TopFIND 4.0

Q571H0: Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1

General Information

Protein names
- Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1
- URB1 ribosome biogenesis 1 homolog
Gene names Urb1
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q571H0

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MGVPKRKASE GPSSAASPAG TVKRTRAEEF TGVRFKTLLK DAQGPGPALE AFVSAAKKLP 
        70         80         90        100        110        120 
QEDMCDVVEG YIKISMECAE IFQLLSGEKR PESEMLLIFQ AFEAILLRTA SDLTHFHVVG 
       130        140        150        160        170        180 
ANIVKKLLYN HMKLLCESLY ASGYRMARAC LDLMTAMVTQ GPEAARDVCS SLDLNKKALF 
       190        200        210        220        230        240 
ALVTKRDSKG VHDVRLAYIQ FALSFLIAGD DNTIGQVLEI KEFIPCIFSS GIKEDKISTI 
       250        260        270        280        290        300 
NILLSTLKTK VIHNKNITKT QKVRFFTGQF LNHIAALYNW NGITDVTPEK PEISAEEAGK 
       310        320        330        340        350        360 
AMVRDLVHNF LMDLCCSRKH GISFYDASLG TSGRGGNLTL LHFLLSLKTA AGDDLVASLV 
       370        380        390        400        410        420 
VSILKVCPDL LTKYFKEVTF SFLPRVKSTW LNNVKLLNKI YEAQPEISPA FWTREFIPLP 
       430        440        450        460        470        480 
RLLAMVMVTT VPLVCNKIMF TQALNLDSIP VKHSALSLIS DILKRALKTV DHCLDKETWQ 
       490        500        510        520        530        540 
DSDVYTAEMM EEFVQLFREA LGKILPDLNT VIWVWQSFKK QEIKEDHEKG KKSSSKTPAV 
       550        560        570        580        590        600 
SKAAQHDVAE TILLKSVLLQ VICLYQQVVP HVIMQYNFDF SKLLKGIISE QGPSQEVPPI 
       610        620        630        640        650        660 
LQHHMLKVAL ELPANKFLWL KAQEGPEAEI IGGERSVFYL LMKMFVNSNH LQLKSSTKLL 
       670        680        690        700        710        720 
IMKILRDTGV FEHTWRELEL WLEHLDSTAE ERKEAVIQFL ERILLTLVMN PYSYTDKASE 
       730        740        750        760        770        780 
FVQEASTLQA SMGKQDADDV SIPISHIDDV LDMVDVLVEG SEGLDEDIGF LLNEDMILLT 
       790        800        810        820        830        840 
FPFSALVPAA LEARNKLLLG TDCEAGESIM AYMTAVLTDL LHTQRDPLAL CLLLQSYDKF 
       850        860        870        880        890        900 
EPVSLLCGQQ LAQFHRYYSL WIPAQAQEAL PLQVSSSSGP CTLPPSSCFS TLLQTAYESQ 
       910        920        930        940        950        960 
TLGDKSVQAQ LLAAVPSLAL QHMLRSAKQV LLYLKSTVEN FSQLGRSVGP ALLQSLLGLL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
KQLVIHAERL DAQNQQKLEA ARAESDLFLD MESVASLELA TDKTIEELLL AILKHPTLET 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
WFLALEQKAL PPHTLSPILV KLLAAHFSAG VLQLLVASSP ILHKLGQLGL LAKYSEAITQ 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SVLIELRTRT LNSTSTPKTL PQLEALRELH PYMEGVQIRE VTLALLALPE AHLLTQQGTQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SLGKERHLSS LGKTLVQLLA SSHQDQLQSS ELLWCAEYVR GLGALLPTLA EHELDTVFLQ 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
TLQKDPVLAP VVPEGVLEYC LARRTQTALG IASLLLQYSG THLVKFELWC GQPGVGPTLQ 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
EHLDDFFPLI HVYLQHRAQG SFMRPTGVSS AVTPVLKALW RQVRDRFFHI TGPSKDALHL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
EALAQLIPFA RTKDLHVLMD HLPNTLRTLS NHKSWTLADS VSAALAESAE ELGSWRKTLL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
RSCIQWLAVS FSGREPEDEN TQEHEKAMLV RLSELLHAVK EVDPGDWQQF VKTGLKFRYH 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
DLTFLKTLLS ATKLLYGPES SGRTKLVQLS VVHMMLTQHS LFLPTMLSSE EEETPDSGVK 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
ETLLDLMSTV VRLCPSVCQS SHFAVLLGTY SATLSVLDQK ILLLLRAYEQ NNLSLISFRV 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LLWGPAAVEH HKTCRSLGKS LWQQPSVGDI LRLLDPDRMM QTILHFPQYR KLLPTEDTGE 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PLVFKDKTAR VDLDSLYDPC FLLHLFGELT RPEFVVDCRK FLDSNALGLT VAALSSYDPQ 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
MRAAAYYVLA AYYSHLEGAR FREQSQVLYL LDVVRNGIRT PNLRLPFTVA LFIAKAAVQI 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
LKPEEHMYWK ISKFLLSHEN LNMDKLPGFY QFFYSSDFQQ KTEQEWVLEI LRQGIRDKHC 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
YELCSRRGVF HIILSFFNSP LCDEVAQNWI LEILQNVAHI TRSAYEVIRD YSLLTWVLHI 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
LESRFVETQL LSNVISLLHT LWVTNLGNKA PEERSQPPGQ VGSQESEKML ALHMVSEFLY 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
VLIALTKHLR PTLASAQLMN FFWTLESVLS YRATIIKLFK DMGRFTVNKV ALSTKDVLIL 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
LHKWSLIERD TKLQGELKAV IEQHQAKDLM KMLKDKSRPV VAAQARGPRG RKRRHGGLEE 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
TAEPQLEASC LEKCKDLLRA TLTHWGPGDP LPGPTQGSVG QTIPKSKTLS SAHAAVSLVA 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
SWVLRSLAER PVSRAEVTRL LDWLKSHILP QPMVVADLLG DSAVKTGIFK LYNHHCSAQG 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
LVGPAQDVAC KFSTVMLQLL VAQGRKESPF HSVAEALCLD SLNEKEEAKR APAAFLVSLY 
      2230       2240       2250       2260       2270    
VKDMWLGAQQ PDTFLAHIRM VCEAAKDVPL DEPEAIVVLC RNVDSSAQCL TRSR

Isoforms

- Isoform 2 of Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MGVPKRKASE GPSSAASPAG TVKRTRAEEF TGVRFKTLLK DAQGPGPALE AFVSAAKKLP 
        70         80         90        100        110        120 
QEDMCDVVEG YIKISMECAE IFQLLSGEKR PESEMLLIFQ AFEAILLRTA SDLTHFHVVG 
       130        140        150        160        170        180 
ANIVKKLLYN HMKLLCESLY ASGYRMARAC LDLMTAMVTQ GPEAARDVCS SLDLNKKALF 
       190        200        210        220        230        240 
ALVTKRDSKG VHDVRLAYIQ FALSFLIAGD DNTIGQVLEI KEFIPCIFSS GIKEDKISTI 
       250        260        270        280        290        300 
NILLSTLKTK VIHNKNITKT QKVRFFTGQF LNHIAALYNW NGITDVTPEK PEISAEEAGK 
       310        320        330        340        350        360 
AMVRDLVHNF LMDLCCSRKH GISFYDASLG TSGRGGNLTL LHFLLSLKTA AGDDLVASLV 
       370        380        390        400        410        420 
VSILKVCPDL LTKYFKEVTF SFLPRVKSTW LNNVKLLNKI YEAQPEISPA FWTREFIPLP 
       430        440        450        460        470        480 
RLLAMVMVTT VPLVCNKIMF TQALNLDSIP VKHSALSLIS DILKRALKTV DHCLDKETWQ 
       490        500        510        520        530        540 
DSDVYTAEMM EEFVQLFREA LGKILPDLNT VIWVWQSFKK QEIKEDHEKG KKSSSKTPAV 
       550        560        570        580        590        600 
SKAAQHDVAE TILLKSVLLQ VICLYQQVVP HVIMQYNFDF SKLLKGIISE QGPSQEVPPI 
       610        620        630        640        650        660 
LQHHMLKVAL ELPANKFLWL KAQEGPEAEI IGGERSVFYL LMKMFVNSNH LQLKSSTKLL 
       670        680        690        700        710        720 
IMKILRDTGV FEHTWRELEL WLEHLDSTAE ERKEAVIQFL ERILLTLVMN PYSYTDKASE 
       730        740        750        760        770        780 
FVQEASTLQA SMGKQDADDV SIPISHIDDV LDMVDVLVEG SEGLDEDIGF LLNEDMILLT 
       790        800        810        820        830        840 
FPFSALVPAA LEARNKLLLG TDCEAGESIM AYMTAVLTDL LHTQRDPLAL CLLLQSYDKF 
       850        860        870        880        890        900 
EPVSLLCGQQ LAQFHRYYSL WIPAQAQEAL PLQVSSSSGP CTLPPSSCFS TLLQTAYESQ 
       910        920        930        940        950        960 
TLGDKSVQAQ LLAAVPSLAL QHMLRSAKQV LLYLKSTVEN FSQLGRSVGP ALLQSLLGLL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
KQLVIHAERL DAQNQQKLEA ARAESDLFLD MESVASLELA TDKTIEELLL AILKHPTLET 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
WFLALEQKAL PPHTLSPILV KLLAAHFSAG VLQLLVASSP ILHKLGQLGL LAKYSEAITQ 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SVLIELRTRT LNSTSTPKTL PQLEALRELH PYMEGVQIRE VTLALLALPE AHLLTQQGTQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SLGKERHLSS LGKTLVQLLA SSHQDQLQSS ELLWCAEYVR GLGALLPTLA EHELDTVFLQ 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
TLQKDPVLAP VVPEGVLEYC LARRTQTALG IASLLLQYSG THLVKFELWC GQPGVGPTLQ 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
EHLDDFFPLI HVYLQHRAQG SFMRPTGVSS AVTPVLKALW RQVRDRFFHI TGPSKDALHL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
EALAQLIPFA RTKDLHVLMD HLPNTLRTLS NHKSWTLADS VSAALAESAE ELGSWRKTLL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
RSCIQWLAVS FSGREPEDEN TQEHEKAMLV RLSELLHAVK EVDPGDWQQF VKTGLKFRYH 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
DLTFLKTLLS ATKLLYGPES SGRTKLVQLS VVHMMLTQHS LFLPTMLSSE EEETPDSGVK 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
ETLLDLMSTV VRLCPSVCQS SHFAVLLGTY SATLSVLDQK ILLLLRAYEQ NNLSLISFRV 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LLWGPAAVEH HKTCRSLGKS LWQQPSVGDI LRLLDPDRMM QTILHFPQYR KLLPTEDTGE 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PLVFKDKTAR VDLDSLYDPC FLLHLFGELT RPEFVVDCRK FLDSNALGLT VAALSSYDPQ 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
MRAAAYYVLA AYYSHLEGAR FREQSQVLYL LDVVRNGIRT PNLRLPFTVA LFIAKAAVQI 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
LKPEEHMYWK ISKFLLSHEN LNMDKLPGFY QFFYSSDFQQ KTEQEWVLEI LRQGIRDKHC 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
YELCSRRGVF HIILSFFNSP LCDEVAQNWI LEILQNVAHI TRSAYEVIRD YSLLTWVLHI 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
LESRFVETQL LSNVISLLHT LWVTNLGNKA PEERSQPPGQ VGSQESEKML ALHMVSEFLY 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
VLIALTKHLR PTLASAQLMN FFWTLESVLS YRATIIKLFK DMGRFTVNKV ALSTKDVLIL 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
LHKWSLIERD TKLQGELKAV IEQHQAKDLM KMLKDKSRPV VAAQARGPRG RKRRHGGLEE 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
TAEPQLEASC LEKCKDLLRA TLTHWGPGDP LPGPTQGSVG QTIPKSKTLS SAHAAVSLVA 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
SWVLRSLAER PVSRAEVTRL LDWLKSHILP QPMVVADLLG DSAVKTGIFK LYNHHCSAQG 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
LVGPAQDVAC KFSTVMLQLL VAQGRKESPF HSVAEALCLD SLNEKEEAKR APAAFLVSLY 
      2230       2240       2250       2260       2270    
VKDMWLGAQQ PDTFLAHIRM VCEAAKDVPL DEPEAIVVLC RNVDSSAQCL TRSR



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q571H0-1-unknown MGVPKR... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q571H0-1-unknown MGVPKR... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt83099

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...LTRSR 2274 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)