TopFIND 4.0

Q00416: Helicase SEN1

General Information

Protein names
- Helicase SEN1
- 3.6.4.-
- tRNA-splicing endonuclease positive effector
Gene names SEN1
Organism Saccharomyces cerevisiae
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q00416

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MNSNNPDNNN SNNINNNNKD KDIAPNSDVQ LATVYTKAKS YIPQIEQVYQ GTNPNIQEAK 
        70         80         90        100        110        120 
LLGELLQVLA EVPKGTHLFC DPILEPISIF SLTIFSFNEE ATATWLKNHF NPILSVCDKC 
       130        140        150        160        170        180 
ILNFARGKCK MLQHFAIQRH VPHEHVAKFN DIVCQWRVEA VFPILRNISV NDNTGINITN 
       190        200        210        220        230        240 
EIETAMYECL CNPHMLRLNK QLKATFEAIF KFFYDTKHRL LDVTNPLSIK TFISGVIFCW 
       250        260        270        280        290        300 
CEGSKEENEW SRAFLKDLYS RNFHINLSNL TPDIIEEVYI HILFLQNPAN WTEIVVSQFW 
       310        320        330        340        350        360 
SRLLPVFNLF DKDVFIEYFQ VPKNVESLKK TFKFPLEPIF KMWYNHLSKS YHDKPLDFLL 
       370        380        390        400        410        420 
RGLTMFLNKF GSEFWSKIEP FTFHSILDII FNRDSFPIKL IKIQDNPIVE HQTEVYFQLT 
       430        440        450        460        470        480 
GSVTDLLSWT LPFYHALSPS KRIQMVRKVS MAFLRIIANY PSLKSIPKAC LMNSATALLR 
       490        500        510        520        530        540 
AVLTIKENER AMLYKNDEFE TVLLTKTDSR ALLNNPLIQD IIIRSASNPN DFYPGLGAAS 
       550        560        570        580        590        600 
ASVATSTMMV LAECIDFDIL LLCHRTFKLY SGKPISEIPI STNVLENVTN KIDLRSFHDG 
       610        620        630        640        650        660 
PLLAKQLLVS LKNINGLLIV PSNTAVAEAH NALNQKFLLL STRLMEKFAD ILPGQLSKIL 
       670        680        690        700        710        720 
ADEDASQGFW SCIFSSDKHL YQAATNILYN TFDVEGRLEG ILAILNSNLT VNLKNINVML 
       730        740        750        760        770        780 
QRLINCEFYE PCPRAVRVLM DVVSAFVDPI SGVFANFQTL KSQNTEKEFL KFWESCWLFL 
       790        800        810        820        830        840 
DTIYKFTLKW ASKYDYSELE NFTKDTLDLS RSLVDSFREF SDILHDQTKN LLLNVLETFK 
       850        860        870        880        890        900 
NMLYWLRLSD EVLLESCVRL IISTSDLAHE KHVKVDDSLV EMMAKYASKA KRFSNKLTEQ 
       910        920        930        940        950        960 
QASEILQKAK IFNKALTEEV ATEAENYRKE KELSRLGKVI DLTDSVPASP SLSPSLSSTI 
       970        980        990       1000       1010       1020 
ASSSAESRAD YLQRKALSSS ITGRPRVAQP KITSFGTFQS SANAKLHRTK PVKPLSKMEL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
ARMQLLNNRV VHPPSAPAFH TKSRGLSNKN DDSSSEESDN DIESARELFA IAKAKGKGIQ 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
TVDINGKVVK RQTAAELAKQ ELEHMRKRLN VDMNPLYEII LQWDYTRNSE YPDDEPIGNY 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SDVKDFFNSP ADYQKVMKPL LLLESWQGLC SSRDREDYKP FSIIVGNRTA VSDFYDVYAS 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
VAKQVIQDCG ISESDLIVMA YLPDFRPDKR LSSDDFKKAQ HTCLAKVRTL KNTKGGNVDV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
TLRIHRNHSF SKFLTLRSEI YCVKVMQMTT IEREYSTLEG LEYYDLVGQI LQAKPSPPVN 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
VDAAEIETVK KSYKLNTSQA EAIVNSVSKE GFSLIQGPPG TGKTKTILGI IGYFLSTKNA 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SSSNVIKVPL EKNSSNTEQL LKKQKILICA PSNAAVDEIC LRLKSGVYDK QGHQFKPQLV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
RVGRSDVVNV AIKDLTLEEL VDKRIGERNY EIRTDPELER KFNNAVTKRR ELRGKLDSES 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
GNPESPMSTE DISKLQLKIR ELSKIINELG RDRDEMREKN SVNYRNRDLD RRNAQAHILA 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
VSDIICSTLS GSAHDVLATM GIKFDTVIID EACQCTELSS IIPLRYGGKR CIMVGDPNQL 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PPTVLSGAAS NFKYNQSLFV RMEKNSSPYL LDVQYRMHPS ISKFPSSEFY QGRLKDGPGM 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
DILNKRPWHQ LEPLAPYKFF DIISGRQEQN AKTMSYTNME EIRVAIELVD YLFRKFDNKI 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
DFTGKIGIIS PYREQMQKMR KEFARYFGGM INKSIDFNTI DGFQGQEKEI ILISCVRADD 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
TKSSVGFLKD FRRMNVALTR AKTSIWVLGH QRSLAKSKLW RDLIEDAKDR SCLAYACSGF 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
LDPRNNRAQS ILRKFNVPVP SEQEDDYKLP MEYITQGPDE VKSNKDTKKR RVVDEGEEAD 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
KAVKKKKKEK KKEKKKSKAD DKKKNNKKAE SPSTSSGTKK KSSIFGGMSV PSAVVPKTFP 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
DVDSNKKAAA VVGKKKNNKH VCFSDDVSFI PRNDEPEIKV TRSLSSVLKE KQLGLKETRT 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
ISPPEISNNE DDDDEDDYTP SISDSSLMKS EANGRNNRVA SHNQNFSASI YDDPQVSQAK 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
QTQVPAAITK HRSSNSVLSG GSSRILTASD YGEPNQNGQN GANRTLSQHV GNANQYSTAP 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
VGTGELHETL PAHPQDSYPA EAEDPYDLNP HPQPQSSAFK GPGSGPTGTR NSSRRNASSS 
      2230    
PFIPKKRKPR S

Isoforms



Sequence View



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q00416-1-unknown MNSNNP... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...RKPRS 2231 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)