TopFIND 4.0

Q571C7: Transcription factor TFIIIB component B'' homolog

General Information

Protein names
- Transcription factor TFIIIB component B'' homolog
- Transcription factor IIIB 150
- TFIIIB150
- Transcription factor-like nuclear regulator
Gene names Bdp1
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q571C7

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MFRRARLSVK PNVRPGVGTR GSAAPNPQRG PEAPRPPEPA TESAPKPAEP TDVPAVDSGG 
        70         80         90        100        110        120 
AEPQEQAPGS SDEKTGDKNN AAESSTLSSA SSQRRKRVSS TSSLVQPSGS APSQSRPLST 
       130        140        150        160        170        180 
VDHDAPQPNP TPAKEKQPCS DRYRIYKARK LREMLKEELR KEKKQWKNKF STNESQRPPD 
       190        200        210        220        230        240 
RSKMTMRDFI YYLPDNNPMT SSVEQEKKPE KSLAPTPTRD RQENQSTQDA NDNEDVEEEV 
       250        260        270        280        290        300 
DDGPLLVPRV KVAEDGSIIL DEESLTVEVL RTKGPCVVEE NDPIFERGST TTYSSFRKNY 
       310        320        330        340        350        360 
YSKPWSNKET DMFFLAISMV GTDFSMIGQL FPHRARIEIK NKFKREEKTN GWRIDKAFQE 
       370        380        390        400        410        420 
KRPFDFDFFA HLLQKVLAEE EKRKQKSTKC QSLKEKASKP RKNLKAKTVT SEEVNDDPDE 
       430        440        450        460        470        480 
SVNSNISDPE RSQNDAETVN EEESPSSSGQ HLEQAMLEQD QNQEKKRRRN QGEANKQEAT 
       490        500        510        520        530        540 
NLLERVLVHS SPPAAEIHKN TCPSEENESE CNKEQIPSLT QNIDDIAGLA PSEETEMRMD 
       550        560        570        580        590        600 
PIPSTCNQQD IMPLARESSE SCAVALPVWE PGNTASADMA HAESSCSEGR GADLKTAAPE 
       610        620        630        640        650        660 
TEQTENVKPK SRSRLQRPKP NLARAVGKKS AVSQDRQDER NKNSPSETAA EKNHMEKETM 
       670        680        690        700        710        720 
NESETSVAKN TDGESPGAKT VSDLSEKSCV QQDSQAKVLR PTRLMRSRMQ RPKPNVVKAA 
       730        740        750        760        770        780 
ERKEILTSQE KFGAHVEKSE DESCVVIPPQ TENESHKNLQ CEDTVSEPGR KDPFENIQPD 
       790        800        810        820        830        840 
QPQVLSDCPS IHEGNKENKR KQVPVLRTRF QKPKPNTGRR RRRISSKEGI PEETPISGEI 
       850        860        870        880        890        900 
PATWEEIPSL DTSLREEVLS VPLAPLTATA STKDSESDVK DSGRNDTASN AEMSEMTDVT 
       910        920        930        940        950        960 
MEMETGLETI GRDTCPGEMG AEMIDIPMET EAGLKASLNE TSCMEKVPEL IDTTGEICTN 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LGETGRKEVF LQENGPKEVG PVSEPETGLQ ETGKDLAMKE STPDTTDSTE EREAYSEETE 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
RQEKISALIK DAEEAKARGE METPLEEIGG GTSQRGKAAG APVEQSASEE EPQGSACREE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
VAVESSTAEG KELNLRETGE DDVSSMVVVL GEKTDIEETN GDPKETERES SVSWERGSGE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
IQVGEEMVED LGKPEKIDVA PREREPEEHS SGQPEADVIL SSSDGSTGSP QDKVNISSKI 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SVMPTLVEEK ETTDKDISSH LGHVESCSQN LGRHETDQGM PLPDALERFS DTNLSKPLPQ 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
EQQPLQVKPA PFLRSRFKKP KPNLSRAALK RATIEAEHCV PGKKSEACKV EAAMLQQDSD 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
QAALSPQHNV PSLMASREND KSGHEEEEEA AILPCTQTEK DASPPNSSEP KEGSQLTPNQ 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
ENGLLVPIGT PMMNTVTQET RQNVVQTTLP VRGRLQRPRP NVQKARQRQI VEKGEARDIA 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
KNEGPELQKD ETRTCLTVAN SSHIESGVAV DMSSRVSECQ VSESQGHADP VENLSVNKAS 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
VVHEQMRHEN KPYVPSPALL IRRRFQKAKP NLGGARRKDE QPGVEKGRTD ESTALTAEDH 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LLQKEDCDTQ LSLQAREKAD MPLEVSVRKE CIHSEESGSD RNDAQPNAGP SEGSRDETAK 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
EQPTSLGLEE QSLSKQIRSS CPQLWKESSY PKTVSSRRTP LSSASECEIE HSWKRTQRKT 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
KPNLTKGRGS KRIRGKTAKK EPRASKSVLV TLRASQKEDE DDAEDFDSDY EEETYHLAPE 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
ELSKAPVFVP VGLRSPEPVS AQIEETMEEL EITMDVADMT VVEHQLSHMD TTAQAVQAEK 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
AVYPPSFEMD VGEQTQEEPG PSDGSTEAAI TLLTMGDIVL QSEIIPGQGD VGVCVFPDVH 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
SEDKSHAPFS PDNVNQKVVH DYPEVCSPVI STSHASFEEN RIVSKEQSNR DAAVEEEAVE 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
ETLPTRNTTS TMSTHLRMES MVVTPELNSE KTLEISESHG HQEVASFCIT KETEVEIQRE 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
TEGDDSKAVE LEDKSHAPVT AAETKEEEQS QCVGDVEGAS VSQEAILPAR IEDHEETLQE 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
VQESGTAVAS SEIGQQTLDS GQSFGESAAK EALKETPKGS DVPVLHGPES VPSHIPEAQQ 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
ENTGPQAVTV NPFADGQQDG EDEQAFILTL VEIPTHATEG FTDAAMQLMP SSLLPAPILV 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
RSGNAAERGD LSGSLQTSLV VQDAPSLSPS RSGSSEKPPA NLDLTSRKRF CCSPDESIHV 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
PPAKKSSLVP GIDYQECTSE VCSEELNVFE KTAESCMGQG IFPTSESTHA TSKPQKEHSE 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
PTDTGSSGSL DEIKDACVEN MAQLPQSEIV SDKEEKTEPA SNSEQRDIVT SSSKPPLTRP 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
GRRPLGFLSL LCPKNSLESD EVTQTHSKKR LKPQIPVSRR NLRKPNLHNT SQKKNQDSSA 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
PPPSPSVTAP LSGTAGSPES SAAQVSSDQP LLKEECKNGP KGAPEEEVTP VSEFVFSDIF 
   
IEVDETL

Isoforms

- Isoform 2 of Transcription factor TFIIIB component B'' homolog

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MFRRARLSVK PNVRPGVGTR GSAAPNPQRG PEAPRPPEPA TESAPKPAEP TDVPAVDSGG 
        70         80         90        100        110        120 
AEPQEQAPGS SDEKTGDKNN AAESSTLSSA SSQRRKRVSS TSSLVQPSGS APSQSRPLST 
       130        140        150        160        170        180 
VDHDAPQPNP TPAKEKQPCS DRYRIYKARK LREMLKEELR KEKKQWKNKF STNESQRPPD 
       190        200        210        220        230        240 
RSKMTMRDFI YYLPDNNPMT SSVEQEKKPE KSLAPTPTRD RQENQSTQDA NDNEDVEEEV 
       250        260        270        280        290        300 
DDGPLLVPRV KVAEDGSIIL DEESLTVEVL RTKGPCVVEE NDPIFERGST TTYSSFRKNY 
       310        320        330        340        350        360 
YSKPWSNKET DMFFLAISMV GTDFSMIGQL FPHRARIEIK NKFKREEKTN GWRIDKAFQE 
       370        380        390        400        410        420 
KRPFDFDFFA HLLQKVLAEE EKRKQKSTKC QSLKEKASKP RKNLKAKTVT SEEVNDDPDE 
       430        440        450        460        470        480 
SVNSNISDPE RSQNDAETVN EEESPSSSGQ HLEQAMLEQD QNQEKKRRRN QGEANKQEAT 
       490        500        510        520        530        540 
NLLERVLVHS SPPAAEIHKN TCPSEENESE CNKEQIPSLT QNIDDIAGLA PSEETEMRMD 
       550        560        570        580        590        600 
PIPSTCNQQD IMPLARESSE SCAVALPVWE PGNTASADMA HAESSCSEGR GADLKTAAPE 
       610        620        630        640        650        660 
TEQTENVKPK SRSRLQRPKP NLARAVGKKS AVSQDRQDER NKNSPSETAA EKNHMEKETM 
       670        680        690        700        710        720 
NESETSVAKN TDGESPGAKT VSDLSEKSCV QQDSQAKVLR PTRLMRSRMQ RPKPNVVKAA 
       730        740        750        760        770        780 
ERKEILTSQE KFGAHVEKSE DESCVVIPPQ TENESHKNLQ CEDTVSEPGR KDPFENIQPD 
       790        800        810        820        830        840 
QPQVLSDCPS IHEGNKENKR KQVPVLRTRF QKPKPNTGRR RRRISSKEGI PEETPISGEI 
       850        860        870        880        890        900 
PATWEEIPSL DTSLREEVLS VPLAPLTATA STKDSESDVK DSGRNDTASN AEMSEMTDVT 
       910        920        930        940        950        960 
MEMETGLETI GRDTCPGEMG AEMIDIPMET EAGLKASLNE TSCMEKVPEL IDTTGEICTN 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LGETGRKEVF LQENGPKEVG PVSEPETGLQ ETGKDLAMKE STPDTTDSTE EREAYSEETE 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
RQEKISALIK DAEEAKARGE METPLEEIGG GTSQRGKAAG APVEQSASEE EPQGSACREE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
VAVESSTAEG KELNLRETGE DDVSSMVVVL GEKTDIEETN GDPKETERES SVSWERGSGE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
IQVGEEMVED LGKPEKIDVA PREREPEEHS SGQPEADVIL SSSDGSTGSP QDKVNISSKI 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SVMPTLVEEK ETTDKDISSH LGHVESCSQN LGRHETDQGM PLPDALERFS DTNLSKPLPQ 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
EQQPLQVKPA PFLRSRFKKP KPNLSRAALK RATIEAEHCV PGKKSEACKV EAAMLQQDSD 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
QAALSPQHNV PSLMASREND KSGHEEEEEA AILPCTQTEK DASPPNSSEP KEGSQLTPNQ 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
ENGLLVPIGT PMMNTVTQET RQNVVQTTLP VRGRLQRPRP NVQKARQRQI VEKGEARDIA 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
KNEGPELQKD ETRTCLTVAN SSHIESGVAV DMSSRVSECQ VSESQGHADP VENLSVNKAS 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
VVHEQMRHEN KPYVPSPALL IRRRFQKAKP NLGGARRKDE QPGVEKGRTD ESTALTAEDH 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LLQKEDCDTQ LSLQAREKAD MPLEVSVRKE CIHSEESGSD RNDAQPNAGP SEGSRDETAK 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
EQPTSLGLEE QSLSKQIRSS CPQLWKESSY PKTVSSRRTP LSSASECEIE HSWKRTQRKT 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
KPNLTKGRGS KRIRGKTAKK EPRASKSVLV TLRASQKEDE DDAEDFDSDY EEETYHLAPE 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
ELSKAPVFVP VGLRSPEPVS AQIEETMEEL EITMDVADMT VVEHQLSHMD TTAQAVQAEK 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
AVYPPSFEMD VGEQTQEEPG PSDGSTEAAI TLLTMGDIVL QSEIIPGQGD VGVCVFPDVH 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
SEDKSHAPFS PDNVNQKVVH DYPEVCSPVI STSHASFEEN RIVSKEQSNR DAAVEEEAVE 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
ETLPTRNTTS TMSTHLRMES MVVTPELNSE KTLEISESHG HQEVASFCIT KETEVEIQRE 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
TEGDDSKAVE LEDKSHAPVT AAETKEEEQS QCVGDVEGAS VSQEAILPAR IEDHEETLQE 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
VQESGTAVAS SEIGQQTLDS GQSFGESAAK EALKETPKGS DVPVLHGPES VPSHIPEAQQ 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
ENTGPQAVTV NPFADGQQDG EDEQAFILTL VEIPTHATEG FTDAAMQLMP SSLLPAPILV 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
RSGNAAERGD LSGSLQTSLV VQDAPSLSPS RSGSSEKPPA NLDLTSRKRF CCSPDESIHV 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
PPAKKSSLVP GIDYQECTSE VCSEELNVFE KTAESCMGQG IFPTSESTHA TSKPQKEHSE 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
PTDTGSSGSL DEIKDACVEN MAQLPQSEIV SDKEEKTEPA SNSEQRDIVT SSSKPPLTRP 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
GRRPLGFLSL LCPKNSLESD EVTQTHSKKR LKPQIPVSRR NLRKPNLHNT SQKKNQDSSA 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
PPPSPSVTAP LSGTAGSPES SAAQVSSDQP LLKEECKNGP KGAPEEEVTP VSEFVFSDIF 
   
IEVDETL



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q571C7-1-unknown MFRRAR... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q571C7-1-unknown MFRRAR... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt68363

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...VDETL 2467 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)