TopFIND 4.0

Q61245: Collagen alpha-1(XI) chain

General Information

Protein names
- Collagen alpha-1(XI) chain
Gene names Col11a1
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q61245

3

N-termini

2

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MEPWSRWKTK RWIWDLTIST LALTFLFQAR EVRGAAPVDI LKALDFHNSP VGISKTTGFC 
        70         80         90        100        110        120 
TNRKNSKDPD VAYRVTEEAQ ISAPTKQLFP GGIFPQDFSI LFTIKPKKGT QAFLLSLYNE 
       130        140        150        160        170        180 
HGIQQLGVEV GRSPVFLFED HTGKPTPENY PLFSTVNIAD GKWHRVAISV EKKTVTMIVD 
       190        200        210        220        230        240 
CKKKITKPLD RSERSIVDTN GIMVFGTRIL ETDVFQGDIQ QFLITGDPKA AYDYCDHYSP 
       250        260        270        280        290        300 
DCDLTSKAAQ AQEPHIDEYA PEDIIEYDYE YGETDYKEAE SVTEMPTFTE ETVAQTEANI 
       310        320        330        340        350        360 
VDDFQDYNYG TMEPYQTETP RRVSGSNEPN PVEEGFTEEY LTGEDYDVQR NTSEDILYGN 
       370        380        390        400        410        420 
KGVDGRDSDL LVDGDLGEYD FYEYKEYEER TTTSPNEEFG PGVPAETDFT ETSINGHGAY 
       430        440        450        460        470        480 
GEKGQKGEPA VVEPGMLVEG PPGPAGPAGL MGPPGLQGPS GLPGDPGDRG PPGRPGLPGA 
       490        500        510        520        530        540 
DGLPGPPGTM LMLPFRYGGD GSKGPTISAQ EAQAQAILQQ ARIALRGPPG PMGLTGRPGP 
       550        560        570        580        590        600 
VGGPGSAGAK GESGDPGPQG PRGVQGPPGP TGKPGKRGRP GADGGRGMPG ESGSKGDRGF 
       610        620        630        640        650        660 
DGLPGLPGDK GHRGERGPQG PPGLPGDDGM RGEDGEIGPR GLPGEAGPRG LLGPRGTPGP 
       670        680        690        700        710        720 
PGQPGIGGID GPQGPKGNMG PQGEPGPPGQ QGNPGPQGLP GPQGPIGPPG EKGPQGKPGL 
       730        740        750        760        770        780 
AGLPGADGPP GHPGKEGQSG EKGALGPPGP QGPIGYPGPR GVKGADGVRG LKGSKGEKGE 
       790        800        810        820        830        840 
DGFPGFKGDM GLKGDRGEVG QVGPRGEDGP EGPKGRAGPT GDPGPSGQAG EKGKLGVPGL 
       850        860        870        880        890        900 
PGYPGRQGPK GSTGFPGFPG ANGEKGARGI AGKPGPRGQR GPTGPRGSRG ARGPTGKPGP 
       910        920        930        940        950        960 
KGTSGGDGPP GPPGERGPQG PQGPVGFPGP KGPPGPAGKD GLPGHPGQRG ETGFQGKTGP 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PGPGGVVGPQ GPTGETGPIG ERGHPGPPGP PGEQGLPGAA GKEGAKGDPG PQGISGKDGP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
AGIRGFPGER GLPGAQGAPG LKGGEGPQGP QGPVGSPGER GSAGTAGPIG LPGRPGPQGP 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
PGPAGEKGAP GEKGPQGPAG RDGVQGPVGL PGPAGPAGSP GEDGDKGEIG EPGQKGSKGD 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
KGENGPPGPP GLQGPVGAPG IAGGDGEPGP RGQQGMFGQK GDEGARGFPG LPGPIGLQGL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PGPPGEKGEN GDVGPMGPPG PPGPRGPQGP NGADGPQGPP GSIGSVGVVG DKGEPGEAGN 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
PGPPGEAGSG GLKGERGEKG EAGPPGAAGP AGIKGPPGDD GPKGNPGPVG FPGDPGPPGE 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PGPAGQDGVG GDKGEDGDPG QPGPPGPSGE AGPPGPPGKR GPPGASGSEG RQGEKGAKGE 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
AGAEGPPGKT GPVGPQGPSG KPGPEGLRGI PGPVGEQGLP GAAGQDGPPG PLGPPGLPGL 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
KGDPGSKGEK GHPGLIGLIG PPGEQGEKGD RGLPGTQGSP GAKGDGGIPG PAGPIGPPGP 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
PGLPGPAGPK GNKGSSGPTG QKGDSGMPGP PGPPGPPGEV IQPLPILSPK KTRRHTESIQ 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
GDAGDNILDY SDGMEEIFGS LNSLKQDIEH MKFPMGTQTN PARTCKDLQL SHPDFPDGEY 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
WIDPNQGCSG DSFKVYCNFT AGGETCIYPD KKSEGVRISS WPKEKPGSWY SEFKRGKLLS 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
YLDVEGNSIN MVQMTFLKLL TASARQNFTY NCHQSAAWYD VLSGSYDKAL RFLGSNDEEM 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
SYENNPHIKA LYDGCASRKG YEKTVIEINT PKIDQVPIID VMINDFGDQN QKFGFEVGPA 
   
CFLG

Isoforms

- Isoform Short of Collagen alpha-1(XI) chain

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MEPWSRWKTK RWIWDLTIST LALTFLFQAR EVRGAAPVDI LKALDFHNSP VGISKTTGFC 
        70         80         90        100        110        120 
TNRKNSKDPD VAYRVTEEAQ ISAPTKQLFP GGIFPQDFSI LFTIKPKKGT QAFLLSLYNE 
       130        140        150        160        170        180 
HGIQQLGVEV GRSPVFLFED HTGKPTPENY PLFSTVNIAD GKWHRVAISV EKKTVTMIVD 
       190        200        210        220        230        240 
CKKKITKPLD RSERSIVDTN GIMVFGTRIL ETDVFQGDIQ QFLITGDPKA AYDYCDHYSP 
       250        260        270        280        290        300 
DCDLTSKAAQ AQEPHIDEYA PEDIIEYDYE YGETDYKEAE SVTEMPTFTE ETVAQTEANI 
       310        320        330        340        350        360 
VDDFQDYNYG TMEPYQTETP RRVSGSNEPN PVEEGFTEEY LTGEDYDVQR NTSEDILYGN 
       370        380        390        400        410        420 
KGVDGRDSDL LVDGDLGEYD FYEYKEYEER TTTSPNEEFG PGVPAETDFT ETSINGHGAY 
       430        440        450        460        470        480 
GEKGQKGEPA VVEPGMLVEG PPGPAGPAGL MGPPGLQGPS GLPGDPGDRG PPGRPGLPGA 
       490        500        510        520        530        540 
DGLPGPPGTM LMLPFRYGGD GSKGPTISAQ EAQAQAILQQ ARIALRGPPG PMGLTGRPGP 
       550        560        570        580        590        600 
VGGPGSAGAK GESGDPGPQG PRGVQGPPGP TGKPGKRGRP GADGGRGMPG ESGSKGDRGF 
       610        620        630        640        650        660 
DGLPGLPGDK GHRGERGPQG PPGLPGDDGM RGEDGEIGPR GLPGEAGPRG LLGPRGTPGP 
       670        680        690        700        710        720 
PGQPGIGGID GPQGPKGNMG PQGEPGPPGQ QGNPGPQGLP GPQGPIGPPG EKGPQGKPGL 
       730        740        750        760        770        780 
AGLPGADGPP GHPGKEGQSG EKGALGPPGP QGPIGYPGPR GVKGADGVRG LKGSKGEKGE 
       790        800        810        820        830        840 
DGFPGFKGDM GLKGDRGEVG QVGPRGEDGP EGPKGRAGPT GDPGPSGQAG EKGKLGVPGL 
       850        860        870        880        890        900 
PGYPGRQGPK GSTGFPGFPG ANGEKGARGI AGKPGPRGQR GPTGPRGSRG ARGPTGKPGP 
       910        920        930        940        950        960 
KGTSGGDGPP GPPGERGPQG PQGPVGFPGP KGPPGPAGKD GLPGHPGQRG ETGFQGKTGP 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PGPGGVVGPQ GPTGETGPIG ERGHPGPPGP PGEQGLPGAA GKEGAKGDPG PQGISGKDGP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
AGIRGFPGER GLPGAQGAPG LKGGEGPQGP QGPVGSPGER GSAGTAGPIG LPGRPGPQGP 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
PGPAGEKGAP GEKGPQGPAG RDGVQGPVGL PGPAGPAGSP GEDGDKGEIG EPGQKGSKGD 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
KGENGPPGPP GLQGPVGAPG IAGGDGEPGP RGQQGMFGQK GDEGARGFPG LPGPIGLQGL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PGPPGEKGEN GDVGPMGPPG PPGPRGPQGP NGADGPQGPP GSIGSVGVVG DKGEPGEAGN 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
PGPPGEAGSG GLKGERGEKG EAGPPGAAGP AGIKGPPGDD GPKGNPGPVG FPGDPGPPGE 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PGPAGQDGVG GDKGEDGDPG QPGPPGPSGE AGPPGPPGKR GPPGASGSEG RQGEKGAKGE 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
AGAEGPPGKT GPVGPQGPSG KPGPEGLRGI PGPVGEQGLP GAAGQDGPPG PLGPPGLPGL 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
KGDPGSKGEK GHPGLIGLIG PPGEQGEKGD RGLPGTQGSP GAKGDGGIPG PAGPIGPPGP 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
PGLPGPAGPK GNKGSSGPTG QKGDSGMPGP PGPPGPPGEV IQPLPILSPK KTRRHTESIQ 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
GDAGDNILDY SDGMEEIFGS LNSLKQDIEH MKFPMGTQTN PARTCKDLQL SHPDFPDGEY 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
WIDPNQGCSG DSFKVYCNFT AGGETCIYPD KKSEGVRISS WPKEKPGSWY SEFKRGKLLS 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
YLDVEGNSIN MVQMTFLKLL TASARQNFTY NCHQSAAWYD VLSGSYDKAL RFLGSNDEEM 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
SYENNPHIKA LYDGCASRKG YEKTVIEINT PKIDQVPIID VMINDFGDQN QKFGFEVGPA 
   
CFLG



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

3 N-termini - 2 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)