TopFIND 4.0

Q4VA53: Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B

General Information

Protein names
- Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B
- Androgen-induced proliferation inhibitor
- Androgen-induced prostate proliferative shutoff-associated protein AS3
Gene names Pds5b
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q4VA53

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MAHSKTRTND GKITYPPGVK EISDKISKEE MVRRLKMVVK TFMDMDQDSE EEKELYLNLA 
        70         80         90        100        110        120 
LHLASDFFLK HPDKDVRLLV ACCLADIFRI YAPEAPYTSP DKLKDIFMFI TRQLKGLEDT 
       130        140        150        160        170        180 
KSPQFNRYFY LLENIAWVKS YNICFELEDS NEIFTQLYRT LFSVINNGHN QKVHMHMVDL 
       190        200        210        220        230        240 
MSSIICEGDT VSQELLDTVL VNLVPAHKNL NKQAYDLAKA LLKRTAQAIE PYITNFFNQV 
       250        260        270        280        290        300 
LMLGKTSISD LSEHVFDLIL ELYNIDSHLL LSVLPQLEFK LKSNDNEERL QVVKLLAKMF 
       310        320        330        340        350        360 
GAKDSELASQ NKPLWQCYLG RFNDIHVPIR LECVKFASHC LMNHPDLAKD LTEYLKVRSH 
       370        380        390        400        410        420 
DPEEAIRHDV IVSIVTAAKK DILLVNDHLL NFVRERTLDK RWRVRKEAMM GLAQIYKKYS 
       430        440        450        460        470        480 
LQSAAGKDAA KQISWVKDKL LHIYYQNSID DRLLVERIFA QYMVPHNLET TERMKCLYYL 
       490        500        510        520        530        540 
YATLDLNAVK ALNEMWKCQN LLRHQVKDLL DLIKQPKTDA SVKAIFSKVM VITRNLPDPG 
       550        560        570        580        590        600 
KAQDFMKKFT QVLEDDEKIR KQLEALVSPT CSCKQAEGCV REITKKLGNP KQPTNPFLEM 
       610        620        630        640        650        660 
IKFLLERIAP VHIDTESISA LIKQVNKSID GTADDEDEGV PTDQAIRAGL ELLKVLSFTH 
       670        680        690        700        710        720 
PISFHSAETF ESLLACLKMD DEKVAEAALQ IFKNTGSKIE EDFPHIRSAL LPVLHHKSKK 
       730        740        750        760        770        780 
GPPRQAKYAI HCIHAIFSSK ETQFAQIFEP LHKSLDPSNL EHLITPLVTI GHIALLAPDQ 
       790        800        810        820        830        840 
FAAPLKSLVA TFIVKDLLMN DRLPGKKTTK LWVPDEEVSP ETMVKIQAIK MMVRWLLGMK 
       850        860        870        880        890        900 
NNHSKSGTST LRLLTTILHS DGDLTEQGKI SKPDMSRLRL AAGSAIVKLA QEPCYHEIIT 
       910        920        930        940        950        960 
LEQYQLCALA INDECYQVRQ VFAQKLHKGL SRLRLPLEYM AICALCAKDP VKERRAHARQ 
       970        980        990       1000       1010       1020 
CLVKNITVRR EYLKQHAAVS EKLLSLLPEY VVPYTIHLLA HDPDYVKVQD IEQLKDVKEC 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LWFVLEILMA KNENNSHAFI RKMVENIKQT KDAQGPDDTK MNEKLYTVCD VAMNIIMSKS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
TTYSLESPKD PVLPARFFTQ PDKNFSNTKN YLPPEMKSFF TPGKPKTANV LGAVNKPLSS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
AGKQSQTKSS RMETVSNASS SSNPSSPGRI KGRLDSSEMD HSENEDYTMS SPLPGKKSDK 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
REDPDLSELE KPRSRKKAPV TDPEEKLGMD DLTKLVQEQK PKGSQRGRKR GRTASDSDEQ 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
QWPEEKRHKE ELLENEDEQN SPPKKGKRGR PPKPLGGGTS KEEPTMKTSK KGNKKKLVPP 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
VVDDDEEEER QIGNTEHKSK SKQHRTSKRA QQRAESPETS AVESTQSTPQ KGRGRPSKAP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SPSQPPKKIR VGRSKQVATK ENDSSEEMDV LQASSPVSDD TTQEGAEEED ISVGNVRRRS 
   
SKRERR

Isoforms

- Isoform 2 of Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B - Isoform 3 of Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MAHSKTRTND GKITYPPGVK EISDKISKEE MVRRLKMVVK TFMDMDQDSE EEKELYLNLA 
        70         80         90        100        110        120 
LHLASDFFLK HPDKDVRLLV ACCLADIFRI YAPEAPYTSP DKLKDIFMFI TRQLKGLEDT 
       130        140        150        160        170        180 
KSPQFNRYFY LLENIAWVKS YNICFELEDS NEIFTQLYRT LFSVINNGHN QKVHMHMVDL 
       190        200        210        220        230        240 
MSSIICEGDT VSQELLDTVL VNLVPAHKNL NKQAYDLAKA LLKRTAQAIE PYITNFFNQV 
       250        260        270        280        290        300 
LMLGKTSISD LSEHVFDLIL ELYNIDSHLL LSVLPQLEFK LKSNDNEERL QVVKLLAKMF 
       310        320        330        340        350        360 
GAKDSELASQ NKPLWQCYLG RFNDIHVPIR LECVKFASHC LMNHPDLAKD LTEYLKVRSH 
       370        380        390        400        410        420 
DPEEAIRHDV IVSIVTAAKK DILLVNDHLL NFVRERTLDK RWRVRKEAMM GLAQIYKKYS 
       430        440        450        460        470        480 
LQSAAGKDAA KQISWVKDKL LHIYYQNSID DRLLVERIFA QYMVPHNLET TERMKCLYYL 
       490        500        510        520        530        540 
YATLDLNAVK ALNEMWKCQN LLRHQVKDLL DLIKQPKTDA SVKAIFSKVM VITRNLPDPG 
       550        560        570        580        590        600 
KAQDFMKKFT QVLEDDEKIR KQLEALVSPT CSCKQAEGCV REITKKLGNP KQPTNPFLEM 
       610        620        630        640        650        660 
IKFLLERIAP VHIDTESISA LIKQVNKSID GTADDEDEGV PTDQAIRAGL ELLKVLSFTH 
       670        680        690        700        710        720 
PISFHSAETF ESLLACLKMD DEKVAEAALQ IFKNTGSKIE EDFPHIRSAL LPVLHHKSKK 
       730        740        750        760        770        780 
GPPRQAKYAI HCIHAIFSSK ETQFAQIFEP LHKSLDPSNL EHLITPLVTI GHIALLAPDQ 
       790        800        810        820        830        840 
FAAPLKSLVA TFIVKDLLMN DRLPGKKTTK LWVPDEEVSP ETMVKIQAIK MMVRWLLGMK 
       850        860        870        880        890        900 
NNHSKSGTST LRLLTTILHS DGDLTEQGKI SKPDMSRLRL AAGSAIVKLA QEPCYHEIIT 
       910        920        930        940        950        960 
LEQYQLCALA INDECYQVRQ VFAQKLHKGL SRLRLPLEYM AICALCAKDP VKERRAHARQ 
       970        980        990       1000       1010       1020 
CLVKNITVRR EYLKQHAAVS EKLLSLLPEY VVPYTIHLLA HDPDYVKVQD IEQLKDVKEC 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LWFVLEILMA KNENNSHAFI RKMVENIKQT KDAQGPDDTK MNEKLYTVCD VAMNIIMSKS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
TTYSLESPKD PVLPARFFTQ PDKNFSNTKN YLPPEMKSFF TPGKPKTANV LGAVNKPLSS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
AGKQSQTKSS RMETVSNASS SSNPSSPGRI KGRLDSSEMD HSENEDYTMS SPLPGKKSDK 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
REDPDLSELE KPRSRKKAPV TDPEEKLGMD DLTKLVQEQK PKGSQRGRKR GRTASDSDEQ 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
QWPEEKRHKE ELLENEDEQN SPPKKGKRGR PPKPLGGGTS KEEPTMKTSK KGNKKKLVPP 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
VVDDDEEEER QIGNTEHKSK SKQHRTSKRA QQRAESPETS AVESTQSTPQ KGRGRPSKAP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SPSQPPKKIR VGRSKQVATK ENDSSEEMDV LQASSPVSDD TTQEGAEEED ISVGNVRRRS 
   
SKRERR         10         20         30         40         50         60 
MAHSKTRTND GKITYPPGVK EISDKISKEE MVRRLKMVVK TFMDMDQDSE EEKELYLNLA 
        70         80         90        100        110        120 
LHLASDFFLK HPDKDVRLLV ACCLADIFRI YAPEAPYTSP DKLKDIFMFI TRQLKGLEDT 
       130        140        150        160        170        180 
KSPQFNRYFY LLENIAWVKS YNICFELEDS NEIFTQLYRT LFSVINNGHN QKVHMHMVDL 
       190        200        210        220        230        240 
MSSIICEGDT VSQELLDTVL VNLVPAHKNL NKQAYDLAKA LLKRTAQAIE PYITNFFNQV 
       250        260        270        280        290        300 
LMLGKTSISD LSEHVFDLIL ELYNIDSHLL LSVLPQLEFK LKSNDNEERL QVVKLLAKMF 
       310        320        330        340        350        360 
GAKDSELASQ NKPLWQCYLG RFNDIHVPIR LECVKFASHC LMNHPDLAKD LTEYLKVRSH 
       370        380        390        400        410        420 
DPEEAIRHDV IVSIVTAAKK DILLVNDHLL NFVRERTLDK RWRVRKEAMM GLAQIYKKYS 
       430        440        450        460        470        480 
LQSAAGKDAA KQISWVKDKL LHIYYQNSID DRLLVERIFA QYMVPHNLET TERMKCLYYL 
       490        500        510        520        530        540 
YATLDLNAVK ALNEMWKCQN LLRHQVKDLL DLIKQPKTDA SVKAIFSKVM VITRNLPDPG 
       550        560        570        580        590        600 
KAQDFMKKFT QVLEDDEKIR KQLEALVSPT CSCKQAEGCV REITKKLGNP KQPTNPFLEM 
       610        620        630        640        650        660 
IKFLLERIAP VHIDTESISA LIKQVNKSID GTADDEDEGV PTDQAIRAGL ELLKVLSFTH 
       670        680        690        700        710        720 
PISFHSAETF ESLLACLKMD DEKVAEAALQ IFKNTGSKIE EDFPHIRSAL LPVLHHKSKK 
       730        740        750        760        770        780 
GPPRQAKYAI HCIHAIFSSK ETQFAQIFEP LHKSLDPSNL EHLITPLVTI GHIALLAPDQ 
       790        800        810        820        830        840 
FAAPLKSLVA TFIVKDLLMN DRLPGKKTTK LWVPDEEVSP ETMVKIQAIK MMVRWLLGMK 
       850        860        870        880        890        900 
NNHSKSGTST LRLLTTILHS DGDLTEQGKI SKPDMSRLRL AAGSAIVKLA QEPCYHEIIT 
       910        920        930        940        950        960 
LEQYQLCALA INDECYQVRQ VFAQKLHKGL SRLRLPLEYM AICALCAKDP VKERRAHARQ 
       970        980        990       1000       1010       1020 
CLVKNITVRR EYLKQHAAVS EKLLSLLPEY VVPYTIHLLA HDPDYVKVQD IEQLKDVKEC 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LWFVLEILMA KNENNSHAFI RKMVENIKQT KDAQGPDDTK MNEKLYTVCD VAMNIIMSKS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
TTYSLESPKD PVLPARFFTQ PDKNFSNTKN YLPPEMKSFF TPGKPKTANV LGAVNKPLSS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
AGKQSQTKSS RMETVSNASS SSNPSSPGRI KGRLDSSEMD HSENEDYTMS SPLPGKKSDK 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
REDPDLSELE KPRSRKKAPV TDPEEKLGMD DLTKLVQEQK PKGSQRGRKR GRTASDSDEQ 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
QWPEEKRHKE ELLENEDEQN SPPKKGKRGR PPKPLGGGTS KEEPTMKTSK KGNKKKLVPP 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
VVDDDEEEER QIGNTEHKSK SKQHRTSKRA QQRAESPETS AVESTQSTPQ KGRGRPSKAP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SPSQPPKKIR VGRSKQVATK ENDSSEEMDV LQASSPVSDD TTQEGAEEED ISVGNVRRRS 
   
SKRERR



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q4VA53-1-unknown MAHSKT... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q4VA53-1-unknown MAHSKT... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt84790
    Q4VA53-530-unknown MVITRN... 530 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt84789
    Q4VA53-530-unknown MVITRN... 530 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt98839

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...KRERR 1446 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...KRERR 1446 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt80408

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)