TopFIND 4.0

Q5H8C4: Vacuolar protein sorting-associated protein 13A

General Information

Protein names
- Vacuolar protein sorting-associated protein 13A
- Chorea-acanthocytosis protein homolog
- Chorein
Gene names Vps13a
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q5H8C4

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MVFESVVVEV LNRFLGDYVV NLDESQLSLG IWKGAVALKN LVIKENALHE LDVPFKVKVG 
        70         80         90        100        110        120 
HIGSLKLKIP WKNLYTQPVE AVLEEIFLLI VPSSRIQYDP IKEEKQLMET KQQELKRIEK 
       130        140        150        160        170        180 
AKQKVFDKEK PREEKQDTFT EKLVTQIIQN LQVQISSIHI RYEDDITNGD KPLSFGISLQ 
       190        200        210        220        230        240 
NISLQTTDQY WIPCLHDNTE KLVRKLIRLD NLFAYWNVNS EMFYLNDYDE SLKALKNGIV 
       250        260        270        280        290        300 
NENIVPEGYD FVFRPISASA KLQMNRRSDF DFSDPKINLA VDLHTIAIEF NKPQYFSLME 
       310        320        330        340        350        360 
LLESIDMMTQ NQPYRKFKPS VPLHLHAKEW WAYAIHSILE VNVCPSLRMW SWEHIRNHRY 
       370        380        390        400        410        420 
KMKRYREFYK KKLTSKKPSP EILMSLEELE KTLDVFNITI ARQQAEVEAK KAGYKIYKEG 
       430        440        450        460        470        480 
VKDPEDNAGW FGWLWTWSES NANQQQDVKP GILEEMLTPE EKSLLYEAIG YSETAVDPTL 
       490        500        510        520        530        540 
PKTFEALKFF VHLKSMSIVL RENHQKPELL NVVVEGLSTS VVQRPGAQAI KFETKIDSFH 
       550        560        570        580        590        600 
ITGLPDDFKK PHLLSSLDDT SLLQITFEIN PLNETVAQRC TIEAEPLEII YDARTVNSIV 
       610        620        630        640        650        660 
EFFRPPKDVH LAQLTSVTLT KLEEFRAKTA TGLLYVIETQ KVLDLRINVK ASYVIVPQYG 
       670        680        690        700        710        720 
NFSPTSNLLL LDLGHLKVSS KRRSLLPDVR PSEASLEDIM HRAYDSFDIQ LTSIQLLYSR 
       730        740        750        760        770        780 
VGDNWKEARK LNVSTQHILI PMHVNVELSK AMVFMDIKMP KFKISGKLPL VSLRISDKKL 
       790        800        810        820        830        840 
QGIMELLGSI PKPEPVTDVS APARSFQIQA SALPVSHISQ KLIPLLEQPV TEDDSEEEFF 
       850        860        870        880        890        900 
DAPCSPLEEC PQVSCRDKCT RQKKLQKKDC VMNLIQLRMR FEVAEVSIQF YHLVGDCELP 
       910        920        930        940        950        960 
VLEMGALGLG TEAEFRTFDL KGSAFLKELW LKCPEYLDEN KKPVYLITTL DNTMEDLLTL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
EFMKVEKNAP NLNSTYNNVL QLIKVNFSSL DIHLHTEALL NTMNYLNNIL PELREKSASV 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SAAEPEDKGD IIKKLALKLP TNEDIITLQL LAELSCLQIF IQDQKQNISE IKIEGLDSEM 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
IMKPLVTEIN AKLRNIIVLD SDKMAIYKKA LYITGKEVFS FKMISYMDAT AGYAYTDMSV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
VDIRVHLTVG CIEVVFITKF LYSILAFIDN FQAVKDALAE ATVQAAEMAA DGVKELARKS 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SRFALDVNIK APVVLIPQSP VSQNVFVADF GLITMKNIFV TVTETQSNIP PVIDLITIKL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
SKMRLYRSQF RNDTYQEVLD LLLPLNLEVI VERNLSWEWY KEVPCFNIKA QLKPMEFILS 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
QEDLTTVFQT LHGNIWYGQD LSAPSSANKD PETMTSGVTS PPDHSPATVV TAAVVEVHPQ 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
ASQAHTMLNV SFQTDYLTMA LYSPGPDEAS FTDVRDPSLE LAEFKLENII SSLKIYTDDS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
TVFSFSVKNC ILDDKRSHVM KATPRMIGLT VGFDKKDMVD IKYRKIKTFV VTDAVVQEMY 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
VCASVEFLMT VAHIFFDAYM TSTALETSVQ TRTTREAPAQ ELGKWEMNIL IKNPEIVFVA 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
DMTRNDAPAL VITTQCEICC KGEPTSNTVT AAIKDLQVRA CPFLPVKRKG KVTTVLQPCD 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
LFYQATQLGR DPQMIDISVK SLTLKVSPVI INTIITITSA LYTTKETVPE ENTSNIAHLW 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
DKKDTKNLKM WFLEESNESE KVVPTNEVMP GGETLNLRID SIFIVLEAGI GHRTVPMLLA 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
KACFSGESKN WLSLINLHCH LELEVHYYNE MFGVWEPLLE PLEIDQTDDF RPWNLGIKMK 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
KKAKEAIVES DSEAENYKVP EYKTAISFYS RDQLNITLSK CGLVMLNNLV EAFTEAATGS 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
SSVFLRDLAP FMIFNSLGLT VSVSPSDSFS VLNVPLAKSY ELKNDESLSM DYVRTKDNDH 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
FNAMTSLSSK LFFILLTPAN HSVADKIPLT KVGRRLYTVR HRESGVERSI ICQIDTVEGS 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
KKVTIRSPVQ IKNHFSIPIS VFEGDTLLGI ASPENEFNIP LASYRSSLSL VPEDQDYQLC 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
EGIDFEEIIK YDGQLLKKKC RSTNPSKKSF VINIVPEKDN LASLSVYSED GWDLPYVLHL 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
WPPILIRNLL PYKVAYYIEG IENTVVTLSE GHSSQIYNVE MDQAKLHLKL LDYLNHDWKS 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
EFYIRSSQQD INFINFTCLT EMEKSDLDIA IHMTYNTGQT VVAFHSPYWM VNKTNRMLQY 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
KADGIHRKHP PNYTKPVLFS FQPNHFFNNN KVQLMVTDSE LSDQFSIDTV GSHGAIRCKG 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
LKMEYQVGVT INLSSFNITR IVTFIPFYMI KNKSKYHISV AEEGSDKWLS LDLEQSIPFW 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
PENASNILLI QVERSEDPPK RIYFNKQDNC ILLRLNNELG GIIAEVNLAE HSTVITFSDY 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
HDGAATFLLI NHTKSDPVQY NQSSLGEIED SLPPGKAVYY TWADPVGSRK LKWSCGQSYG 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
EVTHKDDMMT PISVGKKTIY LVSFFEGLQR IILFTEDPRV FKVTYESEKA ELAELEVVLA 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
LQDVGISLVN NYTKQEVAYI GITSSDVVWE AKPKKKARWK PMSVKHTEKL EKEFREYTEA 
      2590       2600       2610       2620       2630       2640 
SPLEDKVVEL DNIPVRLTPS GNDMKILQPH VIPVRRNYLP ALKVEYNTSA HQSSFRIQIY 
      2650       2660       2670       2680       2690       2700 
RIQIQNQIHG AIFPFVFYPI KPPRSVTMDS APKPFTDVSI VMRSAGHSQI SRIKYFKVLI 
      2710       2720       2730       2740       2750       2760 
QEMDLSLDLG FVYALADLVT KAEVTEKTEV EHFHKDVEAF EQEYEVVSSV DQSQVNLFEY 
      2770       2780       2790       2800       2810       2820 
FHISPIKLHL SVSLSSGRDE AKDSEQHGGL IPVHSLNLLL KSIGATLTDV QDVVFKLAFF 
      2830       2840       2850       2860       2870       2880 
ELNYQFHTTS ELQSEVIRHY SKQAIKQMYV LILGLDVLGN PFGLIREFSE GVEAFFYEPY 
      2890       2900       2910       2920       2930       2940 
QGAIQGPEEF VEGMALGLKA LVGGAVGGLA GAASKITSAM AKGVAAMTMD EDYQQKRREA 
      2950       2960       2970       2980       2990       3000 
MNKQPAGLRE GITRGGKGLV SGFVSGITGI VTKPIKGAQK EGAAGFFKGV GKGLVGAVTR 
      3010       3020       3030       3040       3050       3060 
PTGGIIDMAS STFQGIKRAT ETSEVESLRP PRFFNEDGVI RPYRLRDGSG NQMLQVMENG 
      3070       3080       3090       3100       3110       3120 
RFAKYKYFTH VMINKTDMFM ITRRGVLFVT KGTFGQLTCE WQYTFDEFTK EPFIVHGRRL 
      3130       3140       3150       3160    
RIEAKERVKS VFHAKEFGKI VNFKTPEDAR WILTKLEEAR EPSPRL

Isoforms

- Isoform 2 of Vacuolar protein sorting-associated protein 13A

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MVFESVVVEV LNRFLGDYVV NLDESQLSLG IWKGAVALKN LVIKENALHE LDVPFKVKVG 
        70         80         90        100        110        120 
HIGSLKLKIP WKNLYTQPVE AVLEEIFLLI VPSSRIQYDP IKEEKQLMET KQQELKRIEK 
       130        140        150        160        170        180 
AKQKVFDKEK PREEKQDTFT EKLVTQIIQN LQVQISSIHI RYEDDITNGD KPLSFGISLQ 
       190        200        210        220        230        240 
NISLQTTDQY WIPCLHDNTE KLVRKLIRLD NLFAYWNVNS EMFYLNDYDE SLKALKNGIV 
       250        260        270        280        290        300 
NENIVPEGYD FVFRPISASA KLQMNRRSDF DFSDPKINLA VDLHTIAIEF NKPQYFSLME 
       310        320        330        340        350        360 
LLESIDMMTQ NQPYRKFKPS VPLHLHAKEW WAYAIHSILE VNVCPSLRMW SWEHIRNHRY 
       370        380        390        400        410        420 
KMKRYREFYK KKLTSKKPSP EILMSLEELE KTLDVFNITI ARQQAEVEAK KAGYKIYKEG 
       430        440        450        460        470        480 
VKDPEDNAGW FGWLWTWSES NANQQQDVKP GILEEMLTPE EKSLLYEAIG YSETAVDPTL 
       490        500        510        520        530        540 
PKTFEALKFF VHLKSMSIVL RENHQKPELL NVVVEGLSTS VVQRPGAQAI KFETKIDSFH 
       550        560        570        580        590        600 
ITGLPDDFKK PHLLSSLDDT SLLQITFEIN PLNETVAQRC TIEAEPLEII YDARTVNSIV 
       610        620        630        640        650        660 
EFFRPPKDVH LAQLTSVTLT KLEEFRAKTA TGLLYVIETQ KVLDLRINVK ASYVIVPQYG 
       670        680        690        700        710        720 
NFSPTSNLLL LDLGHLKVSS KRRSLLPDVR PSEASLEDIM HRAYDSFDIQ LTSIQLLYSR 
       730        740        750        760        770        780 
VGDNWKEARK LNVSTQHILI PMHVNVELSK AMVFMDIKMP KFKISGKLPL VSLRISDKKL 
       790        800        810        820        830        840 
QGIMELLGSI PKPEPVTDVS APARSFQIQA SALPVSHISQ KLIPLLEQPV TEDDSEEEFF 
       850        860        870        880        890        900 
DAPCSPLEEC PQVSCRDKCT RQKKLQKKDC VMNLIQLRMR FEVAEVSIQF YHLVGDCELP 
       910        920        930        940        950        960 
VLEMGALGLG TEAEFRTFDL KGSAFLKELW LKCPEYLDEN KKPVYLITTL DNTMEDLLTL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
EFMKVEKNAP NLNSTYNNVL QLIKVNFSSL DIHLHTEALL NTMNYLNNIL PELREKSASV 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SAAEPEDKGD IIKKLALKLP TNEDIITLQL LAELSCLQIF IQDQKQNISE IKIEGLDSEM 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
IMKPLVTEIN AKLRNIIVLD SDKMAIYKKA LYITGKEVFS FKMISYMDAT AGYAYTDMSV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
VDIRVHLTVG CIEVVFITKF LYSILAFIDN FQAVKDALAE ATVQAAEMAA DGVKELARKS 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SRFALDVNIK APVVLIPQSP VSQNVFVADF GLITMKNIFV TVTETQSNIP PVIDLITIKL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
SKMRLYRSQF RNDTYQEVLD LLLPLNLEVI VERNLSWEWY KEVPCFNIKA QLKPMEFILS 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
QEDLTTVFQT LHGNIWYGQD LSAPSSANKD PETMTSGVTS PPDHSPATVV TAAVVEVHPQ 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
ASQAHTMLNV SFQTDYLTMA LYSPGPDEAS FTDVRDPSLE LAEFKLENII SSLKIYTDDS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
TVFSFSVKNC ILDDKRSHVM KATPRMIGLT VGFDKKDMVD IKYRKIKTFV VTDAVVQEMY 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
VCASVEFLMT VAHIFFDAYM TSTALETSVQ TRTTREAPAQ ELGKWEMNIL IKNPEIVFVA 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
DMTRNDAPAL VITTQCEICC KGEPTSNTVT AAIKDLQVRA CPFLPVKRKG KVTTVLQPCD 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
LFYQATQLGR DPQMIDISVK SLTLKVSPVI INTIITITSA LYTTKETVPE ENTSNIAHLW 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
DKKDTKNLKM WFLEESNESE KVVPTNEVMP GGETLNLRID SIFIVLEAGI GHRTVPMLLA 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
KACFSGESKN WLSLINLHCH LELEVHYYNE MFGVWEPLLE PLEIDQTDDF RPWNLGIKMK 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
KKAKEAIVES DSEAENYKVP EYKTAISFYS RDQLNITLSK CGLVMLNNLV EAFTEAATGS 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
SSVFLRDLAP FMIFNSLGLT VSVSPSDSFS VLNVPLAKSY ELKNDESLSM DYVRTKDNDH 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
FNAMTSLSSK LFFILLTPAN HSVADKIPLT KVGRRLYTVR HRESGVERSI ICQIDTVEGS 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
KKVTIRSPVQ IKNHFSIPIS VFEGDTLLGI ASPENEFNIP LASYRSSLSL VPEDQDYQLC 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
EGIDFEEIIK YDGQLLKKKC RSTNPSKKSF VINIVPEKDN LASLSVYSED GWDLPYVLHL 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
WPPILIRNLL PYKVAYYIEG IENTVVTLSE GHSSQIYNVE MDQAKLHLKL LDYLNHDWKS 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
EFYIRSSQQD INFINFTCLT EMEKSDLDIA IHMTYNTGQT VVAFHSPYWM VNKTNRMLQY 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
KADGIHRKHP PNYTKPVLFS FQPNHFFNNN KVQLMVTDSE LSDQFSIDTV GSHGAIRCKG 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
LKMEYQVGVT INLSSFNITR IVTFIPFYMI KNKSKYHISV AEEGSDKWLS LDLEQSIPFW 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
PENASNILLI QVERSEDPPK RIYFNKQDNC ILLRLNNELG GIIAEVNLAE HSTVITFSDY 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
HDGAATFLLI NHTKSDPVQY NQSSLGEIED SLPPGKAVYY TWADPVGSRK LKWSCGQSYG 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
EVTHKDDMMT PISVGKKTIY LVSFFEGLQR IILFTEDPRV FKVTYESEKA ELAELEVVLA 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
LQDVGISLVN NYTKQEVAYI GITSSDVVWE AKPKKKARWK PMSVKHTEKL EKEFREYTEA 
      2590       2600       2610       2620       2630       2640 
SPLEDKVVEL DNIPVRLTPS GNDMKILQPH VIPVRRNYLP ALKVEYNTSA HQSSFRIQIY 
      2650       2660       2670       2680       2690       2700 
RIQIQNQIHG AIFPFVFYPI KPPRSVTMDS APKPFTDVSI VMRSAGHSQI SRIKYFKVLI 
      2710       2720       2730       2740       2750       2760 
QEMDLSLDLG FVYALADLVT KAEVTEKTEV EHFHKDVEAF EQEYEVVSSV DQSQVNLFEY 
      2770       2780       2790       2800       2810       2820 
FHISPIKLHL SVSLSSGRDE AKDSEQHGGL IPVHSLNLLL KSIGATLTDV QDVVFKLAFF 
      2830       2840       2850       2860       2870       2880 
ELNYQFHTTS ELQSEVIRHY SKQAIKQMYV LILGLDVLGN PFGLIREFSE GVEAFFYEPY 
      2890       2900       2910       2920       2930       2940 
QGAIQGPEEF VEGMALGLKA LVGGAVGGLA GAASKITSAM AKGVAAMTMD EDYQQKRREA 
      2950       2960       2970       2980       2990       3000 
MNKQPAGLRE GITRGGKGLV SGFVSGITGI VTKPIKGAQK EGAAGFFKGV GKGLVGAVTR 
      3010       3020       3030       3040       3050       3060 
PTGGIIDMAS STFQGIKRAT ETSEVESLRP PRFFNEDGVI RPYRLRDGSG NQMLQVMENG 
      3070       3080       3090       3100       3110       3120 
RFAKYKYFTH VMINKTDMFM ITRRGVLFVT KGTFGQLTCE WQYTFDEFTK EPFIVHGRRL 
      3130       3140       3150       3160    
RIEAKERVKS VFHAKEFGKI VNFKTPEDAR WILTKLEEAR EPSPRL



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q5H8C4-1-unknown MVFESV... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q5H8C4-1-unknown MVFESV... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt94225

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...PSPRL 3166 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)