TopFIND 4.0

Q5TZA2: Rootletin

General Information

Protein names
- Rootletin
- Ciliary rootlet coiled-coil protein
Gene names CROCC
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q5TZA2

3

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MSLGLARAQE VELTLETVIQ TLESSVLCQE KGLGARDLAQ DAQITSLPAL IREIVTRNLS 
        70         80         90        100        110        120 
QPESPVLLPA TEMASLLSLQ EENQLLQQEL SRVEDLLAQS RAERDELAIK YNAVSERLEQ 
       130        140        150        160        170        180 
ALRLEPGELE TQEPRGLVRQ SVELRRQLQE EQASYRRKLQ AYQEGQQRQA QLVQRLQGKI 
       190        200        210        220        230        240 
LQYKKRCSEL EQQLLERSGE LEQQRLRDTE HSQDLESALI RLEEEQQRSA SLAQVNAMLR 
       250        260        270        280        290        300 
EQLDQAGSAN QALSEDIRKV TNDWTRCRKE LEHREAAWRR EEESFNAYFS NEHSRLLLLW 
       310        320        330        340        350        360 
RQVVGFRRLV SEVKMFTERD LLQLGGELAR TSRAVQEAGL GLSTGLRLAE SRAEAALEKQ 
       370        380        390        400        410        420 
ALLQAQLEEQ LRDKVLREKD LAQQQMQSDL DKADLSARVT ELGLAVKRLE KQNLEKDQVN 
       430        440        450        460        470        480 
KDLTEKLEAL ESLRLQEQAA LETEDGEGLQ QTLRDLAQAV LSDSESGVQL SGSERTADAS 
       490        500        510        520        530        540 
NGSLRGLSGQ RTPSPPRRSS PGRGRSPRRG PSPACSDSST LALIHSALHK RQLQVQDMRG 
       550        560        570        580        590        600 
RYEASQDLLG TLRKQLSDSE SERRALEEQL QRLRDKTDGA MQAHEDAQRE VQRLRSANEL 
       610        620        630        640        650        660 
LSREKSNLAH SLQVAQQQAE ELRQEREKLQ AAQEELRRQR DRLEEEQEDA VQDGARVRRE 
       670        680        690        700        710        720 
LERSHRQLEQ LEGKRSVLAK ELVEVREALS RATLQRDMLQ AEKAEVAEAL TKAEAGRVEL 
       730        740        750        760        770        780 
ELSMTKLRAE EASLQDSLSK LSALNESLAQ DKLDLNRLVA QLEEEKSALQ GRQRQAEQEA 
       790        800        810        820        830        840 
TVAREEQERL EELRLEQEVA RQGLEGSLRV AEQAQEALEQ QLPTLRHERS QLQEQLAQLS 
       850        860        870        880        890        900 
RQLSGREQEL EQARREAQRQ VEALERAARE KEALAKEHAG LAVQLVAAER EGRTLSEEAT 
       910        920        930        940        950        960 
RLRLEKEALE GSLFEVQRQL AQLEARREQL EAEGQALLLA KETLTGELAG LRQQIIATQE 
       970        980        990       1000       1010       1020 
KASLDKELMA QKLVQAEREA QASLREQRAA HEEDLQRLQR EKEAAWRELE AERAQLQSQL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
QREQEELLAR LEAEKEELSE EIAALQQERD EGLLLAESEK QQALSLKESE KTALSEKLMG 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
TRHSLATISL EMERQKRDAQ SRQEQDRSTV NALTSELRDL RAQREEAAAA HAQEVRRLQE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
QARDLGKQRD SCLREAEELR TQLRLLEDAR DGLRRELLEA QRKLRESQEG REVQRQEAGE 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
LRRSLGEGAK EREALRRSNE ELRSAVKKAE SERISLKLAN EDKEQKLALL EEARTAVGKE 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
AGELRTGLQE VERSRLEARR ELQELRRQMK MLDSENTRLG RELAELQGRL ALGERAEKES 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
RRETLGLRQR LLKGEASLEV MRQELQVAQR KLQEQEGEFR TRERRLLGSL EEARGTEKQQ 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LDHARGLELK LEAARAEAAE LGLRLSAAEG RAQGLEAELA RVEVQRRAAE AQLGGLRSAL 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
RRGLGLGRAP SPAPRPVPGS PARDAPAEGS GEGLNSPSTL ECSPGSQPPS PGPATSPASP 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
DLDPEAVRGA LREFLQELRS AQRERDELRT QTSALNRQLA EMEAERDSAT SRARQLQKAV 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
AESEEARRSV DGRLSGVQAE LALQEESVRR SERERRATLD QVATLERSLQ ATESELRASQ 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
EKISKMKANE TKLEGDKRRL KEVLDASESR TVKLELQRRS LEGELQRSRL GLSDREAQAQ 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
ALQDRVDSLQ RQVADSEVKA GTLQLTVERL NGALAKVEES EGALRDKVRG LTEALAQSSA 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
SLNSTRDKNL HLQKALTACE HDRQVLQERL DAARQALSEA RKQSSSLGEQ VQTLRGEVAD 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
LELQRVEAEG QLQQLREVLR QRQEGEAAAL NTVQKLQDER RLLQERLGSL QRALAQLEAE 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
KREVERSALR LEKDRVALRR TLDKVEREKL RSHEDTVRLS AEKGRLDRTL TGAELELAEA 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
QRQIQQLEAQ VVVLEQSHSP AQLEVDAQQQ QLELQQEVER LRSAQAQTER TLEARERAHR 
      1990       2000       2010    
QRVRGLEEQV STLKGQLQQE LRRSSAPFSP PSGPPEK

Isoforms

- Isoform 2 of Rootletin

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MSLGLARAQE VELTLETVIQ TLESSVLCQE KGLGARDLAQ DAQITSLPAL IREIVTRNLS 
        70         80         90        100        110        120 
QPESPVLLPA TEMASLLSLQ EENQLLQQEL SRVEDLLAQS RAERDELAIK YNAVSERLEQ 
       130        140        150        160        170        180 
ALRLEPGELE TQEPRGLVRQ SVELRRQLQE EQASYRRKLQ AYQEGQQRQA QLVQRLQGKI 
       190        200        210        220        230        240 
LQYKKRCSEL EQQLLERSGE LEQQRLRDTE HSQDLESALI RLEEEQQRSA SLAQVNAMLR 
       250        260        270        280        290        300 
EQLDQAGSAN QALSEDIRKV TNDWTRCRKE LEHREAAWRR EEESFNAYFS NEHSRLLLLW 
       310        320        330        340        350        360 
RQVVGFRRLV SEVKMFTERD LLQLGGELAR TSRAVQEAGL GLSTGLRLAE SRAEAALEKQ 
       370        380        390        400        410        420 
ALLQAQLEEQ LRDKVLREKD LAQQQMQSDL DKADLSARVT ELGLAVKRLE KQNLEKDQVN 
       430        440        450        460        470        480 
KDLTEKLEAL ESLRLQEQAA LETEDGEGLQ QTLRDLAQAV LSDSESGVQL SGSERTADAS 
       490        500        510        520        530        540 
NGSLRGLSGQ RTPSPPRRSS PGRGRSPRRG PSPACSDSST LALIHSALHK RQLQVQDMRG 
       550        560        570        580        590        600 
RYEASQDLLG TLRKQLSDSE SERRALEEQL QRLRDKTDGA MQAHEDAQRE VQRLRSANEL 
       610        620        630        640        650        660 
LSREKSNLAH SLQVAQQQAE ELRQEREKLQ AAQEELRRQR DRLEEEQEDA VQDGARVRRE 
       670        680        690        700        710        720 
LERSHRQLEQ LEGKRSVLAK ELVEVREALS RATLQRDMLQ AEKAEVAEAL TKAEAGRVEL 
       730        740        750        760        770        780 
ELSMTKLRAE EASLQDSLSK LSALNESLAQ DKLDLNRLVA QLEEEKSALQ GRQRQAEQEA 
       790        800        810        820        830        840 
TVAREEQERL EELRLEQEVA RQGLEGSLRV AEQAQEALEQ QLPTLRHERS QLQEQLAQLS 
       850        860        870        880        890        900 
RQLSGREQEL EQARREAQRQ VEALERAARE KEALAKEHAG LAVQLVAAER EGRTLSEEAT 
       910        920        930        940        950        960 
RLRLEKEALE GSLFEVQRQL AQLEARREQL EAEGQALLLA KETLTGELAG LRQQIIATQE 
       970        980        990       1000       1010       1020 
KASLDKELMA QKLVQAEREA QASLREQRAA HEEDLQRLQR EKEAAWRELE AERAQLQSQL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
QREQEELLAR LEAEKEELSE EIAALQQERD EGLLLAESEK QQALSLKESE KTALSEKLMG 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
TRHSLATISL EMERQKRDAQ SRQEQDRSTV NALTSELRDL RAQREEAAAA HAQEVRRLQE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
QARDLGKQRD SCLREAEELR TQLRLLEDAR DGLRRELLEA QRKLRESQEG REVQRQEAGE 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
LRRSLGEGAK EREALRRSNE ELRSAVKKAE SERISLKLAN EDKEQKLALL EEARTAVGKE 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
AGELRTGLQE VERSRLEARR ELQELRRQMK MLDSENTRLG RELAELQGRL ALGERAEKES 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
RRETLGLRQR LLKGEASLEV MRQELQVAQR KLQEQEGEFR TRERRLLGSL EEARGTEKQQ 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LDHARGLELK LEAARAEAAE LGLRLSAAEG RAQGLEAELA RVEVQRRAAE AQLGGLRSAL 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
RRGLGLGRAP SPAPRPVPGS PARDAPAEGS GEGLNSPSTL ECSPGSQPPS PGPATSPASP 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
DLDPEAVRGA LREFLQELRS AQRERDELRT QTSALNRQLA EMEAERDSAT SRARQLQKAV 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
AESEEARRSV DGRLSGVQAE LALQEESVRR SERERRATLD QVATLERSLQ ATESELRASQ 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
EKISKMKANE TKLEGDKRRL KEVLDASESR TVKLELQRRS LEGELQRSRL GLSDREAQAQ 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
ALQDRVDSLQ RQVADSEVKA GTLQLTVERL NGALAKVEES EGALRDKVRG LTEALAQSSA 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
SLNSTRDKNL HLQKALTACE HDRQVLQERL DAARQALSEA RKQSSSLGEQ VQTLRGEVAD 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
LELQRVEAEG QLQQLREVLR QRQEGEAAAL NTVQKLQDER RLLQERLGSL QRALAQLEAE 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
KREVERSALR LEKDRVALRR TLDKVEREKL RSHEDTVRLS AEKGRLDRTL TGAELELAEA 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
QRQIQQLEAQ VVVLEQSHSP AQLEVDAQQQ QLELQQEVER LRSAQAQTER TLEARERAHR 
      1990       2000       2010    
QRVRGLEEQV STLKGQLQQE LRRSSAPFSP PSGPPEK



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

3 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q5TZA2-1-unknown MSLGLA... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q5TZA2-579- GAMQAH... 579 Subtiligase Based Positive Selection Wells apoptotic_DB_Doxo 23264352
    Q5TZA2-698-unknown MLQAEK... 698 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt71779

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...GPPEK 2017 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...GPPEK 2017 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt67397

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)