TopFIND 4.0

Q63625: PHD and RING finger domain-containing protein 1 {ECO:0000250|UniProtKB:Q9P1Y6}

General Information

Protein names
- PHD and RING finger domain-containing protein 1 {ECO:0000250|UniProtKB:Q9P1Y6}
- CTD-binding SR-like protein rA9 {ECO:0000303|PubMed:8692929}
Gene names Phrf1 {ECO:0000250|UniProtKB:Q9P1Y6}
Organism Rattus norvegicus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q63625

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MDDDNLDELV AHSPGPDGPP QVGSSELASD AEESSNGHSE DSEDDTGSEQ DDDTDGEETE 
        70         80         90        100        110        120 
GLSEEEDPED RSGSEDSEDG IEVPTAAVET QRKLEASSTP NSDDDAESCP ICLNAFRDQA 
       130        140        150        160        170        180 
VGTPETCAHY FCLDCIIEWS RNANSCPVDR TIFKCICIRA QFNGKILKKI PVENTRACED 
       190        200        210        220        230        240 
EEAEEEDPTF CEVCGRSDRE DRLLLCDGCD AGYHMECLDP PLQEVPVDEW FCPECAVPGV 
       250        260        270        280        290        300 
DPTHDAAPVS DEEVSLLLAD VVPTTSRLRP RVGRTRAIAR TRQSERVRAT VNRNRISSAR 
       310        320        330        340        350        360 
RVQHVPRYLM SSLLDETIEA VATGLSTAVY QRPLTPRVPA KRKRKAGRRK KVLGRKKTRS 
       370        380        390        400        410        420 
RSSVKSKSGG TRAKKRQHRV RRTKGRKLKN EVTARSRIAR TLGLRRPVRG TSMPSVYKPV 
       430        440        450        460        470        480 
DPSLGLMRAD IGAASLSLFG DPYALDPFDS NGEQSADPPS PLSAKRRVLS RSALQSHQPV 
       490        500        510        520        530        540 
ARPVAMGLAR RQLPAVAPEP SVEEAPVPDL LGSILCGQSL LMMSSADVVI HRDGSLSAKR 
       550        560        570        580        590        600 
AAPVSLQRNS VTQSREESRL RDNLQPGALP SESVSGGLIG DRRPNSGLSC GDRTALRCLP 
       610        620        630        640        650        660 
AQIVQTPVRS DSSVTPRSGL SGNLSDESRP KWKHSNSPRL NGSNVRVGSA STKTMTHSNF 
       670        680        690        700        710        720 
PSKNIAPGHP QKTDPRRPDF SKLPRIPKIR RDGSNSTQDQ APASGQTVEL PSACISRLTG 
       730        740        750        760        770        780 
REGPGQPGRG RADSEPSSRG PQETGSHTSG SRPPAPSSHG NLAPLGPSRG KGIGSSFESF 
       790        800        810        820        830        840 
RINIPGNTAH CSQLSSPGFC NTFRPVDSKV QRKENPSPLF SIKKPKQLKS EIYDPFDPTG 
       850        860        870        880        890        900 
SDSSPPSSSP ESLGSGLLPS EITRTISINS PKAPAFQTVR CVTSYRVESV FGTEMDPDPQ 
       910        920        930        940        950        960 
PPGEPVSGML ELLGKGPAEG ASDLEQEGLG EIEPTEIQGS SARAQRPSPP DPWDDEDGVS 
       970        980        990       1000       1010       1020 
CTPFFGSEER TVTCVTVEEP SVPSPDAPQI TTHRIVEFRA SSRSRSTSSS RSRKKTKKKK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KVAREHQRTR SSTRSGSRDR TSRSVSPFTE EHTKRHRAKT KSRRSSSDRA SSQDRAKRRK 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DRDREHRRGP WGHGRCWRKS RSRSGSPGSS SCERHESRRR KRRHSGSRSR GRDGSPHSSL 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
ERDRRHKHRE RSRERMDKKE SMTRSRERRR WRSRSPSVEH RTRRPHSREK HPHSPEKKGA 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
VREVSPAPAP QGEPRQDGDH STKPPVSEVS VLPEVVSVLP EVVVADLNPP EVPPVLAESV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
SCVPEDLDYG DSVEAGHVFE DFSNEAIFIQ LDDMSSPPSP ESTDSSPERD FLPNPILPPA 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
SLPQNSTLPV TQREVLPIHS EDISKPAPQP LAPSDQCLLR QDTVETTATT LSTPGVLPMG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
KDSPLLSGRG CEVVRPKDAV APAPLLRSRT LVKRVTWNLQ EAEASTPALD RDPRTPLQRP 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QRPQEGDWDA EDRALIGFQQ APFSELPPPI HVLQESGLPD ADPSQPPGVP RAEGPPAVGT 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
LHSAGGILAQ VYSPNMPPPL AQPSSIPPYA LVNQPSVQLI LQGTLPLASC GAAQNLAPVP 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
TMPATASELA VPTTNNSEER TATPKTAAEK TKKEEYMKKL HMQERAVEEV KLAIKPFYQK 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
REVTKEEYKD ILRKAVQKIC HSKSGEINPV KVANLVKAYV DKYRHMRKHK KTEAGEEPPT 
   
QGAET

Isoforms

- Isoform 2 of PHD and RING finger domain-containing protein 1

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MDDDNLDELV AHSPGPDGPP QVGSSELASD AEESSNGHSE DSEDDTGSEQ DDDTDGEETE 
        70         80         90        100        110        120 
GLSEEEDPED RSGSEDSEDG IEVPTAAVET QRKLEASSTP NSDDDAESCP ICLNAFRDQA 
       130        140        150        160        170        180 
VGTPETCAHY FCLDCIIEWS RNANSCPVDR TIFKCICIRA QFNGKILKKI PVENTRACED 
       190        200        210        220        230        240 
EEAEEEDPTF CEVCGRSDRE DRLLLCDGCD AGYHMECLDP PLQEVPVDEW FCPECAVPGV 
       250        260        270        280        290        300 
DPTHDAAPVS DEEVSLLLAD VVPTTSRLRP RVGRTRAIAR TRQSERVRAT VNRNRISSAR 
       310        320        330        340        350        360 
RVQHVPRYLM SSLLDETIEA VATGLSTAVY QRPLTPRVPA KRKRKAGRRK KVLGRKKTRS 
       370        380        390        400        410        420 
RSSVKSKSGG TRAKKRQHRV RRTKGRKLKN EVTARSRIAR TLGLRRPVRG TSMPSVYKPV 
       430        440        450        460        470        480 
DPSLGLMRAD IGAASLSLFG DPYALDPFDS NGEQSADPPS PLSAKRRVLS RSALQSHQPV 
       490        500        510        520        530        540 
ARPVAMGLAR RQLPAVAPEP SVEEAPVPDL LGSILCGQSL LMMSSADVVI HRDGSLSAKR 
       550        560        570        580        590        600 
AAPVSLQRNS VTQSREESRL RDNLQPGALP SESVSGGLIG DRRPNSGLSC GDRTALRCLP 
       610        620        630        640        650        660 
AQIVQTPVRS DSSVTPRSGL SGNLSDESRP KWKHSNSPRL NGSNVRVGSA STKTMTHSNF 
       670        680        690        700        710        720 
PSKNIAPGHP QKTDPRRPDF SKLPRIPKIR RDGSNSTQDQ APASGQTVEL PSACISRLTG 
       730        740        750        760        770        780 
REGPGQPGRG RADSEPSSRG PQETGSHTSG SRPPAPSSHG NLAPLGPSRG KGIGSSFESF 
       790        800        810        820        830        840 
RINIPGNTAH CSQLSSPGFC NTFRPVDSKV QRKENPSPLF SIKKPKQLKS EIYDPFDPTG 
       850        860        870        880        890        900 
SDSSPPSSSP ESLGSGLLPS EITRTISINS PKAPAFQTVR CVTSYRVESV FGTEMDPDPQ 
       910        920        930        940        950        960 
PPGEPVSGML ELLGKGPAEG ASDLEQEGLG EIEPTEIQGS SARAQRPSPP DPWDDEDGVS 
       970        980        990       1000       1010       1020 
CTPFFGSEER TVTCVTVEEP SVPSPDAPQI TTHRIVEFRA SSRSRSTSSS RSRKKTKKKK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KVAREHQRTR SSTRSGSRDR TSRSVSPFTE EHTKRHRAKT KSRRSSSDRA SSQDRAKRRK 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DRDREHRRGP WGHGRCWRKS RSRSGSPGSS SCERHESRRR KRRHSGSRSR GRDGSPHSSL 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
ERDRRHKHRE RSRERMDKKE SMTRSRERRR WRSRSPSVEH RTRRPHSREK HPHSPEKKGA 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
VREVSPAPAP QGEPRQDGDH STKPPVSEVS VLPEVVSVLP EVVVADLNPP EVPPVLAESV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
SCVPEDLDYG DSVEAGHVFE DFSNEAIFIQ LDDMSSPPSP ESTDSSPERD FLPNPILPPA 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
SLPQNSTLPV TQREVLPIHS EDISKPAPQP LAPSDQCLLR QDTVETTATT LSTPGVLPMG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
KDSPLLSGRG CEVVRPKDAV APAPLLRSRT LVKRVTWNLQ EAEASTPALD RDPRTPLQRP 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QRPQEGDWDA EDRALIGFQQ APFSELPPPI HVLQESGLPD ADPSQPPGVP RAEGPPAVGT 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
LHSAGGILAQ VYSPNMPPPL AQPSSIPPYA LVNQPSVQLI LQGTLPLASC GAAQNLAPVP 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
TMPATASELA VPTTNNSEER TATPKTAAEK TKKEEYMKKL HMQERAVEEV KLAIKPFYQK 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
REVTKEEYKD ILRKAVQKIC HSKSGEINPV KVANLVKAYV DKYRHMRKHK KTEAGEEPPT 
   
QGAET



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q63625-1-unknown MDDDNL... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...QGAET 1685 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...QGAET 1685 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt153233

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)