TopFIND 4.0

Q5H9U9: Probable ATP-dependent RNA helicase DDX60-like

General Information

Protein names
- Probable ATP-dependent RNA helicase DDX60-like
- 3.6.4.13
- DEAD box protein 60-like
Gene names DDX60L
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q5H9U9

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MGSKDHAVFF REMTQLILNE MPKAGYSSIL NDFVESNFFV IDGDSLLVTC LGVKSFKWGQ 
        70         80         90        100        110        120 
NLHFFYLVEC YLVDLLSNGG QFTIVFFKDA EYAYFDFPEL LSLRTALILH LQHNTNIDVQ 
       130        140        150        160        170        180 
TEFSGCLSQD WKLFLEQHYP YFLIVSEEGL SDLQTYLFNF LIIHSWGMKV NVVLSSGHES 
       190        200        210        220        230        240 
DTLRFYAYTM ESTDRNQTFS KENETVIQSA YKSLIQHLEE IRVLVLATHF EHLKWNDMME 
       250        260        270        280        290        300 
EAYQTLFLLQ HLWSEGSDIQ RVLCVTSCSL SLRMYHRVLV HSNCLSLQEV EDFCRLRCLC 
       310        320        330        340        350        360 
VAFQLHLPLS QRACSRVITC SWIRNSDSFL KMNKWCEYFI LSNLNVFGCW NLNLNHVSDL 
       370        380        390        400        410        420 
YDEQLLKNIA FYYEFESTQE PHLNLGDSIR RDYEDLWNVV SHLVKEFNVG KSFPLRTTRR 
       430        440        450        460        470        480 
HFLRQEKSVI QEISLEKMPS VGFIPMTSAV IDEFVGDMMK DLPILKSDDP VVPSLFKQKT 
       490        500        510        520        530        540 
SDELLHWHAQ RLLSDDYDRI KCHVDEQSRD PHVLDFLKKI QDYQQFYGKS LESISTKVIV 
       550        560        570        580        590        600 
TQTTRPKEDS SGASGEILQN TKPHQITKKS KKKSFLKEDQ NKAQQNDDLL FSIEEEMKNN 
       610        620        630        640        650        660 
LHSGIRKLED YLTSCASNSV KFGVEMLGLI ACFKAWKKHC RGEGKISKDL SIAVQMMKRI 
       670        680        690        700        710        720 
HSLLERYPEI LEAEHHQYIA KCLKYLGFND LANSLDPTLI GDDKNKKKYS IDIGPARFQL 
       730        740        750        760        770        780 
QYMGHYLIRD ERKDRDPRVQ DFIPNAWQQE LLDVVDKNES AVIVAPTSSG KTYASYYCME 
       790        800        810        820        830        840 
KVLRESDVGV VVYVAPAKSL VGQVAATVEN RFTKTLPAGR TLCGAFTRDY CHNVLNCQVL 
       850        860        870        880        890        900 
ITVPECFEIL LLAPHRQKWV ERIRYVIFDE VHYLGREVGA KFWELLLVII RCPFLVLSAT 
       910        920        930        940        950        960 
INNPNLLTKW LQSVKQYWKQ ADKIMEEKCI SEKQADKCLN FLQDHSYKNQ SYEVRLVLYG 
       970        980        990       1000       1010       1020 
ERYNDLEKHI CSVKHDDVYF DHFHPCAALT TDIIEKYGFP PDLTLTPQES IQLYDTMAQV 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
WETWPRAQEL CPEEFILFKN KIVIKKLDAR KYEENLKAEL TNWIKNGQVK KVKRVLKNLS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
PDSLSSSKDM VKMFPLLVEK LRQMDKLPAI FFLFKNDDVG KRAGSVCTFL EKTETKSHPH 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
TECHSYVFAI DEVLEKVRKT QKRITKKNPK KAEKLERKKV YRAEYINFLE NLKILEISED 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
CTYADVKALH TEITRNKDST LERVLPRVRF TRHGKELKAL AQRGIGYHHS SMYFKEKEFV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
EILFVKGLIR VVTATETLAL GIHMPCKSVV FAQDSVYLDA LNYRQMSGRA GRRGQDLLGN 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
VYFFDIPLPK IKRLLASSVP ELRGQFPLSI TLVLRLMLLA SKGDDPEDAK AKVLSVLKHS 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LLSFKRRRAM ETLKLYFLFS LQLLIKEDYL NKKGNPKKFA GLASYLHGHE PSNLVFVNFL 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
KRGLFHNLCK PAWKGSQQFS QDVMEKLVLV LANLFGRKYI PAKFQNANLS FSQSKVILAE 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
LPEDFKAALY EYNLAVMKDF ASFLLIASKS VNMKKEHQLP LSRIKFTGKE CEDSQLVSHL 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
MSCKKGRVAI SPFVCLSGNT DNDLLRPETI NQVILRTVGV SGTQAPLLWP WKLDNRGRRM 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PLNAYVLNFY KHNCLTRLDQ KNGMRMGQLL KCLKDFAFNI QAISDSLSEL CENKRDNVVL 
      1690       1700    
AFKQLSQTFY EKLQEMQIQM SQNHLE

Isoforms

- Isoform 2 of Probable ATP-dependent RNA helicase DDX60-like

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MGSKDHAVFF REMTQLILNE MPKAGYSSIL NDFVESNFFV IDGDSLLVTC LGVKSFKWGQ 
        70         80         90        100        110        120 
NLHFFYLVEC YLVDLLSNGG QFTIVFFKDA EYAYFDFPEL LSLRTALILH LQHNTNIDVQ 
       130        140        150        160        170        180 
TEFSGCLSQD WKLFLEQHYP YFLIVSEEGL SDLQTYLFNF LIIHSWGMKV NVVLSSGHES 
       190        200        210        220        230        240 
DTLRFYAYTM ESTDRNQTFS KENETVIQSA YKSLIQHLEE IRVLVLATHF EHLKWNDMME 
       250        260        270        280        290        300 
EAYQTLFLLQ HLWSEGSDIQ RVLCVTSCSL SLRMYHRVLV HSNCLSLQEV EDFCRLRCLC 
       310        320        330        340        350        360 
VAFQLHLPLS QRACSRVITC SWIRNSDSFL KMNKWCEYFI LSNLNVFGCW NLNLNHVSDL 
       370        380        390        400        410        420 
YDEQLLKNIA FYYEFESTQE PHLNLGDSIR RDYEDLWNVV SHLVKEFNVG KSFPLRTTRR 
       430        440        450        460        470        480 
HFLRQEKSVI QEISLEKMPS VGFIPMTSAV IDEFVGDMMK DLPILKSDDP VVPSLFKQKT 
       490        500        510        520        530        540 
SDELLHWHAQ RLLSDDYDRI KCHVDEQSRD PHVLDFLKKI QDYQQFYGKS LESISTKVIV 
       550        560        570        580        590        600 
TQTTRPKEDS SGASGEILQN TKPHQITKKS KKKSFLKEDQ NKAQQNDDLL FSIEEEMKNN 
       610        620        630        640        650        660 
LHSGIRKLED YLTSCASNSV KFGVEMLGLI ACFKAWKKHC RGEGKISKDL SIAVQMMKRI 
       670        680        690        700        710        720 
HSLLERYPEI LEAEHHQYIA KCLKYLGFND LANSLDPTLI GDDKNKKKYS IDIGPARFQL 
       730        740        750        760        770        780 
QYMGHYLIRD ERKDRDPRVQ DFIPNAWQQE LLDVVDKNES AVIVAPTSSG KTYASYYCME 
       790        800        810        820        830        840 
KVLRESDVGV VVYVAPAKSL VGQVAATVEN RFTKTLPAGR TLCGAFTRDY CHNVLNCQVL 
       850        860        870        880        890        900 
ITVPECFEIL LLAPHRQKWV ERIRYVIFDE VHYLGREVGA KFWELLLVII RCPFLVLSAT 
       910        920        930        940        950        960 
INNPNLLTKW LQSVKQYWKQ ADKIMEEKCI SEKQADKCLN FLQDHSYKNQ SYEVRLVLYG 
       970        980        990       1000       1010       1020 
ERYNDLEKHI CSVKHDDVYF DHFHPCAALT TDIIEKYGFP PDLTLTPQES IQLYDTMAQV 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
WETWPRAQEL CPEEFILFKN KIVIKKLDAR KYEENLKAEL TNWIKNGQVK KVKRVLKNLS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
PDSLSSSKDM VKMFPLLVEK LRQMDKLPAI FFLFKNDDVG KRAGSVCTFL EKTETKSHPH 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
TECHSYVFAI DEVLEKVRKT QKRITKKNPK KAEKLERKKV YRAEYINFLE NLKILEISED 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
CTYADVKALH TEITRNKDST LERVLPRVRF TRHGKELKAL AQRGIGYHHS SMYFKEKEFV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
EILFVKGLIR VVTATETLAL GIHMPCKSVV FAQDSVYLDA LNYRQMSGRA GRRGQDLLGN 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
VYFFDIPLPK IKRLLASSVP ELRGQFPLSI TLVLRLMLLA SKGDDPEDAK AKVLSVLKHS 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LLSFKRRRAM ETLKLYFLFS LQLLIKEDYL NKKGNPKKFA GLASYLHGHE PSNLVFVNFL 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
KRGLFHNLCK PAWKGSQQFS QDVMEKLVLV LANLFGRKYI PAKFQNANLS FSQSKVILAE 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
LPEDFKAALY EYNLAVMKDF ASFLLIASKS VNMKKEHQLP LSRIKFTGKE CEDSQLVSHL 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
MSCKKGRVAI SPFVCLSGNT DNDLLRPETI NQVILRTVGV SGTQAPLLWP WKLDNRGRRM 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PLNAYVLNFY KHNCLTRLDQ KNGMRMGQLL KCLKDFAFNI QAISDSLSEL CENKRDNVVL 
      1690       1700    
AFKQLSQTFY EKLQEMQIQM SQNHLE



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q5H9U9-1-unknown MGSKDH... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q5H9U9-1-unknown MGSKDH... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt72560

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...QNHLE 1706 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)