TopFIND 4.0

Q5SRE5: Nucleoporin NUP188 homolog

General Information

Protein names
- Nucleoporin NUP188 homolog
- hNup188
Gene names NUP188
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q5SRE5

3

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MAAAAGGPCV RSSRELWTIL LGRSALRELS QIEAELNKHW RRLLEGLSYY KPPSPSSAEK 
        70         80         90        100        110        120 
VKANKDVASP LKELGLRISK FLGLDEEQSV QLLQCYLQED YRGTRDSVKT VLQDERQSQA 
       130        140        150        160        170        180 
LILKIADYYY EERTCILRCV LHLLTYFQDE RHPYRVEYAD CVDKLEKELV SKYRQQFEEL 
       190        200        210        220        230        240 
YKTEAPTWET HGNLMTERQV SRWFVQCLRE QSMLLEIIFL YYAYFEMAPS DLLVLTKMFK 
       250        260        270        280        290        300 
EQGFGSRQTN RHLVDETMDP FVDRIGYFSA LILVEGMDIE SLHKCALDDR RELHQFAQDG 
       310        320        330        340        350        360 
LICQDMDCLM LTFGDIPHHA PVLLAWALLR HTLNPEETSS VVRKIGGTAI QLNVFQYLTR 
       370        380        390        400        410        420 
LLQSLASGGN DCTTSTACMC VYGLLSFVLT SLELHTLGNQ QDIIDTACEV LADPSLPELF 
       430        440        450        460        470        480 
WGTEPTSGLG IILDSVCGMF PHLLSPLLQL LRALVSGKST AKKVYSFLDK MSFYNELYKH 
       490        500        510        520        530        540 
KPHDVISHED GTLWRRQTPK LLYPLGGQTN LRIPQGTVGQ VMLDDRAYLV RWEYSYSSWT 
       550        560        570        580        590        600 
LFTCEIEMLL HVVSTADVIQ HCQRVKPIID LVHKVISTDL SIADCLLPIT SRIYMLLQRL 
       610        620        630        640        650        660 
TTVISPPVDV IASCVNCLTV LAARNPAKVW TDLRHTGFLP FVAHPVSSLS QMISAEGMNA 
       670        680        690        700        710        720 
GGYGNLLMNS EQPQGEYGVT IAFLRLITTL VKGQLGSTQS QGLVPCVMFV LKEMLPSYHK 
       730        740        750        760        770        780 
WRYNSHGVRE QIGCLILELI HAILNLCHET DLHSSHTPSL QFLCICSLAY TEAGQTVINI 
       790        800        810        820        830        840 
MGIGVDTIDM VMAAQPRSDG AEGQGQGQLL IKTVKLAFSV TNNVIRLKPP SNVVSPLEQA 
       850        860        870        880        890        900 
LSQHGAHGNN LIAVLAKYIY HKHDPALPRL AIQLLKRLAT VAPMSVYACL GNDAAAIRDA 
       910        920        930        940        950        960 
FLTRLQSKIE DMRIKVMILE FLTVAVETQP GLIELFLNLE VKDGSDGSKE FSLGMWSCLH 
       970        980        990       1000       1010       1020 
AVLELIDSQQ QDRYWCPPLL HRAAIAFLHA LWQDRRDSAM LVLRTKPKFW ENLTSPLFGT 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LSPPSETSEP SILETCALIM KIICLEIYYV VKGSLDQSLK DTLKKFSIEK RFAYWSGYVK 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SLAVHVAETE GSSCTSLLEY QMLVSAWRML LIIATTHADI MHLTDSVVRR QLFLDVLDGT 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
KALLLVPASV NCLRLGSMKC TLLLILLRQW KRELGSVDEI LGPLTEILEG VLQADQQLME 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
KTKAKVFSAF ITVLQMKEMK VSDIPQYSQL VLNVCETLQE EVIALFDQTR HSLALGSATE 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
DKDSMETDDC SRSRHRDQRD GVCVLGLHLA KELCEVDEDG DSWLQVTRRL PILPTLLTTL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
EVSLRMKQNL HFTEATLHLL LTLARTQQGA TAVAGAGITQ SICLPLLSVY QLSTNGTAQT 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PSASRKSLDA PSWPGVYRLS MSLMEQLLKT LRYNFLPEAL DFVGVHQERT LQCLNAVRTV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QSLACLEEAD HTVGFILQLS NFMKEWHFHL PQLMRDIQVN LGYLCQACTS LLHSRKMLQH 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
YLQNKNGDGL PSAVAQRVQR PPSAASAAPS SSKQPAADTE ASEQQALHTV QYGLLKILSK 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
TLAALRHFTP DVCQILLDQS LDLAEYNFLF ALSFTTPTFD SEVAPSFGTL LATVNVALNM 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
LGELDKKKEP LTQAVGLSTQ AEGTRTLKSL LMFTMENCFY LLISQAMRYL RDPAVHPRDK 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
QRMKQELSSE LSTLLSSLSR YFRRGAPSSP ATGVLPSPQG KSTSLSKASP ESQEPLIQLV 
   
QAFVRHMQR

Isoforms

- Isoform 2 of Nucleoporin NUP188 homolog

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MAAAAGGPCV RSSRELWTIL LGRSALRELS QIEAELNKHW RRLLEGLSYY KPPSPSSAEK 
        70         80         90        100        110        120 
VKANKDVASP LKELGLRISK FLGLDEEQSV QLLQCYLQED YRGTRDSVKT VLQDERQSQA 
       130        140        150        160        170        180 
LILKIADYYY EERTCILRCV LHLLTYFQDE RHPYRVEYAD CVDKLEKELV SKYRQQFEEL 
       190        200        210        220        230        240 
YKTEAPTWET HGNLMTERQV SRWFVQCLRE QSMLLEIIFL YYAYFEMAPS DLLVLTKMFK 
       250        260        270        280        290        300 
EQGFGSRQTN RHLVDETMDP FVDRIGYFSA LILVEGMDIE SLHKCALDDR RELHQFAQDG 
       310        320        330        340        350        360 
LICQDMDCLM LTFGDIPHHA PVLLAWALLR HTLNPEETSS VVRKIGGTAI QLNVFQYLTR 
       370        380        390        400        410        420 
LLQSLASGGN DCTTSTACMC VYGLLSFVLT SLELHTLGNQ QDIIDTACEV LADPSLPELF 
       430        440        450        460        470        480 
WGTEPTSGLG IILDSVCGMF PHLLSPLLQL LRALVSGKST AKKVYSFLDK MSFYNELYKH 
       490        500        510        520        530        540 
KPHDVISHED GTLWRRQTPK LLYPLGGQTN LRIPQGTVGQ VMLDDRAYLV RWEYSYSSWT 
       550        560        570        580        590        600 
LFTCEIEMLL HVVSTADVIQ HCQRVKPIID LVHKVISTDL SIADCLLPIT SRIYMLLQRL 
       610        620        630        640        650        660 
TTVISPPVDV IASCVNCLTV LAARNPAKVW TDLRHTGFLP FVAHPVSSLS QMISAEGMNA 
       670        680        690        700        710        720 
GGYGNLLMNS EQPQGEYGVT IAFLRLITTL VKGQLGSTQS QGLVPCVMFV LKEMLPSYHK 
       730        740        750        760        770        780 
WRYNSHGVRE QIGCLILELI HAILNLCHET DLHSSHTPSL QFLCICSLAY TEAGQTVINI 
       790        800        810        820        830        840 
MGIGVDTIDM VMAAQPRSDG AEGQGQGQLL IKTVKLAFSV TNNVIRLKPP SNVVSPLEQA 
       850        860        870        880        890        900 
LSQHGAHGNN LIAVLAKYIY HKHDPALPRL AIQLLKRLAT VAPMSVYACL GNDAAAIRDA 
       910        920        930        940        950        960 
FLTRLQSKIE DMRIKVMILE FLTVAVETQP GLIELFLNLE VKDGSDGSKE FSLGMWSCLH 
       970        980        990       1000       1010       1020 
AVLELIDSQQ QDRYWCPPLL HRAAIAFLHA LWQDRRDSAM LVLRTKPKFW ENLTSPLFGT 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LSPPSETSEP SILETCALIM KIICLEIYYV VKGSLDQSLK DTLKKFSIEK RFAYWSGYVK 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SLAVHVAETE GSSCTSLLEY QMLVSAWRML LIIATTHADI MHLTDSVVRR QLFLDVLDGT 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
KALLLVPASV NCLRLGSMKC TLLLILLRQW KRELGSVDEI LGPLTEILEG VLQADQQLME 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
KTKAKVFSAF ITVLQMKEMK VSDIPQYSQL VLNVCETLQE EVIALFDQTR HSLALGSATE 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
DKDSMETDDC SRSRHRDQRD GVCVLGLHLA KELCEVDEDG DSWLQVTRRL PILPTLLTTL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
EVSLRMKQNL HFTEATLHLL LTLARTQQGA TAVAGAGITQ SICLPLLSVY QLSTNGTAQT 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PSASRKSLDA PSWPGVYRLS MSLMEQLLKT LRYNFLPEAL DFVGVHQERT LQCLNAVRTV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QSLACLEEAD HTVGFILQLS NFMKEWHFHL PQLMRDIQVN LGYLCQACTS LLHSRKMLQH 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
YLQNKNGDGL PSAVAQRVQR PPSAASAAPS SSKQPAADTE ASEQQALHTV QYGLLKILSK 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
TLAALRHFTP DVCQILLDQS LDLAEYNFLF ALSFTTPTFD SEVAPSFGTL LATVNVALNM 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
LGELDKKKEP LTQAVGLSTQ AEGTRTLKSL LMFTMENCFY LLISQAMRYL RDPAVHPRDK 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
QRMKQELSSE LSTLLSSLSR YFRRGAPSSP ATGVLPSPQG KSTSLSKASP ESQEPLIQLV 
   
QAFVRHMQR



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

3 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...RHMQR 1749 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...RHMQR 1749 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt79100

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)