TopFIND 4.0

Q62240: Lysine-specific demethylase 5D

General Information

Protein names
- Lysine-specific demethylase 5D
- 1.14.11.-
- Histocompatibility Y antigen
- H-Y
- Histone demethylase JARID1D
- Jumonji/ARID domain-containing protein 1D
- Protein SmcY
Gene names Kdm5d
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q62240

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MKPGSDDFLP PPECPVFEPS WAEFRDPLGY IAKIRPIAEK SGICKIRPPA DWQPPFAVEV 
        70         80         90        100        110        120 
DNFRFTPRIQ RLNELEAQTR VKLNYLDQIA KFWEIQGSSL KIPNVERKIL DLYSLNKIVM 
       130        140        150        160        170        180 
EEGGYEAICK DRRWARVAQR LNYPSGKNIG SLLRSHYERI IYPYEIFQSG ANLVQCNTDP 
       190        200        210        220        230        240 
FDSEERDKEY KPHSIPLRQS VQPSKFSCYS RRGKRLQPEP EPTEEDIEKN PELKKLQIYG 
       250        260        270        280        290        300 
AGPKMIGLGL KAKEKTLRKK DSKQPDKEEV TCPATIVVKG EASEFGKVTS AFSDKNLNHS 
       310        320        330        340        350        360 
FEPCMKMTMQ LRNNHSSTQF MNSYVCRICS RGDEVDKFLL CDGCSDNYHI FCLLPPLSEV 
       370        380        390        400        410        420 
PKGVWRCPKC ILAECKSPPE AFGFEQATQE YTLQSFGEMA DSFKADYFNM PVHMVPTEVV 
       430        440        450        460        470        480 
EKEFWRLVSS IEEDVTVEYG ADIHSKEFGS GFPVNNSKWD LSPEEKEYAA CGWNLNVMPV 
       490        500        510        520        530        540 
LDQSVLCHIN ADISGMKVPW LYVGMVFSAF CWHIEDHWSY SINYLHWGEP KTWYGVPSLA 
       550        560        570        580        590        600 
AEHLEDVMKR LTPELFDSQP DLLHQLVTLM NPNTLMSHGV PVVRTNQCAG EFVITFPRAY 
       610        620        630        640        650        660 
HSGFNQGYNF AEAVNFCTAD WLPVGRQCIE HYRRLRRYCV FSHEELICKM AAFPEKLDLN 
       670        680        690        700        710        720 
LAVAVHKEMF IMVQEERRLR KTLLEKGITE AEREAFELLP DDERQCIKCK TTCFLSALAC 
       730        740        750        760        770        780 
YDCPDSLVCL SHINDLCKCS RNRQYLRYRY TLDELPAMLQ KLKIRAESFD NWANKVQAAL 
       790        800        810        820        830        840 
EVEDGRKRSF EELRALESEA RDRRFPNSEL LQRLKKCLTE AEACISQVLG LISNSEDRLQ 
       850        860        870        880        890        900 
TPQITLTELQ LLLKQMGTLP CTMHQIDEVK DVLQQVESYQ IETREALTSL PYSLEILQSL 
       910        920        930        940        950        960 
MEKGQQLRVE VPEAHQLEEL LEQAQWLDQV KQALAPSGQR HSLVIMKKLL VMGTKVASSP 
       970        980        990       1000       1010       1020 
SVNKARAELQ ELLTIAECWE EKAHFCLKAS QKHSPATLEV IIREAENIPV YLPNIQSLKE 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
ALTKAQAWIA DVNEIQNGDH YPCLDDLEGL VAVGRDLPVE LEELRQLENQ VLTAHSWKEK 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
ASKTFLKKNS CYTLLEVLCP CADAGSVSTK RSRWIEKEMG LYKYDTELLG LSAQDLRDPG 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SVIMAFKEGE EKEKEGILHL RHINSAKPSP MSSSMNASAT SICICGQVCA GVESLQCDLC 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
HDWFHGQCVT VPHLLSSVRA SHTSSQLLAW WEWDTKFLCP LCMRSRRPRL ETILSLLVGL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
QRLSVRLPEG EALQCLTERA IGWQGRARQA LASEDVTALL KQLEKSRQQL QDELRHKKPP 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
TLPSGFAFDC LTENSGKDIL KEEEELVLNE ERIKSSEKIV PKESSCKGDK ELLPSLLSQL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
TGPVLELPEA TRAPLEELMM EGDLLEVTLD ENYSIWQLLQ AGQNPNLERI HTLLELEKPE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
NPGNWSEEQT PERRRQRRQK VVLSRKGEDF TQKELESKRV KSSRIKPKEE KFQKPILGDN 
      1510       1520       1530       1540    
VLYTHHTEHT NILKEHINSV QGKDPSPSSS FPSLTPLLHL SYFHQQKL

Isoforms

- Isoform 2 of Lysine-specific demethylase 5D - Isoform 3 of Lysine-specific demethylase 5D - Isoform 4 of Lysine-specific demethylase 5D

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MKPGSDDFLP PPECPVFEPS WAEFRDPLGY IAKIRPIAEK SGICKIRPPA DWQPPFAVEV 
        70         80         90        100        110        120 
DNFRFTPRIQ RLNELEAQTR VKLNYLDQIA KFWEIQGSSL KIPNVERKIL DLYSLNKIVM 
       130        140        150        160        170        180 
EEGGYEAICK DRRWARVAQR LNYPSGKNIG SLLRSHYERI IYPYEIFQSG ANLVQCNTDP 
       190        200        210        220        230        240 
FDSEERDKEY KPHSIPLRQS VQPSKFSCYS RRGKRLQPEP EPTEEDIEKN PELKKLQIYG 
       250        260        270        280        290        300 
AGPKMIGLGL KAKEKTLRKK DSKQPDKEEV TCPATIVVKG EASEFGKVTS AFSDKNLNHS 
       310        320        330        340        350        360 
FEPCMKMTMQ LRNNHSSTQF MNSYVCRICS RGDEVDKFLL CDGCSDNYHI FCLLPPLSEV 
       370        380        390        400        410        420 
PKGVWRCPKC ILAECKSPPE AFGFEQATQE YTLQSFGEMA DSFKADYFNM PVHMVPTEVV 
       430        440        450        460        470        480 
EKEFWRLVSS IEEDVTVEYG ADIHSKEFGS GFPVNNSKWD LSPEEKEYAA CGWNLNVMPV 
       490        500        510        520        530        540 
LDQSVLCHIN ADISGMKVPW LYVGMVFSAF CWHIEDHWSY SINYLHWGEP KTWYGVPSLA 
       550        560        570        580        590        600 
AEHLEDVMKR LTPELFDSQP DLLHQLVTLM NPNTLMSHGV PVVRTNQCAG EFVITFPRAY 
       610        620        630        640        650        660 
HSGFNQGYNF AEAVNFCTAD WLPVGRQCIE HYRRLRRYCV FSHEELICKM AAFPEKLDLN 
       670        680        690        700        710        720 
LAVAVHKEMF IMVQEERRLR KTLLEKGITE AEREAFELLP DDERQCIKCK TTCFLSALAC 
       730        740        750        760        770        780 
YDCPDSLVCL SHINDLCKCS RNRQYLRYRY TLDELPAMLQ KLKIRAESFD NWANKVQAAL 
       790        800        810        820        830        840 
EVEDGRKRSF EELRALESEA RDRRFPNSEL LQRLKKCLTE AEACISQVLG LISNSEDRLQ 
       850        860        870        880        890        900 
TPQITLTELQ LLLKQMGTLP CTMHQIDEVK DVLQQVESYQ IETREALTSL PYSLEILQSL 
       910        920        930        940        950        960 
MEKGQQLRVE VPEAHQLEEL LEQAQWLDQV KQALAPSGQR HSLVIMKKLL VMGTKVASSP 
       970        980        990       1000       1010       1020 
SVNKARAELQ ELLTIAECWE EKAHFCLKAS QKHSPATLEV IIREAENIPV YLPNIQSLKE 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
ALTKAQAWIA DVNEIQNGDH YPCLDDLEGL VAVGRDLPVE LEELRQLENQ VLTAHSWKEK 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
ASKTFLKKNS CYTLLEVLCP CADAGSVSTK RSRWIEKEMG LYKYDTELLG LSAQDLRDPG 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SVIMAFKEGE EKEKEGILHL RHINSAKPSP MSSSMNASAT SICICGQVCA GVESLQCDLC 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
HDWFHGQCVT VPHLLSSVRA SHTSSQLLAW WEWDTKFLCP LCMRSRRPRL ETILSLLVGL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
QRLSVRLPEG EALQCLTERA IGWQGRARQA LASEDVTALL KQLEKSRQQL QDELRHKKPP 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
TLPSGFAFDC LTENSGKDIL KEEEELVLNE ERIKSSEKIV PKESSCKGDK ELLPSLLSQL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
TGPVLELPEA TRAPLEELMM EGDLLEVTLD ENYSIWQLLQ AGQNPNLERI HTLLELEKPE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
NPGNWSEEQT PERRRQRRQK VVLSRKGEDF TQKELESKRV KSSRIKPKEE KFQKPILGDN 
      1510       1520       1530       1540    
VLYTHHTEHT NILKEHINSV QGKDPSPSSS FPSLTPLLHL SYFHQQKL         10         20         30         40         50         60 
MKPGSDDFLP PPECPVFEPS WAEFRDPLGY IAKIRPIAEK SGICKIRPPA DWQPPFAVEV 
        70         80         90        100        110        120 
DNFRFTPRIQ RLNELEAQTR VKLNYLDQIA KFWEIQGSSL KIPNVERKIL DLYSLNKIVM 
       130        140        150        160        170        180 
EEGGYEAICK DRRWARVAQR LNYPSGKNIG SLLRSHYERI IYPYEIFQSG ANLVQCNTDP 
       190        200        210        220        230        240 
FDSEERDKEY KPHSIPLRQS VQPSKFSCYS RRGKRLQPEP EPTEEDIEKN PELKKLQIYG 
       250        260        270        280        290        300 
AGPKMIGLGL KAKEKTLRKK DSKQPDKEEV TCPATIVVKG EASEFGKVTS AFSDKNLNHS 
       310        320        330        340        350        360 
FEPCMKMTMQ LRNNHSSTQF MNSYVCRICS RGDEVDKFLL CDGCSDNYHI FCLLPPLSEV 
       370        380        390        400        410        420 
PKGVWRCPKC ILAECKSPPE AFGFEQATQE YTLQSFGEMA DSFKADYFNM PVHMVPTEVV 
       430        440        450        460        470        480 
EKEFWRLVSS IEEDVTVEYG ADIHSKEFGS GFPVNNSKWD LSPEEKEYAA CGWNLNVMPV 
       490        500        510        520        530        540 
LDQSVLCHIN ADISGMKVPW LYVGMVFSAF CWHIEDHWSY SINYLHWGEP KTWYGVPSLA 
       550        560        570        580        590        600 
AEHLEDVMKR LTPELFDSQP DLLHQLVTLM NPNTLMSHGV PVVRTNQCAG EFVITFPRAY 
       610        620        630        640        650        660 
HSGFNQGYNF AEAVNFCTAD WLPVGRQCIE HYRRLRRYCV FSHEELICKM AAFPEKLDLN 
       670        680        690        700        710        720 
LAVAVHKEMF IMVQEERRLR KTLLEKGITE AEREAFELLP DDERQCIKCK TTCFLSALAC 
       730        740        750        760        770        780 
YDCPDSLVCL SHINDLCKCS RNRQYLRYRY TLDELPAMLQ KLKIRAESFD NWANKVQAAL 
       790        800        810        820        830        840 
EVEDGRKRSF EELRALESEA RDRRFPNSEL LQRLKKCLTE AEACISQVLG LISNSEDRLQ 
       850        860        870        880        890        900 
TPQITLTELQ LLLKQMGTLP CTMHQIDEVK DVLQQVESYQ IETREALTSL PYSLEILQSL 
       910        920        930        940        950        960 
MEKGQQLRVE VPEAHQLEEL LEQAQWLDQV KQALAPSGQR HSLVIMKKLL VMGTKVASSP 
       970        980        990       1000       1010       1020 
SVNKARAELQ ELLTIAECWE EKAHFCLKAS QKHSPATLEV IIREAENIPV YLPNIQSLKE 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
ALTKAQAWIA DVNEIQNGDH YPCLDDLEGL VAVGRDLPVE LEELRQLENQ VLTAHSWKEK 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
ASKTFLKKNS CYTLLEVLCP CADAGSVSTK RSRWIEKEMG LYKYDTELLG LSAQDLRDPG 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SVIMAFKEGE EKEKEGILHL RHINSAKPSP MSSSMNASAT SICICGQVCA GVESLQCDLC 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
HDWFHGQCVT VPHLLSSVRA SHTSSQLLAW WEWDTKFLCP LCMRSRRPRL ETILSLLVGL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
QRLSVRLPEG EALQCLTERA IGWQGRARQA LASEDVTALL KQLEKSRQQL QDELRHKKPP 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
TLPSGFAFDC LTENSGKDIL KEEEELVLNE ERIKSSEKIV PKESSCKGDK ELLPSLLSQL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
TGPVLELPEA TRAPLEELMM EGDLLEVTLD ENYSIWQLLQ AGQNPNLERI HTLLELEKPE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
NPGNWSEEQT PERRRQRRQK VVLSRKGEDF TQKELESKRV KSSRIKPKEE KFQKPILGDN 
      1510       1520       1530       1540    
VLYTHHTEHT NILKEHINSV QGKDPSPSSS FPSLTPLLHL SYFHQQKL         10         20         30         40         50         60 
MKPGSDDFLP PPECPVFEPS WAEFRDPLGY IAKIRPIAEK SGICKIRPPA DWQPPFAVEV 
        70         80         90        100        110        120 
DNFRFTPRIQ RLNELEAQTR VKLNYLDQIA KFWEIQGSSL KIPNVERKIL DLYSLNKIVM 
       130        140        150        160        170        180 
EEGGYEAICK DRRWARVAQR LNYPSGKNIG SLLRSHYERI IYPYEIFQSG ANLVQCNTDP 
       190        200        210        220        230        240 
FDSEERDKEY KPHSIPLRQS VQPSKFSCYS RRGKRLQPEP EPTEEDIEKN PELKKLQIYG 
       250        260        270        280        290        300 
AGPKMIGLGL KAKEKTLRKK DSKQPDKEEV TCPATIVVKG EASEFGKVTS AFSDKNLNHS 
       310        320        330        340        350        360 
FEPCMKMTMQ LRNNHSSTQF MNSYVCRICS RGDEVDKFLL CDGCSDNYHI FCLLPPLSEV 
       370        380        390        400        410        420 
PKGVWRCPKC ILAECKSPPE AFGFEQATQE YTLQSFGEMA DSFKADYFNM PVHMVPTEVV 
       430        440        450        460        470        480 
EKEFWRLVSS IEEDVTVEYG ADIHSKEFGS GFPVNNSKWD LSPEEKEYAA CGWNLNVMPV 
       490        500        510        520        530        540 
LDQSVLCHIN ADISGMKVPW LYVGMVFSAF CWHIEDHWSY SINYLHWGEP KTWYGVPSLA 
       550        560        570        580        590        600 
AEHLEDVMKR LTPELFDSQP DLLHQLVTLM NPNTLMSHGV PVVRTNQCAG EFVITFPRAY 
       610        620        630        640        650        660 
HSGFNQGYNF AEAVNFCTAD WLPVGRQCIE HYRRLRRYCV FSHEELICKM AAFPEKLDLN 
       670        680        690        700        710        720 
LAVAVHKEMF IMVQEERRLR KTLLEKGITE AEREAFELLP DDERQCIKCK TTCFLSALAC 
       730        740        750        760        770        780 
YDCPDSLVCL SHINDLCKCS RNRQYLRYRY TLDELPAMLQ KLKIRAESFD NWANKVQAAL 
       790        800        810        820        830        840 
EVEDGRKRSF EELRALESEA RDRRFPNSEL LQRLKKCLTE AEACISQVLG LISNSEDRLQ 
       850        860        870        880        890        900 
TPQITLTELQ LLLKQMGTLP CTMHQIDEVK DVLQQVESYQ IETREALTSL PYSLEILQSL 
       910        920        930        940        950        960 
MEKGQQLRVE VPEAHQLEEL LEQAQWLDQV KQALAPSGQR HSLVIMKKLL VMGTKVASSP 
       970        980        990       1000       1010       1020 
SVNKARAELQ ELLTIAECWE EKAHFCLKAS QKHSPATLEV IIREAENIPV YLPNIQSLKE 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
ALTKAQAWIA DVNEIQNGDH YPCLDDLEGL VAVGRDLPVE LEELRQLENQ VLTAHSWKEK 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
ASKTFLKKNS CYTLLEVLCP CADAGSVSTK RSRWIEKEMG LYKYDTELLG LSAQDLRDPG 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SVIMAFKEGE EKEKEGILHL RHINSAKPSP MSSSMNASAT SICICGQVCA GVESLQCDLC 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
HDWFHGQCVT VPHLLSSVRA SHTSSQLLAW WEWDTKFLCP LCMRSRRPRL ETILSLLVGL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
QRLSVRLPEG EALQCLTERA IGWQGRARQA LASEDVTALL KQLEKSRQQL QDELRHKKPP 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
TLPSGFAFDC LTENSGKDIL KEEEELVLNE ERIKSSEKIV PKESSCKGDK ELLPSLLSQL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
TGPVLELPEA TRAPLEELMM EGDLLEVTLD ENYSIWQLLQ AGQNPNLERI HTLLELEKPE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
NPGNWSEEQT PERRRQRRQK VVLSRKGEDF TQKELESKRV KSSRIKPKEE KFQKPILGDN 
      1510       1520       1530       1540    
VLYTHHTEHT NILKEHINSV QGKDPSPSSS FPSLTPLLHL SYFHQQKL



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...HQQKL 1548 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...HQQKL 1548 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt74510

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)