TopFIND 4.0

Q62968: Sodium channel protein type 10 subunit alpha

General Information

Protein names
- Sodium channel protein type 10 subunit alpha
- Peripheral nerve sodium channel 3
- PN3
- Sensory neuron sodium channel
- Sodium channel protein type X subunit alpha
- Voltage-gated sodium channel subunit alpha Nav1.8
Gene names Scn10a
Organism Rattus norvegicus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q62968

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MELPFASVGT TNFRRFTPES LAEIEKQIAA HRAAKKARTK HRGQEDKGEK PRPQLDLKAC 
        70         80         90        100        110        120 
NQLPKFYGEL PAELVGEPLE DLDPFYSTHR TFMVLNKSRT ISRFSATWAL WLFSPFNLIR 
       130        140        150        160        170        180 
RTAIKVSVHS WFSIFITITI LVNCVCMTRT DLPEKVEYVF TVIYTFEALI KILARGFCLN 
       190        200        210        220        230        240 
EFTYLRDPWN WLDFSVITLA YVGAAIDLRG ISGLRTFRVL RALKTVSVIP GLKVIVGALI 
       250        260        270        280        290        300 
HSVRKLADVT ILTVFCLSVF ALVGLQLFKG NLKNKCIRNG TDPHKADNLS SEMAEYIFIK 
       310        320        330        340        350        360 
PGTTDPLLCG NGSDAGHCPG GYVCLKTPDN PDFNYTSFDS FAWAFLSLFR LMTQDSWERL 
       370        380        390        400        410        420 
YQQTLRASGK MYMVFFVLVI FLGSFYLVNL ILAVVTMAYE EQSQATIAEI EAKEKKFQEA 
       430        440        450        460        470        480 
LEVLQKEQEV LAALGIDTTS LQSHSGSPLA SKNANERRPR VKSRVSEGST DDNRSPQSDP 
       490        500        510        520        530        540 
YNQRRMSFLG LSSGRRRASH GSVFHFRAPS QDISFPDGIT DDGVFHGDQE SRRGSILLGR 
       550        560        570        580        590        600 
GAGQTGPLPR SPLPQSPNPG RRHGEEGQLG VPTGELTAGA PEGPALDTTG QKSFLSAGYL 
       610        620        630        640        650        660 
NEPFRAQRAM SVVSIMTSVI EELEESKLKC PPCLISFAQK YLIWECCPKW RKFKMALFEL 
       670        680        690        700        710        720 
VTDPFAELTI TLCIVVNTVF MAMEHYPMTD AFDAMLQAGN IVFTVFFTME MAFKIIAFDP 
       730        740        750        760        770        780 
YYYFQKKWNI FDCVIVTVSL LELSASKKGS LSVLRTFRLL RVFKLAKSWP TLNTLIKIIG 
       790        800        810        820        830        840 
NSVGALGNLT FILAIIVFIF ALVGKQLLSE DYGCRKDGVS VWNGEKLRWH MCDFFHSFLV 
       850        860        870        880        890        900 
VFRILCGEWI ENMWVCMEVS QKSICLILFL TVMVLGNLVV LNLFIALLLN SFSADNLTAP 
       910        920        930        940        950        960 
EDDGEVNNLQ LALARIQVLG HRASRAIASY ISSHCRFRWP KVETQLGMKP PLTSSEAKNH 
       970        980        990       1000       1010       1020 
IATDAVSAAV GNLTKPALSS PKENHGDFIT DPNVWVSVPI AEGESDLDEL EEDMEQASQS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SWQEEDPKGQ QEQLPQVQKC ENHQAARSPA SMMSSEDLAP YLGESWKRKD SPQVPAEGVD 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DTSSSEGSTV DCPDPEEILR KIPELADDLD EPDDCFTEGC TRRCPCCNVN TSKSPWATGW 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
QVRKTCYRIV EHSWFESFII FMILLSSGAL AFEDNYLEEK PRVKSVLEYT DRVFTFIFVF 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
EMLLKWVAYG FKKYFTNAWC WLDFLIVNIS LTSLIAKILE YSDVASIKAL RTLRALRPLR 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
ALSRFEGMRV VVDALVGAIP SIMNVLLVCL IFWLIFSIMG VNLFAGKFSK CVDTRNNPFS 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
NVNSTMVNNK SECHNQNSTG HFFWVNVKVN FDNVAMGYLA LLQVATFKGW MDIMYAAVDS 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
GEINSQPNWE NNLYMYLYFV VFIIFGGFFT LNLFVGVIID NFNQQKKKLG GQDIFMTEEQ 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
KKYYNAMKKL GSKKPQKPIP RPLNKYQGFV FDIVTRQAFD IIIMVLICLN MITMMVETDE 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
QGEEKTKVLG RINQFFVAVF TGECVMKMFA LRQYYFTNGW NVFDFIVVIL SIGSLLFSAI 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LKSLENYFSP TLFRVIRLAR IGRILRLIRA AKGIRTLLFA LMMSLPALFN IGLLLFLVMF 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
IYSIFGMASF ANVVDEAGID DMFNFKTFGN SMLCLFQITT SAGWDGLLSP ILNTGPPYCD 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
PNLPNSNGSR GNCGSPAVGI IFFTTYIIIS FLIVVNMYIA VILENFNVAT EESTEPLSED 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
DFDMFYETWE KFDPEATQFI AFSALSDFAD TLSGPLRIPK PNQNILIQMD LPLVPGDKIH 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
CLDILFAFTK NVLGESGELD SLKTNMEEKF MATNLSKASY EPIATTLRWK QEDLSATVIQ 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
KAYRSYMLHR SLTLSNTLHV PRAEEDGVSL PGEGYVTFMA NSGLPDKSET ASATSFPPSY 
      1930       1940       1950    
DSVTRGLSDR ANINPSSSMQ NEDEVAAKEG NSPGPQ

Isoforms

- Isoform 2 of Sodium channel protein type 10 subunit alpha

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MELPFASVGT TNFRRFTPES LAEIEKQIAA HRAAKKARTK HRGQEDKGEK PRPQLDLKAC 
        70         80         90        100        110        120 
NQLPKFYGEL PAELVGEPLE DLDPFYSTHR TFMVLNKSRT ISRFSATWAL WLFSPFNLIR 
       130        140        150        160        170        180 
RTAIKVSVHS WFSIFITITI LVNCVCMTRT DLPEKVEYVF TVIYTFEALI KILARGFCLN 
       190        200        210        220        230        240 
EFTYLRDPWN WLDFSVITLA YVGAAIDLRG ISGLRTFRVL RALKTVSVIP GLKVIVGALI 
       250        260        270        280        290        300 
HSVRKLADVT ILTVFCLSVF ALVGLQLFKG NLKNKCIRNG TDPHKADNLS SEMAEYIFIK 
       310        320        330        340        350        360 
PGTTDPLLCG NGSDAGHCPG GYVCLKTPDN PDFNYTSFDS FAWAFLSLFR LMTQDSWERL 
       370        380        390        400        410        420 
YQQTLRASGK MYMVFFVLVI FLGSFYLVNL ILAVVTMAYE EQSQATIAEI EAKEKKFQEA 
       430        440        450        460        470        480 
LEVLQKEQEV LAALGIDTTS LQSHSGSPLA SKNANERRPR VKSRVSEGST DDNRSPQSDP 
       490        500        510        520        530        540 
YNQRRMSFLG LSSGRRRASH GSVFHFRAPS QDISFPDGIT DDGVFHGDQE SRRGSILLGR 
       550        560        570        580        590        600 
GAGQTGPLPR SPLPQSPNPG RRHGEEGQLG VPTGELTAGA PEGPALDTTG QKSFLSAGYL 
       610        620        630        640        650        660 
NEPFRAQRAM SVVSIMTSVI EELEESKLKC PPCLISFAQK YLIWECCPKW RKFKMALFEL 
       670        680        690        700        710        720 
VTDPFAELTI TLCIVVNTVF MAMEHYPMTD AFDAMLQAGN IVFTVFFTME MAFKIIAFDP 
       730        740        750        760        770        780 
YYYFQKKWNI FDCVIVTVSL LELSASKKGS LSVLRTFRLL RVFKLAKSWP TLNTLIKIIG 
       790        800        810        820        830        840 
NSVGALGNLT FILAIIVFIF ALVGKQLLSE DYGCRKDGVS VWNGEKLRWH MCDFFHSFLV 
       850        860        870        880        890        900 
VFRILCGEWI ENMWVCMEVS QKSICLILFL TVMVLGNLVV LNLFIALLLN SFSADNLTAP 
       910        920        930        940        950        960 
EDDGEVNNLQ LALARIQVLG HRASRAIASY ISSHCRFRWP KVETQLGMKP PLTSSEAKNH 
       970        980        990       1000       1010       1020 
IATDAVSAAV GNLTKPALSS PKENHGDFIT DPNVWVSVPI AEGESDLDEL EEDMEQASQS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SWQEEDPKGQ QEQLPQVQKC ENHQAARSPA SMMSSEDLAP YLGESWKRKD SPQVPAEGVD 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DTSSSEGSTV DCPDPEEILR KIPELADDLD EPDDCFTEGC TRRCPCCNVN TSKSPWATGW 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
QVRKTCYRIV EHSWFESFII FMILLSSGAL AFEDNYLEEK PRVKSVLEYT DRVFTFIFVF 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
EMLLKWVAYG FKKYFTNAWC WLDFLIVNIS LTSLIAKILE YSDVASIKAL RTLRALRPLR 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
ALSRFEGMRV VVDALVGAIP SIMNVLLVCL IFWLIFSIMG VNLFAGKFSK CVDTRNNPFS 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
NVNSTMVNNK SECHNQNSTG HFFWVNVKVN FDNVAMGYLA LLQVATFKGW MDIMYAAVDS 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
GEINSQPNWE NNLYMYLYFV VFIIFGGFFT LNLFVGVIID NFNQQKKKLG GQDIFMTEEQ 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
KKYYNAMKKL GSKKPQKPIP RPLNKYQGFV FDIVTRQAFD IIIMVLICLN MITMMVETDE 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
QGEEKTKVLG RINQFFVAVF TGECVMKMFA LRQYYFTNGW NVFDFIVVIL SIGSLLFSAI 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LKSLENYFSP TLFRVIRLAR IGRILRLIRA AKGIRTLLFA LMMSLPALFN IGLLLFLVMF 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
IYSIFGMASF ANVVDEAGID DMFNFKTFGN SMLCLFQITT SAGWDGLLSP ILNTGPPYCD 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
PNLPNSNGSR GNCGSPAVGI IFFTTYIIIS FLIVVNMYIA VILENFNVAT EESTEPLSED 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
DFDMFYETWE KFDPEATQFI AFSALSDFAD TLSGPLRIPK PNQNILIQMD LPLVPGDKIH 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
CLDILFAFTK NVLGESGELD SLKTNMEEKF MATNLSKASY EPIATTLRWK QEDLSATVIQ 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
KAYRSYMLHR SLTLSNTLHV PRAEEDGVSL PGEGYVTFMA NSGLPDKSET ASATSFPPSY 
      1930       1940       1950    
DSVTRGLSDR ANINPSSSMQ NEDEVAAKEG NSPGPQ



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q62968-1-unknown MELPFA... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q62968-1-unknown MELPFA... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt193458

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...SPGPQ 1956 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...SPGPQ 1956 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt153404

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)