TopFIND 4.0

Q38SD2: Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1

General Information

Protein names
- Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1
- 2.7.11.1
Gene names LRRK1
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q38SD2

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MAGMSQRPPS MYWCVGPEES AVCPERAMET LNGAGDTGGK PSTRGGDPAA RSRRTEGIRA 
        70         80         90        100        110        120 
AYRRGDRGGA RDLLEEACDQ CASQLEKGQL LSIPAAYGDL EMVRYLLSKR LVELPTEPTD 
       130        140        150        160        170        180 
DNPAVVAAYF GHTAVVQELL ESLPGPCSPQ RLLNWMLALA CQRGHLGVVK LLVLTHGADP 
       190        200        210        220        230        240 
ESYAVRKNEF PVIVRLPLYA AIKSGNEDIA IFLLRHGAYF CSYILLDSPD PSKHLLRKYF 
       250        260        270        280        290        300 
IEASPLPSSY PGKTALRVKW SHLRLPWVDL DWLIDISCQI TELDLSANCL ATLPSVIPWG 
       310        320        330        340        350        360 
LINLRKLNLS DNHLGELPGV QSSDEIICSR LLEIDISSNK LSHLPPGFLH LSKLQKLTAS 
       370        380        390        400        410        420 
KNCLEKLFEE ENATNWIGLR KLQELDISDN KLTELPALFL HSFKSLNSLN VSRNNLKVFP 
       430        440        450        460        470        480 
DPWACPLKCC KASRNALECL PDKMAVFWKN HLKDVDFSEN ALKEVPLGLF QLDALMFLRL 
       490        500        510        520        530        540 
QGNQLAALPP QEKWTCRQLK TLDLSRNQLG KNEDGLKTKR IAFFTTRGRQ RSGTEAASVL 
       550        560        570        580        590        600 
EFPAFLSESL EVLCLNDNHL DTVPPSVCLL KSLSELYLGN NPGLRELPPE LGQLGNLWQL 
       610        620        630        640        650        660 
DTEDLTISNV PAEIQKEGPK AMLSYLRAQL RKAEKCKLMK MIIVGPPRQG KSTLLEILQT 
       670        680        690        700        710        720 
GRAPQVVHGE ATIRTTKWEL QRPAGSRAKV ESVEFNVWDI GGPASMATVN QCFFTDKALY 
       730        740        750        760        770        780 
VVVWNLALGE EAVANLQFWL LNIEAKAPNA VVLVVGTHLD LIEAKFRVER IATLRAYVLA 
       790        800        810        820        830        840 
LCRSPSGSRA TGFPDITFKH LHEISCKSLE GQEGLRQLIF HVTCSMKDVG STIGCQRLAG 
       850        860        870        880        890        900 
RLIPRSYLSL QEAVLAEQQR RSRDDDVQYL TDRQLEQLVE QTPDNDIKDY EDLQSAISFL 
       910        920        930        940        950        960 
IETGTLLHFP DTSHGLRNLY FLDPIWLSEC LQRIFNIKGS RSVAKNGVIR AEDLRMLLVG 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TGFTQQTEEQ YFQFLAKFEI ALPVANDSYL LPHLLPSKPG LDTHGMRHPT ANTIQRVFKM 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SFVPVGFWQR FIARMLISLA EMDLQLFENK KNTKSRNRKV TIYSFTGNQR NRCSTFRVKR 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
NQTIYWQEGL LVTFDGGYLS VESSDVNWKK KKSGGMKIVC QSEVRDFSAM AFITDHVNSL 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
IDQWFPALTA TESDGTPLME QYVPCPVCET AWAQHTDPSE KSEDVQYFDM EDCVLTAIER 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
DFISCPRHPD LPVPLQELVP ELFMTDFPAR LFLENSKLEH SEDEGSVLGQ GGSGTVIYRA 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RYQGQPVAVK RFHIKKFKNF ANVPADTMLR HLRATDAMKN FSEFRQEASM LHALQHPCIV 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
ALIGISIHPL CFALELAPLS SLNTVLSENA RDSSFIPLGH MLTQKIAYQI ASGLAYLHKK 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
NIIFCDLKSD NILVWSLDVK EHINIKLSDY GISRQSFHEG ALGVEGTPGY QAPEIRPRIV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
YDEKVDMFSY GMVLYELLSG QRPALGHHQL QIAKKLSKGI RPVLGQPEEV QFRRLQALMM 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
ECWDTKPEKR PLALSVVSQM KDPTFATFMY ELCCGKQTAF FSSQGQEYTV VFWDGKEESR 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
NYTVVNTEKG LMEVQRMCCP GMKVSCQLQV QRSLWTATED QKIYIYTLKG MCPLNTPQQA 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
LDTPAVVTCF LAVPVIKKNS YLVLAGLADG LVAVFPVVRG TPKDSCSYLC SHTANRSKFS 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
IADEDARQNP YPVKAMEVVN SGSEVWYSNG PGLLVIDCAS LEICRRLEPY MAPSMVTSVV 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
CSSEGRGEEV VWCLDDKANS LVMYHSTTYQ LCARYFCGVP SPLRDMFPVR PLDTEPPAAS 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
HTANPKVPEG DSIADVSIMY SEELGTQILI HQESLTDYCS MSSYSSSPPR QAARSPSSLP 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
SSPASSSSVP FSTDCEDSDM LHTPGAASDR SEHDLTPMDG ETFSQHLQAV KILAVRDLIW 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
VPRRGGDVIV IGLEKDSGAQ RGRVIAVLKA RELTPHGVLV DAAVVAKDTV VCTFENENTE 
      1990       2000       2010    
WCLAVWRGWG AREFDIFYQS YEELGRLEAC TRKRR

Isoforms

- Isoform 2 of Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MAGMSQRPPS MYWCVGPEES AVCPERAMET LNGAGDTGGK PSTRGGDPAA RSRRTEGIRA 
        70         80         90        100        110        120 
AYRRGDRGGA RDLLEEACDQ CASQLEKGQL LSIPAAYGDL EMVRYLLSKR LVELPTEPTD 
       130        140        150        160        170        180 
DNPAVVAAYF GHTAVVQELL ESLPGPCSPQ RLLNWMLALA CQRGHLGVVK LLVLTHGADP 
       190        200        210        220        230        240 
ESYAVRKNEF PVIVRLPLYA AIKSGNEDIA IFLLRHGAYF CSYILLDSPD PSKHLLRKYF 
       250        260        270        280        290        300 
IEASPLPSSY PGKTALRVKW SHLRLPWVDL DWLIDISCQI TELDLSANCL ATLPSVIPWG 
       310        320        330        340        350        360 
LINLRKLNLS DNHLGELPGV QSSDEIICSR LLEIDISSNK LSHLPPGFLH LSKLQKLTAS 
       370        380        390        400        410        420 
KNCLEKLFEE ENATNWIGLR KLQELDISDN KLTELPALFL HSFKSLNSLN VSRNNLKVFP 
       430        440        450        460        470        480 
DPWACPLKCC KASRNALECL PDKMAVFWKN HLKDVDFSEN ALKEVPLGLF QLDALMFLRL 
       490        500        510        520        530        540 
QGNQLAALPP QEKWTCRQLK TLDLSRNQLG KNEDGLKTKR IAFFTTRGRQ RSGTEAASVL 
       550        560        570        580        590        600 
EFPAFLSESL EVLCLNDNHL DTVPPSVCLL KSLSELYLGN NPGLRELPPE LGQLGNLWQL 
       610        620        630        640        650        660 
DTEDLTISNV PAEIQKEGPK AMLSYLRAQL RKAEKCKLMK MIIVGPPRQG KSTLLEILQT 
       670        680        690        700        710        720 
GRAPQVVHGE ATIRTTKWEL QRPAGSRAKV ESVEFNVWDI GGPASMATVN QCFFTDKALY 
       730        740        750        760        770        780 
VVVWNLALGE EAVANLQFWL LNIEAKAPNA VVLVVGTHLD LIEAKFRVER IATLRAYVLA 
       790        800        810        820        830        840 
LCRSPSGSRA TGFPDITFKH LHEISCKSLE GQEGLRQLIF HVTCSMKDVG STIGCQRLAG 
       850        860        870        880        890        900 
RLIPRSYLSL QEAVLAEQQR RSRDDDVQYL TDRQLEQLVE QTPDNDIKDY EDLQSAISFL 
       910        920        930        940        950        960 
IETGTLLHFP DTSHGLRNLY FLDPIWLSEC LQRIFNIKGS RSVAKNGVIR AEDLRMLLVG 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TGFTQQTEEQ YFQFLAKFEI ALPVANDSYL LPHLLPSKPG LDTHGMRHPT ANTIQRVFKM 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SFVPVGFWQR FIARMLISLA EMDLQLFENK KNTKSRNRKV TIYSFTGNQR NRCSTFRVKR 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
NQTIYWQEGL LVTFDGGYLS VESSDVNWKK KKSGGMKIVC QSEVRDFSAM AFITDHVNSL 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
IDQWFPALTA TESDGTPLME QYVPCPVCET AWAQHTDPSE KSEDVQYFDM EDCVLTAIER 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
DFISCPRHPD LPVPLQELVP ELFMTDFPAR LFLENSKLEH SEDEGSVLGQ GGSGTVIYRA 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RYQGQPVAVK RFHIKKFKNF ANVPADTMLR HLRATDAMKN FSEFRQEASM LHALQHPCIV 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
ALIGISIHPL CFALELAPLS SLNTVLSENA RDSSFIPLGH MLTQKIAYQI ASGLAYLHKK 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
NIIFCDLKSD NILVWSLDVK EHINIKLSDY GISRQSFHEG ALGVEGTPGY QAPEIRPRIV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
YDEKVDMFSY GMVLYELLSG QRPALGHHQL QIAKKLSKGI RPVLGQPEEV QFRRLQALMM 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
ECWDTKPEKR PLALSVVSQM KDPTFATFMY ELCCGKQTAF FSSQGQEYTV VFWDGKEESR 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
NYTVVNTEKG LMEVQRMCCP GMKVSCQLQV QRSLWTATED QKIYIYTLKG MCPLNTPQQA 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
LDTPAVVTCF LAVPVIKKNS YLVLAGLADG LVAVFPVVRG TPKDSCSYLC SHTANRSKFS 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
IADEDARQNP YPVKAMEVVN SGSEVWYSNG PGLLVIDCAS LEICRRLEPY MAPSMVTSVV 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
CSSEGRGEEV VWCLDDKANS LVMYHSTTYQ LCARYFCGVP SPLRDMFPVR PLDTEPPAAS 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
HTANPKVPEG DSIADVSIMY SEELGTQILI HQESLTDYCS MSSYSSSPPR QAARSPSSLP 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
SSPASSSSVP FSTDCEDSDM LHTPGAASDR SEHDLTPMDG ETFSQHLQAV KILAVRDLIW 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
VPRRGGDVIV IGLEKDSGAQ RGRVIAVLKA RELTPHGVLV DAAVVAKDTV VCTFENENTE 
      1990       2000       2010    
WCLAVWRGWG AREFDIFYQS YEELGRLEAC TRKRR



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q38SD2-1-unknown MAGMSQ... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q38SD2-1-unknown MAGMSQ... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt79985

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...TRKRR 2015 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)