TopFIND 4.0

Q2WEA5: Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1

General Information

Protein names
- Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1
- Melastatin-1
Gene names Trpm1 {ECO:0000312|EMBL:CAI30141.1}
Organism Rattus norvegicus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q2WEA5

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MGSMRKMSSS FKRGSIKSST SGSQKGQKAW IEKTFCKREC IFVIPSTKDP NRCCCGQLTN 
        70         80         90        100        110        120 
QHIPPLPSVT PSSTAEDTKQ GDAQSGKWSV SKHTQSYPTD SYGILEFQGG GYSNKAMYIR 
       130        140        150        160        170        180 
VSYDTKPDSL LHLMVKDWQL ELPKLLISVH GGLQSFEMQP KLKQVFGKGL IKAAMTTGAW 
       190        200        210        220        230        240 
IFTGGVSTGV VSHVGDALKD HSSKSRGRLC AIGIAPWGMV ENKEDLVGKD VTRVYQTMSN 
       250        260        270        280        290        300 
PLSKLSVLNN SHTHFILADN GTLGKYGAEV KLRRQLEKHI SLQKINTRLG QGVPVVGLVV 
       310        320        330        340        350        360 
EGGPNVVSIV LEYLREDPPV PVVVCDGSGR ASDILSFAHK YCDEGGVINE SLRDQLLVTI 
       370        380        390        400        410        420 
QKTFNYSKSQ SHQLFAIIME CMKKKELVTV FRMGSEGQQD VEMAILTALL KGTNVSAPDQ 
       430        440        450        460        470        480 
LSLALAWNRV DIARSQIFVF GPHWPPLGSL APPVDTKVAE KEKKPPTATT KGRGKGKGKK 
       490        500        510        520        530        540 
KGKVKEEVEE ETDPRKIELL NWVNALEQAM LDALVLDRVD FVKLLIENGV NMQHFLTIPR 
       550        560        570        580        590        600 
LEELYNTRLG PPNTLHLLVR DVKKSNLPPD YHISLIDIGL VLEYLMGGAY RCNYTRKSFR 
       610        620        630        640        650        660 
TLYNNLFGPK RPKALKLLGM EDDEPPAKGK KKKKKKKEEE IDIDVDDPAV SRFQYPFHEL 
       670        680        690        700        710        720 
MVWAVLMKRQ KMAVFLWQRG EECMAKALVA CKLYKAMAHE SSESELVDDI SQDLDNNSKD 
       730        740        750        760        770        780 
FGQLAVELLD QSYKHDEQVA MKLLTYELKN WSNSTCLKLA VAAKHRDFIA HTCSQMLLTD 
       790        800        810        820        830        840 
MWMGRLRMRK NPGLKVIMGI LIPPTILFLE FRSYDDFSYQ TSKENEDGKE KEEENVDANA 
       850        860        870        880        890        900 
DAGSRKGDEE NEHKKQRSIP IGTKICEFYN APIVKFWFYT ISYLGYLLLF NYVILVRMDG 
       910        920        930        940        950        960 
WPSPQEWIVI SYIVSLALEK IREILMSEPG KLSQKIKVWL QEYWNITDLV AISMFMVGAI 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LRLQNQPYMG YGRVIYCVDI ILWYIRVLDI FGVNKYLGPY VMMIGKMMID MLYFVVIMLV 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
VLMSFGVARQ AILHPEEKPS WKLARNIFYM PYWMIYGEVF ADQIDRKTRI HIYAMEINPP 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
CGENLYDEEG KRLPPCIPGA WLTPALMACY LLVANILLVN LLIAVFNNTF FEVKSISNQV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
WKFQRYQLIM TFHDRPVLPP PMIILSHIYI IVMRLSGRCR KKREGDQEER DRGLKLFLSD 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
EELKKLHEFE EQCVQEHFRE KEDEQQSSSD ERIRVTSERV ENMSMRLEEI NERENFMKAS 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
LQTVDLRLSQ LEELSGRMVG ALENLAGIDR SDLIQARSRA SSECEATYLL RQSSINSADG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
YSMYRYHFNG EELLFEEPAL STSPGTVFRK KTCSFRVKEE DVKPHLDQPS SLHHTPGPSP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PATPGRSRLA LDGPLSTELR PGLDPGISAG ELDPRADFKS AEVAPSLNTA NVASTQLTVE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
STVSHPLRES KLARYYPGDL NTYKTMKSRS FVYSEGRKLV RGLSNWGAEY SSIMDQTWNS 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
AEWRCQVQRI TRSRSTDIPY IVSEAASQDE FEDEHRESLL APQISRSALT VSDRPEKENL 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LSVKPHQTLG FPCLRSRSLH GHPRSAKPSP SKLDRAGHAS STSNLAVMSD APEGQNTQQE 
   
KGNPETEC

Isoforms

- Isoform 2 of Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MGSMRKMSSS FKRGSIKSST SGSQKGQKAW IEKTFCKREC IFVIPSTKDP NRCCCGQLTN 
        70         80         90        100        110        120 
QHIPPLPSVT PSSTAEDTKQ GDAQSGKWSV SKHTQSYPTD SYGILEFQGG GYSNKAMYIR 
       130        140        150        160        170        180 
VSYDTKPDSL LHLMVKDWQL ELPKLLISVH GGLQSFEMQP KLKQVFGKGL IKAAMTTGAW 
       190        200        210        220        230        240 
IFTGGVSTGV VSHVGDALKD HSSKSRGRLC AIGIAPWGMV ENKEDLVGKD VTRVYQTMSN 
       250        260        270        280        290        300 
PLSKLSVLNN SHTHFILADN GTLGKYGAEV KLRRQLEKHI SLQKINTRLG QGVPVVGLVV 
       310        320        330        340        350        360 
EGGPNVVSIV LEYLREDPPV PVVVCDGSGR ASDILSFAHK YCDEGGVINE SLRDQLLVTI 
       370        380        390        400        410        420 
QKTFNYSKSQ SHQLFAIIME CMKKKELVTV FRMGSEGQQD VEMAILTALL KGTNVSAPDQ 
       430        440        450        460        470        480 
LSLALAWNRV DIARSQIFVF GPHWPPLGSL APPVDTKVAE KEKKPPTATT KGRGKGKGKK 
       490        500        510        520        530        540 
KGKVKEEVEE ETDPRKIELL NWVNALEQAM LDALVLDRVD FVKLLIENGV NMQHFLTIPR 
       550        560        570        580        590        600 
LEELYNTRLG PPNTLHLLVR DVKKSNLPPD YHISLIDIGL VLEYLMGGAY RCNYTRKSFR 
       610        620        630        640        650        660 
TLYNNLFGPK RPKALKLLGM EDDEPPAKGK KKKKKKKEEE IDIDVDDPAV SRFQYPFHEL 
       670        680        690        700        710        720 
MVWAVLMKRQ KMAVFLWQRG EECMAKALVA CKLYKAMAHE SSESELVDDI SQDLDNNSKD 
       730        740        750        760        770        780 
FGQLAVELLD QSYKHDEQVA MKLLTYELKN WSNSTCLKLA VAAKHRDFIA HTCSQMLLTD 
       790        800        810        820        830        840 
MWMGRLRMRK NPGLKVIMGI LIPPTILFLE FRSYDDFSYQ TSKENEDGKE KEEENVDANA 
       850        860        870        880        890        900 
DAGSRKGDEE NEHKKQRSIP IGTKICEFYN APIVKFWFYT ISYLGYLLLF NYVILVRMDG 
       910        920        930        940        950        960 
WPSPQEWIVI SYIVSLALEK IREILMSEPG KLSQKIKVWL QEYWNITDLV AISMFMVGAI 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LRLQNQPYMG YGRVIYCVDI ILWYIRVLDI FGVNKYLGPY VMMIGKMMID MLYFVVIMLV 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
VLMSFGVARQ AILHPEEKPS WKLARNIFYM PYWMIYGEVF ADQIDRKTRI HIYAMEINPP 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
CGENLYDEEG KRLPPCIPGA WLTPALMACY LLVANILLVN LLIAVFNNTF FEVKSISNQV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
WKFQRYQLIM TFHDRPVLPP PMIILSHIYI IVMRLSGRCR KKREGDQEER DRGLKLFLSD 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
EELKKLHEFE EQCVQEHFRE KEDEQQSSSD ERIRVTSERV ENMSMRLEEI NERENFMKAS 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
LQTVDLRLSQ LEELSGRMVG ALENLAGIDR SDLIQARSRA SSECEATYLL RQSSINSADG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
YSMYRYHFNG EELLFEEPAL STSPGTVFRK KTCSFRVKEE DVKPHLDQPS SLHHTPGPSP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PATPGRSRLA LDGPLSTELR PGLDPGISAG ELDPRADFKS AEVAPSLNTA NVASTQLTVE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
STVSHPLRES KLARYYPGDL NTYKTMKSRS FVYSEGRKLV RGLSNWGAEY SSIMDQTWNS 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
AEWRCQVQRI TRSRSTDIPY IVSEAASQDE FEDEHRESLL APQISRSALT VSDRPEKENL 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LSVKPHQTLG FPCLRSRSLH GHPRSAKPSP SKLDRAGHAS STSNLAVMSD APEGQNTQQE 
   
KGNPETEC



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q2WEA5-1-unknown MGSMRK... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q2WEA5-1-unknown MGSMRK... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt193656

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...PETEC 1628 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...PETEC 1628 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt153602

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)