TopFIND 4.0

Q5VXU9: Protein shortage in chiasmata 1 ortholog {ECO:0000305}

General Information

Protein names
- Protein shortage in chiasmata 1 ortholog {ECO:0000305}
- 3.6.-.- {ECO:0000269|PubMed:29742103}
Gene names C9orf84
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q5VXU9

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MTDTSVLDQW KASFFVEDFL EKKTITRMVT QINCEFEEVV PSSNPDSQIE VEEVSLYTHM 
        70         80         90        100        110        120 
DYNEVFTPVS CLEKCSALQN QNQDLFIDDK GILFVSSRKH LPTLPTLLSR LKLFLVKDPL 
       130        140        150        160        170        180 
LDFKGQIFTE ANFSRECFSL QETLEAFVKE DFCMDKVNFC QEKLEDTICL NEPSSFLIEY 
       190        200        210        220        230        240 
EFLIPPSLKP EIDIPSLSEL KELLNPVPEI INYVDEKEKL FERDLTNKHG IEDIGDIKFS 
       250        260        270        280        290        300 
STEILTIQSQ SEPEECSKPG ELEMPLTPLF LTCQHSSVNS LRTELQTFPL SPVCKINLLT 
       310        320        330        340        350        360 
AEESANEYYM MWQLERCRSP LNPFLLTVPR IQEPHSQYSV TDLKKIFSVK EESLVINLEK 
       370        380        390        400        410        420 
AEWWKQAGLN LKMMETLEHL NTYLCHDNLS SNDTKIEIFL PTKVLQLESC LEHKSHSSPI 
       430        440        450        460        470        480 
ALIDEKSTNA HLSLPQKSPS LAKEVPDLCF SDDYFSDKGA AKEEKPKNDQ EPVNRIIQKK 
       490        500        510        520        530        540 
ENNDHFELDC TGPSIKSPSS SIIKKASFEH GKKQENDLDL LSDFIMLRNK YKTCTSKTEV 
       550        560        570        580        590        600 
TNSDEKHDKE ACSLTLQEES PIVHINKTLE EINQERGTDS VIEIQASDSQ CQAFCLLEAA 
       610        620        630        640        650        660 
ASPILKNLVS LCTLPTANWK FATVIFDQTR FLLKEQEKVV SDAVRQGTID EREMTFKHAA 
       670        680        690        700        710        720 
LLHLLVTIRD VLLTCSLDTA LGYLSKAKDI YNSILGPYLG DIWRQLEIVQ FIRGKKPETN 
       730        740        750        760        770        780 
YKIQELQCQI LSWMQSQQQI KVLIIIRMDS DGEKHFLIKI LNKIEGLTLT VLHSNERKDF 
       790        800        810        820        830        840 
LESEGVLRGT SSCVVVHNQY IGADFPWSNF SFVVEYNYVE DSCWTKHCKE LNIPYMAFKV 
       850        860        870        880        890        900 
ILPDTVLERS TLLDRFGGFL LEIQIPYVFF ASEGLLNTPD ILQLLESNYN ISLVERGCSE 
       910        920        930        940        950        960 
SLKLFGSSEC YVVVTIDEHT AIILQDLEEL NYEKASDNII MRLMALSLQY RYCWIILYTK 
       970        980        990       1000       1010       1020 
ETLNSEYLLT EKTLHHLALI YAALVSFGLN SEELDVKLII APGVEATALI IRQIADHSLM 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
TSKRDPHEWL DKSWLKVSPS EEEMYLLDFP CINPLVAQLM LNKGPSLHWI LLATLCQLQE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
LLPEVPEKVL KHFCSITSLF KIGSSSITKS PQISSPQENR NQISTLSSQS SASDLDSVIQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
EHNEYYQYLG LGETVQEDKT TILNDNSSIM ELKEISSFLP PVTSYNQTSY WKDSSCKSNI 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GQNTPFLINI ESRRPAYNSF LNHSDSESDV FSLGLTQMNC ETIKSPTDTQ KRVSVVPRFI 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
NSQKRRTHEA KGFINKDVSD PIFSLEGTQS PLHWNFKKNI WEQENHPFNL QYGAQQTACN 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
KLYSQKGNLF TDQQKCLSDE SEGLTCESSK DETFWRELPS VPSLDLFRAS DSNANQKEFN 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SLYFYQRAGK SLGQKRHHES SFNSGDKESL TGFMCSQLPQ FKKRRLAYEK VPGRVDGQTR 
   
LRFF

Isoforms

- Isoform 2 of Uncharacterized protein C9orf84 - Isoform 3 of Uncharacterized protein C9orf84 - Isoform 2 of Protein shortage in chiasmata 1 ortholog - Isoform 3 of Protein shortage in chiasmata 1 ortholog

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MTDTSVLDQW KASFFVEDFL EKKTITRMVT QINCEFEEVV PSSNPDSQIE VEEVSLYTHM 
        70         80         90        100        110        120 
DYNEVFTPVS CLEKCSALQN QNQDLFIDDK GILFVSSRKH LPTLPTLLSR LKLFLVKDPL 
       130        140        150        160        170        180 
LDFKGQIFTE ANFSRECFSL QETLEAFVKE DFCMDKVNFC QEKLEDTICL NEPSSFLIEY 
       190        200        210        220        230        240 
EFLIPPSLKP EIDIPSLSEL KELLNPVPEI INYVDEKEKL FERDLTNKHG IEDIGDIKFS 
       250        260        270        280        290        300 
STEILTIQSQ SEPEECSKPG ELEMPLTPLF LTCQHSSVNS LRTELQTFPL SPVCKINLLT 
       310        320        330        340        350        360 
AEESANEYYM MWQLERCRSP LNPFLLTVPR IQEPHSQYSV TDLKKIFSVK EESLVINLEK 
       370        380        390        400        410        420 
AEWWKQAGLN LKMMETLEHL NTYLCHDNLS SNDTKIEIFL PTKVLQLESC LEHKSHSSPI 
       430        440        450        460        470        480 
ALIDEKSTNA HLSLPQKSPS LAKEVPDLCF SDDYFSDKGA AKEEKPKNDQ EPVNRIIQKK 
       490        500        510        520        530        540 
ENNDHFELDC TGPSIKSPSS SIIKKASFEH GKKQENDLDL LSDFIMLRNK YKTCTSKTEV 
       550        560        570        580        590        600 
TNSDEKHDKE ACSLTLQEES PIVHINKTLE EINQERGTDS VIEIQASDSQ CQAFCLLEAA 
       610        620        630        640        650        660 
ASPILKNLVS LCTLPTANWK FATVIFDQTR FLLKEQEKVV SDAVRQGTID EREMTFKHAA 
       670        680        690        700        710        720 
LLHLLVTIRD VLLTCSLDTA LGYLSKAKDI YNSILGPYLG DIWRQLEIVQ FIRGKKPETN 
       730        740        750        760        770        780 
YKIQELQCQI LSWMQSQQQI KVLIIIRMDS DGEKHFLIKI LNKIEGLTLT VLHSNERKDF 
       790        800        810        820        830        840 
LESEGVLRGT SSCVVVHNQY IGADFPWSNF SFVVEYNYVE DSCWTKHCKE LNIPYMAFKV 
       850        860        870        880        890        900 
ILPDTVLERS TLLDRFGGFL LEIQIPYVFF ASEGLLNTPD ILQLLESNYN ISLVERGCSE 
       910        920        930        940        950        960 
SLKLFGSSEC YVVVTIDEHT AIILQDLEEL NYEKASDNII MRLMALSLQY RYCWIILYTK 
       970        980        990       1000       1010       1020 
ETLNSEYLLT EKTLHHLALI YAALVSFGLN SEELDVKLII APGVEATALI IRQIADHSLM 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
TSKRDPHEWL DKSWLKVSPS EEEMYLLDFP CINPLVAQLM LNKGPSLHWI LLATLCQLQE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
LLPEVPEKVL KHFCSITSLF KIGSSSITKS PQISSPQENR NQISTLSSQS SASDLDSVIQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
EHNEYYQYLG LGETVQEDKT TILNDNSSIM ELKEISSFLP PVTSYNQTSY WKDSSCKSNI 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GQNTPFLINI ESRRPAYNSF LNHSDSESDV FSLGLTQMNC ETIKSPTDTQ KRVSVVPRFI 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
NSQKRRTHEA KGFINKDVSD PIFSLEGTQS PLHWNFKKNI WEQENHPFNL QYGAQQTACN 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
KLYSQKGNLF TDQQKCLSDE SEGLTCESSK DETFWRELPS VPSLDLFRAS DSNANQKEFN 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SLYFYQRAGK SLGQKRHHES SFNSGDKESL TGFMCSQLPQ FKKRRLAYEK VPGRVDGQTR 
   
LRFF         10         20         30         40         50         60 
MTDTSVLDQW KASFFVEDFL EKKTITRMVT QINCEFEEVV PSSNPDSQIE VEEVSLYTHM 
        70         80         90        100        110        120 
DYNEVFTPVS CLEKCSALQN QNQDLFIDDK GILFVSSRKH LPTLPTLLSR LKLFLVKDPL 
       130        140        150        160        170        180 
LDFKGQIFTE ANFSRECFSL QETLEAFVKE DFCMDKVNFC QEKLEDTICL NEPSSFLIEY 
       190        200        210        220        230        240 
EFLIPPSLKP EIDIPSLSEL KELLNPVPEI INYVDEKEKL FERDLTNKHG IEDIGDIKFS 
       250        260        270        280        290        300 
STEILTIQSQ SEPEECSKPG ELEMPLTPLF LTCQHSSVNS LRTELQTFPL SPVCKINLLT 
       310        320        330        340        350        360 
AEESANEYYM MWQLERCRSP LNPFLLTVPR IQEPHSQYSV TDLKKIFSVK EESLVINLEK 
       370        380        390        400        410        420 
AEWWKQAGLN LKMMETLEHL NTYLCHDNLS SNDTKIEIFL PTKVLQLESC LEHKSHSSPI 
       430        440        450        460        470        480 
ALIDEKSTNA HLSLPQKSPS LAKEVPDLCF SDDYFSDKGA AKEEKPKNDQ EPVNRIIQKK 
       490        500        510        520        530        540 
ENNDHFELDC TGPSIKSPSS SIIKKASFEH GKKQENDLDL LSDFIMLRNK YKTCTSKTEV 
       550        560        570        580        590        600 
TNSDEKHDKE ACSLTLQEES PIVHINKTLE EINQERGTDS VIEIQASDSQ CQAFCLLEAA 
       610        620        630        640        650        660 
ASPILKNLVS LCTLPTANWK FATVIFDQTR FLLKEQEKVV SDAVRQGTID EREMTFKHAA 
       670        680        690        700        710        720 
LLHLLVTIRD VLLTCSLDTA LGYLSKAKDI YNSILGPYLG DIWRQLEIVQ FIRGKKPETN 
       730        740        750        760        770        780 
YKIQELQCQI LSWMQSQQQI KVLIIIRMDS DGEKHFLIKI LNKIEGLTLT VLHSNERKDF 
       790        800        810        820        830        840 
LESEGVLRGT SSCVVVHNQY IGADFPWSNF SFVVEYNYVE DSCWTKHCKE LNIPYMAFKV 
       850        860        870        880        890        900 
ILPDTVLERS TLLDRFGGFL LEIQIPYVFF ASEGLLNTPD ILQLLESNYN ISLVERGCSE 
       910        920        930        940        950        960 
SLKLFGSSEC YVVVTIDEHT AIILQDLEEL NYEKASDNII MRLMALSLQY RYCWIILYTK 
       970        980        990       1000       1010       1020 
ETLNSEYLLT EKTLHHLALI YAALVSFGLN SEELDVKLII APGVEATALI IRQIADHSLM 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
TSKRDPHEWL DKSWLKVSPS EEEMYLLDFP CINPLVAQLM LNKGPSLHWI LLATLCQLQE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
LLPEVPEKVL KHFCSITSLF KIGSSSITKS PQISSPQENR NQISTLSSQS SASDLDSVIQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
EHNEYYQYLG LGETVQEDKT TILNDNSSIM ELKEISSFLP PVTSYNQTSY WKDSSCKSNI 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GQNTPFLINI ESRRPAYNSF LNHSDSESDV FSLGLTQMNC ETIKSPTDTQ KRVSVVPRFI 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
NSQKRRTHEA KGFINKDVSD PIFSLEGTQS PLHWNFKKNI WEQENHPFNL QYGAQQTACN 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
KLYSQKGNLF TDQQKCLSDE SEGLTCESSK DETFWRELPS VPSLDLFRAS DSNANQKEFN 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SLYFYQRAGK SLGQKRHHES SFNSGDKESL TGFMCSQLPQ FKKRRLAYEK VPGRVDGQTR 
   
LRFF         10         20         30         40         50         60 
MTDTSVLDQW KASFFVEDFL EKKTITRMVT QINCEFEEVV PSSNPDSQIE VEEVSLYTHM 
        70         80         90        100        110        120 
DYNEVFTPVS CLEKCSALQN QNQDLFIDDK GILFVSSRKH LPTLPTLLSR LKLFLVKDPL 
       130        140        150        160        170        180 
LDFKGQIFTE ANFSRECFSL QETLEAFVKE DFCMDKVNFC QEKLEDTICL NEPSSFLIEY 
       190        200        210        220        230        240 
EFLIPPSLKP EIDIPSLSEL KELLNPVPEI INYVDEKEKL FERDLTNKHG IEDIGDIKFS 
       250        260        270        280        290        300 
STEILTIQSQ SEPEECSKPG ELEMPLTPLF LTCQHSSVNS LRTELQTFPL SPVCKINLLT 
       310        320        330        340        350        360 
AEESANEYYM MWQLERCRSP LNPFLLTVPR IQEPHSQYSV TDLKKIFSVK EESLVINLEK 
       370        380        390        400        410        420 
AEWWKQAGLN LKMMETLEHL NTYLCHDNLS SNDTKIEIFL PTKVLQLESC LEHKSHSSPI 
       430        440        450        460        470        480 
ALIDEKSTNA HLSLPQKSPS LAKEVPDLCF SDDYFSDKGA AKEEKPKNDQ EPVNRIIQKK 
       490        500        510        520        530        540 
ENNDHFELDC TGPSIKSPSS SIIKKASFEH GKKQENDLDL LSDFIMLRNK YKTCTSKTEV 
       550        560        570        580        590        600 
TNSDEKHDKE ACSLTLQEES PIVHINKTLE EINQERGTDS VIEIQASDSQ CQAFCLLEAA 
       610        620        630        640        650        660 
ASPILKNLVS LCTLPTANWK FATVIFDQTR FLLKEQEKVV SDAVRQGTID EREMTFKHAA 
       670        680        690        700        710        720 
LLHLLVTIRD VLLTCSLDTA LGYLSKAKDI YNSILGPYLG DIWRQLEIVQ FIRGKKPETN 
       730        740        750        760        770        780 
YKIQELQCQI LSWMQSQQQI KVLIIIRMDS DGEKHFLIKI LNKIEGLTLT VLHSNERKDF 
       790        800        810        820        830        840 
LESEGVLRGT SSCVVVHNQY IGADFPWSNF SFVVEYNYVE DSCWTKHCKE LNIPYMAFKV 
       850        860        870        880        890        900 
ILPDTVLERS TLLDRFGGFL LEIQIPYVFF ASEGLLNTPD ILQLLESNYN ISLVERGCSE 
       910        920        930        940        950        960 
SLKLFGSSEC YVVVTIDEHT AIILQDLEEL NYEKASDNII MRLMALSLQY RYCWIILYTK 
       970        980        990       1000       1010       1020 
ETLNSEYLLT EKTLHHLALI YAALVSFGLN SEELDVKLII APGVEATALI IRQIADHSLM 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
TSKRDPHEWL DKSWLKVSPS EEEMYLLDFP CINPLVAQLM LNKGPSLHWI LLATLCQLQE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
LLPEVPEKVL KHFCSITSLF KIGSSSITKS PQISSPQENR NQISTLSSQS SASDLDSVIQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
EHNEYYQYLG LGETVQEDKT TILNDNSSIM ELKEISSFLP PVTSYNQTSY WKDSSCKSNI 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GQNTPFLINI ESRRPAYNSF LNHSDSESDV FSLGLTQMNC ETIKSPTDTQ KRVSVVPRFI 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
NSQKRRTHEA KGFINKDVSD PIFSLEGTQS PLHWNFKKNI WEQENHPFNL QYGAQQTACN 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
KLYSQKGNLF TDQQKCLSDE SEGLTCESSK DETFWRELPS VPSLDLFRAS DSNANQKEFN 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SLYFYQRAGK SLGQKRHHES SFNSGDKESL TGFMCSQLPQ FKKRRLAYEK VPGRVDGQTR 
   
LRFF         10         20         30         40         50         60 
MTDTSVLDQW KASFFVEDFL EKKTITRMVT QINCEFEEVV PSSNPDSQIE VEEVSLYTHM 
        70         80         90        100        110        120 
DYNEVFTPVS CLEKCSALQN QNQDLFIDDK GILFVSSRKH LPTLPTLLSR LKLFLVKDPL 
       130        140        150        160        170        180 
LDFKGQIFTE ANFSRECFSL QETLEAFVKE DFCMDKVNFC QEKLEDTICL NEPSSFLIEY 
       190        200        210        220        230        240 
EFLIPPSLKP EIDIPSLSEL KELLNPVPEI INYVDEKEKL FERDLTNKHG IEDIGDIKFS 
       250        260        270        280        290        300 
STEILTIQSQ SEPEECSKPG ELEMPLTPLF LTCQHSSVNS LRTELQTFPL SPVCKINLLT 
       310        320        330        340        350        360 
AEESANEYYM MWQLERCRSP LNPFLLTVPR IQEPHSQYSV TDLKKIFSVK EESLVINLEK 
       370        380        390        400        410        420 
AEWWKQAGLN LKMMETLEHL NTYLCHDNLS SNDTKIEIFL PTKVLQLESC LEHKSHSSPI 
       430        440        450        460        470        480 
ALIDEKSTNA HLSLPQKSPS LAKEVPDLCF SDDYFSDKGA AKEEKPKNDQ EPVNRIIQKK 
       490        500        510        520        530        540 
ENNDHFELDC TGPSIKSPSS SIIKKASFEH GKKQENDLDL LSDFIMLRNK YKTCTSKTEV 
       550        560        570        580        590        600 
TNSDEKHDKE ACSLTLQEES PIVHINKTLE EINQERGTDS VIEIQASDSQ CQAFCLLEAA 
       610        620        630        640        650        660 
ASPILKNLVS LCTLPTANWK FATVIFDQTR FLLKEQEKVV SDAVRQGTID EREMTFKHAA 
       670        680        690        700        710        720 
LLHLLVTIRD VLLTCSLDTA LGYLSKAKDI YNSILGPYLG DIWRQLEIVQ FIRGKKPETN 
       730        740        750        760        770        780 
YKIQELQCQI LSWMQSQQQI KVLIIIRMDS DGEKHFLIKI LNKIEGLTLT VLHSNERKDF 
       790        800        810        820        830        840 
LESEGVLRGT SSCVVVHNQY IGADFPWSNF SFVVEYNYVE DSCWTKHCKE LNIPYMAFKV 
       850        860        870        880        890        900 
ILPDTVLERS TLLDRFGGFL LEIQIPYVFF ASEGLLNTPD ILQLLESNYN ISLVERGCSE 
       910        920        930        940        950        960 
SLKLFGSSEC YVVVTIDEHT AIILQDLEEL NYEKASDNII MRLMALSLQY RYCWIILYTK 
       970        980        990       1000       1010       1020 
ETLNSEYLLT EKTLHHLALI YAALVSFGLN SEELDVKLII APGVEATALI IRQIADHSLM 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
TSKRDPHEWL DKSWLKVSPS EEEMYLLDFP CINPLVAQLM LNKGPSLHWI LLATLCQLQE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
LLPEVPEKVL KHFCSITSLF KIGSSSITKS PQISSPQENR NQISTLSSQS SASDLDSVIQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
EHNEYYQYLG LGETVQEDKT TILNDNSSIM ELKEISSFLP PVTSYNQTSY WKDSSCKSNI 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GQNTPFLINI ESRRPAYNSF LNHSDSESDV FSLGLTQMNC ETIKSPTDTQ KRVSVVPRFI 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
NSQKRRTHEA KGFINKDVSD PIFSLEGTQS PLHWNFKKNI WEQENHPFNL QYGAQQTACN 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
KLYSQKGNLF TDQQKCLSDE SEGLTCESSK DETFWRELPS VPSLDLFRAS DSNANQKEFN 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SLYFYQRAGK SLGQKRHHES SFNSGDKESL TGFMCSQLPQ FKKRRLAYEK VPGRVDGQTR 
   
LRFF



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q5VXU9-1-unknown MTDTSV... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q5VXU9-1-unknown MTDTSV... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt102051

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...RLRFF 1444 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...RLRFF 1444 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt66244

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)