TopFIND 4.0

P58365: Cadherin-23

General Information

Protein names
- Cadherin-23
- Otocadherin

Gene names Cdh23
Organism Rattus norvegicus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID P58365

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MRHPPVTWCA MLWLLMLVSG SWGQVNRLPF FTNHFFDTYL LISEDTPVGS SVTQLLARDM 
        70         80         90        100        110        120 
DNDPLVFGVS GEEASRFFAV EPDTGVVWLR QPLDRETKSE FTVEFSVSDH QGVITRKVNI 
       130        140        150        160        170        180 
QVGDVNDNAP TFHNQPYSVR IPENTPVGTP IFIVNATDPD LGAGGSVLYS FQPPSQFFAI 
       190        200        210        220        230        240 
DSARGIVTVI RELDYEVTQA YQLTVNATDQ DKTRPLSTLA NLAIIITDVQ DMDPIFINLP 
       250        260        270        280        290        300 
YSTNIYEHSP PGTTVRVITA VDQDKGRPRG IGYTIVSGNT NSIFALDYIS GALTLNGLLD 
       310        320        330        340        350        360 
RENPLYSHGF ILTVKGTELN DDRSPSDATV TTTFNILVID INDNAPEFNS SEYSVAITEL 
       370        380        390        400        410        420 
AQVGFALPLF IQVVDKDEGL NSMFEVYLVG NNSHHFIISP TSVQGKADIR IRVAIPLDYE 
       430        440        450        460        470        480 
TVDRYDFDLF ANESVPDHVG YAKVKITLIN ENDNRPIFSQ PLYNVSLYEN ITVGTSVLTV 
       490        500        510        520        530        540 
LATDNDVGTF GEVNYFFSDD PDRFSLDKDT GLIMLIARLD YELIQRFTLT VIARDGGGEE 
       550        560        570        580        590        600 
TTGRVRINVL DVNDNVPTFQ KDAYVGALRE NEPSVTQLVR LRATDEDSPP NNLITYSIVN 
       610        620        630        640        650        660 
ASAFGSYFDI SVYEGYGVIS VSRPLDYEQI PNGLIYLTVM AKDAGNPPLY STVPVTIEVF 
       670        680        690        700        710        720 
DENDNPPTFS KPAYFVSVVE NIMAGATVLF LNATDLDRSR EYGQESIIYS LEGSSQFRIN 
       730        740        750        760        770        780 
ARSGEITTTS LLDRETKAEY ILIVRAVDGG VGHNQKTGIA TVNVTLLDIN DNHPTWKDAP 
       790        800        810        820        830        840 
YYINLVEMTP PDSDVTTVVA VDPDLGKNGT LVYSIQPPNK FYSLNSTTGK IRTTHVMLDR 
       850        860        870        880        890        900 
ENPDPVEAEL MRKIIVSVTD CGRPPLKATS SATVFVNLLD LNDNDPTFQN LPFVAEVLEG 
       910        920        930        940        950        960 
TPAGVSVYQV VAIDLDEGLN GLVSYRMQVG MPRMDFVINS TSGVVTTTAE LDRERIAEYQ 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LRVVASDAGT PTKSSTSTLT IRVLDVNDET PTFFPAVYNV SVSEDVPREF RVVWLNCTDN 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
DVGLNAELSY FITAGNVDGK FSVGYRDAVV RTVVGLDRET TAAYTLVLEA IDNVPVGKRR 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
TGTATVFVTV LDVNDNRPIF LQSSYEASVP EDIPEGHSIV QLKATDADEG EFGRVWYRIL 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
HGNHGNNFRL HVSSGLLVRG PRPLDRERNS SHVLMAEAYN HDLGPMRSSV RVIVYVEDVN 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
DEAPVFTQQQ YNRLGLRETA GIGTSVIVVR ATDRDTGDGG LVNYRILSGA EGKFEIDEST 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GLIVTVDYLD YETKTSYLMN VSATDGAPPF NQGFCSVYVT LLNELDEAVQ FSNASYEAVI 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
MENLALGTEI VRVQAYSIDN LNQITYRFDA YTSAQAKALF KIDAITGVIT VKGLVDREKG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
DFYTLTVVAD DGGPKVDSTV KVYVTVLDEN DNSPRFDFTS DSAISVPEDC PVGQRVATVK 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
ARDPDAGSNG QVVFSLASGN IAGAFEIITS NDSIGEVFVA KPLDREELDH YILKIVASDR 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
GTPPRKKDHI LQVTILDVND NPPVIESPFG YNVSVNENVG GGTSVVQVRA TDRDIGINSV 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LSYYITEGNE DMTFRMDRIS GEIATRPAPP DRERQNFYHL VVTVEDEGTP TLSATTHVYV 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
TIVDENDNAP VFQQPHYEVV LDEGPDTVNT SLITVQALDL DEGPNGTVTY AIVAGNIINT 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
FRINRRTGVI TAAKELDYEI SHGRYTLIVT ATDQCPILSH RLTSTTTVLV NVNDINDNVP 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
TFPRDYEGPF DVTEGQPGPR VWTFLAHDRD SGPNGQVEYS VVDGDPLGEF VISPVEGVLR 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
VRKDVELDRE TIAFYNLTIC ARDRGVPPLS STMLVGIRVL DINDNDPVLL NLPMNITISE 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
NSPVSSFVAH VLASDADSGC NALLTFNITA GNRERAFFIN ATTGIVTVNR PLDRERIPEY 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
RLTVSVKDNP ENPRIARKDF DLLLVSLADE NDNHPLFTEG TYQAEVMENS PAGTPLTVLN 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
GPILALDADE DVYAVVTYQL LGTHSDLFVI DNSTGVVTVR SGVIIDREAF SPPFLELLLL 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
AEDVGQLNGT AYLFITILDD NDNWPTFSPP AYTVHLLENC PPGFSVLQIT ATDEDSGLNG 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
ELVYRIEAGA QDRFLIHPVT GVIRVGNATI DREEQESYRL TVVATDRGTV PLSGTATVTI 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
LIDDINDSRP EFLNPIQTVS VLESTEPGTV IANVTAIDLD LNPKLEYHIL SIVAKDDTDR 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
LVPDQEDAFA VNINTGSVIV KSPLNRELVA TYEVTLSVID NASDLPERSV SVPNAKLTVN 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
ILDVNDNTPQ FKPFGITYYT ERVLEGATPG TTLIAVAAVD PDKGLNGLIT YTLLDLIPPG 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
YVQLEDSSAG KVIANRTVDY EEVHWLNFTV RASDNGSPPR AAEIPVYLEI VDINDNNPIF 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
DQLSYQEAVF EDVAVGTVIL RVTATDADSG NFALIEYSLV DGEGKFAINP NTGDIYVLSS 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
LDREKKDHYI LTALAKDNPG DVASNRRENS VQVVIRVLDV NDCRPQFSKP QFSTSVYENE 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
PAGTSVITML ATDQDEGSNG QLTYSLEGPG MEAFSVDMDS GLVTTQRPLQ SYERFNLTVV 
      2590       2600       2610       2620       2630       2640 
ATDGGEPPLW GTTMLLVEVI DVNDNRPVFV RPPNGTILHI KEEIPLRSNV YEVYATDKDE 
      2650       2660       2670       2680       2690       2700 
GLNGAVRYSF LKSTGNRDWE YFTIDPISGL IQTAQRLDRE KQAVYSLILV ASDLGQPVPY 
      2710       2720       2730       2740       2750       2760 
ETMQPLQVAL EDIDDNEPLF VRPPKGSPQY QLLTVPEHSP RGTLVGNVTG AVDADEGPNA 
      2770       2780       2790       2800       2810       2820 
IVYYFIAAGN EDKNFHLQPD GRLLVLRDLD RETEAIFSFI VKASSNRSWT PPRGPSPALD 
      2830       2840       2850       2860       2870       2880 
LLTDLTLQEV RVVLEDINDQ PPRFTKAEYT AGVATDAKVG SELIQVLALD ADIGNNSLVF 
      2890       2900       2910       2920       2930       2940 
YGILAIHYFR ALANDSEDVG QVFTMGSVDG ILRTFDLFMA YSPGYFVVDI VARDLAGHND 
      2950       2960       2970       2980       2990       3000 
TAIIGIYILR DDQRVKIVIN EIPDRVRGFE EEFIRLLSNI TGAIVNTDDV QFHVDMKGRV 
      3010       3020       3030       3040       3050       3060 
NFAQTELLIH VVNRDTNRIL DVDRVIQMID ENKEQLRNLF RNYNVLDVQP AISVQLPDDM 
      3070       3080       3090       3100       3110       3120 
SALQMAIIVL AILLFLAAML FVLMNWYYRT IHKRKLKAIV AGSAGNRGFI DIMDMPNTNK 
      3130       3140       3150       3160       3170       3180 
YSFDGANPVW LDPFCRNLEL AAQAEHEDDL PENLSEIADL WNSPTRTHGT FGREPAAVKP 
      3190       3200       3210       3220       3230       3240 
EDDRYLRAAI QEYDNIAKLG QIIREGPIKL IHTDLEEEPG DHSPGQGSLR FRHKPPTELK 
      3250       3260       3270       3280       3290       3300 
GPDGIHIVHG STGTLLATDL NSLPEDDQKG LDRSLETLTA SEATAFERNA RTESAKSTPL 
      3310    
HKLRDVIMES PLEITEL

Isoforms



Sequence View



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    P58365-24-unknown QVNRLP... 24 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...EITEL 3317 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)