TopFIND 4.0

P42859: Huntingtin

General Information

Protein names
- Huntingtin
- Huntington disease protein homolog
- HD protein homolog
- Huntingtin, myristoylated N-terminal fragment {ECO:0000250|UniProtKB:P42858}
Gene names Htt
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID P42859

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MATLEKLMKA FESLKSFQQQ QQQQPPPQAP PPPPPPPPQP PQPPPQGQPP PPPPPLPGPA 
        70         80         90        100        110        120 
EEPLHRPKKE LSATKKDRVN HCLTICENIV AQSLRNSPEF QKLLGIAMEL FLLCSNDAES 
       130        140        150        160        170        180 
DVRMVADECL NKVIKALMDS NLPRLQLELY KEIKKNGAPR SLRAALWRFA ELAHLVRPQK 
       190        200        210        220        230        240 
CRPYLVNLLP CLTRTSKRPE ESVQETLAAA VPKIMASFGN FANDNEIKVL LKAFIANLKS 
       250        260        270        280        290        300 
SSPTVRRTAA GSAVSICQHS RRTQYFYNWL LNVLLGLLVP MEEEHSTLLI LGVLLTLRCL 
       310        320        330        340        350        360 
VPLLQQQVKD TSLKGSFGVT RKEMEVSPST EQLVQVYELT LHHTQHQDHN VVTGALELLQ 
       370        380        390        400        410        420 
QLFRTPPPEL LQALTTPGGL GQLTLVQEEA RGRGRSGSIV ELLAGGGSSC SPVLSRKQKG 
       430        440        450        460        470        480 
KVLLGEEEAL EDDSESRSDV SSSAFAASVK SEIGGELAAS SGVSTPGSVG HDIITEQPRS 
       490        500        510        520        530        540 
QHTLQADSVD LSGCDLTSAA TDGDEEDILS HSSSQFSAVP SDPAMDLNDG TQASSPISDS 
       550        560        570        580        590        600 
SQTTTEGPDS AVTPSDSSEI VLDGADSQYL GMQIGQPQED DEEGAAGVLS GEVSDVFRNS 
       610        620        630        640        650        660 
SLALQQAHLL ERMGHSRQPS DSSIDKYVTR DEVAEASDPE SKPCRIKGDI GQPNDDDSAP 
       670        680        690        700        710        720 
LVHCVRLLSA SFLLTGEKKA LVPDRDVRVS VKALALSCIG AAVALHPESF FSRLYKVPLN 
       730        740        750        760        770        780 
TTESTEEQYV SDILNYIDHG DPQVRGATAI LCGTLVYSIL SRSRLRVGDW LGNIRTLTGN 
       790        800        810        820        830        840 
TFSLVDCIPL LQKTLKDESS VTCKLACTAV RHCVLSLCSS SYSDLGLQLL IDMLPLKNSS 
       850        860        870        880        890        900 
YWLVRTELLD TLAEIDFRLV SFLEAKAESL HRGAHHYTGF LKLQERVLNN VVIYLLGDED 
       910        920        930        940        950        960 
PRVRHVAATS LTRLVPKLFY KCDQGQADPV VAVARDQSSV YLKLLMHETQ PPSHFSVSTI 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TRIYRGYSLL PSITDVTMEN NLSRVVAAVS HELITSTTRA LTFGCCEALC LLSAAFPVCT 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
WSLGWHCGVP PLSASDESRK SCTVGMASMI LTLLSSAWFP LDLSAHQDAL ILAGNLLAAS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
APKSLRSSWT SEEEANSAAT RQEEIWPALG DRTLVPLVEQ LFSHLLKVIN ICAHVLDDVT 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
PGPAIKAALP SLTNPPSLSP IRRKGKEKEP GEQASTPMSP KKVGEASAAS RQSDTSGPVT 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
ASKSSSLGSF YHLPSYLKLH DVLKATHANY KVTLDLQNST EKFGGFLRSA LDVLSQILEL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
ATLQDIGKCV EEVLGYLKSC FSREPMMATV CVQQLLKTLF GTNLASQFDG LSSNPSKSQC 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
RAQRLGSSSV RPGLYHYCFM APYTHFTQAL ADASLRNMVQ AEQERDASGW FDVLQKVSAQ 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LKTNLTSVTK NRADKNAIHN HIRLFEPLVI KALKQYTTTT SVQLQKQVLD LLAQLVQLRV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
NYCLLDSDQV FIGFVLKQFE YIEVGQFRES EAIIPNIFFF LVLLSYERYH SKQIIGIPKI 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
IQLCDGIMAS GRKAVTHAIP ALQPIVHDLF VLRGTNKADA GKELETQKEV VVSMLLRLIQ 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
YHQVLEMFIL VLQQCHKENE DKWKRLSRQV ADIILPMLAK QQMHIDSHEA LGVLNTLFEI 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
LAPSSLRPVD MLLRSMFITP STMASVSTVQ LWISGILAIL RVLISQSTED IVLCRIQELS 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
FSPHLLSCPV INRLRGGGGN VTLGECSEGK QKSLPEDTFS RFLLQLVGIL LEDIVTKQLK 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
VDMSEQQHTF YCQELGTLLM CLIHIFKSGM FRRITAAATR LFTSDGCEGS FYTLESLNAR 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
VRSMVPTHPA LVLLWCQILL LINHTDHRWW AEVQQTPKRH SLSCTKSLNP QKSGEEEDSG 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
SAAQLGMCNR EIVRRGALIL FCDYVCQNLH DSEHLTWLIV NHIQDLISLS HEPPVQDFIS 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
AIHRNSAASG LFIQAIQSRC ENLSTPTTLK KTLQCLEGIH LSQSGAVLTL YVDRLLGTPF 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
RALARMVDTL ACRRVEMLLA ANLQSSMAQL PEEELNRIQE HLQNSGLAQR HQRLYSLLDR 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
FRLSTVQDSL SPLPPVTSHP LDGDGHTSLE TVSPDKDWYL QLVRSQCWTR SDSALLEGAE 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
LVNRIPAEDM NDFMMSSEFN LSLLAPCLSL GMSEIANGQK SPLFEAARGV ILNRVTSVVQ 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
QLPAVHQVFQ PFLPIEPTAY WNKLNDLLGD TTSYQSLTIL ARALAQYLVV LSKVPAHLHL 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
PPEKEGDTVK FVVMTVEALS WHLIHEQIPL SLDLQAGLDC CCLALQVPGL WGVLSSPEYV 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
THACSLIHCV RFILEAIAVQ PGDQLLGPES RSHTPRAVRK EEVDSDIQNL SHVTSACEMV 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
ADMVESLQSV LALGHKRNST LPSFLTAVLK NIVISLARLP LVNSYTRVPP LVWKLGWSPK 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
PGGDFGTVFP EIPVEFLQEK EILKEFIYRI NTLGWTNRTQ FEETWATLLG VLVTQPLVME 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
QEESPPEEDT ERTQIHVLAV QAITSLVLSA MTVPVAGNPA VSCLEQQPRN KPLKALDTRF 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
GRKLSMIRGI VEQEIQEMVS QRENTATHHS HQAWDPVPSL LPATTGALIS HDKLLLQINP 
      2590       2600       2610       2620       2630       2640 
EREPGNMSYK LGQVSIHSVW LGNNITPLRE EEWDEEEEEE SDVPAPTSPP VSPVNSRKHR 
      2650       2660       2670       2680       2690       2700 
AGVDIHSCSQ FLLELYSRWI LPSSAARRTP VILISEVVRS LLVVSDLFTE RTQFEMMYLT 
      2710       2720       2730       2740       2750       2760 
LTELRRVHPS EDEILIQYLV PATCKAAAVL GMDKTVAEPV SRLLESTLRS SHLPSQIGAL 
      2770       2780       2790       2800       2810       2820 
HGILYVLECD LLDDTAKQLI PVVSDYLLSN LKGIAHCVNI HSQQHVLVMC ATAFYLMENY 
      2830       2840       2850       2860       2870       2880 
PLDVGPEFSA SVIQMCGVML SGSEESTPSI IYHCALRGLE RLLLSEQLSR LDTESLVKLS 
      2890       2900       2910       2920       2930       2940 
VDRVNVQSPH RAMAALGLML TCMYTGKEKA SPGRASDPSP ATPDSESVIV AMERVSVLFD 
      2950       2960       2970       2980       2990       3000 
RIRKGFPCEA RVVARILPQF LDDFFPPQDV MNKVIGEFLS NQQPYPQFMA TVVYKVFQTL 
      3010       3020       3030       3040       3050       3060 
HSAGQSSMVR DWVMLSLSNF TQRTPVAMAM WSLSCFLVSA STSPWVSAIL PHVISRMGKL 
      3070       3080       3090       3100       3110    
EQVDVNLFCL VATDFYRHQI EEEFDRRAFQ SVFEVVAAPG SPYHRLLACL QNVHKVTTC

Isoforms

- Isoform Short of Huntingtin

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MATLEKLMKA FESLKSFQQQ QQQQPPPQAP PPPPPPPPQP PQPPPQGQPP PPPPPLPGPA 
        70         80         90        100        110        120 
EEPLHRPKKE LSATKKDRVN HCLTICENIV AQSLRNSPEF QKLLGIAMEL FLLCSNDAES 
       130        140        150        160        170        180 
DVRMVADECL NKVIKALMDS NLPRLQLELY KEIKKNGAPR SLRAALWRFA ELAHLVRPQK 
       190        200        210        220        230        240 
CRPYLVNLLP CLTRTSKRPE ESVQETLAAA VPKIMASFGN FANDNEIKVL LKAFIANLKS 
       250        260        270        280        290        300 
SSPTVRRTAA GSAVSICQHS RRTQYFYNWL LNVLLGLLVP MEEEHSTLLI LGVLLTLRCL 
       310        320        330        340        350        360 
VPLLQQQVKD TSLKGSFGVT RKEMEVSPST EQLVQVYELT LHHTQHQDHN VVTGALELLQ 
       370        380        390        400        410        420 
QLFRTPPPEL LQALTTPGGL GQLTLVQEEA RGRGRSGSIV ELLAGGGSSC SPVLSRKQKG 
       430        440        450        460        470        480 
KVLLGEEEAL EDDSESRSDV SSSAFAASVK SEIGGELAAS SGVSTPGSVG HDIITEQPRS 
       490        500        510        520        530        540 
QHTLQADSVD LSGCDLTSAA TDGDEEDILS HSSSQFSAVP SDPAMDLNDG TQASSPISDS 
       550        560        570        580        590        600 
SQTTTEGPDS AVTPSDSSEI VLDGADSQYL GMQIGQPQED DEEGAAGVLS GEVSDVFRNS 
       610        620        630        640        650        660 
SLALQQAHLL ERMGHSRQPS DSSIDKYVTR DEVAEASDPE SKPCRIKGDI GQPNDDDSAP 
       670        680        690        700        710        720 
LVHCVRLLSA SFLLTGEKKA LVPDRDVRVS VKALALSCIG AAVALHPESF FSRLYKVPLN 
       730        740        750        760        770        780 
TTESTEEQYV SDILNYIDHG DPQVRGATAI LCGTLVYSIL SRSRLRVGDW LGNIRTLTGN 
       790        800        810        820        830        840 
TFSLVDCIPL LQKTLKDESS VTCKLACTAV RHCVLSLCSS SYSDLGLQLL IDMLPLKNSS 
       850        860        870        880        890        900 
YWLVRTELLD TLAEIDFRLV SFLEAKAESL HRGAHHYTGF LKLQERVLNN VVIYLLGDED 
       910        920        930        940        950        960 
PRVRHVAATS LTRLVPKLFY KCDQGQADPV VAVARDQSSV YLKLLMHETQ PPSHFSVSTI 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TRIYRGYSLL PSITDVTMEN NLSRVVAAVS HELITSTTRA LTFGCCEALC LLSAAFPVCT 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
WSLGWHCGVP PLSASDESRK SCTVGMASMI LTLLSSAWFP LDLSAHQDAL ILAGNLLAAS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
APKSLRSSWT SEEEANSAAT RQEEIWPALG DRTLVPLVEQ LFSHLLKVIN ICAHVLDDVT 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
PGPAIKAALP SLTNPPSLSP IRRKGKEKEP GEQASTPMSP KKVGEASAAS RQSDTSGPVT 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
ASKSSSLGSF YHLPSYLKLH DVLKATHANY KVTLDLQNST EKFGGFLRSA LDVLSQILEL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
ATLQDIGKCV EEVLGYLKSC FSREPMMATV CVQQLLKTLF GTNLASQFDG LSSNPSKSQC 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
RAQRLGSSSV RPGLYHYCFM APYTHFTQAL ADASLRNMVQ AEQERDASGW FDVLQKVSAQ 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LKTNLTSVTK NRADKNAIHN HIRLFEPLVI KALKQYTTTT SVQLQKQVLD LLAQLVQLRV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
NYCLLDSDQV FIGFVLKQFE YIEVGQFRES EAIIPNIFFF LVLLSYERYH SKQIIGIPKI 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
IQLCDGIMAS GRKAVTHAIP ALQPIVHDLF VLRGTNKADA GKELETQKEV VVSMLLRLIQ 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
YHQVLEMFIL VLQQCHKENE DKWKRLSRQV ADIILPMLAK QQMHIDSHEA LGVLNTLFEI 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
LAPSSLRPVD MLLRSMFITP STMASVSTVQ LWISGILAIL RVLISQSTED IVLCRIQELS 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
FSPHLLSCPV INRLRGGGGN VTLGECSEGK QKSLPEDTFS RFLLQLVGIL LEDIVTKQLK 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
VDMSEQQHTF YCQELGTLLM CLIHIFKSGM FRRITAAATR LFTSDGCEGS FYTLESLNAR 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
VRSMVPTHPA LVLLWCQILL LINHTDHRWW AEVQQTPKRH SLSCTKSLNP QKSGEEEDSG 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
SAAQLGMCNR EIVRRGALIL FCDYVCQNLH DSEHLTWLIV NHIQDLISLS HEPPVQDFIS 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
AIHRNSAASG LFIQAIQSRC ENLSTPTTLK KTLQCLEGIH LSQSGAVLTL YVDRLLGTPF 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
RALARMVDTL ACRRVEMLLA ANLQSSMAQL PEEELNRIQE HLQNSGLAQR HQRLYSLLDR 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
FRLSTVQDSL SPLPPVTSHP LDGDGHTSLE TVSPDKDWYL QLVRSQCWTR SDSALLEGAE 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
LVNRIPAEDM NDFMMSSEFN LSLLAPCLSL GMSEIANGQK SPLFEAARGV ILNRVTSVVQ 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
QLPAVHQVFQ PFLPIEPTAY WNKLNDLLGD TTSYQSLTIL ARALAQYLVV LSKVPAHLHL 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
PPEKEGDTVK FVVMTVEALS WHLIHEQIPL SLDLQAGLDC CCLALQVPGL WGVLSSPEYV 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
THACSLIHCV RFILEAIAVQ PGDQLLGPES RSHTPRAVRK EEVDSDIQNL SHVTSACEMV 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
ADMVESLQSV LALGHKRNST LPSFLTAVLK NIVISLARLP LVNSYTRVPP LVWKLGWSPK 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
PGGDFGTVFP EIPVEFLQEK EILKEFIYRI NTLGWTNRTQ FEETWATLLG VLVTQPLVME 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
QEESPPEEDT ERTQIHVLAV QAITSLVLSA MTVPVAGNPA VSCLEQQPRN KPLKALDTRF 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
GRKLSMIRGI VEQEIQEMVS QRENTATHHS HQAWDPVPSL LPATTGALIS HDKLLLQINP 
      2590       2600       2610       2620       2630       2640 
EREPGNMSYK LGQVSIHSVW LGNNITPLRE EEWDEEEEEE SDVPAPTSPP VSPVNSRKHR 
      2650       2660       2670       2680       2690       2700 
AGVDIHSCSQ FLLELYSRWI LPSSAARRTP VILISEVVRS LLVVSDLFTE RTQFEMMYLT 
      2710       2720       2730       2740       2750       2760 
LTELRRVHPS EDEILIQYLV PATCKAAAVL GMDKTVAEPV SRLLESTLRS SHLPSQIGAL 
      2770       2780       2790       2800       2810       2820 
HGILYVLECD LLDDTAKQLI PVVSDYLLSN LKGIAHCVNI HSQQHVLVMC ATAFYLMENY 
      2830       2840       2850       2860       2870       2880 
PLDVGPEFSA SVIQMCGVML SGSEESTPSI IYHCALRGLE RLLLSEQLSR LDTESLVKLS 
      2890       2900       2910       2920       2930       2940 
VDRVNVQSPH RAMAALGLML TCMYTGKEKA SPGRASDPSP ATPDSESVIV AMERVSVLFD 
      2950       2960       2970       2980       2990       3000 
RIRKGFPCEA RVVARILPQF LDDFFPPQDV MNKVIGEFLS NQQPYPQFMA TVVYKVFQTL 
      3010       3020       3030       3040       3050       3060 
HSAGQSSMVR DWVMLSLSNF TQRTPVAMAM WSLSCFLVSA STSPWVSAIL PHVISRMGKL 
      3070       3080       3090       3100       3110    
EQVDVNLFCL VATDFYRHQI EEEFDRRAFQ SVFEVVAAPG SPYHRLLACL QNVHKVTTC



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    P42859-1-unknown MATLEK... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    P42859-1-unknown MATLEK... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt76857

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...KVTTC 3119 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...KVTTC 3119 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt72475

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)