TopFIND 4.0

Q07878: Vacuolar protein sorting-associated protein 13

General Information

Protein names
- Vacuolar protein sorting-associated protein 13
- Suppression of the onset of impotence protein 1
- Vacuolar protein-targeting protein 2

Gene names VPS13
Organism Saccharomyces cerevisiae
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q07878

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MLESLAANLL NRLLGSYVEN FDPNQLNVGI WSGDVKLKNL KLRKDCLDSL NLPIDVKSGI 
        70         80         90        100        110        120 
LGDLVLTVPW SSLKNKPVKI IIEDCYLLCS PRSEDHENDE EMIKRAFRLK MRKVSEWELT 
       130        140        150        160        170        180 
NQARILSTQS ENKTSSSSSE KNNAGFMQSL TTKIIDNLQV TIKNIHLRYE DMDGIFTTGP 
       190        200        210        220        230        240 
SSVGLTLNEL SAVSTDSNWA PSFIDITQNI THKLLTLNSL CLYWNTDSPP LISDDDQDRS 
       250        260        270        280        290        300 
LENFVRGFKD MIASKNSTAP KHQYILKPVS GLGKLSINKL GSTEEQPHID LQMFYDEFGL 
       310        320        330        340        350        360 
ELDDTEYNDI LHVLSSIQLR QITKKFKKAR PSFAVSENPT EWFKYIAACV INEIHEKNKM 
       370        380        390        400        410        420 
WTWESMKEKC EQRRLYTKLW VEKLKLKNLE APLRDPIQEA QLSELHKDLT YDEIILFRSV 
       430        440        450        460        470        480 
AKRQYAQYKL GMTEDSPTPT ASSNIEPQTS NKSATKNNGS WLSSWWNGKP TEEVDEDLIM 
       490        500        510        520        530        540 
TEEQRQELYD AIEFDENEDK GPVLQVPRER VELRVTSLLK KGSFTIRKKK QNLNLGSIIF 
       550        560        570        580        590        600 
ENCKVDFAQR PDSFLSSFQL NKFSLEDGSP NALYKHIISV RNSSKDQSSI DNHATGEEEE 
       610        620        630        640        650        660 
EDEPLLRASF ELNPLDGLAD SNLNIKLLGM TVFYHVHFIT EVHKFFKASN QHMETIGNIV 
       670        680        690        700        710        720 
NAAEATVEGW TTQTRMGIES LLEDHKTVNV SLDLQAPLII LPLDPHDWDT PCAIIDAGHM 
       730        740        750        760        770        780 
SILSDLVPKE KIKEIKELSP EEYDKIDGNE INRLMFDRFQ ILSQDTQIFV GPDIQSTIGK 
       790        800        810        820        830        840 
INTASSTNDF RILDKMKLEL TVDLSILPKA YKLPTIRVFG HLPRLSLSIN DIQYKTIMNL 
       850        860        870        880        890        900 
IANSIPSMID DEENNGDYVN YSSGSEKEMK KQIQLQLKNT LKALENMQPL QIEQKFLELH 
       910        920        930        940        950        960 
FDIDQAKIAF FQCIKNDSRN SEKLVDILCQ RLNFNFDKRA KEMNLDLRVH SLDVEDYIEL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TDNKEFKNLI SSGVEKVTRS QKDLFTLKYK RVQRIVPHND TLIELFDQDI VMHMSELQLV 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LTPRSVLTLM NYAMLTFTDP NAPEMPADVL RHNKEDRDDA PQKINMKIKM EAVNVIFNDD 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SIKLATLVLS AGEFTMVLLP ERYNINLKLG GLELTDETNE SFSRDSVFRK IIQMKGQELV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
ELSYESFDPA TNTKDYDSFL KYSTGSMHVN FIESAVNRMV NFFAKFQKSK VSFDRARLAA 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
YNQAPSIDAV NNMKMDIVIK APIIQFPKLV GTQENNYDTM RFYLGEFFIE NKFSVIDESH 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
KINHIKLGVR EGQLSSNLNF DGSSQQLYLV ENIGLLFNID RDPLPQDDTP ELKVTSNFES 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
FALDLTENQL TYLLEISNKV SSAFNITDEN SGESGGKGEI KSPSPDPASL SSESERTATP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
QSLQGSNKSN IKNPEQKYLD FSFKAPKIAL TLYNKTKGVT SLNDCGLTRI MFQDIGCSLG 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
LKNDGTVDGQ AHVAAFRIED VRNIKDNKHT ELIPKSKNKE YQFVANISRK NLEVGRLLNI 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
SMTMDSPKMI LAMDYLVSLK EFFDAIMSKS HENNLYYPEN TNQKPENKAI VESVQEGGDV 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
TKIQYSVNII ETALILLADP CDMNSEAISF KIGQFLVTDQ NIMTVAANNV GIFLFKMNSS 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
EEKLRLLDDF SSSLTIDKRN STPQTLMTNI QLSVQPLLMR ISLRDIRLAM LIFKRVTTLL 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
NKMTEKEDNG EEEESTDKIQ FSHEFERKLA VLDPSILGER SRASQSSDSE SIEVPTAILK 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
NETFNADLGG LRFILIGDVH EMPILDMNVN EITASAKDWS TDFEALASLE TYVNIFNYSR 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
SSWEPLLEMI PITFHLSKGH SEMDPAFSFD ILTQRIAEIT LSARSIAMLS HIPASLTEEL 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
PLASRVSQKP YQLVNDTELD FDVWIQDKTT EDNKNEVVLL KANTSLPWEF EDWRSIREKL 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
DIDKSKNILG VCVSGQNYKT IMNIDATTEG ENLHVLSPPR NNVHNRIVCE ARCDENNVKI 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
ITFRSTLVIE NTTSTEIELL VDSKDPNKPS LKYAIKPHQS KSVPVEYAYD SDIRIRPASE 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
DIYDWSQQTL SWKSLLSNQM SIFCSSKEDS NQRFHFEIGA KYDEREPLAK IFPHMKIVVS 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
ASMTIENLLP ADINFSIFDK REEKRTDFLK TGESMEVHHI SLDSFLLMSV QPLQDEASAS 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
KPSIVNTPHK SPLNPEDSLS LTLSGGQNLL LKLDYKNIDG TRSKVIRIYS PYIIMNSTDR 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
ELYIQSSLLN IAQSKILLEN EKRYTIPKMF SFDKEDDKSN RARIRFKESE WSSKLSFDAI 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
GQSFDASVRI KNKEQESNLG INISEGKGKY LLSKVIEIAP RYIISNTLDI PIEVCETGSM 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
DVQQIESNIT KPLYRMRNIV DKQLVLKFLG GDSNWSQPFF IKNVGVTYLK VLKNSRHKLL 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
KIEILLDKAT IFIRIKDGGD RWPFSIRNFS DHDFIFYQRD PRKVSDPYKD DQSNESSSRS 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
FKPIFYRIPS KSIMPYAWDF PTAKEKYLVL ESGTRTREVR LAEIGELPPL RLDKRSKDKP 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
APIVGLHVVA DDDMQALVIV NYKANVGLYK LKTASATTTS SVSVNSSVTD GFVQKDEDEK 
      2590       2600       2610       2620       2630       2640 
VNTQIVVSFK GVGISLINGR LQELLYINMR GIELRYNESK AYQTFSWKMK WMQIDNQLFS 
      2650       2660       2670       2680       2690       2700 
GNYSNILYPT EIPYTEKEIE NHPVISGSIS KVNDSLQAVP YFKHVTLLIQ EFSIQLDEDM 
      2710       2720       2730       2740       2750       2760 
LYAMMDFIKF PGSPWIMDSR DYKYDEEIQL PDVSELKTAG DIYFEIFHIQ PTVLHLSFIR 
      2770       2780       2790       2800       2810       2820 
SDEISPGLAE ETEESFSSSL YYVHMFAMTL GNINEAPVKV NSLFMDNVRV PLPILMDHIE 
      2830       2840       2850       2860       2870       2880 
RHYTTQFVYQ IHKILGSADC FGNPVGLFNT ISSGVWDLFY EPYQGYMMND RPQEIGIHLA 
      2890       2900       2910       2920       2930       2940 
KGGLSFAKKT VFGLSDSMSK FTGSMAKGLS VTQDLEFQRV RRLQQRINKN NRNALANSAQ 
      2950       2960       2970       2980       2990       3000 
SFASTLGSGL SGIALDPYKA MQKEGAAGFL KGLGKGIVGL PTKTAIGFLD LTSNLSQGVK 
      3010       3020       3030       3040       3050       3060 
STTTVLDMQK GCRVRLPRYV DHDQIIKPYD LREAQGQYWL KTVNGGVFMN DEYLSHVILP 
      3070       3080       3090       3100       3110       3120 
GKELAVIVSM QHIAEVQMAT QELMWSTGYP SIQGITLERS GLQIKLKSQS EYFIPISDPE 
      3130       3140    
ERRSLYRNIA IAVREYNKYC EAIL

Isoforms



Sequence View



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q07878-1-unknown MLESLA... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...CEAIL 3144 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)