TopFIND 4.0

Q17RW2: Collagen alpha-1(XXIV) chain

General Information

Protein names
- Collagen alpha-1(XXIV) chain
Gene names COL24A1
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q17RW2

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MHLRAHRTRR GKVSPTAKTK SLLHFIVLCV AGVVVHAQEQ GIDILHQLGL GGKDVRHSSP 
        70         80         90        100        110        120 
ATAVPSASTP LPQGVHLTES GVIFKNDAYI ETPFVKILPV NLGQPFTILT GLQSHRVNNA 
       130        140        150        160        170        180 
FLFSIRNKNR LQLGVQLLPK KLVVHIRGKQ PAVFNYSVHD EQWHSFAITI RNQSVSMFVE 
       190        200        210        220        230        240 
CGKKYFSTET IPEVQTFDSN SVFTLGSMNN NSIHFEGIVC QLDIIPSAEA SADYCRYVKQ 
       250        260        270        280        290        300 
QCRQADKYQP ETSIPCTTLI PTKIPEHSPP PKLFAEKVLS EDTFTEGKSI PNIIKNDSET 
       310        320        330        340        350        360 
VYKRQEHQIS RSQLSSLQSG NVSAVDLTNH GIQAKEMITE EDTQTNFSLS VTTHRISEAK 
       370        380        390        400        410        420 
MNTKEKFSSL LNMSDNITQH DDRVTGLSLF KKMPSILPQI KQDTITNLKK AITANLHTNE 
       430        440        450        460        470        480 
LMEMQPILNT SLHRVTNEPS VDNHLDLRKE GEFYPDATYP IENSYETELY DYYYYEDLNT 
       490        500        510        520        530        540 
MLEMEYLRGP KGDTGPPGPP GPAGIPGPSG KRGPRGIPGP HGNPGLPGLP GPKGPKGDPG 
       550        560        570        580        590        600 
FSPGQPVPGE KGDQGLSGLM GPPGMQGDKG LKGHPGLPGL PGEQGIPGFA GNIGSPGYPG 
       610        620        630        640        650        660 
RQGLAGPEGN PGPKGAQGFI GSPGEAGQLG PEGERGIPGI RGKKGFKGRQ GFPGDFGDRG 
       670        680        690        700        710        720 
PAGLDGSPGL VGGTGPPGFP GLRGSVGPVG PIGPAGIPGP MGLSGNKGLP GIKGDKGEQG 
       730        740        750        760        770        780 
TAGELGEPGY PGDKGAVGLP GPPGMRGKSG PSGQTGDPGL QGPSGPPGPE GFPGDIGIPG 
       790        800        810        820        830        840 
QNGPEGPKGL LGNRGPPGPP GLKGTQGEEG PIGAFGELGP RGKPGQKGYA GEPGPEGLKG 
       850        860        870        880        890        900 
EVGDQGNIGK IGETGPVGLP GEVGMTGSIG EKGERGSPGP LGPQGEKGVM GYPGPPGVPG 
       910        920        930        940        950        960 
PIGPLGLPGH VGARGPPGSQ GPKGQRGSRG PDGLLGEQGI QGAKGEKGDQ GKRGPHGLIG 
       970        980        990       1000       1010       1020 
KTGNPGERGF QGKPGLQGLP GSTGDRGLPG EPGLRGLQGD VGPPGEMGME GPPGTEGESG 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LQGEPGAKGD VGTAGSVGGT GEPGLRGEPG APGEEGLQGK DGLKGVPGGR GLPGEDGEKG 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
EMGLPGIIGP LGRSGQTGLP GPEGIVGIPG QRGRPGKKGD KGQIGPTGEV GSRGPPGKIG 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
KSGPKGARGT RGAVGHLGLM GPDGEPGIPG YRGHQGQPGP SGLPGPKGEK GYPGEDSTVL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GPPGPRGEPG PVGDQGERGE PGAEGYKGHV GVPGLRGATG QQGPPGEPGD QGEQGLKGER 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GSEGNKGKKG APGPSGKPGI PGLQGLLGPK GIQGYHGADG ISGNPGKIGP PGKQGLPGIR 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
GGPGRTGLAG APGPPGVKGS SGLPGSPGIQ GPKGEQGLPG QPGIQGKRGH RGAQGDQGPC 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
GDPGLKGQPG EYGVQGLTGF QGFPGPKGPE GDAGIVGISG PKGPIGHRGN TGPLGREGII 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
GPTGRTGPRG EKGFRGETGP QGPRGQPGPP GPPGAPGPRK QMDINAAIQA LIESNTALQM 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
ESYQNTEVTL IDHSEEIFKT LNYLSNLLHS IKNPLGTRDN PARICKDLLN CEQKVSDGKY 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
WIDPNLGCPS DAIEVFCNFS AGGQTCLPPV SVTKLEFGVG KVQMNFLHLL SSEATHIITI 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
HCLNTPRWTS TQTSGPGLPI GFKGWNGQIF KVNTLLEPKV LSDDCKIQDG SWHKATFLFH 
      1690       1700       1710    
TQEPNQLPVI EVQKLPHLKT ERKYYIDSSS VCFL

Isoforms

- Isoform 2 of Collagen alpha-1(XXIV) chain

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MHLRAHRTRR GKVSPTAKTK SLLHFIVLCV AGVVVHAQEQ GIDILHQLGL GGKDVRHSSP 
        70         80         90        100        110        120 
ATAVPSASTP LPQGVHLTES GVIFKNDAYI ETPFVKILPV NLGQPFTILT GLQSHRVNNA 
       130        140        150        160        170        180 
FLFSIRNKNR LQLGVQLLPK KLVVHIRGKQ PAVFNYSVHD EQWHSFAITI RNQSVSMFVE 
       190        200        210        220        230        240 
CGKKYFSTET IPEVQTFDSN SVFTLGSMNN NSIHFEGIVC QLDIIPSAEA SADYCRYVKQ 
       250        260        270        280        290        300 
QCRQADKYQP ETSIPCTTLI PTKIPEHSPP PKLFAEKVLS EDTFTEGKSI PNIIKNDSET 
       310        320        330        340        350        360 
VYKRQEHQIS RSQLSSLQSG NVSAVDLTNH GIQAKEMITE EDTQTNFSLS VTTHRISEAK 
       370        380        390        400        410        420 
MNTKEKFSSL LNMSDNITQH DDRVTGLSLF KKMPSILPQI KQDTITNLKK AITANLHTNE 
       430        440        450        460        470        480 
LMEMQPILNT SLHRVTNEPS VDNHLDLRKE GEFYPDATYP IENSYETELY DYYYYEDLNT 
       490        500        510        520        530        540 
MLEMEYLRGP KGDTGPPGPP GPAGIPGPSG KRGPRGIPGP HGNPGLPGLP GPKGPKGDPG 
       550        560        570        580        590        600 
FSPGQPVPGE KGDQGLSGLM GPPGMQGDKG LKGHPGLPGL PGEQGIPGFA GNIGSPGYPG 
       610        620        630        640        650        660 
RQGLAGPEGN PGPKGAQGFI GSPGEAGQLG PEGERGIPGI RGKKGFKGRQ GFPGDFGDRG 
       670        680        690        700        710        720 
PAGLDGSPGL VGGTGPPGFP GLRGSVGPVG PIGPAGIPGP MGLSGNKGLP GIKGDKGEQG 
       730        740        750        760        770        780 
TAGELGEPGY PGDKGAVGLP GPPGMRGKSG PSGQTGDPGL QGPSGPPGPE GFPGDIGIPG 
       790        800        810        820        830        840 
QNGPEGPKGL LGNRGPPGPP GLKGTQGEEG PIGAFGELGP RGKPGQKGYA GEPGPEGLKG 
       850        860        870        880        890        900 
EVGDQGNIGK IGETGPVGLP GEVGMTGSIG EKGERGSPGP LGPQGEKGVM GYPGPPGVPG 
       910        920        930        940        950        960 
PIGPLGLPGH VGARGPPGSQ GPKGQRGSRG PDGLLGEQGI QGAKGEKGDQ GKRGPHGLIG 
       970        980        990       1000       1010       1020 
KTGNPGERGF QGKPGLQGLP GSTGDRGLPG EPGLRGLQGD VGPPGEMGME GPPGTEGESG 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LQGEPGAKGD VGTAGSVGGT GEPGLRGEPG APGEEGLQGK DGLKGVPGGR GLPGEDGEKG 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
EMGLPGIIGP LGRSGQTGLP GPEGIVGIPG QRGRPGKKGD KGQIGPTGEV GSRGPPGKIG 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
KSGPKGARGT RGAVGHLGLM GPDGEPGIPG YRGHQGQPGP SGLPGPKGEK GYPGEDSTVL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GPPGPRGEPG PVGDQGERGE PGAEGYKGHV GVPGLRGATG QQGPPGEPGD QGEQGLKGER 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GSEGNKGKKG APGPSGKPGI PGLQGLLGPK GIQGYHGADG ISGNPGKIGP PGKQGLPGIR 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
GGPGRTGLAG APGPPGVKGS SGLPGSPGIQ GPKGEQGLPG QPGIQGKRGH RGAQGDQGPC 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
GDPGLKGQPG EYGVQGLTGF QGFPGPKGPE GDAGIVGISG PKGPIGHRGN TGPLGREGII 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
GPTGRTGPRG EKGFRGETGP QGPRGQPGPP GPPGAPGPRK QMDINAAIQA LIESNTALQM 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
ESYQNTEVTL IDHSEEIFKT LNYLSNLLHS IKNPLGTRDN PARICKDLLN CEQKVSDGKY 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
WIDPNLGCPS DAIEVFCNFS AGGQTCLPPV SVTKLEFGVG KVQMNFLHLL SSEATHIITI 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
HCLNTPRWTS TQTSGPGLPI GFKGWNGQIF KVNTLLEPKV LSDDCKIQDG SWHKATFLFH 
      1690       1700       1710    
TQEPNQLPVI EVQKLPHLKT ERKYYIDSSS VCFL



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q17RW2-1-unknown MHLRAH... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt71418
    Q17RW2-36-unknown HAQEQG... 36 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q17RW2-36-unknown HAQEQG... 36 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt115298

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...SVCFL 1714 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...SVCFL 1714 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt67036

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)