TopFIND 4.0

P47024: Transposon Ty4-J Gag-Pol polyprotein

General Information

Protein names
- Transposon Ty4-J Gag-Pol polyprotein
- TY4A-TY4B
- Transposon Ty4 TYA-TYB polyprotein
- Capsid protein
- CA
- Ty4 protease
- PR
- 3.4.23.-
- Integrase
- IN
- Reverse transcriptase/ribonuclease H
- RT
- RT-RH
- 2.7.7.49
- 2.7.7.7
- 3.1.26.4
Gene names TY4B-J
Organism Saccharomyces cerevisiae
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID P47024

3

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MATPVRGETR NVIDDNISAR IQSKVKTNDT VRQTPSSLRK VSIKDEQVRQ YQRNLNRFKT 
        70         80         90        100        110        120 
ILNGLKAEEE KLSEADDIQM LAEKLLKLGE TIDKVENRIV DLVEKIQLLE TNENNNILHE 
       130        140        150        160        170        180 
HIDATGTYYL FDTLTSTNKR FYPKDCVFDY RTNNVENIPI LLNNFKKFIK KYQFDDVFEN 
       190        200        210        220        230        240 
DIIEIDPREN EILCKIIKEG LGESLDIMNT NTTDIFRIID GLKKQNIEVC MVEMSELEPG 
       250        260        270        280        290        300 
EKVLVDTTCR NSALLMNKLQ KLVLMEKWIF SKCCQDCPNL KDYLQEAIMG TLHESLRNSV 
       310        320        330        340        350        360 
KQRLYNIPHD VGIDHEEFLI NTVIETVIDL SPIADDQIEN SCMYCKSVFH CSINCKKKPN 
       370        380        390        400        410        420 
RELGLTRPIS QKPIIYKVHR DNNHLSPVQN EQKSWNKTQK RSNKVYNSKK LVIIDTGSGV 
       430        440        450        460        470        480 
NITNDKTLLH NYEDSNRSTR FFGIGKNSSV SVKGYGYIKI KNGHNNTDNK CLLTYYVPEE 
       490        500        510        520        530        540 
ESTIISCYDL AKKTKMVLSR KYTRLGNKII KIKTKIVNGV IHVKMNELIE RPSDDSKINA 
       550        560        570        580        590        600 
IKPTSSPGFK LNKRSITLED AHKRMGHTGI QQIENSIKHN HYEESLDLIK EPNEFWCQTC 
       610        620        630        640        650        660 
KISKATKRNH YTGSMNNHST DHEPGSSWCM DIFGPVSSSN ADTKRYMLIM VDNNTRYCMT 
       670        680        690        700        710        720 
STHFNKNAET ILAQVRKNIQ YVETQFDRKV REINSDRGTE FTNDQIEEYF ISKGIHHILT 
       730        740        750        760        770        780 
STQDHAANGR AERYIRTIIT DATTLLRQSN LRVKFWEYAV TSATNIRNYL EHKSTGKLPL 
       790        800        810        820        830        840 
KAISRQPVTV RLMSFLPFGE KGIIWNHNHK KLKPSGLPSI ILCKDPNSYG YKFFIPSKNK 
       850        860        870        880        890        900 
IVTSDNYTIP NYTMDGRVRN TQNINKSHQF SSDNDDEEDQ IETVTNLCEA LENYEDDNKP 
       910        920        930        940        950        960 
ITRLEDLFTE EELSQIDSNA KYPSPSNNLE GDLDYVFSDV EESGDYDVES ELSTTNNSIS 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TDKNKILSNK DFNSELASTE ISISGIDKKG LINTSHIDED KYDEKVHRIP SIIQEKLVGS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KNTIKINDEN KISDRIRSKN IGSILNTGLS RCVDITDESI TNKDESMHNA KPELIQEQLK 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
KTNHETSFPK EGSIGTNVKF RNTNNEISLK TGDTSLPIKT LESINNHHSN DYSTNKVEKF 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
EKENHHPPPI EDIVDMSDQT DMESNCQDGN NLKELKVTDK NVPTDNGTNV SPRLEQNIEA 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SGSPVQTVNK SAFLNKEFSS LNMKRKRKRH DKNNSLTSYE LERDKKRSKK NRVKLIPDNM 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
ETVSAPKIRA IYYNEAISKN PDLKEKHEYK QAYHKELQNL KDMKVFDVDV KYSRSEIPDN 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
LIVPTNTIFT KKRNGIYKAR IVCRGDTQSP DTYSVITTES LNHNHIKIFL MIANNRNMFM 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
KTLDINHAFL YAKLEEEIYI PHPHDRRCVV KLNKALYGLK QSPKEWNDHL RQYLNGIGLK 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
DNSYTPGLYQ TEDKNLMIAV YVDDCVIAAS NEQRLDEFIN KLKSNFELKI TGTLIDDVLD 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
TDILGMDLVY NKRLGTIDLT LKSFINRMDK KYNEELKKIR KSSIPHMSTY KIDPKKDVLQ 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
MSEEEFRQGV LKLQQLLGEL NYVRHKCRYD IEFAVKKVAR LVNYPHERVF YMIYKIIQYL 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
VRYKDIGIHY DRDCNKDKKV IAITDASVGS EYDAQSRIGV ILWYGMNIFN VYSNKSTNRC 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
VSSTEAELHA IYEGYADSET LKVTLKELGE GDNNDIVMIT DSKPAIQGLN RSYQQPKEKF 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
TWIKTEIIKE KIKEKSIKLL KITGKGNIAD LLTKPVSASD FKRFIQVLKN KITSQDILAS 
   
TDY

Isoforms



Sequence View



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

3 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...ASTDY 1803 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)