TopFIND 4.0

Q5SWW4: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13

General Information

Protein names
- Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13
- Thyroid hormone receptor-associated protein 1
- Thyroid hormone receptor-associated protein complex 240 kDa component
- Trap240
Gene names Med13
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q5SWW4

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MSSSFVSNGA SLEDCHCNLF CLADLTGIKW KRYVWQGPTS APILFPVTEE DPILSSFSRC 
        70         80         90        100        110        120 
LKADVLGVWR RDQRPGRREL WIFWWGKDPN FADLIHHDLS EEEDGVWENG LSYECRTLLF 
       130        140        150        160        170        180 
KAVHNLLERC LMNRNFVRIG KWFVKPYEKD EKPINKSEHL SCSFTFFLHG DSNVCTSVEI 
       190        200        210        220        230        240 
NQHQPVYLLS EEHVTLAQQS NSPFQVILSP FGLNGTLTGQ AFKMSDSATK KLIGEWKQFY 
       250        260        270        280        290        300 
PISCGLKEMS EEKQDDMDWE DDSLAAVEVL VAGVRMIYPA CFVLVPQSDI PAPSSVGASH 
       310        320        330        340        350        360 
CSASCLGIHQ VPASTRDPAM SSVTLTPPTS PEEVQTVDPQ SAQKWVKFSS VSDGFSTDST 
       370        380        390        400        410        420 
SHHGGKIPRK LANHVVDRVW QECNMNRLQN KRKYSATSSG LCEEETADKI GCWDFVEATQ 
       430        440        450        460        470        480 
RTSCSCLRHK SLKTRNTGQQ GQAPSLGQQQ QVLPKHKTNE KQDKSEKPQK RPLTPFHHRV 
       490        500        510        520        530        540 
SVSDEIGMDT DSASQRLVIS AADSQVRFSN IRTNDVAKTP QMHGTELANS PQPPPLSPHP 
       550        560        570        580        590        600 
CDVVDEGVTK TPSTPQSQHF YQMPTPDPLV PTKPMEDRID SLSQSFPPPF QEAVEPTVYV 
       610        620        630        640        650        660 
GTAVSLEEDE ANVAWKYYKV PKKKDVEFLP PQLPNDKFKD DPVGPFGQES VTSVTELMVQ 
       670        680        690        700        710        720 
CKKPLKVSDE IVQQYQIKNQ YLSAIASDTE QEPKIDPYAF VEGDEEFIFT DKKDRQNSER 
       730        740        750        760        770        780 
EAGKKHKVED GTSAVTVLSH EEDAMSLFSP SKQDAPRPTN HARPPSTSLI YDSDLAVSYT 
       790        800        810        820        830        840 
DLDNLFNSDE DELTPGSKKS ASGSDDKASS KESKTGNLDP LSCISTADLH KMYPTPPSLE 
       850        860        870        880        890        900 
QHIMGFSPMN MNNKEYGSVD TAPGGTVLEG NSSSVGTQFR IEVEEGFCSP KPSEIKDFSY 
       910        920        930        940        950        960 
VYKPENCQVL VGCSMFAPLK TLPSHCLPPI KLPEECVYRQ SWTVGKLDLL PSGPSMPFIK 
       970        980        990       1000       1010       1020 
EGDGSNLDQD YGPAYTPQTH ASFGMPPSSA PPSNGGAGIL PSPSTPRFPT PRTPRTPRTP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
RGAGGPASAQ GSVKYENSDL YSPASTPSTC RPLNSVEPAT VPSIPEAHSL YVNLILSESV 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
MNLFKDCNFD SCCICVCNMN IKGADVGVYI PDPTQEAQYR CTCGFSAVMN RKFGNNSGLF 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
LEDELDIIGR NTDCGKEAEK RFEALRASSV ENVNGGLKES EKVPDELILL LQDQCTNLFS 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PFGAADQDPF PKVGISSNWV RVEERDCCSD CCLALEHGRQ FMDNMSGGKV DEALVRSSCL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
HPWAKQNDAS VQCSQDILRM LLSLQPVLQD AIQKKRTVRP WGVQGPLTWQ QFHKMAGRGS 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
YGTDESPEPL PIPTFLLGYD YDFLVLSPFA LPYWEKLMLE PYGSQRDIAY VVLCPENEAL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LNGARSFFRD LTAIYESCRL GQHRPISRLL TDGIMKVGAT ASKKLSEKFV TEWFSQAADG 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
NNEAFSKLKL YAQVCRYDLG PYLASQPLDS SLLSQPNLVA PPNQSLVTAP QMTNTGNANA 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
PSATLASAAS STMTMTSGVP ISTSVATANS TLTTTSSSSS SSLSSGVSSN KLPSFPPFGS 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
MNTSGTGSMS AQASTVQSGQ LGGQQSSSLQ AAGISGESAS LPTQPHPDVS ESTMDRDKVG 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
IPTDGDSHAI TYPPAIVVYI IDPFTYENKD ESTNSSNVWT LGLLRCFLEM VQTLPPHIKS 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
TVSVQIVPCQ YLLQPVKHDD RQIYSQHLKS LAFSVFTQCR RPLPTSTNVK TLTGFGPGLA 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
METALKSPDR PECIRLYTPP FILAPVKDKQ TELGETFGEA GQKYNVLFVG YCLSHDQRWI 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
LASCTDLYGE LLETCIINID VPNRARRKKG SARRFGLQKL WEWCLGLVQM SSLPWRVVIG 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
RLGRIGHGEL KDWSCLLSRR NLQSLSKRLK DMCRMCGISA ADSPSILSAC LVAMEPQGSF 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
VIMPDSVSTG SVFGRSTTLN MQTPQLNTPQ DTSCTHILVF PTSASVQVAS ATYTTENLDL 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
AFNPNNDGAD GMGIFDLLDT GDDLDPDIIN ILPASPTASP VHSPGSHYPH GGDAGKGQGT 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
DRLLSTESHD EVTNILQQPL ALGYFVSTAK AGPLPDWFWS ACPQAQYQCP LFLKASLHLH 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
VPSVQSDELL HSKHSHPLDS NQTSDVLRFV LEQYNALSWL TCDPAVQDRR SCLPVHFVVL 
      2170    
NQLYNFIMNM L

Isoforms



Sequence View



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q5SWW4-1-unknown MSSSFV... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...IMNML 2171 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)