KGESIRGPPG PPGPQGPPGI GYEGRQGPPG PPGPPGPPSF PGPHRQTVSV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
PGPPGPPGPP GPPGAMGASA GQVRIWATYQ TMLDKIREVP EGWLIFVAER EELYVRVRNG 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
FRKVLLEART ALPRGTGNEV AALQPPLVQL HEGSPYTRRE YSYSTARPWR ADDILANPPR 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LPDRQPYPGV PHHHSSYVHL PPARPTLSLA HTHQDFQPVL HLVALNTPLS GGMRGIRGAD 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
FQCFQQARAV GLSGTFRAFL SSRLQDLYSI VRRADRGSVP IVNLKDEVLS PSWDSLFSGS 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
QGQLQPGARI FSFDGRDVLR HPAWPQKSVW HGSDPSGRRL MESYCETWRT ETTGATGQAS 
      1750       1760       1770    
SLLSGRLLEQ KAASCHNSYI VLCIENSFMT SFSK



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    P39061-27-unknown DGNSLS... 27 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    P39061-1591-unknown HTHQDF... 1591 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    P39061-1591-unknown HTHQDF... 1591 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt116502

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...TSFSK 1774 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...TSFSK 1774 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt66999

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)