TopFIND 4.0

Q6NXI6: Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2

General Information

Protein names
- Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2
Gene names Rprd2
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q6NXI6

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MAAGGGGGSS KASSSSASSA GALESSLDRK FQSVTNTMES IQGLSSWCIE NKKHHSTIVY 
        70         80         90        100        110        120 
HWMKWLRRST YPHRLNLFYL ANDVIQNCKR KNAIIFRESF ADVLPEAAAL VKDPSVSKSI 
       130        140        150        160        170        180 
ERIFKIWEDR NVYPEDMIVA LREALMDRAA SHNARLQKLQ CFPGTTFKTQ KQLKENLNKQ 
       190        200        210        220        230        240 
PNKQWKKSQT STNPKAALKS KIVAEFRSQA LIEELLMYKR SEDQIELKEK QLSTMRVDVC 
       250        260        270        280        290        300 
STETLKCLKD KTGGKKFSKE FEEASSKLEE FVNGLDKQVK NGPSLTEALE NAGIFYEAQY 
       310        320        330        340        350        360 
KEVKVVANAY KTFANRVNNL KKKLDQLKST LPDPEESPVP SPSMDAPSPT GSESPFQGMG 
       370        380        390        400        410        420 
GEEPQSPAME SDKSATPEPV TDNRDVEDME LSDVEDDGSK IIVEDRKEKP VEKPAVSTGV 
       430        440        450        460        470        480 
PTKSTESVSK ASPCAPPSVP TTAAPPLPKP LSTALLSPSP TLVLPNLANV DLAKISSILS 
       490        500        510        520        530        540 
SLTSVMKNTG VSSASRPSPG IPTSPSNLSS GLKTPAPATT PSHNPLANIL SKVEITPESI 
       550        560        570        580        590        600 
LSALSKTQTQ SAPALQGLSS LLQSVTANPV PASEVTSQST TASPASTTGS AVKGRNLLSS 
       610        620        630        640        650        660 
TQSFIPKSFN YSPSSSTSEV SSTSASKASV GQSPVLPSTT FKLPSSSLGF TGTHNPSPAA 
       670        680        690        700        710        720 
PPTEVAVCQS SEVSKPKPES ESTSPSLEMK IHNFLKGNPG FSGLNLNIPI LSSLGSSAPS 
       730        740        750        760        770        780 
EGHASDFQRG PTSTSVDSID GTPVRDERSG TPTQDEMMDK PTSSSVDTMS LLSKIISPGS 
       790        800        810        820        830        840 
STPSSTRSPP PGRDESYPQE LPNSVSTYRP FGLGSDSPYK QPSGGVERPS SLMDSSQEKL 
       850        860        870        880        890        900 
FPDTSFQEDE DYRDFEYSGP PPSAMMNLEK KPAKSILKSS KLSDATEYQP ILSSYNHRAQ 
       910        920        930        940        950        960 
EFGVKSAFPP SVRALLDSSE NCDRLSSPPG LFGAFNIRGN EPGSERSPSP SKNDAFFTPD 
       970        980        990       1000       1010       1020 
SNHSGLSQST AGHLTLPQTQ YPDSPHSVPH RSIFSSQSTL AAPAGHPPTS GVEKVLASTI 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
STTSTIEFKN MLKNASRKPS DDKHFGQTPN KGTSSDGVSL SNLTQPSLPT TDQQQEEHYR 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
IETRVSSSCL DLPDSTEEKG APIETLGYHN AANRRMSGEP IKTVESIRVP GKGNRGHGRE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
VSRVGWFDLS TPGSSFDNGP SSASELASLG GGGSGGLTGF KTTPYKERAP QFQESVTSFR 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SNSFNSTFEH HLPPSPLEHG APFQREPVGP SSAPPAPPKD HGGIFSREAP THLPSVDLSN 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
PFTKEASLAH AGPPPPPGEH SGVPFPPPPP PPPPGELSSG GTGVPFATPA PPPPPVDHSG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
VVPFPTPPLP EHGVTGAVSV FPKDHSSLLQ GTMAEHFGVL TGPRDLNGPG LNRSRESLSL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PSHPLEHLGP ALGGGGGGNT SSSGLPLSPA HRDAIGRSGM ILRSPRPDFR PREAFLGRDP 
      1450       1460    
FHSLKRPRPP FVRGPPFFAP KRPFFPPRY

Isoforms

- Isoform 2 of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MAAGGGGGSS KASSSSASSA GALESSLDRK FQSVTNTMES IQGLSSWCIE NKKHHSTIVY 
        70         80         90        100        110        120 
HWMKWLRRST YPHRLNLFYL ANDVIQNCKR KNAIIFRESF ADVLPEAAAL VKDPSVSKSI 
       130        140        150        160        170        180 
ERIFKIWEDR NVYPEDMIVA LREALMDRAA SHNARLQKLQ CFPGTTFKTQ KQLKENLNKQ 
       190        200        210        220        230        240 
PNKQWKKSQT STNPKAALKS KIVAEFRSQA LIEELLMYKR SEDQIELKEK QLSTMRVDVC 
       250        260        270        280        290        300 
STETLKCLKD KTGGKKFSKE FEEASSKLEE FVNGLDKQVK NGPSLTEALE NAGIFYEAQY 
       310        320        330        340        350        360 
KEVKVVANAY KTFANRVNNL KKKLDQLKST LPDPEESPVP SPSMDAPSPT GSESPFQGMG 
       370        380        390        400        410        420 
GEEPQSPAME SDKSATPEPV TDNRDVEDME LSDVEDDGSK IIVEDRKEKP VEKPAVSTGV 
       430        440        450        460        470        480 
PTKSTESVSK ASPCAPPSVP TTAAPPLPKP LSTALLSPSP TLVLPNLANV DLAKISSILS 
       490        500        510        520        530        540 
SLTSVMKNTG VSSASRPSPG IPTSPSNLSS GLKTPAPATT PSHNPLANIL SKVEITPESI 
       550        560        570        580        590        600 
LSALSKTQTQ SAPALQGLSS LLQSVTANPV PASEVTSQST TASPASTTGS AVKGRNLLSS 
       610        620        630        640        650        660 
TQSFIPKSFN YSPSSSTSEV SSTSASKASV GQSPVLPSTT FKLPSSSLGF TGTHNPSPAA 
       670        680        690        700        710        720 
PPTEVAVCQS SEVSKPKPES ESTSPSLEMK IHNFLKGNPG FSGLNLNIPI LSSLGSSAPS 
       730        740        750        760        770        780 
EGHASDFQRG PTSTSVDSID GTPVRDERSG TPTQDEMMDK PTSSSVDTMS LLSKIISPGS 
       790        800        810        820        830        840 
STPSSTRSPP PGRDESYPQE LPNSVSTYRP FGLGSDSPYK QPSGGVERPS SLMDSSQEKL 
       850        860        870        880        890        900 
FPDTSFQEDE DYRDFEYSGP PPSAMMNLEK KPAKSILKSS KLSDATEYQP ILSSYNHRAQ 
       910        920        930        940        950        960 
EFGVKSAFPP SVRALLDSSE NCDRLSSPPG LFGAFNIRGN EPGSERSPSP SKNDAFFTPD 
       970        980        990       1000       1010       1020 
SNHSGLSQST AGHLTLPQTQ YPDSPHSVPH RSIFSSQSTL AAPAGHPPTS GVEKVLASTI 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
STTSTIEFKN MLKNASRKPS DDKHFGQTPN KGTSSDGVSL SNLTQPSLPT TDQQQEEHYR 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
IETRVSSSCL DLPDSTEEKG APIETLGYHN AANRRMSGEP IKTVESIRVP GKGNRGHGRE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
VSRVGWFDLS TPGSSFDNGP SSASELASLG GGGSGGLTGF KTTPYKERAP QFQESVTSFR 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SNSFNSTFEH HLPPSPLEHG APFQREPVGP SSAPPAPPKD HGGIFSREAP THLPSVDLSN 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
PFTKEASLAH AGPPPPPGEH SGVPFPPPPP PPPPGELSSG GTGVPFATPA PPPPPVDHSG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
VVPFPTPPLP EHGVTGAVSV FPKDHSSLLQ GTMAEHFGVL TGPRDLNGPG LNRSRESLSL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PSHPLEHLGP ALGGGGGGNT SSSGLPLSPA HRDAIGRSGM ILRSPRPDFR PREAFLGRDP 
      1450       1460    
FHSLKRPRPP FVRGPPFFAP KRPFFPPRY



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q6NXI6-1-unknown MAAGGG... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q6NXI6-1-unknown MAAGGG... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt88202

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...FPPRY 1469 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...FPPRY 1469 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt83820

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)