TopFIND 4.0

Q14031: Collagen alpha-6(IV) chain

General Information

Protein names
- Collagen alpha-6(IV) chain
Gene names COL4A6
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q14031

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MLINKLWLLL VTLCLTEELA AAGEKSYGKP CGGQDCSGSC QCFPEKGARG RPGPIGIQGP 
        70         80         90        100        110        120 
TGPQGFTGST GLSGLKGERG FPGLLGPYGP KGDKGPMGVP GFLGINGIPG HPGQPGPRGP 
       130        140        150        160        170        180 
PGLDGCNGTQ GAVGFPGPDG YPGLLGPPGL PGQKGSKGDP VLAPGSFKGM KGDPGLPGLD 
       190        200        210        220        230        240 
GITGPQGAPG FPGAVGPAGP PGLQGPPGPP GPLGPDGNMG LGFQGEKGVK GDVGLPGPAG 
       250        260        270        280        290        300 
PPPSTGELEF MGFPKGKKGS KGEPGPKGFP GISGPPGFPG LGTTGEKGEK GEKGIPGLPG 
       310        320        330        340        350        360 
PRGPMGSEGV QGPPGQQGKK GTLGFPGLNG FQGIEGQKGD IGLPGPDVFI DIDGAVISGN 
       370        380        390        400        410        420 
PGDPGVPGLP GLKGDEGIQG LRGPSGVPGL PALSGVPGAL GPQGFPGLKG DQGNPGRTTI 
       430        440        450        460        470        480 
GAAGLPGRDG LPGPPGPPGP PSPEFETETL HNKESGFPGL RGEQGPKGNL GLKGIKGDSG 
       490        500        510        520        530        540 
FCACDGGVPN TGPPGEPGPP GPWGLIGLPG LKGARGDRGS GGAQGPAGAP GLVGPLGPSG 
       550        560        570        580        590        600 
PKGKKGEPIL STIQGMPGDR GDSGSQGFRG VIGEPGKDGV PGLPGLPGLP GDGGQGFPGE 
       610        620        630        640        650        660 
KGLPGLPGEK GHPGPPGLPG NGLPGLPGPR GLPGDKGKDG LPGQQGLPGS KGITLPCIIP 
       670        680        690        700        710        720 
GSYGPSGFPG TPGFPGPKGS RGLPGTPGQP GSSGSKGEPG SPGLVHLPEL PGFPGPRGEK 
       730        740        750        760        770        780 
GLPGFPGLPG KDGLPGMIGS PGLPGSKGAT GDIFGAENGA PGEQGLQGLT GHKGFLGDSG 
       790        800        810        820        830        840 
LPGLKGVHGK PGLLGPKGER GSPGTPGQVG QPGTPGSSGP YGIKGKSGLP GAPGFPGISG 
       850        860        870        880        890        900 
HPGKKGTRGK KGPPGSIVKK GLPGLKGLPG NPGLVGLKGS PGSPGVAGLP ALSGPKGEKG 
       910        920        930        940        950        960 
SVGFVGFPGI PGLPGIPGTR GLKGIPGSTG KMGPSGRAGT PGEKGDRGNP GPVGIPSPRR 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PMSNLWLKGD KGSQGSAGSN GFPGPRGDKG EAGRPGPPGL PGAPGLPGII KGVSGKPGPP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
GFMGIRGLPG LKGSSGITGF PGMPGESGSQ GIRGSPGLPG ASGLPGLKGD NGQTVEISGS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
PGPKGQPGES GFKGTKGRDG LIGNIGFPGN KGEDGKVGVS GDVGLPGAPG FPGVAGMRGE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
PGLPGSSGHQ GAIGPLGSPG LIGPKGFPGF PGLHGLNGLP GTKGTHGTPG PSITGVPGPA 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GLPGPKGEKG YPGIGIGAPG KPGLRGQKGD RGFPGLQGPA GLPGAPGISL PSLIAGQPGD 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
PGRPGLDGER GRPGPAGPPG PPGPSSNQGD TGDPGFPGIP GPKGPKGDQG IPGFSGLPGE 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
LGLKGMRGEP GFMGTPGKVG PPGDPGFPGM KGKAGPRGSS GLQGDPGQTP TAEAVQVPPG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PLGLPGIDGI PGLTGDPGAQ GPVGLQGSKG LPGIPGKDGP SGLPGPPGAL GDPGLPGLQG 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
PPGFEGAPGQ QGPFGMPGMP GQSMRVGYTL VKHSQSEQVP PCPIGMSQLW VGYSLLFVEG 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
QEKAHNQDLG FAGSCLPRFS TMPFIYCNIN EVCHYARRND KSYWLSTTAP IPMMPVSQTQ 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
IPQYISRCSV CEAPSQAIAV HSQDITIPQC PLGWRSLWIG YSFLMHTAAG AEGGGQSLVS 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PGSCLEDFRA TPFIECSGAR GTCHYFANKY SFWLTTVEER QQFGELPVSE TLKAGQLHTR 
      1690    
VSRCQVCMKS L

Isoforms

- Isoform B of Collagen alpha-6(IV) chain

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MLINKLWLLL VTLCLTEELA AAGEKSYGKP CGGQDCSGSC QCFPEKGARG RPGPIGIQGP 
        70         80         90        100        110        120 
TGPQGFTGST GLSGLKGERG FPGLLGPYGP KGDKGPMGVP GFLGINGIPG HPGQPGPRGP 
       130        140        150        160        170        180 
PGLDGCNGTQ GAVGFPGPDG YPGLLGPPGL PGQKGSKGDP VLAPGSFKGM KGDPGLPGLD 
       190        200        210        220        230        240 
GITGPQGAPG FPGAVGPAGP PGLQGPPGPP GPLGPDGNMG LGFQGEKGVK GDVGLPGPAG 
       250        260        270        280        290        300 
PPPSTGELEF MGFPKGKKGS KGEPGPKGFP GISGPPGFPG LGTTGEKGEK GEKGIPGLPG 
       310        320        330        340        350        360 
PRGPMGSEGV QGPPGQQGKK GTLGFPGLNG FQGIEGQKGD IGLPGPDVFI DIDGAVISGN 
       370        380        390        400        410        420 
PGDPGVPGLP GLKGDEGIQG LRGPSGVPGL PALSGVPGAL GPQGFPGLKG DQGNPGRTTI 
       430        440        450        460        470        480 
GAAGLPGRDG LPGPPGPPGP PSPEFETETL HNKESGFPGL RGEQGPKGNL GLKGIKGDSG 
       490        500        510        520        530        540 
FCACDGGVPN TGPPGEPGPP GPWGLIGLPG LKGARGDRGS GGAQGPAGAP GLVGPLGPSG 
       550        560        570        580        590        600 
PKGKKGEPIL STIQGMPGDR GDSGSQGFRG VIGEPGKDGV PGLPGLPGLP GDGGQGFPGE 
       610        620        630        640        650        660 
KGLPGLPGEK GHPGPPGLPG NGLPGLPGPR GLPGDKGKDG LPGQQGLPGS KGITLPCIIP 
       670        680        690        700        710        720 
GSYGPSGFPG TPGFPGPKGS RGLPGTPGQP GSSGSKGEPG SPGLVHLPEL PGFPGPRGEK 
       730        740        750        760        770        780 
GLPGFPGLPG KDGLPGMIGS PGLPGSKGAT GDIFGAENGA PGEQGLQGLT GHKGFLGDSG 
       790        800        810        820        830        840 
LPGLKGVHGK PGLLGPKGER GSPGTPGQVG QPGTPGSSGP YGIKGKSGLP GAPGFPGISG 
       850        860        870        880        890        900 
HPGKKGTRGK KGPPGSIVKK GLPGLKGLPG NPGLVGLKGS PGSPGVAGLP ALSGPKGEKG 
       910        920        930        940        950        960 
SVGFVGFPGI PGLPGIPGTR GLKGIPGSTG KMGPSGRAGT PGEKGDRGNP GPVGIPSPRR 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PMSNLWLKGD KGSQGSAGSN GFPGPRGDKG EAGRPGPPGL PGAPGLPGII KGVSGKPGPP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
GFMGIRGLPG LKGSSGITGF PGMPGESGSQ GIRGSPGLPG ASGLPGLKGD NGQTVEISGS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
PGPKGQPGES GFKGTKGRDG LIGNIGFPGN KGEDGKVGVS GDVGLPGAPG FPGVAGMRGE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
PGLPGSSGHQ GAIGPLGSPG LIGPKGFPGF PGLHGLNGLP GTKGTHGTPG PSITGVPGPA 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GLPGPKGEKG YPGIGIGAPG KPGLRGQKGD RGFPGLQGPA GLPGAPGISL PSLIAGQPGD 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
PGRPGLDGER GRPGPAGPPG PPGPSSNQGD TGDPGFPGIP GPKGPKGDQG IPGFSGLPGE 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
LGLKGMRGEP GFMGTPGKVG PPGDPGFPGM KGKAGPRGSS GLQGDPGQTP TAEAVQVPPG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PLGLPGIDGI PGLTGDPGAQ GPVGLQGSKG LPGIPGKDGP SGLPGPPGAL GDPGLPGLQG 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
PPGFEGAPGQ QGPFGMPGMP GQSMRVGYTL VKHSQSEQVP PCPIGMSQLW VGYSLLFVEG 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
QEKAHNQDLG FAGSCLPRFS TMPFIYCNIN EVCHYARRND KSYWLSTTAP IPMMPVSQTQ 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
IPQYISRCSV CEAPSQAIAV HSQDITIPQC PLGWRSLWIG YSFLMHTAAG AEGGGQSLVS 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PGSCLEDFRA TPFIECSGAR GTCHYFANKY SFWLTTVEER QQFGELPVSE TLKAGQLHTR 
      1690    
VSRCQVCMKS L



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q14031-23-unknown GEKSYG... 23 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q14031-23-unknown GEKSYG... 23 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt113225

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...CMKSL 1691 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...CMKSL 1691 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt66896

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)