TopFIND 4.0

Q3UHA3: Spatacsin

General Information

Protein names
- Spatacsin
- Spastic paraplegia 11 protein homolog
Gene names Spg11
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q3UHA3

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MAAQPGPGSA ASPGCAGAME RVLPMLLVRI PAEETAQLGP RAQLHRELEA LGSLTAAGSL 
        70         80         90        100        110        120 
QVLSLAPGSR GGSSCCLPGP FRQFLWEESQ NSTSRDRPKL LVAREDYELL VYEFDLRDGR 
       130        140        150        160        170        180 
CDAALLHGCC GRTLQKLTED QGVSISFKSL RILSFHNNTS LLLINRCLIL RVVFPGKEPG 
       190        200        210        220        230        240 
VPVLDCLSLP LPAQAADMII DAQLCERFLF VLSTVGLIYI FNTMDGTQVA QVDLALLRED 
       250        260        270        280        290        300 
SEQLEPASVS SFTSLRVSQD LDVLVLVSSA STAVALNLHL YFRQHPGHLL CEGTLEDLPI 
       310        320        330        340        350        360 
EGPPGIDEDD LVNSAHNMKL SKVSFQVDRS WRAQLLSLNE SVRGSEPEVS CCAPWFQSAL 
       370        380        390        400        410        420 
RLESLESADH TPTVPTHVFI PGDVPRGRCA FPQKEHVKSS DPGRPWKTMH LSEHEQPTEL 
       430        440        450        460        470        480 
TCLSVTGFTA LFTWAVGATS CTIGLWDLET QSMQCFSLSQ KCTPVDIGGD QQLCLALTDD 
       490        500        510        520        530        540 
GLSLILFGLT QEEFLNRLMI HGSASTVDSL CHLNGWGRCS IPIHALEAGI ENRQLDTVDF 
       550        560        570        580        590        600 
FLKSKENLLT PSSQSPAPDQ QHPFSSHLYL RQVEEMSPAL DLLCSAIRES DSETQSKHFA 
       610        620        630        640        650        660 
EQLLHLTLSF LNKQIRELCV HTEELDEHFQ KGVAILTSYI NELRTFMIKF PWKPGDAIDE 
       670        680        690        700        710        720 
SDVNEGVVTV KEDRVWEELS FEEVIADAIL NNRIPEAQTF FRISGHSAQR LEELVRIGLD 
       730        740        750        760        770        780 
LAFDSLKKNN VEEASRLLRN MGFSVEDELL KICFYTTDKN IRDFLVEILK EKECFSEKER 
       790        800        810        820        830        840 
RTVDFVHQLE ALYSGHFQEN AQTQAFPRYW IKEQDCFKHK SVLDTFLKYD KKDEFHKQDH 
       850        860        870        880        890        900 
RIALNWAHRW DLQTQECILL RRLSPEEYKA RSPEALWRHL TARHDCSSIS LWMEEFQTQE 
       910        920        930        940        950        960 
TESPQQSKWP PLSADIIEQG TCCHSHMRNE ILDKLARSGI FLASELEDFE RLLLRLSRIG 
       970        980        990       1000       1010       1020 
GVMQDSLPVQ SYKSRAGCDF HSRFILYCLE HGLQHLLYTY LDYYKLSPGN CPFLEKKELH 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
EAHPWLEFLV QCRQVSSNLT DPKLIFQASL ANAQILIPTN QASVSSMLLE GHTLLALATT 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
MYAPGGVSQV IQNEDSENCL KKVDPQLLKV ALTPYPKLKA ALFPQYTAPS ILPSDITLYH 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
LIQSLPPFDP SRLFVWQSAN TLAIGDTGSQ LPHFSSPDLV SKYAVLERLN YAYYLHHGRP 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SFAFGTFLVQ ELIKSKTPKQ LIQQVGKEAY TLGLSSFTNP SVGAACVCFL ELLGLSSLKL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RVDLKMANVI LGSKRRDEDA RSSFIRESLA EKLSKLADGD RAATEELLVL LEEGVWDSIE 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
QQGFSRLSSE SSSQWALVLQ FCMLHDRKLS VSYLRECAKA NDWLQFLVHS QLHNYHPAEV 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
ESLLQYFSPV LQSHLKLASE KLSSGSISRD DSCLQELQKN KGETSNFFEI LHRCSDESTS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
WSWLLAEAVR HRAPILSVLA SCVQGASVVS CLCVWIVTSV EDKVAAEAMG HIQISVEDHH 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
WSLKDLSIIW RTVLTRRKSH TLIRGFQLFI KDSPLLLIME MYELCMFFKN YEKAKVKLLE 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
FQKSLETLDT VAARVLPIIP ASWMKDQVCF LLKLMPQQCE TQYELGKLLQ LFVGTEQLFS 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
DGPDVQKLCL LSQVLKDTPI AISPAVISSY STENFQRECR SILEKLKADG QFAVARRVAE 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
LAALPVDSLL IEQLTQEMQT LTHTPQWSLK QERLGFWKKC HEIFKKNSIS KRAASSFFSS 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
QAPEVSEHPA EQGSLEERHL LLTLAGHWLA QEEPVPVEEL EGLEKQIWIC RVAQHTCGGA 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
EEEAKPSLSQ HKLAAAELSF DSLASELSFS KLAALNTSKY LGLNDLPSKT TCENRLKHKE 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
QESLNTLIGQ LLDGGCVHEA SRVCQYFRFY SQDLVLVLHC RALASAEATM EDLHSEIRAL 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
LSSAAQPEDL ESPSVPLRKA HSSSSLDSQS FVMVPPTDEV AQNLHTLISK CLHGKNYCRQ 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
VLCLYELAKD LGCSYGDVAA RDSEAMLRAI LASQRPDRCR QAQVFINTQG LEADTVAELV 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
AEEVTRELLT PSEGTGEKQP FNPAEESQTF LQLTALCQDR TLVGMKLLDK IPSVPHGELS 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
CTTELLILAH HCFTFTCHME GITRVLQAAR MLTDNHLAPN EEYGLVVRLL TGIGRYNEMT 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
YIFDLLHQKH YFEVLMRKKL DPTGTLKTAL LDYIKRCRPG DSEKHNMIAL CFSMCREIGE 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
NHEAAACIQL KLIESQPWEE SLKDGAQLKQ LLLKALTLML DAAESYAKDS CVRQALHCNR 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
LTKLITLQIH FLNSGQNTML INLGHQKLMD CIMTLPRFYQ ASIVAEAYDF VPDWAEVLYQ 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
QVILKGDFSY LEEFKQQKLL RPNIFEDISK KYKQHQPTDR VTENLKKLLS YCEDIYLYYK 
      2410       2420       2430    
LAYEHKFFEI VNMLLKDPQT GCCLKDMLAG 

Isoforms

- Isoform 2 of Spatacsin

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MAAQPGPGSA ASPGCAGAME RVLPMLLVRI PAEETAQLGP RAQLHRELEA LGSLTAAGSL 
        70         80         90        100        110        120 
QVLSLAPGSR GGSSCCLPGP FRQFLWEESQ NSTSRDRPKL LVAREDYELL VYEFDLRDGR 
       130        140        150        160        170        180 
CDAALLHGCC GRTLQKLTED QGVSISFKSL RILSFHNNTS LLLINRCLIL RVVFPGKEPG 
       190        200        210        220        230        240 
VPVLDCLSLP LPAQAADMII DAQLCERFLF VLSTVGLIYI FNTMDGTQVA QVDLALLRED 
       250        260        270        280        290        300 
SEQLEPASVS SFTSLRVSQD LDVLVLVSSA STAVALNLHL YFRQHPGHLL CEGTLEDLPI 
       310        320        330        340        350        360 
EGPPGIDEDD LVNSAHNMKL SKVSFQVDRS WRAQLLSLNE SVRGSEPEVS CCAPWFQSAL 
       370        380        390        400        410        420 
RLESLESADH TPTVPTHVFI PGDVPRGRCA FPQKEHVKSS DPGRPWKTMH LSEHEQPTEL 
       430        440        450        460        470        480 
TCLSVTGFTA LFTWAVGATS CTIGLWDLET QSMQCFSLSQ KCTPVDIGGD QQLCLALTDD 
       490        500        510        520        530        540 
GLSLILFGLT QEEFLNRLMI HGSASTVDSL CHLNGWGRCS IPIHALEAGI ENRQLDTVDF 
       550        560        570        580        590        600 
FLKSKENLLT PSSQSPAPDQ QHPFSSHLYL RQVEEMSPAL DLLCSAIRES DSETQSKHFA 
       610        620        630        640        650        660 
EQLLHLTLSF LNKQIRELCV HTEELDEHFQ KGVAILTSYI NELRTFMIKF PWKPGDAIDE 
       670        680        690        700        710        720 
SDVNEGVVTV KEDRVWEELS FEEVIADAIL NNRIPEAQTF FRISGHSAQR LEELVRIGLD 
       730        740        750        760        770        780 
LAFDSLKKNN VEEASRLLRN MGFSVEDELL KICFYTTDKN IRDFLVEILK EKECFSEKER 
       790        800        810        820        830        840 
RTVDFVHQLE ALYSGHFQEN AQTQAFPRYW IKEQDCFKHK SVLDTFLKYD KKDEFHKQDH 
       850        860        870        880        890        900 
RIALNWAHRW DLQTQECILL RRLSPEEYKA RSPEALWRHL TARHDCSSIS LWMEEFQTQE 
       910        920        930        940        950        960 
TESPQQSKWP PLSADIIEQG TCCHSHMRNE ILDKLARSGI FLASELEDFE RLLLRLSRIG 
       970        980        990       1000       1010       1020 
GVMQDSLPVQ SYKSRAGCDF HSRFILYCLE HGLQHLLYTY LDYYKLSPGN CPFLEKKELH 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
EAHPWLEFLV QCRQVSSNLT DPKLIFQASL ANAQILIPTN QASVSSMLLE GHTLLALATT 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
MYAPGGVSQV IQNEDSENCL KKVDPQLLKV ALTPYPKLKA ALFPQYTAPS ILPSDITLYH 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
LIQSLPPFDP SRLFVWQSAN TLAIGDTGSQ LPHFSSPDLV SKYAVLERLN YAYYLHHGRP 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SFAFGTFLVQ ELIKSKTPKQ LIQQVGKEAY TLGLSSFTNP SVGAACVCFL ELLGLSSLKL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RVDLKMANVI LGSKRRDEDA RSSFIRESLA EKLSKLADGD RAATEELLVL LEEGVWDSIE 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
QQGFSRLSSE SSSQWALVLQ FCMLHDRKLS VSYLRECAKA NDWLQFLVHS QLHNYHPAEV 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
ESLLQYFSPV LQSHLKLASE KLSSGSISRD DSCLQELQKN KGETSNFFEI LHRCSDESTS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
WSWLLAEAVR HRAPILSVLA SCVQGASVVS CLCVWIVTSV EDKVAAEAMG HIQISVEDHH 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
WSLKDLSIIW RTVLTRRKSH TLIRGFQLFI KDSPLLLIME MYELCMFFKN YEKAKVKLLE 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
FQKSLETLDT VAARVLPIIP ASWMKDQVCF LLKLMPQQCE TQYELGKLLQ LFVGTEQLFS 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
DGPDVQKLCL LSQVLKDTPI AISPAVISSY STENFQRECR SILEKLKADG QFAVARRVAE 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
LAALPVDSLL IEQLTQEMQT LTHTPQWSLK QERLGFWKKC HEIFKKNSIS KRAASSFFSS 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
QAPEVSEHPA EQGSLEERHL LLTLAGHWLA QEEPVPVEEL EGLEKQIWIC RVAQHTCGGA 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
EEEAKPSLSQ HKLAAAELSF DSLASELSFS KLAALNTSKY LGLNDLPSKT TCENRLKHKE 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
QESLNTLIGQ LLDGGCVHEA SRVCQYFRFY SQDLVLVLHC RALASAEATM EDLHSEIRAL 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
LSSAAQPEDL ESPSVPLRKA HSSSSLDSQS FVMVPPTDEV AQNLHTLISK CLHGKNYCRQ 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
VLCLYELAKD LGCSYGDVAA RDSEAMLRAI LASQRPDRCR QAQVFINTQG LEADTVAELV 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
AEEVTRELLT PSEGTGEKQP FNPAEESQTF LQLTALCQDR TLVGMKLLDK IPSVPHGELS 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
CTTELLILAH HCFTFTCHME GITRVLQAAR MLTDNHLAPN EEYGLVVRLL TGIGRYNEMT 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
YIFDLLHQKH YFEVLMRKKL DPTGTLKTAL LDYIKRCRPG DSEKHNMIAL CFSMCREIGE 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
NHEAAACIQL KLIESQPWEE SLKDGAQLKQ LLLKALTLML DAAESYAKDS CVRQALHCNR 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
LTKLITLQIH FLNSGQNTML INLGHQKLMD CIMTLPRFYQ ASIVAEAYDF VPDWAEVLYQ 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
QVILKGDFSY LEEFKQQKLL RPNIFEDISK KYKQHQPTDR VTENLKKLLS YCEDIYLYYK 
      2410       2420       2430    
LAYEHKFFEI VNMLLKDPQT GCCLKDMLAG 



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q3UHA3-1-unknown MAAQPG... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q3UHA3-1-unknown MAAQPG... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt90572

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...DMLAG 2430 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)