TopFIND 4.0

Q6IE24: Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54

General Information

Protein names
- Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54
- Inactive ubiquitin-specific peptidase 54
Gene names Usp54
Organism Rattus norvegicus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q6IE24

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MSWKRNYFSG GRGSVQGMFA PRSSMSIAPS KGLSNEPGQN SCFLNSALQV LWHLDIFRRS 
        70         80         90        100        110        120 
FRQLTSHKCM GDSCIFCALK GIFKQFQCSS EKVLPSDTLR SALAKTFQDE QRFQLGIMDD 
       130        140        150        160        170        180 
AAECFENLLM RIHFHIADET KEDICTAPHC ISHQKFAMTL FEQCVCTSCG ATSDPLPFIQ 
       190        200        210        220        230        240 
MVHYISTTSL CNQAICMLEK REKPSPGMFG ELLQNASTMG DLRDCPSNCG ERIRIRRVLM 
       250        260        270        280        290        300 
NAPQIITIGL VWDSDHSDLA EDVIHSLGTC LKLGDLFFRV TDDRAKQSEL YLVGMICYYG 
       310        320        330        340        350        360 
KHYSTFFFQT KIRKWMYFDD AHVKEIGPKW KDVVTKCIKG HYQPLLLLYA DPQGTPVSAQ 
       370        380        390        400        410        420 
DLPPHAQLLS HTKTCYDSED SGHLTDSECN QKHTTKKGPL VERRRGSGRI RRKADAPQAS 
       430        440        450        460        470        480 
GYHSEGETLK EKQAPRNASK SSSTSRLKDF KETVSNMIHS RPSLASQTNA ASPCVGRAGD 
       490        500        510        520        530        540 
QPDKIPARNL PLHSRGWETE STSSEARSSS SSKYRPTWRP KRESLNIDSI FSKDKRKHCG 
       550        560        570        580        590        600 
YTQLKTFPED AAKEFAQDEV SNPVANDIKD GGPSSQHKLW GTARPGSHLL EQHPRLIQRM 
       610        620        630        640        650        660 
ESGYESSERN SSSPVSLDAA PPECLNVYRD QSTKRAVGFV PSWRHIPKSH SSSILEVDST 
       670        680        690        700        710        720 
APVTGWTETQ PFSDGEITSK SELDELQEEV ARRAQEQELR KKREKELEAA KGFNPHPSRY 
       730        740        750        760        770        780 
MDLDELQNQG RSDGFERSLQ EANSVFEESL HLEQEGDCAA ALALCNEAIS KLRLTLHDAS 
       790        800        810        820        830        840 
SSTHSRALVD KKLQISIRKA RSLQDRMQQQ PPSQQPVQPS ASLPSQGGGL PQPTSEQSVP 
       850        860        870        880        890        900 
LQVLLSQQTQ LEPCKDSELG ATSPFFHSPA SCPEPHSSLV SPSPAQSVSQ HSPPGTSALK 
       910        920        930        940        950        960 
LLKSFEVDIV NHSAFHRQDL PKATGRTEMN SQHECLPFDA LEDRLQGHRE DNSCCSKFPP 
       970        980        990       1000       1010       1020 
QEGRDTTQDQ LLEGRKTPVD ISMGMPWSHS AGGATSERVM HSLNSPSSPS AQPAVPPYGA 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
CHPIMSAAAS PVLHAADPMQ KLNQHLQAQS LQTSLASKVV RGSEEPYRPE FPSTKGLVRS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
LAEQFQKIRN TSTRDVIGSQ DRSLPNGLRK SSSPSDFMLP LSQGPEKEHC RWVNQPPSPD 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
GRERQPCWEE PAGHPSVSID SGLPNGEASR RRQPRLAEAD IYQGKLPQVT DTRPTELGSS 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
VSLGTSLPLD SWVNVTRLCD SQVKHRAPGL GVKSSSHDSR TCVTYPERNP ILLHPHWNQD 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
TEQETSELES LYQASLQASS HTGYSDWRSQ DVAWQPLSLT GSADGMGRRL HSAPGLDLSK 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
TPTAEMERIL YEPSTVPVSQ DSSNVRKKTL ETGHHCSSSS SLPVIHDPPV FLLDPKLYPP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
QPQFLSPDVL MPSMAGEPYR SPGTSRSVQQ FLAMCDRDET PQGVKYTGRT LNYRSLPHRS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
RTDASWGPGT ETNQHIGARV LTAPACKPQL TYTATLPERH QGLQVPHAQS WGNLFHLPSH 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
PSAVHPGSPP SSSLHVLHRS SWNSGSVLGS RTPGPRRIDV PPDDDGRQSQ YPSQYRHRSA 
      1570       1580    
GEERVRFALS NTAGTEQSRV RLLQHSRW

Isoforms

- Isoform 2 of Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MSWKRNYFSG GRGSVQGMFA PRSSMSIAPS KGLSNEPGQN SCFLNSALQV LWHLDIFRRS 
        70         80         90        100        110        120 
FRQLTSHKCM GDSCIFCALK GIFKQFQCSS EKVLPSDTLR SALAKTFQDE QRFQLGIMDD 
       130        140        150        160        170        180 
AAECFENLLM RIHFHIADET KEDICTAPHC ISHQKFAMTL FEQCVCTSCG ATSDPLPFIQ 
       190        200        210        220        230        240 
MVHYISTTSL CNQAICMLEK REKPSPGMFG ELLQNASTMG DLRDCPSNCG ERIRIRRVLM 
       250        260        270        280        290        300 
NAPQIITIGL VWDSDHSDLA EDVIHSLGTC LKLGDLFFRV TDDRAKQSEL YLVGMICYYG 
       310        320        330        340        350        360 
KHYSTFFFQT KIRKWMYFDD AHVKEIGPKW KDVVTKCIKG HYQPLLLLYA DPQGTPVSAQ 
       370        380        390        400        410        420 
DLPPHAQLLS HTKTCYDSED SGHLTDSECN QKHTTKKGPL VERRRGSGRI RRKADAPQAS 
       430        440        450        460        470        480 
GYHSEGETLK EKQAPRNASK SSSTSRLKDF KETVSNMIHS RPSLASQTNA ASPCVGRAGD 
       490        500        510        520        530        540 
QPDKIPARNL PLHSRGWETE STSSEARSSS SSKYRPTWRP KRESLNIDSI FSKDKRKHCG 
       550        560        570        580        590        600 
YTQLKTFPED AAKEFAQDEV SNPVANDIKD GGPSSQHKLW GTARPGSHLL EQHPRLIQRM 
       610        620        630        640        650        660 
ESGYESSERN SSSPVSLDAA PPECLNVYRD QSTKRAVGFV PSWRHIPKSH SSSILEVDST 
       670        680        690        700        710        720 
APVTGWTETQ PFSDGEITSK SELDELQEEV ARRAQEQELR KKREKELEAA KGFNPHPSRY 
       730        740        750        760        770        780 
MDLDELQNQG RSDGFERSLQ EANSVFEESL HLEQEGDCAA ALALCNEAIS KLRLTLHDAS 
       790        800        810        820        830        840 
SSTHSRALVD KKLQISIRKA RSLQDRMQQQ PPSQQPVQPS ASLPSQGGGL PQPTSEQSVP 
       850        860        870        880        890        900 
LQVLLSQQTQ LEPCKDSELG ATSPFFHSPA SCPEPHSSLV SPSPAQSVSQ HSPPGTSALK 
       910        920        930        940        950        960 
LLKSFEVDIV NHSAFHRQDL PKATGRTEMN SQHECLPFDA LEDRLQGHRE DNSCCSKFPP 
       970        980        990       1000       1010       1020 
QEGRDTTQDQ LLEGRKTPVD ISMGMPWSHS AGGATSERVM HSLNSPSSPS AQPAVPPYGA 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
CHPIMSAAAS PVLHAADPMQ KLNQHLQAQS LQTSLASKVV RGSEEPYRPE FPSTKGLVRS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
LAEQFQKIRN TSTRDVIGSQ DRSLPNGLRK SSSPSDFMLP LSQGPEKEHC RWVNQPPSPD 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
GRERQPCWEE PAGHPSVSID SGLPNGEASR RRQPRLAEAD IYQGKLPQVT DTRPTELGSS 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
VSLGTSLPLD SWVNVTRLCD SQVKHRAPGL GVKSSSHDSR TCVTYPERNP ILLHPHWNQD 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
TEQETSELES LYQASLQASS HTGYSDWRSQ DVAWQPLSLT GSADGMGRRL HSAPGLDLSK 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
TPTAEMERIL YEPSTVPVSQ DSSNVRKKTL ETGHHCSSSS SLPVIHDPPV FLLDPKLYPP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
QPQFLSPDVL MPSMAGEPYR SPGTSRSVQQ FLAMCDRDET PQGVKYTGRT LNYRSLPHRS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
RTDASWGPGT ETNQHIGARV LTAPACKPQL TYTATLPERH QGLQVPHAQS WGNLFHLPSH 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
PSAVHPGSPP SSSLHVLHRS SWNSGSVLGS RTPGPRRIDV PPDDDGRQSQ YPSQYRHRSA 
      1570       1580    
GEERVRFALS NTAGTEQSRV RLLQHSRW



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q6IE24-1-unknown MSWKRN... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q6IE24-1-unknown MSWKRN... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt193677

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...QHSRW 1588 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)