TopFIND 4.0

Q6EVK6: ATP-dependent helicase BRM {ECO:0000303|PubMed:15371304}

General Information

Protein names
- ATP-dependent helicase BRM {ECO:0000303|PubMed:15371304}
- 3.6.4.12
- Protein BRAHMA {ECO:0000303|PubMed:15371304}
- AtBRM {ECO:0000303|PubMed:15371304}
- Protein CHROMATIN REMODELING 2 {ECO:0000303|PubMed:16547115}
- AtCHR2 {ECO:0000303|PubMed:16547115}
Gene names BRM
Organism Arabidopsis thaliana
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q6EVK6

3

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MQSGGSGGGP ARNPAMGPAG RTASTSSAAS PSSSSSSVQQ QQQQQQQQQQ QQQLASRQQQ 
        70         80         90        100        110        120 
QQHRNSDTNE NMFAYQPGGV QGMMGGGNFA SSPGSMQMPQ QSRNFFESPQ QQQQQQQQGS 
       130        140        150        160        170        180 
STQEGQQNFN PMQQAYIQFA MQAQHQKAQQ QARMGMVGSS SVGKDQDARM GMLNMQDLNP 
       190        200        210        220        230        240 
SSQPQASSSK PSGDQFARGE RQTESSSQQR NETKSHPQQQ VGTGQLMPGN MIRPMQAPQA 
       250        260        270        280        290        300 
QQLVNNMGNN QLAFAQQWQA MQAWARERNI DLSHPANASQ MAHILQARMA AQQKAGEGNV 
       310        320        330        340        350        360 
ASQSPSIPIS SQPASSSVVP GENSPHANSA SDISGQSGSA KARHALSTGS FASTSSPRMV 
       370        380        390        400        410        420 
NPAMNPFSGQ GRENPMYPRH LVQPTNGMPS GNPLQTSANE TPVLDQNAST KKSLGPAEHL 
       430        440        450        460        470        480 
QMQQPRQLNT PTPNLVAPSD TGPLSNSSLQ SGQGTQQAQQ RSGFTKQQLH VLKAQILAFR 
       490        500        510        520        530        540 
RLKKGEGSLP PELLQAISPP PLELQTQRQI SPAIGKVQDR SSDKTGEDQA RSLECGKESQ 
       550        560        570        580        590        600 
AAASSNGPIF SKEEDNVGDT EVALTTGHSQ LFQNLGKEAT STDVATKEEQ QTDVFPVKSD 
       610        620        630        640        650        660 
QGADSSTQKN PRSDSTADKG KAVASDGSQS KVPPQANSPQ PPKDTASARK YYGPLFDFPF 
       670        680        690        700        710        720 
FTRKLDSYGS ATANANNNLT LAYDIKDLIC EEGAEFLSKK RTDSLKKING LLAKNLERKR 
       730        740        750        760        770        780 
IRPDLVLRLQ IEEKKLRLSD LQSRVREEVD RQQQEIMSMP DRPYRKFVRL CERQRLEMNR 
       790        800        810        820        830        840 
QVLANQKAVR EKQLKTIFQW RKKLLEAHWA IRDARTARNR GVAKYHEKML REFSKRKDDG 
       850        860        870        880        890        900 
RNKRMEALKN NDVERYREML LEQQTNMPGD AAERYAVLSS FLTQTEDYLH KLGGKITATK 
       910        920        930        940        950        960 
NQQEVEEAAN AAAVAARLQG LSEEEVRAAA TCAREEVVIR NRFTEMNAPK ENSSVNKYYT 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LAHAVNEVVV RQPSMLQAGT LRDYQLVGLQ WMLSLYNNKL NGILADEMGL GKTVQVMALI 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
AYLMEFKGNY GPHLIIVPNA VLVNWKSELH TWLPSVSCIY YVGTKDQRSK LFSQEVCAMK 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
FNVLVTTYEF IMYDRSKLSK VDWKYIIIDE AQRMKDRESV LARDLDRYRC QRRLLLTGTP 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
LQNDLKELWS LLNLLLPDVF DNRKAFHDWF AQPFQKEGPA HNIEDDWLET EKKVIVIHRL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
HQILEPFMLR RRVEDVEGSL PAKVSVVLRC RMSAIQSAVY DWIKATGTLR VDPDDEKLRA 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
QKNPIYQAKI YRTLNNRCME LRKACNHPLL NYPYFNDFSK DFLVRSCGKL WILDRILIKL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
QRTGHRVLLF STMTKLLDIL EEYLQWRRLV YRRIDGTTSL EDRESAIVDF NDPDTDCFIF 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LLSIRAAGRG LNLQTADTVV IYDPDPNPKN EEQAVARAHR IGQTREVKVI YMEAVVEKLS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
SHQKEDELRS GGSVDLEDDM AGKDRYIGSI EGLIRNNIQQ YKIDMADEVI NAGRFDQRTT 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
HEERRMTLET LLHDEERYQE TVHDVPSLHE VNRMIARSEE EVELFDQMDE EFDWTEEMTN 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
HEQVPKWLRA STREVNATVA DLSKKPSKNM LSSSNLIVQP GGPGGERKRG RPKSKKINYK 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
EIEDDIAGYS EESSEERNID SGNEEEGDIR QFDDDELTGA LGDHQTNKGE FDGENPVCGY 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
DYPPGSGSYK KNPPRDDAGS SGSSPESHRS KEMASPVSSQ KFGSLSALDT RPGSVSKRLL 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
DDLEEGEIAA SGDSHIDLQR SGSWAHDRDE GDEEQVLQPT IKRKRSIRLR PRQTAERVDG 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
SEMPAAQPLQ VDRSYRSKLR TVVDSHSSRQ DQSDSSSRLR SVPAKKVAST SKLHVSSPKS 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
GRLNATQLTV EDNAEASRET WDGTSPISSS NAGARMSHII QKRCKIVISK LQRRIDKEGQ 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
QIVPMLTNLW KRIQNGYAAG GVNNLLELRE IDHRVERLEY AGVMELASDV QLMLRGAMQF 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
YGFSHEVRSE AKKVHNLFFD LLKMSFPDTD FREARNALSF SGSAPTLVST PTPRGAGISQ 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
GKRQKLVNEP ETEPSSPQRS QQRENSRIRV QIPQKETKLG GTTSHTDESP ILAHPGELVI 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
CKKKRKDREK SGPKTRTGGS SSPVSPPPAM IGRGLRSPVS GGVPRETRLA QQQRWPNQPT 
      2170       2180       2190    
HPNNSGAAGD SVGWANPVKR LRTDSGKRRP SHL

Isoforms

- Isoform 2 of ATP-dependent helicase BRM

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MQSGGSGGGP ARNPAMGPAG RTASTSSAAS PSSSSSSVQQ QQQQQQQQQQ QQQLASRQQQ 
        70         80         90        100        110        120 
QQHRNSDTNE NMFAYQPGGV QGMMGGGNFA SSPGSMQMPQ QSRNFFESPQ QQQQQQQQGS 
       130        140        150        160        170        180 
STQEGQQNFN PMQQAYIQFA MQAQHQKAQQ QARMGMVGSS SVGKDQDARM GMLNMQDLNP 
       190        200        210        220        230        240 
SSQPQASSSK PSGDQFARGE RQTESSSQQR NETKSHPQQQ VGTGQLMPGN MIRPMQAPQA 
       250        260        270        280        290        300 
QQLVNNMGNN QLAFAQQWQA MQAWARERNI DLSHPANASQ MAHILQARMA AQQKAGEGNV 
       310        320        330        340        350        360 
ASQSPSIPIS SQPASSSVVP GENSPHANSA SDISGQSGSA KARHALSTGS FASTSSPRMV 
       370        380        390        400        410        420 
NPAMNPFSGQ GRENPMYPRH LVQPTNGMPS GNPLQTSANE TPVLDQNAST KKSLGPAEHL 
       430        440        450        460        470        480 
QMQQPRQLNT PTPNLVAPSD TGPLSNSSLQ SGQGTQQAQQ RSGFTKQQLH VLKAQILAFR 
       490        500        510        520        530        540 
RLKKGEGSLP PELLQAISPP PLELQTQRQI SPAIGKVQDR SSDKTGEDQA RSLECGKESQ 
       550        560        570        580        590        600 
AAASSNGPIF SKEEDNVGDT EVALTTGHSQ LFQNLGKEAT STDVATKEEQ QTDVFPVKSD 
       610        620        630        640        650        660 
QGADSSTQKN PRSDSTADKG KAVASDGSQS KVPPQANSPQ PPKDTASARK YYGPLFDFPF 
       670        680        690        700        710        720 
FTRKLDSYGS ATANANNNLT LAYDIKDLIC EEGAEFLSKK RTDSLKKING LLAKNLERKR 
       730        740        750        760        770        780 
IRPDLVLRLQ IEEKKLRLSD LQSRVREEVD RQQQEIMSMP DRPYRKFVRL CERQRLEMNR 
       790        800        810        820        830        840 
QVLANQKAVR EKQLKTIFQW RKKLLEAHWA IRDARTARNR GVAKYHEKML REFSKRKDDG 
       850        860        870        880        890        900 
RNKRMEALKN NDVERYREML LEQQTNMPGD AAERYAVLSS FLTQTEDYLH KLGGKITATK 
       910        920        930        940        950        960 
NQQEVEEAAN AAAVAARLQG LSEEEVRAAA TCAREEVVIR NRFTEMNAPK ENSSVNKYYT 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LAHAVNEVVV RQPSMLQAGT LRDYQLVGLQ WMLSLYNNKL NGILADEMGL GKTVQVMALI 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
AYLMEFKGNY GPHLIIVPNA VLVNWKSELH TWLPSVSCIY YVGTKDQRSK LFSQEVCAMK 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
FNVLVTTYEF IMYDRSKLSK VDWKYIIIDE AQRMKDRESV LARDLDRYRC QRRLLLTGTP 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
LQNDLKELWS LLNLLLPDVF DNRKAFHDWF AQPFQKEGPA HNIEDDWLET EKKVIVIHRL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
HQILEPFMLR RRVEDVEGSL PAKVSVVLRC RMSAIQSAVY DWIKATGTLR VDPDDEKLRA 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
QKNPIYQAKI YRTLNNRCME LRKACNHPLL NYPYFNDFSK DFLVRSCGKL WILDRILIKL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
QRTGHRVLLF STMTKLLDIL EEYLQWRRLV YRRIDGTTSL EDRESAIVDF NDPDTDCFIF 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LLSIRAAGRG LNLQTADTVV IYDPDPNPKN EEQAVARAHR IGQTREVKVI YMEAVVEKLS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
SHQKEDELRS GGSVDLEDDM AGKDRYIGSI EGLIRNNIQQ YKIDMADEVI NAGRFDQRTT 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
HEERRMTLET LLHDEERYQE TVHDVPSLHE VNRMIARSEE EVELFDQMDE EFDWTEEMTN 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
HEQVPKWLRA STREVNATVA DLSKKPSKNM LSSSNLIVQP GGPGGERKRG RPKSKKINYK 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
EIEDDIAGYS EESSEERNID SGNEEEGDIR QFDDDELTGA LGDHQTNKGE FDGENPVCGY 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
DYPPGSGSYK KNPPRDDAGS SGSSPESHRS KEMASPVSSQ KFGSLSALDT RPGSVSKRLL 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
DDLEEGEIAA SGDSHIDLQR SGSWAHDRDE GDEEQVLQPT IKRKRSIRLR PRQTAERVDG 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
SEMPAAQPLQ VDRSYRSKLR TVVDSHSSRQ DQSDSSSRLR SVPAKKVAST SKLHVSSPKS 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
GRLNATQLTV EDNAEASRET WDGTSPISSS NAGARMSHII QKRCKIVISK LQRRIDKEGQ 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
QIVPMLTNLW KRIQNGYAAG GVNNLLELRE IDHRVERLEY AGVMELASDV QLMLRGAMQF 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
YGFSHEVRSE AKKVHNLFFD LLKMSFPDTD FREARNALSF SGSAPTLVST PTPRGAGISQ 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
GKRQKLVNEP ETEPSSPQRS QQRENSRIRV QIPQKETKLG GTTSHTDESP ILAHPGELVI 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
CKKKRKDREK SGPKTRTGGS SSPVSPPPAM IGRGLRSPVS GGVPRETRLA QQQRWPNQPT 
      2170       2180       2190    
HPNNSGAAGD SVGWANPVKR LRTDSGKRRP SHL



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

3 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...RPSHL 2193 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...RPSHL 2193 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt64259

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)