TopFIND 4.0

Q60974: Nuclear receptor corepressor 1

General Information

Protein names
- Nuclear receptor corepressor 1
- N-CoR
- N-CoR1
- Retinoid X receptor-interacting protein 13
- RIP13
Gene names Ncor1
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q60974

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MSSSGYPPNQ GAFSTEQSRY PSHSVQYTFP SARHQQEFAV PDYRSSHLEV SQASQLLQQQ 
        70         80         90        100        110        120 
QQQQLRRRPS LLSEFHPGSD RPQERRSGYE QFHPGPSPVD HDSLESKRPR LEQVSDSHFQ 
       130        140        150        160        170        180 
RISAAVLPLV HTLPEGLRSS ANAKKDPAFG VKHEAPSSPL SGQPCGDDQN ASPSKLSKEE 
       190        200        210        220        230        240 
LIQSMDRVDR EIAKVEQQIL KLKKKQQQLE EEAAKPPEPE KPVSPPPVEQ KHRSIVQIIY 
       250        260        270        280        290        300 
DENRKKAEEA HKIFEGLGPK VELPLYNQPS DTKVYHENIK TNQVMRKKLI LFFKRRNHAR 
       310        320        330        340        350        360 
KQREQKICQR YDQLMEAWEK KVDRIENNPR RKAKESKTRE YYEKQFPEIR KQREQQERFQ 
       370        380        390        400        410        420 
RVGQRGAGLS ATIARSEHEI SEIIDGLSEQ ENNEKQMRQL SVIPPMMFDA EQRRVKFINM 
       430        440        450        460        470        480 
NGLMEDPMKV YKDRQFMNVW TDHEKEIFKD KFIQHPKNFG LIASYLERKS VPDCVLYYYL 
       490        500        510        520        530        540 
TKKNENYKAL VRRNYGKRRG RNQQIARPSQ EEKVEEKEED KAEKTEKKEE EKKDDEEKDD 
       550        560        570        580        590        600 
KEDSKETTKE KDRTEATAEE PEEREQVTPR GRKTANSQGR GKGRVTRSMT SEAAAANAAA 
       610        620        630        640        650        660 
AATEEPPPPL PPPPEPISTE PVETSRWTEE EMEVAKKGLV EHGRNWAAIA KMVGTKSEAQ 
       670        680        690        700        710        720 
CKNFYFNYKR RHNLDNLLQQ HKQKASRKPR EERDVSQCES VASTVSAQED EDIEASNEEE 
       730        740        750        760        770        780 
NPEDSEGAEN SSDTESAPSP SPVEAAKSSE DSSENAASRG NTEPVAELEA TTDPAPCASP 
       790        800        810        820        830        840 
SSAVPTTKPA ERESVEAQVT DSASAETAEP MDVDHEECGA EGSSVLDPPA PTKADSVDPE 
       850        860        870        880        890        900 
MQVPENTASK GEGDAKERDL ESTSEKTEAR DEDVVVAEQI ERPEPQSDDD SSATCSADEG 
       910        920        930        940        950        960 
VDGEPERQRV FPMDAKPSLL TPPGSILISS PIKPNLLDLP QLQHRAAVIP PMVSCTPCNI 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PIGTPVSGYA LYQRHIKAMH ESALLEEQRQ RQEQVDLECR SSTSPCSTSK SPNREWEVLQ 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
PAPHQVITNL PEGVRLPTTR PTRPPPPLIP SSKTTVASEK PSFIMGGSIS QGTPGTYLSS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
HNQAYPQEAP KPSVGSISLG LPRQQESTKA APLTYIKQEE FSPRSQNSQP EGLLVRAQHE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
GVVRGTAGAV QEGSITRGTP ASKISVETIS SLRGSITQGT PALPQAGIPT EALVKGPVSR 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
MPIEESSPEK VREEAASKGH VIYEGKSGHI LSYDNIKNAR EGTRSPRTAH EMSLKRSYEA 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
VEGSIKQGMS MRESPVSAPL EGLICRALPR GSPHSDLKER TVLSGSIMQG TPRATAESFE 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
DGLKYPKQIK RESPPIRAFE GAITKGKPYD GITTIKEMGR SIHEIPRQDI LTQESRKTPE 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
VVQSTRPIIE GSISQGTPIK FDNNSGQSAI KHNVKSLITG PSKLPRGMLE IVPENIKVVE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
RGKYEDVKAG EPVRARHTSV VSSGPSVLRS TLHEAPKAQL SPGLYDDSSA RRTPVSYQNT 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
ISRGSPMMNR TSDVSSSKSA SHERKSTLTP TQRESIPAKS PVPGVDPIVS HSPFDPHHRS 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
SAAGEVYRSH LPTHLDPAMP FHRALDPAAA YLLQRQLSPT PGYPSQYQLY AMENTRQTIL 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
NDYITSQQMQ VNLRPDVTRG LSPREQPLGL PYPATRGIID LTNMPPTILV PHAGGTSTPP 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
MDRITYIPGT QVTFPPRPYN AASLSPGHPT HLAAAASAER EREREREKER ERERERERER 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
ERERIAAAPA DLYLRPGSEQ PGRPGSHGYV RSPSPSVRTQ ETILQQRPSV FQGTNGTSVI 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
TPLDPTAQLR IMPLPSGGPS ISQGLPASRY NTAADALAAL VDAAASAPQM DVSKTKESKH 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
EAARLEENLR SRSAAVSEQQ QLEQKNLEVE KRSVQCVCTS SALPSGKAQP HASVVYSEAG 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
KDKGPPPKSR YEEELRTRGK TTITAANFID VIITRQIASD KDARERGSQS SDSSSSLSSH 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
RYETASDAIE VISPASSPAP PQEKPQAYQP DMVKANQAEN ESTRQYEGPL HHYRSQQESP 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
SPQQQPPLPP SSQSEGMGQV PRTHRLITLA DHICQIITQD FARNQVPSQA STSTFQTSPS 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
ALSSTPVRTK TSSRYSPESQ SQTVLHPRPG PRVSPENLVD KSRGSRPGKS PERSHIPSEP 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
YEPISPPQGP AVHEKQDSML LLSQRGVDPA EQRSDSRSPG SISYLPSFFT KLESTSPMVK 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
SKKQEIFRKL NSSGGGDSDM AAAQPGTEIF NLPAVTTSGA VSSRSHSFAD PASNLGLEDI 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
IRKALMGSFD DKVEDHGVVM SHPVGIMPGS ASTSVVTSSE ARRDEGEPSP HAGVCKPKLI 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
NKSNSRKSKS PIPGQSYLGT ERPSSVSSVH SEGDYHRQTP GWAWEDRPSS TGSTQFPYNP 
      2410       2420       2430       2440       2450    
LTIRMLSSTP PTQIACAPSA ITQAAPHQQN RIWEREPAPL LSAQYETLSD SDD

Isoforms

- Isoform 2 of Nuclear receptor corepressor 1

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MSSSGYPPNQ GAFSTEQSRY PSHSVQYTFP SARHQQEFAV PDYRSSHLEV SQASQLLQQQ 
        70         80         90        100        110        120 
QQQQLRRRPS LLSEFHPGSD RPQERRSGYE QFHPGPSPVD HDSLESKRPR LEQVSDSHFQ 
       130        140        150        160        170        180 
RISAAVLPLV HTLPEGLRSS ANAKKDPAFG VKHEAPSSPL SGQPCGDDQN ASPSKLSKEE 
       190        200        210        220        230        240 
LIQSMDRVDR EIAKVEQQIL KLKKKQQQLE EEAAKPPEPE KPVSPPPVEQ KHRSIVQIIY 
       250        260        270        280        290        300 
DENRKKAEEA HKIFEGLGPK VELPLYNQPS DTKVYHENIK TNQVMRKKLI LFFKRRNHAR 
       310        320        330        340        350        360 
KQREQKICQR YDQLMEAWEK KVDRIENNPR RKAKESKTRE YYEKQFPEIR KQREQQERFQ 
       370        380        390        400        410        420 
RVGQRGAGLS ATIARSEHEI SEIIDGLSEQ ENNEKQMRQL SVIPPMMFDA EQRRVKFINM 
       430        440        450        460        470        480 
NGLMEDPMKV YKDRQFMNVW TDHEKEIFKD KFIQHPKNFG LIASYLERKS VPDCVLYYYL 
       490        500        510        520        530        540 
TKKNENYKAL VRRNYGKRRG RNQQIARPSQ EEKVEEKEED KAEKTEKKEE EKKDDEEKDD 
       550        560        570        580        590        600 
KEDSKETTKE KDRTEATAEE PEEREQVTPR GRKTANSQGR GKGRVTRSMT SEAAAANAAA 
       610        620        630        640        650        660 
AATEEPPPPL PPPPEPISTE PVETSRWTEE EMEVAKKGLV EHGRNWAAIA KMVGTKSEAQ 
       670        680        690        700        710        720 
CKNFYFNYKR RHNLDNLLQQ HKQKASRKPR EERDVSQCES VASTVSAQED EDIEASNEEE 
       730        740        750        760        770        780 
NPEDSEGAEN SSDTESAPSP SPVEAAKSSE DSSENAASRG NTEPVAELEA TTDPAPCASP 
       790        800        810        820        830        840 
SSAVPTTKPA ERESVEAQVT DSASAETAEP MDVDHEECGA EGSSVLDPPA PTKADSVDPE 
       850        860        870        880        890        900 
MQVPENTASK GEGDAKERDL ESTSEKTEAR DEDVVVAEQI ERPEPQSDDD SSATCSADEG 
       910        920        930        940        950        960 
VDGEPERQRV FPMDAKPSLL TPPGSILISS PIKPNLLDLP QLQHRAAVIP PMVSCTPCNI 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PIGTPVSGYA LYQRHIKAMH ESALLEEQRQ RQEQVDLECR SSTSPCSTSK SPNREWEVLQ 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
PAPHQVITNL PEGVRLPTTR PTRPPPPLIP SSKTTVASEK PSFIMGGSIS QGTPGTYLSS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
HNQAYPQEAP KPSVGSISLG LPRQQESTKA APLTYIKQEE FSPRSQNSQP EGLLVRAQHE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
GVVRGTAGAV QEGSITRGTP ASKISVETIS SLRGSITQGT PALPQAGIPT EALVKGPVSR 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
MPIEESSPEK VREEAASKGH VIYEGKSGHI LSYDNIKNAR EGTRSPRTAH EMSLKRSYEA 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
VEGSIKQGMS MRESPVSAPL EGLICRALPR GSPHSDLKER TVLSGSIMQG TPRATAESFE 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
DGLKYPKQIK RESPPIRAFE GAITKGKPYD GITTIKEMGR SIHEIPRQDI LTQESRKTPE 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
VVQSTRPIIE GSISQGTPIK FDNNSGQSAI KHNVKSLITG PSKLPRGMLE IVPENIKVVE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
RGKYEDVKAG EPVRARHTSV VSSGPSVLRS TLHEAPKAQL SPGLYDDSSA RRTPVSYQNT 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
ISRGSPMMNR TSDVSSSKSA SHERKSTLTP TQRESIPAKS PVPGVDPIVS HSPFDPHHRS 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
SAAGEVYRSH LPTHLDPAMP FHRALDPAAA YLLQRQLSPT PGYPSQYQLY AMENTRQTIL 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
NDYITSQQMQ VNLRPDVTRG LSPREQPLGL PYPATRGIID LTNMPPTILV PHAGGTSTPP 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
MDRITYIPGT QVTFPPRPYN AASLSPGHPT HLAAAASAER EREREREKER ERERERERER 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
ERERIAAAPA DLYLRPGSEQ PGRPGSHGYV RSPSPSVRTQ ETILQQRPSV FQGTNGTSVI 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
TPLDPTAQLR IMPLPSGGPS ISQGLPASRY NTAADALAAL VDAAASAPQM DVSKTKESKH 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
EAARLEENLR SRSAAVSEQQ QLEQKNLEVE KRSVQCVCTS SALPSGKAQP HASVVYSEAG 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
KDKGPPPKSR YEEELRTRGK TTITAANFID VIITRQIASD KDARERGSQS SDSSSSLSSH 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
RYETASDAIE VISPASSPAP PQEKPQAYQP DMVKANQAEN ESTRQYEGPL HHYRSQQESP 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
SPQQQPPLPP SSQSEGMGQV PRTHRLITLA DHICQIITQD FARNQVPSQA STSTFQTSPS 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
ALSSTPVRTK TSSRYSPESQ SQTVLHPRPG PRVSPENLVD KSRGSRPGKS PERSHIPSEP 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
YEPISPPQGP AVHEKQDSML LLSQRGVDPA EQRSDSRSPG SISYLPSFFT KLESTSPMVK 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
SKKQEIFRKL NSSGGGDSDM AAAQPGTEIF NLPAVTTSGA VSSRSHSFAD PASNLGLEDI 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
IRKALMGSFD DKVEDHGVVM SHPVGIMPGS ASTSVVTSSE ARRDEGEPSP HAGVCKPKLI 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
NKSNSRKSKS PIPGQSYLGT ERPSSVSSVH SEGDYHRQTP GWAWEDRPSS TGSTQFPYNP 
      2410       2420       2430       2440       2450    
LTIRMLSSTP PTQIACAPSA ITQAAPHQQN RIWEREPAPL LSAQYETLSD SDD



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q60974-1-unknown MSSSGY... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q60974-1-unknown MSSSGY... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt82434

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...SDSDD 2453 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...SDSDD 2453 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt78052

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)